| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 3,334,940 | T→G | 31.8% | S106A (TCT→GCT) | kdsD → | D‑arabinose 5‑phosphate isomerase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 3,334,940 | 0 | T | G | 31.8% | 255.7 / 283.5 | 267 | S106A (TCT→GCT) | kdsD | D‑arabinose 5‑phosphate isomerase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (86/96); new base G (40/45); total (126/141) | |||||||||||
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Only 100 of 276 total aligned reads displayed.
GATGGGAAAATCGGGGCATATTGGGCGAAAAATGGCGGCAACGTTTGCCAGCACCGGTACACCTTCATTTTTCGTCCATCCTGGTGAAGCCGCGCATGGTGATTTAGGCATGGTTACCCCACAGGATGTGGTGATTGCTATCTCTAACTCTGGTGAATCCAGCGAAATCACGGCCTTAATTCCAGTGCTTAAGCGTCTTCACGTACCGTTAATCTGCATCACCGGTCGCCCGGAGAGCAGCATGGCGCGCGCCGCAGATGTGCATCTGTGTGTTAAAGTAGCGAAAGAAGCCTGTCC > CP009273/3334792‑3335088 | gATGGGAAAATCGGGGCATATTGGGCGAAAAATGGCGGCAACGTTTGCCAGCACCGGTACACCTTCATTTTTCGTCCATCCTGGTGAAGCCGCGCATGGTGATTTAGGCATGGTTACCCCACAGGATGTGGTGATTGCTATCTCTAAct < 1:1274053/149‑1 (MQ=255) aTGGGAAAATCGGGGCATATTGGGCGAAAAATGGCGGCAACGTTTGCCAGCACCGGTACACCTTCATTTTTCGTCCATCCTGGTGAAGCCGCGCATGGTGATTTAGGCATGGTTACCCCACAGGATGTGGTGATTGCTATCTCTAActc < 1:3899706/149‑1 (MQ=255) ggAAAATCGGGGCAGATTGGGCGAAAAATGGCGGCAACGTTTGCCAGCACCGGTACACCTTCATTTTTCGTCCACCCTGGTGAAGCCGCGCATGGTGATTTAGGCATGGTTACCCCACAGGATGTGGTGATTGCTATCTCTAACTCTgg < 1:2422634/149‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |