| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 3,535,850 | 0 | C | A | 8.0% | 816.3 / 29.0 | 224 | F695L (TTC→TTA) | feoB | fused ferrous iron transporter, protein B: GTP‑binding protein/membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (78/128); new base A (6/12); total (84/140) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.03e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.88e-01 | |||||||||||
Only 100 of 229 total aligned reads displayed.
GGGTACCGGGGCGATGGGCGTGATGGATCAGAAATTCGGTAGCGCAGCAGCAGCTTACAGCTACCTGATTTTCGTCCTGCTGTATGTACCATGTATCTCGGTGATGGGGGCTATCGCCCGTGAATCAAGCCGTGGCTGGATGGGCTTCTCCATCCTGTGGGGGCTGAATATCGCTTACTCACTGGCAACATTGTTCTATCAGGTCGCCAGCTACAGTCAGCATCCAACTTACAGCCTGGTGTGCATTCTGGCGGTTATCCTGTTTAACATCGTGGTTATCGGTCTGCTGCGCCGC > CP009273/3535703‑3535997 | gTACCGGGGCGATGGGCGTGATGGATCAGAAATTCGGTAGCGCAGCAGCAGCTTACAGCTTCCTGATTTTCGTCCTGCTGTATGTACCATGTATCTCGGTGATGGGGGCTATCGCCCGTGAATCAAGCCGTGGCTGGATGGGCTtctc < 1:1099884/148‑1 (MQ=255) aCCGGGGCGATGGGCGTGATGGATCAGAAATTCGGTAGCGCAGCAGCAGCTTACAGCTACCTGATTTTCGTCCTGCTGTATGTACCATGTATCTCGGTGATGGGGGCTATCGCCCGTGAATCAAGCCGTGGCTGGATGGGCTTCTCCa > 1:3014256/1‑148 (MQ=255) gggCGATGGGCGTGATGGATCAGAAATTCGGTAGCGCAGCAGCAGCTGACAGCTACCTGATTTTCGTCGTGCTGTATGTACCATGTATCTCGGTGATGGGGGCTATCGCCCGTGAATCAAGCCGTGGCTGGATGGGCTTCTCCATCCt < 2:3350945/148‑1 (MQ=255) 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ctcCATCCTGTGGGGGCTGAATATCGCTTACTCACTGGCAACATTGTTCTATCAGGTCGCCAGCTACAGTCAGCATCCAACTTACAGCCTGGTGTGCATTCTGGCGGTTATCCTGTTTAACATCGTGGTTATCGGTCTGCTGcgccgc > 1:1136077/1‑148 (MQ=255) | GGGTACCGGGGCGATGGGCGTGATGGATCAGAAATTCGGTAGCGCAGCAGCAGCTTACAGCTACCTGATTTTCGTCCTGCTGTATGTACCATGTATCTCGGTGATGGGGGCTATCGCCCGTGAATCAAGCCGTGGCTGGATGGGCTTCTCCATCCTGTGGGGGCTGAATATCGCTTACTCACTGGCAACATTGTTCTATCAGGTCGCCAGCTACAGTCAGCATCCAACTTACAGCCTGGTGTGCATTCTGGCGGTTATCCTGTTTAACATCGTGGTTATCGGTCTGCTGCGCCGC > CP009273/3535703‑3535997 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |