| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 3744959 = | 180 (0.890) | 562 (2.780) | 199/274 | NT | 76.6% | coding (270/741 nt) | yiaT | putative outer membrane protein |
| ? | CP009273 | = 3752673 | 164 (0.810) | coding (549/1845 nt) | selB | selenocysteinyl‑tRNA‑specific translation factor | |||||
Only 100 of 784 total aligned reads displayed.
ATTGGCGGTTTCTGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCTGCGGTGATAAACAGTTTTGCCTCAGCAAAACCGTATTCC > CP009273/3752526‑3752820 | tGGCGGTTTCTGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTaaa < 2:1179522/148‑1 (MQ=255) tGGCGGTTTCTGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAgg > 2:453749‑M2/1‑146 (MQ=255) gCGGTTTCTGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggta < 2:1844754‑M2/148‑5 (MQ=255) gCGGTTTCTGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggta < 1:2972168‑M2/148‑5 (MQ=255) gCGGTTTCTGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATg < 2:2629629/148‑1 (MQ=255) gCGGTTTATGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggta < 1:3185324‑M2/148‑5 (MQ=255) gTTTCTGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtaggg > 1:750401‑M2/1‑141 (MQ=255) tttCTGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggt < 2:1667818‑M2/148‑9 (MQ=255) cTGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaa > 1:3437539‑M2/1‑137 (MQ=255) tGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaa > 1:1971442‑M2/1‑136 (MQ=255) tGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattc < 1:2567963‑M2/148‑16 (MQ=255) ggCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattcc > 1:984801‑M2/1‑132 (MQ=255) gCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattcca > 1:1547253‑M2/1‑131 (MQ=255) cTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCGGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATcgcg < 1:802038/148‑1 (MQ=255) cTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccag > 1:685439‑M2/1‑130 (MQ=255) ggTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcg > 2:1396650‑M2/1‑128 (MQ=255) ttGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcat > 2:2259273‑M2/1‑124 (MQ=255) tGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatc > 1:520203‑M2/1‑123 (MQ=255) cATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccagg > 2:2695739‑M2/1‑119 (MQ=255) cATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccagg > 1:1608236‑M2/1‑119 (MQ=255) cATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACt < 2:3082862/148‑1 (MQ=255) aTGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccagga > 2:1808716‑M2/1‑118 (MQ=255) gCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatg > 1:2521517‑M2/1‑116 (MQ=255) 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acacGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggcta < 1:2652836‑M2/148‑44 (MQ=255) cacGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaa < 1:1634492‑M2/148‑45 (MQ=255) cacGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaa < 1:434738‑M2/148‑45 (MQ=255) cacGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTg > 1:2762047/1‑148 (MQ=255) acGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaag > 1:1783745‑M2/1‑103 (MQ=255) cGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagt > 1:260612‑M2/1‑102 (MQ=255) cATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttc > 2:1987599‑M2/1‑100 (MQ=255) cATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttc < 2:2449082‑M2/148‑49 (MQ=255) aTCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttca > 1:3017040‑M2/1‑99 (MQ=255) cGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcatt < 1:1488600‑M2/148‑52 (MQ=255) cGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGt > 1:1018995/1‑148 (MQ=255) cGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGt > 2:412529/1‑148 (MQ=255) ggTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcattt > 1:2119083‑M2/1‑96 (MQ=255) gTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcatttt > 1:619659‑M2/1‑95 (MQ=255) tttatttaCACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcattttt < 2:248654‑M2/148‑55 (MQ=255) ttatttaCACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcatttttt < 2:2088351‑M2/148‑56 (MQ=255) tatttaCACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcattttttt > 2:2582960‑M2/1‑92 (MQ=255) atttaCACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGc > 1:1318077/1‑148 (MQ=255) tttaCACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCa < 1:206308/148‑1 (MQ=255) ccAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGaa < 2:1892580/148‑1 (MQ=255) 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gTGAATCGCCTACCTTCACGTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcatttttttcactttgcgacagaataaaac > 2:1948306‑M2/1‑71 (MQ=255) tGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCgcgc > 1:2231513/1‑148 (MQ=255) aaTCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcatttttttcactttgcgacagaataaaaccta > 2:2018879‑M2/1‑68 (MQ=255) aTCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAgg > 2:2825136/1‑148 (MQ=255) aTCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCAGGCAACTGAAGCAGATGATCGCGCAgg > 2:501238/1‑148 (MQ=255) 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gTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCTGCgg < 2:1484257/148‑1 (MQ=255) tACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcatttttttcactttgcgacagaataaaacctaacgtggtctgacgaacataaaaagtatcacctt < 1:324578‑M2/148‑114 (MQ=255) gTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcatttttttcactttgcgacagaataaaacctaacgtggtctgacgaacataaaaagtatcaccttcataa < 2:640813‑M2/148‑119 (MQ=255) gTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCTGCGGTGATaa < 2:2379608/148‑1 (MQ=255) gTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCTGCGGTGATaa < 2:3125247/148‑1 (MQ=255) acgacCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCTGCGGTGATAAACa > 2:749195/1‑148 (MQ=255) acCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcatttttttcactttgcgacagaataaaacctaacgtggtctgacgaacataaaaagtatcaccttcataactaatc > 2:2181738‑M2/1‑24 (MQ=255) ccAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcatttttttcactttgcgacagaataaaacctaacgtggtctgacgaacataaaaagtatcaccttcataactaatca < 1:3498000‑M2/148‑126 (MQ=255) ccAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcatttttttcactttgcgacagaataaaacctaacgtggtctgacgaacataaaaagtatcaccttcataactaatca < 1:1376756‑M2/148‑126 (MQ=255) aGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcatttttttcactttgcgacagaataaaacctaacgtggtctgacgaacataaaaagtatcaccttcataactaatcagc > 1:1167529‑M2/1‑21 (MQ=255) aGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCTGCGGTGATAAACAGTTTTg < 1:3382961/148‑1 (MQ=255) gCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCTGCGGTGATAAACAGTTTTGc < 2:2867630/148‑1 (MQ=255) cACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcatttttttcactttgcgacagaataaaacctaacgtggtctgacgaacataaaaagtatcaccttcataactaatcagcggaattg < 2:1619033‑M2/148‑135 (MQ=255) ccTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcatttttttcactttgcgacagaataaaacctaacgtggtctgacgaacataaaaagtatcaccttcataactaatcagcggaattgcc < 1:289756‑M2/148‑137 (MQ=255) cTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcatttttttcactttgcgacagaataaaacctaacgtggtctgacgaacataaaaagtatcaccttcataactaatcagcggaattgcct < 1:2824315‑M2/148‑138 (MQ=255) ttttACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcatttttttcactttgcgacagaataaaacctaacgtggtctgacgaacataaaaagtatcaccttcataactaatcagcggaattgcctt > 1:3094829‑M2/1‑10 (MQ=255) ttttACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCTGCGGTGATAAACAGTTTTGCCTCAGCaaaa < 2:2227893/148‑1 (MQ=255) ttttACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCTGCGGTGATAAACAGTTTTGCCTCAGCaaaa > 2:3403372/1‑148 (MQ=255) ttttACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCTGCGGTGATAAACAGTTTTGCCTCAGCaaaa > 2:1562603/1‑148 (MQ=255) ttttACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCTGCGGTGATAAACAGTTTTGCCTCAGCaaaa < 2:1238777/148‑1 (MQ=255) tttACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcatttttttcactttgcgacagaataaaacctaacgtggtctgacgaacataaaaagtatcaccttcataactaatcagcggaattgccttc < 2:1353454‑M2/148‑140 (MQ=255) ggtaggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcatttttttcactttgcgacagaataaaacctaacgtggtctgacgaacataaaaagtatcaccttcataactaatcagcggaattgccttcgtatt > 2:3539713‑M2/1‑4 (MQ=255) | ATTGGCGGTTTCTGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCTGCGGTGATAAACAGTTTTGCCTCAGCAAAACCGTATTCC > CP009273/3752526‑3752820 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |