| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC JC | CP009273 | 2,709,656 | IS2 (–) +5 bp | 94.5% | coding (149‑153/384 nt) | grcA ← | autonomous glycyl radical cofactor |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 2709656 = | 13 (0.070) | 247 (1.220) | 121/274 | NT | 94.8% | coding (153/384 nt) | grcA | autonomous glycyl radical cofactor |
| ? | CP009273 | = 2991050 | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
| * | ? | CP009273 | = 2709660 | 13 (0.070) | 198 (0.980) | 104/274 | NT | 93.6% | coding (149/384 nt) | grcA | autonomous glycyl radical cofactor |
| ? | CP009273 | 2989720 = | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
Only 100 of 215 total aligned reads displayed.
GATGGTCAGCTGCGGATATTTTTCCGGATGCTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/2709515‑2709660‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTT > CP009273/2989720‑2989865 GATGGTCAGCTGCGGATATTTTTCCGGATGCTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTG < 1:2043160/148‑1 ATGGTCAGCTGCGGATATTTTTCCGGATGCTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGG > 2:1326075/1‑148 GGTCAGCTGCGGATATTTTTCCGGATGCTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGAT < 2:702704/148‑1 GTCAGCTGCGGATATTTTTCCGGATGCTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATT > 2:1203497/1‑148 GCTGCGGATATTTTTCCGGATGCTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCC < 2:3390787/148‑1 TGCGGATATTTTTCCGGATGCTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCC < 2:524596/148‑1 GCGGATATTTTTCCGGATGCTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCT < 1:2282917/148‑1 GCGGATATTTTTCCGGATGCTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCT < 1:665777/148‑1 GCGGATATTTTTCCGGATGCTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCT < 1:927996/148‑1 GCGGATATTTTTCCGGATGCTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCT < 1:2396264/148‑1 GCGGATATTTTTCCGGATGCTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACATTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCtt < 1:3248252/148‑3 CGGATATTTTTCCGGATGCTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGACCTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTA > 2:2428058/1‑148 GATATTTTTCCGGATGCTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATA < 2:1991264/148‑1 GATATTTTTCCGGATGCTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGCTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATA < 2:1921728/148‑1 ATTTTTCCGGATGCTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTT < 1:486784/148‑1 TTTTTCCGGATGCTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTC < 1:1844291/148‑1 TTTTCCGGATGCTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCC < 2:655435/148‑1 TTTTCCGGATGCTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCC > 1:2235878/1‑148 TCCGGATGCTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGA > 1:543637/1‑148 GGATGCTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACAT < 2:3133680/148‑1 GCTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGT < 1:2883925/148‑1 CTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTT < 2:2884966/148‑1 TTATCTGCATCTTCGAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCTCCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCAAGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTA < 1:3180343/148‑1 TTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGGTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTA < 2:2860313/148‑1 TAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTAT > 1:46222/1‑148 TAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTAT < 2:59376/148‑1 AACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATC > 2:1451983/1‑148 CTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCAC > 2:2708314/1‑148 TGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACT < 2:1235112/148‑1 TGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACT < 2:2407940/148‑1 TCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACTTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCAAGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAAC > 1:2682456/1‑148 TCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGATCTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAAC < 1:3429590/148‑1 TCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAAC > 1:1761592/1‑148 TCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAAC > 1:1736523/1‑148 TCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAAC > 1:1532809/1‑148 TTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCC > 1:779162/1‑148 AGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTA > 1:3516925/1‑148 AGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACA > 1:1248959/1‑148 GTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAA < 2:809652/148‑1 TTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAG < 1:145381/148‑1 TTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAG < 1:3307663/148‑1 TTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAG < 1:2337120/148‑1 TTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGC < 2:779496/148‑1 tCGACGCAGAACGTTAAAGTTCAGTTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGTTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTTGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATATGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCG < 1:1342957/147‑1 GCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCG < 1:2832457/148‑1 GCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGGTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCG < 1:46735/148‑1 ACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTG > 1:752518/1‑148 ACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTG > 1:117529/1‑148 ACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTG > 1:1239842/1‑148 CGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGC > 1:1506398/1‑148 CAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCG > 1:2781516/1‑148 AACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAG > 1:302444/1‑148 AACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAG > 1:2035100/1‑148 AACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAG > 2:828044/1‑148 ACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGA > 2:788716/1‑148 TTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATAT > 1:1037892/1‑148 TAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATT > 1:1219688/1‑148 TAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATT > 1:1818329/1‑148 CGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCC > 2:2729180/1‑148 CAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGG < 2:1945064/148‑1 CAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGG < 1:1942221/148‑1 CAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGG < 2:175932/148‑1 AGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTATACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGACCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACACATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGC > 2:1669405/1‑148 GTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGA > 1:2988794/1‑148 ACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATA > 1:1232153/1‑148 ACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACC > 2:1801011/1‑148 CGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGTCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCAC < 1:1307191/148‑1 CGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCAC > 2:1282049/1‑148 CGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCAC > 1:2602795/1‑148 GCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACT < 2:2127800/148‑1 TTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGG < 2:779162/148‑1 TTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGG < 2:283380/148‑1 TCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGA < 1:3142532/148‑1 GTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCC > 1:1107047/1‑148 GTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCC < 2:2995184/148‑1 ACTTCTACTGGAACTTAACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCG > 2:755431/1‑148 TCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTA > 1:2441564/1‑148 TACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATA < 1:2547292/148‑1 CTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTTCCCATATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAAT < 2:1886851/148‑1 TGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATG > 1:11308/1‑148 GAACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCT < 1:2448456/148‑1 ACTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCG < 1:2560049/148‑1 CTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGA < 2:1656555/148‑1 CTTCACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGA > 2:2565916/1‑148 ACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGC < 2:2745795/148‑1 ACGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGC < 1:1007873/148‑1 CGGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCC > 2:3025115/1‑148 GGTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCT < 2:2407473/148‑1 GTATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTC > 1:828518/1‑148 TATTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCT > 2:3176662/1‑148 TTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGC > 2:1850257/1‑148 TTCAATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGC > 2:1367030/1‑148 ATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAATCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGG < 2:382209/148‑1 ATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGG < 2:1506398/148‑1 ATGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGG < 2:916255/148‑1 TGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGT < 2:2278360/148‑1 TGTCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGT < 2:109009/148‑1 TCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTC < 1:2068192/148‑1 CACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCT < 2:3321208/148‑1 ACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTT < 2:712304/148‑1 GATGGTCAGCTGCGGATATTTTTCCGGATGCTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/2709515‑2709660‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTT > CP009273/2989720‑2989865 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |