Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 3,373,457 | C→A | 94.9% | intergenic (‑101/‑93) | yhcM ← / → yhcB | putative AFG1‑like family P‑loop ATPase/DUF1043 family inner membrane‑anchored protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 3,373,457 | 0 | C | A | 94.9% | 567.7 / 19.3 | 197 | intergenic (‑101/‑93) | yhcM/yhcB | putative AFG1‑like family P‑loop ATPase/DUF1043 family inner membrane‑anchored protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (5/5); new base A (89/98); total (94/103) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.90e-01 |
Only 100 of 197 total aligned reads displayed.
ATTAAGCGCCTTCAGGTATTGCGATGTTGGGGTAACGCTTTGCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTCTGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAGACAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTGG > CP009273/3373312‑3373599 | aTTAAGCGCCTTCAGGTATTGCGATGTTGGGGTAACGCTTTGCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTAtg > 1:1411597/1‑148 (MQ=255) tAAGCGCCTTCAGGTATTGCGATGTTGGGGTAACGCTTTGCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTAtgtg > 2:2050008/1‑148 (MQ=255) tAAGCGCCTTCAGGTATTGCGATGTTGGGGTAACGCTTTGCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTAtgtg > 1:3012198/1‑148 (MQ=255) tAAGCGCCTTCAGGTATTGCGATGTTGGGGTAACGCTTTGCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTAtgtg < 1:1335071/148‑1 (MQ=255) cgcCTTCAGGTATTGCGATGTTGGGGTAACGCTTTGCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAAt > 2:2995789/1‑148 (MQ=255) gcCTTCAGGTATTGCGATGTTGGGGTAACGCTTTGCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAAtt < 1:3440131/148‑1 (MQ=255) cTTCAGGTATTGCGATGTTGGGGTAACGCTTTGCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTaa < 2:873841/148‑1 (MQ=255) tCAGGTATTGCGATGTTGGGGTAACGCTTTGCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTCTGTGGAATTAACg < 1:479119/148‑1 (MQ=255) tCAGGTATTGCGATGTTGGGGTAACGCTTTGCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACg > 1:1110325/1‑148 (MQ=255) tCAGGTATTGCGATGTTGGGGTAACGCTTTGCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACg > 1:1110462/1‑148 (MQ=255) aGGTATTGCGATGTTGGGGTAACGCTTTGCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCCGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGt < 1:3474883/148‑1 (MQ=255) aGGTATTGCGATGTTGGGGTAACGCTTTGCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGt < 2:2684374/148‑1 (MQ=255) ggTATTGCGATGTTGGGGTAACGCTTTGCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGGTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGtt < 1:409295/148‑1 (MQ=255) gTATTGCGATGTTGGGGTAACGCTTTGCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTta > 2:2623557/1‑148 (MQ=255) gTATTGCGATGTTGGGGTAACGCTTTGCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTta < 2:1159471/148‑1 (MQ=255) tATTGCGATGTTGGGGTAACGCTTTGCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTtat < 1:475435/148‑1 (MQ=255) tGTTGGGGTAACGCTTTGCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCAt > 2:923104/1‑148 (MQ=255) tGTTGGGGTAACGCTTTGCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCAt > 2:1790693/1‑148 (MQ=255) gTTGGGGTAACGCTTTGCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATa < 1:2309997/148‑1 (MQ=255) ttGCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCCGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCa > 2:1957289/1‑148 (MQ=255) gCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTCTGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATg < 1:250995/148‑1 (MQ=255) gCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATg < 2:1085586/148‑1 (MQ=255) gCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATg < 2:1086704/148‑1 (MQ=255) gCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATg < 2:477471/148‑1 (MQ=255) gCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATg < 2:477426/148‑1 (MQ=255) cATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATgg > 1:2830323/1‑148 (MQ=255) tGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAg < 2:334408/148‑1 (MQ=255) tGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAg > 2:2161941/1‑148 (MQ=255) gATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGc > 2:1278413/1‑148 (MQ=255) aTCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGcc < 1:1192456/148‑1 (MQ=255) aTCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGcc > 2:668991/1‑148 (MQ=255) ttATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGa > 2:788880/1‑148 (MQ=255) aTTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAg > 2:2779679/1‑148 (MQ=255) ttGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGc < 2:2893256/148‑1 (MQ=255) ttGTTATTCCTGGAATAATCGGGGCGCCGTTGGTCACGGTAGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGc < 2:3475692/148‑1 (MQ=255) gTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCa < 2:3381921/148‑1 (MQ=255) ttATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCaa < 1:466692/148‑1 (MQ=255) ttATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCaa > 1:2231049/1‑148 (MQ=255) tATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTGATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAac > 1:1889390/1‑148 (MQ=255) tCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACAcc < 2:3029601/148‑1 (MQ=255) tCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACAcc > 1:2584664/1‑148 (MQ=255) ccTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACAccc > 2:2878099/1‑148 (MQ=255) cTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCTCTGTTGACGAATAAAAGGCAGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCt < 2:1708538/148‑1 (MQ=255) taatCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGaa > 1:49375/1‑148 (MQ=255) taatCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGaa > 1:47453/1‑148 (MQ=255) taatCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGaa < 2:1667907/148‑1 (MQ=255) taatCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGaa < 2:1668415/148‑1 (MQ=255) aatCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGaaa > 2:3084446/1‑148 (MQ=255) cGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACaa < 2:554760/148‑1 (MQ=255) cGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACaa > 2:2491008/1‑148 (MQ=255) tGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAg < 1:2996651/148‑1 (MQ=255) tGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAg < 1:2492493/148‑1 (MQ=255) tGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAg < 2:1451108/148‑1 (MQ=255) gcgcCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAGa < 1:1779249/148‑1 (MQ=255) cgcCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAGAc > 2:1880682/1‑148 (MQ=255) ccGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAGACaa > 2:2564506/1‑148 (MQ=255) cGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAGACAAc < 1:940769/148‑1 (MQ=255) cGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAGACAAc > 1:2367838/1‑148 (MQ=255) gttgttCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAGACAACg < 2:1040566/148‑1 (MQ=255) ttCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAGACAACGGgag < 2:3501651/148‑1 (MQ=255) ttCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAGACAACGGgag < 2:2161637/148‑1 (MQ=255) aCGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAGACAACGGGAGATg < 1:1152760/148‑1 (MQ=255) ttGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATTCAGTCGTGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATATTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAGACAACGGGAGATGTTCa < 2:2669503/148‑1 (MQ=255) gACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAGACAACGGGAGATGTTCATg < 2:1411597/148‑1 (MQ=255) cGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAGACAACGGGAGATGTTCATGAc > 2:426708/1‑148 (MQ=255) gAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAGACAACGGGAGATGTTCATGAcc < 1:556032/148‑1 (MQ=255) aaaaaaaGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAGACAACGGGAGATGTTCATGACCt > 1:223940/1‑148 (MQ=255) aaaaaaaGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAGACAACGGGAGATGTTCATGACCt > 2:3048546/1‑148 (MQ=255) aaaaaaaGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAGACAACGGGAGATGTTCATGACCt > 2:2987370/1‑148 (MQ=255) aaaaaaaGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAGACAACGGGAGATGTTCATGACCt < 2:2643880/148‑1 (MQ=255) aaaaGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAGACAACGGGAGATGTTCATGACCTggg > 1:3270337/1‑148 (MQ=255) aaaGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAGACAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGa > 1:674689/1‑148 (MQ=255) aaaGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAGACAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGa > 1:1207507/1‑148 (MQ=255) aaGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAGACAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGaa < 2:575654/148‑1 (MQ=255) cTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAGACAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTa < 1:3052522/148‑1 (MQ=255) cTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAGACAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTa > 2:1199322/1‑148 (MQ=255) tACACTACGCGAGATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAGACAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTaa < 1:1619765/148‑1 (MQ=255) acacTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTCTGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAGACAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGACTATGCGCTAAt > 2:2628925/1‑148 (MQ=255) acacTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTCTGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAGACAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAAt > 2:2152670/1‑148 (MQ=255) acacTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGTCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAGACAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAAt < 2:1834262/148‑1 (MQ=255) cacTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAGACAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAAtt > 2:1535086/1‑148 (MQ=255) tACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAGACAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTggg < 1:707853/148‑1 (MQ=255) tACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAGACAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTggg < 2:129903/148‑1 (MQ=255) aCGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAGACAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGt < 1:2623557/148‑1 (MQ=255) aCGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAGACAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGt < 1:1729692/148‑1 (MQ=255) cgcgATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAGACAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGtt > 1:2159591/1‑148 (MQ=255) gcgATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAGACAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTa < 2:2236077/148‑1 (MQ=255) cgATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAGACAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAg < 2:340816/148‑1 (MQ=255) cgATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAGACAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCGAATTGGGTTAg < 1:780882/148‑1 (MQ=255) gATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAGACAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAgt < 1:3119174/148‑1 (MQ=255) atatGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAGACAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAgtc > 2:3300368/1‑148 (MQ=255) atatGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAGACAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAgtc > 2:3095747/1‑148 (MQ=255) atatGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAGACAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAgtc > 1:1985983/1‑148 (MQ=255) atatGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAGACAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAAGTGGGTTAgtc > 2:2419091/1‑148 (MQ=255) atatGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAGACAACGGGAGATGTTCATGACCGGGGAATATGCGCTCATTGGGTTAgtc > 2:2419128/1‑148 (MQ=255) tatGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAGACAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAgtcg < 2:3012198/148‑1 (MQ=255) tGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAGACAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAgtcgtc > 2:2200832/1‑148 (MQ=255) aTTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAGACAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCatta < 1:2755866/148‑1 (MQ=255) cACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAGACAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTgg > 2:1922338/1‑148 (MQ=255) cACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGAGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAGACAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCAGTATTgg > 2:124953/1‑148 (MQ=255) | ATTAAGCGCCTTCAGGTATTGCGATGTTGGGGTAACGCTTTGCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTCTGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAGACAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTGG > CP009273/3373312‑3373599 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |