| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,649,797 | C→A | 100% | E102* (GAA→TAA) | hdeA ← | stress response protein acid‑resistance protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,649,797 | 0 | C | A | 97.3% | 700.2 / 7.5 | 223 | E102* (GAA→TAA) | hdeA | stress response protein acid‑resistance protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (6/0); new base A (109/108); total (115/108) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.96e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 223 total aligned reads displayed.
TTTGTAACCCATTCAATATAGAGATTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTCGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTTTGTTGTTCAGCGCTTCAGCAAAACCAA > CP009273/3649653‑3649940 | tttGTAACCCATTCAATATAGAGATTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGcc > 2:300787/1‑148 (MQ=255)tttGTAACCCATTCAATATAGAGATTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGcc > 2:703503/1‑148 (MQ=255) ttGTAACCCATTCAATATAGAGATTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCt < 1:2523639/148‑1 (MQ=255) ttGTAACCCATTCAATATAGAGATTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCt < 1:1457780/148‑1 (MQ=255) tAACCCATTCAATATAGAGATTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTa < 1:231556/148‑1 (MQ=255) aaCCCATTCAATATAGAGATTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTaa < 1:2155782/148‑1 (MQ=255) aCCCATTCAATATAGAGATTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAAc < 1:2662526/148‑1 (MQ=255) aCCCATTCAATATAGAGATTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAAc > 2:663659/1‑148 (MQ=255) cATTCAATATAGAGATTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACttt < 1:2694366/148‑1 (MQ=255) cATTCAATATAGAGATTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACttt < 1:872740/148‑1 (MQ=255) cATTCAATATAGAGATTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACttt < 1:2694879/148‑1 (MQ=255) tCAATATAGAGATTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGACTTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATc > 2:1181429/1‑148 (MQ=255) aaTATAGAGATTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCtt < 2:2014717/148‑1 (MQ=255) atatAGAGATTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCttt < 2:2857601/148‑1 (MQ=255) tataGAGATTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTa > 2:2347271/1‑148 (MQ=255) tataGAGATTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTa > 1:2073749/1‑148 (MQ=255) ataGAGATTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTaa > 2:2150505/1‑148 (MQ=255) ataGAGATTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTaa < 1:744000/148‑1 (MQ=255) ataGAGATTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTaa > 1:694213/1‑148 (MQ=255) ataGAGATTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTaa < 1:1111316/148‑1 (MQ=255) taGAGATTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTaaa > 1:1346781/1‑148 (MQ=255) gagaTTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGt > 1:1829321/1‑148 (MQ=255) gagaTTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGt < 1:3067428/148‑1 (MQ=255) agaTTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGtt > 2:3177709/1‑148 (MQ=255) gaTTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTg < 2:3440990/148‑1 (MQ=255) gaTTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTg < 2:2223568/148‑1 (MQ=255) gaTTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTg < 2:2223083/148‑1 (MQ=255) aTTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTgg > 2:499578/1‑148 (MQ=255) aTTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTgg > 1:1991715/1‑148 (MQ=255) ttATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGc > 1:153467/1‑148 (MQ=255) ttATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGc < 2:1410423/148‑1 (MQ=255) atatatGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTGAACTTTATCTTTAAAGTTGGCtt < 2:185968/148‑1 (MQ=255) atatGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGt > 2:1600437/1‑148 (MQ=255) tGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTa > 1:328731/1‑148 (MQ=255) tGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTa < 1:1064656/148‑1 (MQ=255) gAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTAt > 2:1308021/1‑148 (MQ=255) aaCAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGttt > 1:1018341/1‑145 (MQ=255) aaCAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGttt < 2:1018341/145‑1 (MQ=255) aaCAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATc < 2:1261577/148‑1 (MQ=255) aaCAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATc < 2:3034860/148‑1 (MQ=255) aCAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATcc > 1:1950040/1‑148 (MQ=255) aggaggAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTg > 2:2050156/1‑148 (MQ=255) aaTAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACa > 1:2764466/1‑148 (MQ=255) ctgctTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCt > 1:2432797/1‑148 (MQ=255) tgctTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGACTg > 2:2590909/1‑148 (MQ=255) gctTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCTATATGCAAGGAAGTTCGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTACCATTAGCCATTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGa < 1:425776/148‑1 (MQ=255) gctTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGa < 1:593575/148‑1 (MQ=255) ttttAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAAc > 1:2118309/1‑148 (MQ=255) ttAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGa < 1:2582464/148‑1 (MQ=255) aagaagATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTCCAAGCCTGAACGATAg > 2:1875823/1‑148 (MQ=255) agaagaTATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGc > 1:992778/1‑148 (MQ=255) aagaTATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTg > 1:3314318/1‑148 (MQ=255) ttCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTa < 2:437457/148‑1 (MQ=255) ccTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTg > 2:745283/1‑148 (MQ=255) ccTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTg < 2:1355285/148‑1 (MQ=255) ttCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAAt < 2:2634098/148‑1 (MQ=255) ttCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAAt < 2:621246/148‑1 (MQ=255) cAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTCGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATAc > 2:270445/1‑148 (MQ=255) atatGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATAccc > 1:1051309/1‑148 (MQ=255) atatGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATAccc > 2:1469286/1‑148 (MQ=255) tatGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCt > 1:602137/1‑148 (MQ=255) tatGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCt > 2:756568/1‑148 (MQ=255) tGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGa < 1:2321690/148‑1 (MQ=255) gCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGaa > 1:3442049/1‑148 (MQ=255) cAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAAc < 1:3177872/148‑1 (MQ=255) ggAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATc < 1:663573/148‑1 (MQ=255) ggAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATc > 1:2739442/1‑148 (MQ=255) gTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTaaa < 2:198010/148‑1 (MQ=255) gTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTaaa > 2:333168/1‑148 (MQ=255) tACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTaaaa < 2:2977123/148‑1 (MQ=255) tACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTaaaa < 2:320053/148‑1 (MQ=255) cGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAAcc > 2:173640/1‑148 (MQ=255) aTGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTCGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGc > 1:2799296/1‑148 (MQ=255) tGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCa > 2:932358/1‑148 (MQ=255) tAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCAtc < 2:240565/148‑1 (MQ=255) tAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCAtc > 2:2375792/1‑148 (MQ=255) aaCGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCAtct < 1:187379/148‑1 (MQ=255) aaCGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCAtct > 1:205151/1‑148 (MQ=255) aCGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCAtctt < 2:802793/148‑1 (MQ=255) cccGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGttt < 1:1371617/148‑1 (MQ=255) gAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCt < 1:2639480/148‑1 (MQ=255) aaTTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTCGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAATCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCtt > 2:3556112/1‑148 (MQ=255) aaTTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCtt > 2:1554492/1‑148 (MQ=255) aTTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCttt > 1:3032307/1‑148 (MQ=255) ttACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTttg < 1:730266/148‑1 (MQ=255) tACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTttgt < 1:2984372/148‑1 (MQ=255) aCATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTttgtt < 2:2261536/148‑1 (MQ=255) cATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTttgttg < 1:3306776/148‑1 (MQ=255) atatCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTTtgttgt < 2:694213/148‑1 (MQ=255) tctttcttAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTTTGTTGTTCa > 1:1754568/1‑148 (MQ=255) ctttcttAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTTTGTTGTTCAg > 2:2463398/1‑148 (MQ=255) ctttcttAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTTTGTTGTTCAg > 2:2742354/1‑148 (MQ=255) ttcttAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTTTGTTGTTCAgcg < 2:1223736/148‑1 (MQ=255) tcttAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTTTGTTGTTCAgcgc > 2:289179/1‑148 (MQ=255) cttAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTTTGTTGTTCAGCGCt > 1:2636157/1‑148 (MQ=255) tAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTTTGTTGTTCAGCGCTTc > 2:3113957/1‑148 (MQ=255) tttGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTTTGTTGTTCAGCGCTTCAGCa > 2:2869498/1‑148 (MQ=255) tCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTTTGTTGTTCAGCGCTTCAGCAAAAc < 1:1307988/148‑1 (MQ=255) ccATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTTTGTTGTTCAGCGCTTCAGCAAAACCa > 2:1100817/1‑148 (MQ=255) cATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTTTGTTGTTCAGCGCTTCAGCAAAACCaa < 1:1181429/148‑1 (MQ=255) | TTTGTAACCCATTCAATATAGAGATTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTCGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTTTGTTGTTCAGCGCTTCAGCAAAACCAA > CP009273/3649653‑3649940 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |