| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,598,440 | C→A | 100% | N34K (AAC→AAA) | yhhL → | DUF1145 family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,598,440 | 0 | C | A | 98.2% | 542.0 / 0.8 | 169 | N34K (AAC→AAA) | yhhL | DUF1145 family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/2); new base A (83/83); total (84/85) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 169 total aligned reads displayed.
GGTGGCTTATCGGCTGTATCAACGCGAAGCACAAGGAGAAAGTGATGCTGATTAATATTGGTCGTTTGTTAATGCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAACGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTGATGCATGGTATGCAGCTGGCGCTATTGAAATCCACTTTACCGAAAGATGGCCCGCAGATGACCACCGCCGAAAAGGTACGGATTTTCCTTTTCGGCGTGTTTGAACTGCTGGCCTGG > CP009273/3598295‑3598581 | ggTGGCTTATCGGCTGTATCAACGCGAAGCACAAGGAGAAAGTGATGCTGATTAATATTGGTCGTTTGTTAATGCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGt > 2:2877465/1‑148 (MQ=255)ggTGGCTTATCGGCTGTATCAACGCGAAGCACAAGGAGAAAGTGATGCTGATTAATATTGGTCGTTTGTTAATGCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGt > 2:2755122/1‑148 (MQ=255) tGGCTTATCGGCTGTATCAACGCGAAGCACAAGGAGAAAGTGATGCTGATTAATATTGGTCGTTTGTTAATGCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTgg > 1:1786649/1‑148 (MQ=255) gCTTATCGGCTGTATCAACGCGAAGCACAAGGAGAAAGTGATGCTGATTAATATTGGTCGTTTGTTAATGCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGgcg > 1:2294734/1‑148 (MQ=255) gCTTATCGGCTGTATCAACGCGAAGCACAAGGAGAAAGTGATGCTGATTAATATTGGTCGTTTGTTAATGCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGgcg < 1:2263359/148‑1 (MQ=255) gCTTATCGGCTGTATCAACGCGAAGCACAAGGAGAAAGTGATGCTGATTAATATTGGTCGTTTGTTAATGCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGgcg < 2:1660723/148‑1 (MQ=255) gCTTATCGGCTGTATCAACGCGAAGCACAAGGAGAAAGTGATGCTGATTAATATTGGTCGTTTGTTAATGCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGgcg < 1:882937/148‑1 (MQ=255) tATCGGCTGTATCAACGCGAAGCACAAGGAGAAAGTGATGCTGATTAATATTGGTCGTTTGTTAATGCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTg < 1:3490979/148‑1 (MQ=255) tCGGCTGTATCAACGCGAAGCACAAGGAGAAAGTGATGCTGATTAATATTGGTCGTTTGTTAATGCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGAt > 1:2137348/1‑148 (MQ=255) ggCTGTATCAACGCGAAGCACAAGGAGAAAGTGATGCTGATTAATATTGGTCGTTTGTTAATGCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGAttt < 2:1796391/148‑1 (MQ=255) ggCTGTATCAACGCGAAGCACAAGGAGAAAGTGATGCTGATTAATATTGGTCGTTTGTTAATGCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGAttt < 1:1589733/148‑1 (MQ=255) gTATCAACGCGAAGCACAAGGAGAAAGTGATGCTGATTAATATTGGTCGTTTGTTAATGCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTAc > 1:1695187/1‑148 (MQ=255) aTCAACGCGAAGCACAAGGAGAAAGTGATGCTGATTAATATTGGTCGTTTGTTAATGCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCg > 2:1101542/1‑148 (MQ=255) aTCAACGCGAAGCACAAGGAGAAAGTGATGCTGATTAATATTGGTCGTTTGTTAATGCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCg < 1:2695168/148‑1 (MQ=255) tCAACGCGAAGCACAAGGAGAAAGTGATGCTGATTAATATTGGTCGTTTGTTAATGCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGt > 2:1172123/1‑148 (MQ=255) tCAACGCGAAGCACAAGGAGAAAGTGATGCTGATTAATATTGGTCGTTTGTTAATGCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTAACGt > 1:2850526/1‑148 (MQ=255) cAACGCGAAGCACAAGGAGAAAGTGATGCTGATTAATATTGGTCGTTTGTTAATGCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTg < 2:1249810/148‑1 (MQ=255) cAACGCGAAGCACAAGGAGAAAGTGATGCTGATTAATATTGGTCGTTTGTTAATGCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTg < 2:280122/148‑1 (MQ=255) aCGCGAAGCACAAGGAGAAAGTGATGCTGATTAATATTGGTCGTTTGTTAATGCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTAACGTGCt > 1:402810/1‑148 (MQ=255) cgcgAAGCACAAGGAGAAAGTGATGCTGATTAATATTGGTCGTTTGTTAATGCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAACGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTg < 1:1042332/148‑1 (MQ=255) cgcgAAGCACAAGGAGAAAGTGATGCTGATTAATATTGGTCGTTTGTTAATGCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTg > 1:1187383/1‑148 (MQ=255) cgcgAAGCACAAGGAGAAAGTGATGCTGATTAATATTGGTCGTTTGTTAATGCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTg < 2:215279/148‑1 (MQ=255) cgcgAAGCACAAGGAGAAAGTGATGCTGATTAATATTGGTCGTTTGTTAATGCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTg < 1:2844631/148‑1 (MQ=255) cgcgAAGCACAAGGAGAAAGTGATGCTGATTAATATTGGTCGTTTGTTAATGCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTg > 1:2065213/1‑148 (MQ=255) cgAAGCACAAGGAGAAAGTGATGCTGATTAATATTGGTCGTTTGTTAATGCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTGAt > 2:1330633/1‑148 (MQ=255) aaGCACAAGGAGAAAGTGATGCTGATTAATATTGGTCGTTTGTTAATGCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTGATGc > 2:2473891/1‑148 (MQ=255) aaGCACAAGGAGAAAGTGATGCTGATTAATATTGGTCGTTTGTTAATGCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTGATGc > 1:589290/1‑148 (MQ=255) gCACAAGGAGAAAGTGATGCTGATTAATATTGGTCGTTTGTTAATGCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTGATGCAt > 2:3401213/1‑148 (MQ=255) gCACAAGGAGAAAGTGATGCTGATTAATATTGGTCGTTTGTTAATGCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTAACGTGCTGATGCAt > 2:3401218/1‑148 (MQ=255) acaAGGAGAAAGTGATGCTGATTAATATTGGTCGTTTGTTAATGCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTGATGCATgg > 2:839596/1‑148 (MQ=255) acaAGGAGAAAGTGATGCTGATTAATATTGGTCGTTTGTTAATGCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTGATGCATgg > 2:839595/1‑148 (MQ=255) ggAGAAAGTGATGCTGATTAATATTGGTCGTTTGTTAATGCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTGATGCATGGTATg > 1:1537374/1‑148 (MQ=255) gaAAGTGATGCTGATTAATATTGGTCGTGTGTTAATGCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAACGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTGATGCATGGTATGCAg > 2:1408945/1‑148 (MQ=255) aaaGTGATGCTGATTAATATTGGTCGTTTGTTAATGCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATGTCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTGATGCATGGTATGCAGc < 2:3267202/148‑1 (MQ=255) aaaGTGATGCTGATTAATATTGGTCGTTTGTTAATGCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTGATGCATGGTATGCAGc > 2:117321/1‑148 (MQ=255) aaGTGATGCTGATTAATATTGGTCGTTTGTTAATGCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTGATGCATGGTATGCAGCt > 2:304652/1‑148 (MQ=255) aaGTGATGCTGATTAATATTGGTCGTTTGTTAATGCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTGATGCATGGTATGCAGCt < 2:1531701/148‑1 (MQ=255) aGTGATGCTGATTAATATTGGTCGTTTGTTAATGCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTGATGCATGGTATGCAGCTg < 2:398297/148‑1 (MQ=255) aTGCTGATTAATATTGGTCGTTTGTTAATTCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTAACGTGCTGATGCATGGTATGCAGCTGgcgc > 1:1582859/1‑148 (MQ=255) gCTGATTAATATTGGTCGTTTGTTAATGCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTGATGCATGGTATGCAGCTGGCGCTa < 2:3168697/148‑1 (MQ=255) gCTGATTAATATTGGTCGTTTGTTAATGCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTGATGCATGGTATGCAGCTGGCGCTa < 1:1363489/148‑1 (MQ=255) gCTGATTAATATTGGTCGTTTGTTAATGCTCTGCGTTTGGGGATTTTGAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTGATGCATGGTATGCAGCTGGCGCTa < 2:1594636/148‑1 (MQ=255) gCTGATTAATATTGGTCGTGTGTTAATGCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTGATGCATGGTATGCAGCTGGCGCTa < 2:3168762/148‑1 (MQ=255) cTGATTAATATTGGTCGTTTGTTAATGCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTTGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAATTTGCGCTGATTTTTAACGTGCGGATTAATGGTATGCAGCAGGCGCGAt > 1:3270478/1‑148 (MQ=255) tGATTAATATTGGTCGTTTGTTAATGCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTGATGCATGGTCTGCAGCTGGCGCGAtt > 2:2724200/1‑148 (MQ=255) gATTAATATTGGTCGTTTGTTAATGCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTGATGCATGGTATGCAGCTGGCGCTATTg < 1:1464820/148‑1 (MQ=255) gATTAATATTGGTCGTTTGTTAATGCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTGATGCATGGTATGCAGCTGGCGCTATTg > 2:2893482/1‑148 (MQ=255) ttAATATTGGTCGTTTGTTAATGCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTGATGCATGGTATGCAGCTGGCGCTATTGaa > 2:2404766/1‑148 (MQ=255) ttAATATTGGTCGTTTGTTAATGCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTGATGCATGGTATGCAGCTGGCGCTATTGaa < 2:1557916/148‑1 (MQ=255) aaTATTGGTCGTTTGTTAATGCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTGATGCATGGTATGCAGCTGGCGCTATTGAAAt < 1:1330633/148‑1 (MQ=255) tatTGGTCGTTTGTTAATGCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTGATGCATGGTATGCAGCTGGCGCTATTGAAATcc > 2:2795420/1‑148 (MQ=255) ttGGTCGTTTGTTAATGCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTGATGCATGGTATGCAGCTGgcg > 2:2648311/1‑134 (MQ=255) ttGGTCGTTTGTTAATGCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTGATGCATGGTATGCAGCTGgcg < 1:2648311/134‑1 (MQ=255) ttGGTCGTTTGTTAATGCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTGATGCATGGTATGCAGCTGGCGCTATTGAAATCCAc < 2:1613523/148‑1 (MQ=255) ttGGTCGTTTGTTAATGCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTGATGCATGGTATGCAGCTGGCGCTATTGAAATCCAc < 2:1613708/148‑1 (MQ=255) ttGGTCGTTTGTTAATGCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTGATGCATGGTATGCAGCTGGCGCTATTGAAATCCAc < 2:904316/148‑1 (MQ=255) ttGTTAATGCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTGATGCATGGTATGCAGCTGGCGCTATTGAAATCCACTTTACCGa > 1:1708283/1‑148 (MQ=255) ttAATGCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTGATGCATGGTATGCAGCTGGCGCTATTGAAATCCACTTTACCGAAAg < 1:2389942/148‑1 (MQ=255) tAATGCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTGATGCATGGTATGCAGCTGGCGCTATTGAAATCCACTTTACCGAAAGa < 2:3252774/148‑1 (MQ=255) tGCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTGATGCATGGTATGCAGCTGGCGCTATTGAAATCCACTTTACCGAAAGATgg < 2:1878720/148‑1 (MQ=255) tGCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTGATGCATGGTATGCAGCTGGCGCTATTGAAATCCACTTTACCGAAAGATgg < 2:2969900/148‑1 (MQ=255) tGCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTGATGCATGGTATGCAGCTGGCGCTATTGAAATCCACTTTACCGAAAGATgg > 2:2380860/1‑148 (MQ=255) tGCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTGATGCATGGTATGCAGCTGGCGCTATTGAAATCCACTTTACCGAAAGATgg > 2:596903/1‑148 (MQ=255) ctGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTGATGCATGGTATGCAGCTGGCGCTATTGAAATCCACTTTACCGAAAGATGGCCCg > 1:2502756/1‑148 (MQ=255) ctGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTGATGCATGGTATGCAGCTGGCGCTATTGAAATCCACTTTACCGAAAGATGGCCCg > 1:719719/1‑148 (MQ=255) cGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTGATGCATGGTATGCAGCTGGCGCTATTGAAATCCACTTTACCGAAAGATGGCCCGCAg < 2:3085379/148‑1 (MQ=255) ttGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTGATGCATGGTATGCAGCTGGCGCTATTGAAATCCACTTTACCGAAAGATGGCCCGCAGATg > 2:2050931/1‑148 (MQ=255) gggATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTGATGCATGGTATGCAGCTGGCGCTATTGAAATCCACTTTACCGACAGATGGCCCGCAGATGacc > 2:3078128/1‑148 (MQ=255) gggATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTGATGCATGGTATGCAGCTGGCGCTATTGAAATCCACTTTACCGAAAGATGGCCCGCAGATGacc < 1:1384978/148‑1 (MQ=255) ccTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTGATGCATGGTATGCAGCTGGCGCTATTGAAATCCACTTTACCGAAAGATGGCCCGCAGATGACCACCGCCGAAAAg > 2:2589800/1‑148 (MQ=255) tCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTGATGCATGGTATGCAGCTGGCGCTATTGAAATCCACTTTACCGAAAGATGGCCCGCAGATGACCACCGCCGAAAAGGt < 1:2471270/148‑1 (MQ=255) cAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTGATGCATGGTATGCAGCTGGCGCTATTGAAATCCACTTTACCGAAAGATGGCCCGCAGATGACCACCGCCGAAAAGGTa > 1:3298670/1‑148 (MQ=255) ccTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTTATTTTTACCGTTCTGATGCATTTTATGCATCTGGCGCTATTGAAATACACTTTAACGAAAGATGGCCAGCAGATCACCACCGCCCAAAATGTACgg > 1:1980337/1‑148 (MQ=255) ccTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTGATGCATGGTATGCAGCTGGCGCTATTGAAATCCACTTTACCGAAAGATGGCCCGCAGATGACCACCGCCGAAAAGGTACgg > 2:91178/1‑148 (MQ=255) ccTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTGATGCATGGTATCCAGCTGGCGCTATTGAAATCCACTTTACCGAAAGATGGCCCGCATATGACCACCGCCGAAAAGGTACgg > 1:334200/1‑148 (MQ=255) cTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTGATGCATGGTATGCAGCTGGCGCTATTGAAATCCACTTTACCGAAAGATGGCCCGCAGATGACCACCGCCGAAAAGGTACGGa < 1:2602470/148‑1 (MQ=255) gTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTGATGCATGGTATGCAGCTGGCGCTATTGAAATCCACTTTACCGAAAGATGGCCCGCAGATGACCACCGCCGAAAAGGTACGGAttt < 1:3052008/148‑1 (MQ=255) gCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTGATGCATGGTATGCAGCTGGCGCTATTGAAATCCACTTTACCGAAAGATGGCCCGCAGATGACCACCGCCGAAAAGGTACGGATTTTc < 1:3095700/148‑1 (MQ=255) cATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTGATGCATGGTATGCAGCTGGCGCTATTGAAATCCACTTTACCGAAAGATGGCCCGCAGATGACCACCGCCGAAAAGGTACGGATTTTcc < 1:1496628/148‑1 (MQ=255) cATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTGATGCATGGTATGCAGCTGGCGCTATTGAAATCCACTTTACCGAAAGATGGCCCGCAGATGACCACCGCCGAAAAGGTACGGATTTTcc < 2:1816614/148‑1 (MQ=255) cATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTGATGCATGGTATGCAGCTGGCGCTATTGAAATCCACTTTACCGAAAGATGGCCCGCAGATGACCACCGCCGAAAAGGTACGGATTTTcc < 1:1496655/148‑1 (MQ=255) cTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTGATGCATGGTATGCAGCTGGCGCTATTGAAATCCACTTTACCGAAAGATGGCCCGCAGATGACCACCGCCGAAAAGGTACGGATTTTCCTTTTc > 1:3450080/1‑148 (MQ=255) cACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCAGATGCATGGTATTCAGGTGGCGCTATTGAAAACCACTTTACCGCAAGATGGCCCGCACATGACCACCGCCGAAAAGGGACGGATTTTCCTTTTCTGCgt > 1:2538778/1‑148 (MQ=255) cccGCTGAATATCTTCGTTACAGTGGCGCTGATTTTGACCGTGCTGATGCATGGTATGCAGCTGGCGCTATTGAAATCCACTTTACCGAAAGATGGCCCGCAGATGACCACCGCCGAAAAGGTACGGATTTTCCTTTTCGGCGTGttt < 2:719280/148‑1 (MQ=255) gAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTGATGCATGGTATGCAGCTGGCGCTATTGAAATCCACTTTACCGAAAGATGGCCCGCAGATGACCACCGCCGAAAAGGTACGGATTTTCCTTTTCGGCGTGTTTGAActg > 2:1302247/1‑148 (MQ=255) gAATATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTGATGCATGGTATGCAGCTGGCGCTATTGAAATCCACTTTACCGAAAGATGGCCCGCAGATGACCACCGCCGAAAAGGTACGGATTTTCCTTTTCGGCGTGTTTGAActg > 2:1302152/1‑148 (MQ=255) aaTATCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTGATGCATGGTATGCAGCTGGCGCTATTGAAATCCACTTTACCGAAAGATGGCCCGCAGATGACCACCGCCGAAAAGGTACGGATTTTCCTTTTCGGCGTGTTTGAActgc < 1:1596972/148‑1 (MQ=255) atatCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTGATGCATGGTATGCAGCTGGCGCTATTGAAATCCACTTTACCGAAAGATGGCCCGCAGATGACCACCGCCGAAAAGGTACGGATTTTCCTTTTCGGCGTGTTTGAActgct < 1:2893482/148‑1 (MQ=255) atatCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTGATGCATGGTATGCAGCTGGCGCTATTGAAATCCACTTTACCGAAAGATGGCCCGCAGATGACCACCGCCGAAAAGGTACGGATTTTCCTTTTCGGCGTGTTTGAActgct > 2:2470290/1‑148 (MQ=255) tCTTCGTTAAAGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTGATGCATGGTATGCAGCTGGCGCTATTGAAATCCACTTTACCGAAAGATGGCCCGCAGATGACCACCGCCGAAAAGGTACGGATTTTCCTTTTCGGCGTGTTTGAACTGctggc < 2:3315123/148‑1 (MQ=255) 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GGTGGCTTATCGGCTGTATCAACGCGAAGCACAAGGAGAAAGTGATGCTGATTAATATTGGTCGTTTGTTAATGCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAACGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTGATGCATGGTATGCAGCTGGCGCTATTGAAATCCACTTTACCGAAAGATGGCCCGCAGATGACCACCGCCGAAAAGGTACGGATTTTCCTTTTCGGCGTGTTTGAACTGCTGGCCTGG > CP009273/3598295‑3598581 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |