| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,262,740 | T→A | 38.7% | Y323N (TAT→AAT) | yhaC → | pentapetide repeats‑related protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,262,740 | 0 | T | A | 38.7% | 225.4 / inf | 266 | Y323N (TAT→AAT) | yhaC | pentapetide repeats‑related protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (84/79); new base A (51/52); total (135/131) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.02e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 269 total aligned reads displayed.
ACAAAAGAAATATATAAAAGCTCATCGAAAATCATCAATTGCTTGAACAGAATTAAATTAACAGAGATGAAAGAATTCTCATCAGAAAAAATATATGATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTTATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGACTCTAGCTCAGAAGAGTTACTTTCAGATAATACCCTCGAGAAAGACGAAAATTCTCCGGACAATGGCTTTGAGGTCGGGGAATATAACACATATGAAG > CP009273/3262593‑3262887 | aaaGAAATATATAAAAGCTCATCGAAAATCATCAATTGCTTGAACAGAATTAAATTAACAGAGATGAAAGAATTCTCATCAGAAAAAATATATGATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTTATc < 2:1231964/148‑1 (MQ=255) aaaGAAATATATAAAAGCTCATCGAAAATCATCAATTGCTTGAACAGAATTAAATTAACAGAGATGAAAGAATTCTCATCAGAAAAAATATATGATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTTATc > 2:1348426/1‑148 (MQ=255) aaaTATATAAAAGCTCATCGAAAATCATCAATTGCTTGAACAGAATTAAATTAACAGAGATGAAAGAATTCTCATCAGAAAAAATATATGATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTTATCTGgt < 1:3185581/148‑1 (MQ=255) aaaTATATAAAAGCTCATCGAAAATCATCAATTGCTTGAACAGAATTAAATTAACAGAGATGAAAGAATTCTCATCAGAAAAAATATATGATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTAATCTGgt > 2:2874116/1‑148 (MQ=255) aaaTATATAAAAGCTCATCGAAAATCATCAATTGCTTGAACAGAATTAAATTAACAGAGATGAAAGAATTCTCATCAGAAAAAATATATGATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGATAATATGgt > 2:1542283/1‑148 (MQ=255) taAAAGCTCATCGAAAATCATCAATTGCTTGAACAGAATTAAATTAACAGAGATGAAAGAATTCTCATCAGAAAAAATATATGATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTAATCTGGTCGTcccc > 1:3001563/1‑148 (MQ=255) aaaGCTCATCGAAAATCATCAATTGCTTGAACAGAATTAAATTAACAGAGATGAAAGAATTCTCATCAGAAAAAATATATGATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTAATCTGGTCGTCCCCCa > 1:3362893/1‑148 (MQ=255) aaGCTCATCGAAAATCATCAATTGCTTGAACAGAATTAAATTAACAGAGATGAAAGAATTCTCATCAGAAAAAATATATGATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTAATCTGGTCGTCCCCCaa > 1:2041053/1‑148 (MQ=255) aGCTCATCGAAAATCATCAATTGCTTGAACAGAATTAAATTAACAGAGATGAAAGAATTCTCATCAGAAAAAATATATGATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTTATCTGGTCGTCCCCCaaa > 2:563166/1‑148 (MQ=255) aGCTCATCGAAAATCATCAATTGCTTGAACAGAATTAAATTAACAGAGATGAAAGAATTCTCATCAGAAAAAATATATGATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTAATCTGGTCGTCCCCCaaa > 1:2471154/1‑148 (MQ=255) gCTCATCGAAAATCATCAATTGCTTGAACAGAATTAAATTAACAGAGATGAAAGAATTCTCATCAGAAAAAATATATGATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTTATCTGGTCGTCCCCCAaat > 2:381503/1‑148 (MQ=255) tCATCTAAAATCATCAATTGCTTGAACAGAATTAAATTAACCGAGATGAAAGAATTCTCATCAGAAAAAATATATGATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTTATCTGGTCGTCCCCCAaatta < 1:2783385/148‑1 (MQ=255) cATCGAAAATCATCAATTGCTTGAACAGAATTAAATTAACAGAGATGAAAGAATTCTCATCAGAAAAAATATATGATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTTATCTGGTCGTCCCCCAaattaa < 1:1952896/148‑1 (MQ=255) cATCGAAAATCATCAATTGCTTGAACAGAATTAAATTAACAGAGATGAAAGAATTCTCATCAGAAAAAATATATGATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTTATCTGGTCGTCCCCCAaattaa > 1:293163/1‑148 (MQ=255) cATCGAAAATCATCAATTGCTTGAACAGAATTAAATTAACAGAGATGAAAGAATTCTCATCAGAAAAAATATATGATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTTATCTGGTCGTCCCCCAaattaa > 1:916610/1‑148 (MQ=255) cATCGAAAATCATCAATTGCTTGAACAGAATTAAATTAACAGAGATGAAAGAATTCTCATCAGAAAAAATATATGATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTAATCTGGTCGTCCCCCAaattaa < 1:2277875/148‑1 (MQ=255) cATCGAAAATCATCAATTGCTTGAACAGAATTAAATTAACAGAGATGAAAGAATTCTCATCAGAAAAAATATATGATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTAATCTGGTCGTCCCCCAaattaa < 2:1549923/148‑1 (MQ=255) aTCGAAAATCATCAATTGCTTGAACAGAATTAAATTAACAGAGATGAAAGAATTCTCATCAGAAAAAATATATGATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTAATCTGGTCGTCCCCCAaattaat > 1:3375673/1‑148 (MQ=255) tCGAAAATCATCAATTGCTTGAACAGAATTAAATTAACAGAGATGAAAGAATTCTCATCAGAAAAAATATATGATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTAATCTGGTCGTCCCCCAaattaatt < 1:1170417/148‑1 (MQ=255) cGAAAATCATCAATTGCTTGAACAGAATTAAATTAACAGAGATGAAAGAATTCTCATCAGAAAAAATATATGATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTAATCTGGTCGTCCCCCAAattaatta > 2:45655/1‑148 (MQ=255) gAAAATCATCAATTGCTTGAACAGAATTAAATTAACAGAGATGAAAGAATTCTCATCAGAAAAAATATATGATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTTATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATtat < 2:2572006/148‑1 (MQ=255) atcatcAATTGCTTGAACAGAATTAAATTAACAGAGATGAAAGAATTCTCATCAGAAAAAATATATGATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTAATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTa > 1:2217563/1‑148 (MQ=255) catcaATTGCTTGAACAGAATTAAATTAACAGAGATGAAAGAATTCTCATCAGAAAAAATATATGATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTAATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATg > 2:2490964/1‑148 (MQ=255) tcaATTGCTTGAACAGAATTAAATTAACAGAGATGAAAGAATTCTCATCAGAAAAAATATATGATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTTATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGa > 2:1791005/1‑148 (MQ=255) caATTGCTTGAACAGAATTAAATTAACAGAGATGAAAGAATTCTCATCAGAAAAAATATATGATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTTATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGAt > 2:1396895/1‑148 (MQ=255) caATTGCTTGAACAGAATTAAATTAACAGAGATGAAAGAATTCTCATCAGAAAAAATATATGATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTTATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGAt < 1:1009871/148‑1 (MQ=255) tGCTTGAACAGAATTAAATTAACAGAGATGAAAGAATTCTCATCAGAAAAAATATATGATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTTATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTaa < 2:2235018/148‑1 (MQ=255) gCTTGAACAGAATTAAATTAACAGAGATGAAAGAATTCTCATCAGAAAAAATATATGATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTTATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTaaa < 2:607356/148‑1 (MQ=255) acacAATTAAATTAACAGAGATGAAAGAAATCTCATCAGAAAAAATATATGATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTAATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATaga < 2:2125700/148‑1 (MQ=255) aCAGAATTAAATTAACAGAGATGAAAGAATTCTCATCAGAAAAAATATATGATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTTATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATaga > 1:3271762/1‑148 (MQ=255) aGAATTAAATTAACAGAGATGAAAGAATTCTCATCAGAAAAAATATATGATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTTATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATagaag > 2:3001525/1‑148 (MQ=255) taattaaattaACAGAGTTGTTTGAATTCTCATCAGAAAAAATATATGATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTAATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATagaaga < 2:3245651/147‑1 (MQ=255) gAATTAAATTAACAGAGATGAAAGAATTCTCATCAGAAAAAAAATATGATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTTATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATagaaga > 2:1641943/1‑148 (MQ=255) aattaaattaACAGAGATTAAAGAATTCTCATCAGAAAAAATATATGATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCACAGAAAATGCTAATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGAc < 2:1854326/148‑1 (MQ=255) attaaattaaCAGAGATGAAAGAATTCTCATCAGAAAAAATATATGATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTTATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGAct > 2:740354/1‑148 (MQ=255) attaaattaaCAGAGATGAAAGAATTCTCATCAGAAAAAATATATGATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTTATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGAct > 1:1937390/1‑148 (MQ=255) taaattaaCAGAGATGAAAGAATTCTCATCATAAAAAATATATGATTACATCTATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTTATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGActct < 2:3315239/148‑1 (MQ=255) aaattaaCAGAGATGAAAGAATTCTCATCAGAAAAAATATATGATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTTATCTGGTCGTCTCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGACTCTa > 2:1471996/1‑148 (MQ=255) aattaaCAGATATGAAAGAATTCTCATCAGAAAAAATATATGATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAACAAAATGCTTATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGACTCTAg < 1:49648/148‑1 (MQ=255) ttaaCAGAGATGAAAGAATTCTCATCAGAAAAAATATATGATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTTATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGACTCTAGCt < 2:702336/148‑1 (MQ=255) ttaaCAGAGATGAAAGAATTCTCATCAGAAAAAATATATGATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTTATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGACTCTAGCt > 1:2600746/1‑148 (MQ=255) gagaTGAAAGAATTCTCATCAGAAAAAATATATTATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAACAAAATGCTAATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGACTCTAGCTCagaag < 1:2128938/148‑1 (MQ=255) gagaTGAAAGAATTCTCATCAGAAAAAATATATGATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTAATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGACTCTAGCTCagaag > 2:3132703/1‑148 (MQ=255) gagaTGAAACAATTCTCATCATAAAAAATATATGATTACATCTATATAATAATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTAATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGACTCTAGCTCagaag < 1:339185/148‑1 (MQ=255) gAAAGAATTCTCATCAGAAAAAATATATGATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTAATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGACTCTAGCTCAGAAGAGTTa < 2:3335347/148‑1 (MQ=255) aaaGAATTCTCATCAGAAAAAATATATGATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTAATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGACTCTAGCTCAGAAGAGTTAc < 1:285033/148‑1 (MQ=255) aGAATTCTCATCAGAAAAAATATATGATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTTATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGACTCTAGCTCAGAAGAGTTACtt > 2:635680/1‑148 (MQ=255) gAATTCTCATCAGAAAAAATATATGATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTTATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGACTCTAGCTCAGAAGAGTTACttt > 1:3556901/1‑148 (MQ=255) gAATTCTCAACAGAAAAAATATATGATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTTATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGACTCTAGCTCAGAAGAGTTACttt < 1:3025003/148‑1 (MQ=255) caagcctcATAACAAAAAATATATGATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTTATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGACTCTAGCTCAGAAGAGTTACttt < 1:2524370/143‑1 (MQ=255) aTTCTCATCAGAAAAAATATATGATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTTATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGACTCTAGCTCAGAAGAGTTACTTTCa < 1:2966714/148‑1 (MQ=255) ttCTCATCAGAAAAAATATATGATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTAATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGACTCTAGCTCAGAAGAGTTACTTTCAg < 2:1003782/148‑1 (MQ=255) tcatcaGAAAAAATATATGATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTTATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGACTCTAGCTCAGAAGAGTTACTTTCAGata > 2:1123702/1‑148 (MQ=255) atcaGAAAAAATATATGATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTTATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGACTCTAGCTCAGAAGAGTTACTTTCAGataat < 1:594497/148‑1 (MQ=255) tcaGAAAAAATATATGATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTAATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGACTCTAGCTCAGAAGAGTTACTTTCAGataata < 1:3540132/148‑1 (MQ=255) tcaGAAAAAATATATGATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTAATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGACTCTAGCTCAGAAGAGTTACTTTCAGataata > 2:180541/1‑148 (MQ=255) caGAAAAAATATATGATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTTATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGACTCTAGCTCAGAAGAGTTACTTTCAGATAATAc < 1:476235/148‑1 (MQ=255) gAAAAAATATATGATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAACGAAAATGCTAATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGACTCTAGCTCAGAAGAGTTACTTTCAGATAATAccc < 1:3091820/148‑1 (MQ=255) gAAAAAATATATGATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTAATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGACTCTAGCTCAGAAGAGTTACTTTCAGATAATAccc > 2:2436814/1‑148 (MQ=255) gAAAAAATATATGATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTAATCTGGTCGTCCCCAAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGACTCTAGCTCAGAAGAGTTACTTTCAGATAATAccc < 1:1190309/148‑1 (MQ=255) aaaaaTATATGATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTTATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGACTCTAGCTCAGAAGAGTTACTTTCAGATAATACCCTc > 2:1046946/1‑148 (MQ=255) tatatGATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTAATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGACTCTAGCTCAGAAGAGTTACTTTCAGATAATACCCTCGAGaa > 2:2791192/1‑148 (MQ=255) tatGATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTTATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGACTCTAGCTCAGAAGAGTTACTTTCAGATAATACCCTCGAGAAAg < 2:2909909/148‑1 (MQ=255) atGATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTTATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGACTCTAGCTCAGAAGAGTTACTTTCAGATAATACCCTCGAGAAAGa > 2:2807825/1‑148 (MQ=255) atGATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTTATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGACTCTAGCTCAGAAGAGTTACTTTCAGATAATACCCTCGAGAAAGa < 2:2894648/148‑1 (MQ=255) tGATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTTATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGACTCTAGCTCAGAAGAGTTACTTTCAGATAATACCCTCGAGAAAGAc > 2:2370931/1‑148 (MQ=255) aTTACATCTATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTTATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGACTCTAGCTCAGAAGAGTTACTTTCAGATAATACCCTCGAGAAAGACGa < 2:2541009/148‑1 (MQ=255) aTCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTTATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGACTCTAGCTCAGAAGAGTTACTTTCAGATAATACCCTCGAGAAAGACGAAAAtt > 2:930415/1‑148 (MQ=255) tCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTTATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGACTCTAGCTCAGAAGAGTTACTTTCAGATAATACCCTCGAGAAAGACGAAAATtc < 2:2318251/148‑1 (MQ=255) atatAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTTATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGACTCTAGCTCAGAAGAGTTACTTTCAGATAATACCCTCGAGAAAGACGAAAATTCTcc > 2:648475/1‑148 (MQ=255) ataATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTTATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGACTCTAGCTCAGAAGAGTTACTTTCAGATAATACCCTCGAGAAAGACGAAAATTCTCCgg < 2:371508/148‑1 (MQ=255) aTCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTAATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGACTCTAGCTCAGAAGAGTTACTTTCAGATAATACCCTCGAGAAAGACGAAAATTCTCCGGACa > 1:1004130/1‑148 (MQ=255) tCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTTATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGACTCTAGCTCAGAAGAGTTACTTTCAGATAATACCCTCGAGAAAGACGAAAATTCTCCGGACaa > 2:304996/1‑148 (MQ=255) tCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTAATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGACTCTAGCTCAGAAGAGTTACTTTCAGATAATACCCTCGAGAAAGACGAAAATTCTCCGGACaa > 2:870948/1‑148 (MQ=255) tCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTAATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGACTCTAGCTCAGAAGAGTTACTTTCAGATAATACCCTCGAGAAAGACGAAAATTCTCCGGACaa > 1:1376625/1‑148 (MQ=255) ttGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTTATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGACTCTAGCTCAGAAGAGTTACTTTCAGATAATACCCTCGAGAAAGACGAAAATTCTCCGGACAATgg < 2:54682/148‑1 (MQ=255) tGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTTATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGACTCTAGCTCAGAAGAGTTACTTTCAGATAATACCCTCGAGAAAGACGAAAATTCTCCGGACAATGGc > 1:1838560/1‑148 (MQ=255) tGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTTATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGACTCTAGCTCAGAAGAGTTACTTTCAGATAATACCCTCGAGAAAGACGAAAATTCTCCGGACAATGGc > 1:1243087/1‑148 (MQ=255) tGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTTATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGACTCTAGCTCAGAAGAGTTACTTTCAGATAATACCCTCGAGAAAGACGAAAATTCTCCGGACAATGGc < 2:3348752/148‑1 (MQ=255) gAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTAATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGACTCTAGCTCAGAAGAGTTACTTTCAGATAATACCCTCGAGAAAGACGAAAATTCTCCGGACAATGGCt < 2:167405/148‑1 (MQ=255) aatattattAAAATACCAAAGAAAATGCTAATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGACTCTAGCTCAGAAGAGTTACTTTCAGATAATACCCTCGAGAAAGACGAAAATTCTCCGGACAATGGCtt < 1:1622461/145‑1 (MQ=255) gATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTTATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGACTCTAGCTCAGAAGAGTTACTTTCAGATAATACCCTCGAGAAAGACGAAAATTCTCCGGACAATGGCTTTg < 1:1928898/148‑1 (MQ=255) aTGAAAATACCAAAGAAAATGCTTATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGACTCTAGCTCAGAAGAGTTACTTTCAGATAATACCCTCGAGAAAGACGAAAATTCTCCGGACAATGGCTTTGAGGt < 2:1941039/148‑1 (MQ=255) tGAAAATACCAAAGAAAATGCTTATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGACTCTAGCTCAGAAGAGTTACTTTCAGATAATACCCTCGAGAAAGACGAAAATTCTCCGGACAATGGCTTTGAGGTc > 2:2016881/1‑148 (MQ=255) tGAAAATACCAAAGAAAATGCTAATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGGCTCTAGCTCAGAAGAGTTACTTTCAGATAATACCCTCGAGAAAGACGAAAATTCTCCGGACAATGGCTTTGAGGTc > 2:2306829/1‑148 (MQ=255) aaaaTACCAAAGAAAATGCTTATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGTATTTAAACATAGAAGACTCTAGCTCAGAAGAGTTACTTTCAGATAATACCCTCGAGAAAGACGAAAATTCTCCGGACAATGGCTTTGAGGTCgg < 1:990303/148‑1 (MQ=255) aaaaTACCAAAGAAAATGCTTATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGACTCTAGCTCAGAAGAGTTACTTTCAGATAATACCCTCGAGAAAGACGAAAATTCTCCGGACAATGGCTTTGAGGTCgg > 1:655570/1‑148 (MQ=255) aaaaTACCAAAGAAAATGCGTATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGACTCTAGCTCAGAAGAGTTACTTTCAGATAATACCCTCGAGAAAGACGAAAATTCTCCGGACAATGGCTTTGAGGTCgg < 1:3485809/148‑1 (MQ=255) aaaTACCAAACAAAATGCTTATCTGGTCGTCCCCAAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGACTCTAGCTCAGAAGAGTTACTTTCAGATAATACCCTCGAGAAAGACGAAAATTCTCCGGACAATGGCTTTGAGGTCggg < 1:67109/148‑1 (MQ=255) aTACCAAAGAAAATGCTTATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGACTCTAGCTCAGAAGAGTTACTTTCAGATAATACCCTCGAGAAAGACGAAAATTATCCGGACAATGGCTTTGAGGTCGGGGa > 2:67163/1‑148 (MQ=255) tACCAAAGAAAATGCTTATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGACTCTAGCTCAGAAGAGTTACTTTCAGATAATACCCTCGAGAAAGACGAAAATTCTCCGGACAATGGCTTTGAGGTCGGGGaa < 1:563166/148‑1 (MQ=255) aCCAAAGAAAATGCTAATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGACTCTAGCTCAGAAGAGTTACTTTCAGATAATACCCTCGAGAAAGACGAAAATTCTCCGGACAATGGCTTTGAGGTCGGGGAat > 1:758200/1‑148 (MQ=255) ccAAAGAAAATGCTTATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGACTCTAGCTCAGAAGAGTTACTTTCAGATAATACCCTCGAGAAAGACGAAAATTCTCCGGACAATGGCTTTGAGGTCGGGGAata > 1:2737060/1‑148 (MQ=255) ccAAAGAAAATGCTAATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGACTCTAGCTCAGAAGAGTTACTTTCAGATAATACCCTCGAGAAAGACGAAAATTCTCCGGACAATGGCTTTGAGGTCGGGGAata < 1:224713/148‑1 (MQ=255) aaGAAAATGCTAATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGACTCTAGCTCAGAAGAGTTACTTTCAGATAATACCCTCGAGAAAGACGAAAATTCTCCGGACAATGGCTTTGAGGTCGGGGAATATaa < 2:2665666/148‑1 (MQ=255) aaaaTGCTTATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGACTCTAGCTCAGAAGAGTTACTTTCAGATAATACCCTCGAGAAAGCCGAAAATTCTCCGGACACTGGCTTGGAGGTCGGGGCCTATAccac > 2:3294782/1‑148 (MQ=255) aaaaTGCTAATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGACTCTAGCTCAGAAGAGTTACTTTCAGATAATACCCTCGAGAAAGACGAAAATTCTCCGGACAATGGCTTTGAGGTCGGGGAATATAacac < 2:3375673/148‑1 (MQ=255) aaTGCTAATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGACTCTAGCTCAGAAGAGTTACTTTCAGATAATACCCTCGAGAAAGACGAAAATTCTCCGGACAATGGCTTTGAGGTCGGGGAATATAACACat < 1:727989/148‑1 (MQ=255) aaTGCTAATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGACTCTAGCTCAGAAGAGTTACTTTCAGATAATACCCTCGAGAAAGACGAAAATTCTCCGGACAATGGCTTTGAGGTCGGGGAATATAACACat < 1:727386/148‑1 (MQ=255) aTGCTTATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGACTCTAGCTCAGAAGAGTTACTTTCAGATAATACCCTCGAGAAAGACGAAAATTCTCCGGACAATGGCTTTGAGGTCGGGGAATATAACACata < 2:1164850/148‑1 (MQ=255) | ACAAAAGAAATATATAAAAGCTCATCGAAAATCATCAATTGCTTGAACAGAATTAAATTAACAGAGATGAAAGAATTCTCATCAGAAAAAATATATGATTACATCGATATAATCATTGAAGATTATGAAAATACCAAAGAAAATGCTTATCTGGTCGTCCCCCAAATTAATTATACTATGGATTTAAACATAGAAGACTCTAGCTCAGAAGAGTTACTTTCAGATAATACCCTCGAGAAAGACGAAAATTCTCCGGACAATGGCTTTGAGGTCGGGGAATATAACACATATGAAG > CP009273/3262593‑3262887 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |