Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 3,306,165 | C→A | 39.4% | V125F (GTT→TTT) | rbfA ← | 30s ribosome binding factor |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 3,306,165 | 0 | C | A | 39.4% | 281.8 / 221.8 | 223 | V125F (GTT→TTT) | rbfA | 30s ribosome binding factor |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (60/75); new base A (45/43); total (105/118) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.40e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 228 total aligned reads displayed.
GGTTGGCGTTATATATACGTTTCACTTTTTGCAGCGCATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATCCCTTCAACCAGAGAGTTGTCGTAGAAGAAGGTCAGTTCCGGCACGATACGCAGGCGCATCGCTTTCCCCAGCAGGCTGCGGATGAAACCAG > CP009273/3306019‑3306311 | gCGTTATATATACGTTTCACTTTTTGCAGCGCATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAAAacgacg > 1:3400396/1‑148 (MQ=255) ttATATATACGTTTCACTTTTTGCAGCGCATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGttc < 2:2391539/148‑1 (MQ=255) ttATATATACGTTTCACTTTTTGCAGCGCATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGttc < 1:1668710/148‑1 (MQ=255) ttATATATACGTTTCACTTTTTGCAGCGCATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGttc > 1:517365/1‑148 (MQ=255) tatatataCGTTTCACTTTTTGCAGCGCATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGttct > 1:401188/1‑148 (MQ=255) atatataCGGTTCACTTTTTGCAGCGCATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGttctt < 2:2106040/148‑1 (MQ=255) tatataCGTTTCACTTTTTGCAGCGCATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAAAACGACGttcttc > 1:2514908/1‑148 (MQ=255) atataCGTTTCACTTTTTGCAGCGCATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCg > 1:730448/1‑148 (MQ=255) gTTTCACTTTTTGCAGCGCATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGt < 1:3193029/148‑1 (MQ=255) tttCACTTTTTGCAGCGCATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGtt > 2:345138/1‑148 (MQ=255) tttCACTTTTTGCAGCGCATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGtt > 2:2561287/1‑148 (MQ=255) tttCACTTTTTGCAGCGCATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGtt > 2:1909766/1‑148 (MQ=255) tCACTTTTTGCAGCGCATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTg > 1:1865863/1‑148 (MQ=255) cTTTTTGCAGCGCATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGAcc > 1:1121946/1‑148 (MQ=255) cTTTTTGCAGCGCATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAAAACGACGTTCTTCGTCATGTTTGAcc > 1:1725511/1‑148 (MQ=255) tttttGCAGCGCATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCa < 2:1788554/148‑1 (MQ=255) tttttGCAGCGCATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAAAACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCa < 2:27282/148‑1 (MQ=255) tttttGCAGCGCATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAAAACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCa < 2:99006/148‑1 (MQ=255) tttGCAGCGCATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACg < 1:51319/148‑1 (MQ=255) tttGCAGCGCATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACg < 1:1006242/148‑1 (MQ=255) tttGCAGCGCATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACg < 1:1582570/148‑1 (MQ=255) tGCAGCGCATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCt < 2:2787973/148‑1 (MQ=255) gCAGCGCATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTg < 1:793978/148‑1 (MQ=255) gCAGCGCATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTg < 1:2849212/148‑1 (MQ=255) cAGCGCATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTgg > 2:924779/1‑148 (MQ=255) cAGCGCATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAAAACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTgg < 1:188622/148‑1 (MQ=255) cAGCGCATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAAAACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTgg < 1:2477992/148‑1 (MQ=255) gcgcATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTc > 1:1763969/1‑148 (MQ=255) gcgcATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTc > 2:2329197/1‑148 (MQ=255) cgcATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCa > 2:3474296/1‑148 (MQ=255) cATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCAcc < 1:2459055/148‑1 (MQ=255) tCGTTGCTGGGCATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAAAACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAg > 1:2710964/1‑148 (MQ=255) cGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAAAACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAgg > 2:1740088/1‑148 (MQ=255) cGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAAAACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAgg < 2:3086086/148‑1 (MQ=255) gTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAAAACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGt < 1:3033211/148‑1 (MQ=255) tGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGttt > 1:1486982/1‑148 (MQ=255) gCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTg < 1:2959247/148‑1 (MQ=255) gCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTg < 1:3223477/148‑1 (MQ=255) tGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAAAACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGAc < 2:1656998/148‑1 (MQ=255) gACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACAt > 2:1363728/1‑148 (MQ=255) gACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACAt > 1:291478/1‑148 (MQ=255) gACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAAAACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACAt > 1:1965720/1‑148 (MQ=255) aCATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATg < 1:3036922/148‑1 (MQ=255) aCATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAAAACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATg < 1:151764/148‑1 (MQ=255) tACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAAAACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCGGGTTTGACATgcgc > 1:2721867/1‑148 (MQ=255) ccTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATc > 2:861266/1‑148 (MQ=255) cTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAAAACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATcc > 1:277552/1‑148 (MQ=255) tGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATccc > 2:380245/1‑148 (MQ=255) tGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAAAACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATccc < 1:3485301/148‑1 (MQ=255) 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ccAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAAAACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATCCCTTCAACCaga < 1:2959863/148‑1 (MQ=255) caacaaAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATCCCTTCAACCAGAGAGt < 1:1215213/148‑1 (MQ=255) aaaaCGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATCCCTTCAACCAGAGAGTTGTc < 2:3290684/148‑1 (MQ=255) aaaCGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAAAACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATCCCTTCAACCAGAGAGTTGTCg > 2:468036/1‑148 (MQ=255) cGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATCCCTTCAACCAGAGAGTTGTCGTag < 1:780469/148‑1 (MQ=255) 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2:2647232/1‑133 (MQ=255) ccgcgacGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATCCCTTCAACCAGAGAGTTGTCGTAGAAGAAGGTCAGTTCCgg > 2:639348/1‑148 (MQ=255) ccgcgacGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATCCCTTCAACCAGAGAGTTGTCGTAGAAGAAGGTCAGTTCCgg > 2:331955/1‑148 (MQ=255) ccgcgacGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATCCCTTCAACCAGAGAGTTGTCGTAGAAGAAGGTCAGTTCCgg > 2:2428377/1‑148 (MQ=255) ccgcgacGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAAAACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATCCCTTCAACCAGAGAGTTGTCGTAGAAGAAGGTCAGTTCCgg > 1:2053561/1‑148 (MQ=255) ccgcgacGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAAAACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATCCCTTCAACCAGAGAGTTGTCGTAGAAGAAGGTCAGTTCCgg > 1:961465/1‑148 (MQ=255) 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cctcctTGCTGTCGTCCGGGTTAAAACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCATGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATCCCTTCAACCAGAGAGTTGTCGTAGAAGAAGGTCAGTTCCGGCACGATACGCAGGCGCATCGCTTTccc < 1:527719/148‑1 (MQ=255) ctTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATCCCTTCAACCAGAGAGTTGTCGTAGAAGAAGGTCAGTTCCGGCACGATACGCAGGCGCATCGCTTTCCCcagc < 2:730448/148‑1 (MQ=255) ttGCTGTCGTCCGGGTTAAAACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATCCCTTCAACCAGAGAGTTGTCGTAGAAGAAGGTCAGTTCCGGCACGATACGCAGGCGCATCGCTTTCCCcagca > 1:922249/1‑148 (MQ=255) gCTGTCGTCCGGGTTAAAACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATCCCTTCAACCAGAGAGTTGTCGTAGAAGAAGGTCAGTTCCGGCACGATACGCAGGCGCATCGCTTTCCCCAGCAgg > 2:230861/1‑148 (MQ=255) tGTCGTCCGGGTTAAAACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATCCCTTCAACCAGAGAGTTGTCGTAGAAGAAGGTCAGTTCCGGCACGATACGCAGGCGCATCGCTTTCCCCAGCAGGCt > 2:1738474/1‑148 (MQ=255) 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GGTTGGCGTTATATATACGTTTCACTTTTTGCAGCGCATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATCCCTTCAACCAGAGAGTTGTCGTAGAAGAAGGTCAGTTCCGGCACGATACGCAGGCGCATCGCTTTCCCCAGCAGGCTGCGGATGAAACCAG > CP009273/3306019‑3306311 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |