Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 3,724,487 | 0 | C | T | 6.2% | 753.7 / 24.3 | 209 | intergenic (‑362/‑4) | xylA/xylF | D‑xylose isomerase/D‑xylose transporter subunit |
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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Only 100 of 211 total aligned reads displayed.
GTCATAAATCAAGAAATAAACCAAAAATCGTAATCGAAAGATAAAAATCTGTAATTGTTTTCCCCTGTTTAGTTGCTAAAAATTGGTTACGTTTATCGCGGTGATTGTTACTTATTAAAACTGTCCTCTAACTACAGAAGGCCCTACACCATGAAAATAAAGAACATTCTACTCACCCTTTGCACCTCACTCCTGCTTACCAACGTTGCTGCACACGCCAAAGAAGTCAAAATAGGTATGGCGATTGATGATCTCCGTCTTGAACGCTGGCAAAAAGATCGAGATATCTTTGTG > CP009273/3724341‑3724634 | cATAAATCAAGAAATAAACCAAAAATCGTAATCGAAAGATAAAAATCTGTAATTGTTTTCCCCTGTTTAGTTGCTAAAAATTGGTTACGTTTATCGCGGTGATTGTTACTTATTAAAACTGTCCTCTAACTACAGAAGGCCCTACAcc < 2:1641967/148‑1 (MQ=255) cATAAATCAAGAAATAAACCAAAAATCGTAATCGAAAGATAAAAATCTGTAATTGTTTTCCCCTGTTTAGTTGCTAAAAATTGGTTACGTTTATCGCGGTGATTGTTACTTATTAAAACTGTCCTCTAACTACAGAAGGCCCTACAcc > 2:2267505/1‑148 (MQ=255) aaaTCAAGAAATAAACCAAAAATCGTAATCGAAAGATAAAAATCTGTAATTGTTTTCCCCTGTTTAGTTGCTAAAAATTGGTTACGTTTATCGCGGTGATTGTTACTTATTAAAACTGTCCTCTAACTACAGAAGGCCCTATACCATg > 1:1245864/1‑148 (MQ=255) aTCAAGAAATAAACCAAAAATCGTAATCGAAAGATAAAAATCTGTAATTGTTTTCCCCTGTTTAGTTGCTAAAAATTGGTTACGTTTATCGCGGTGATTGTTACTTATTAAAACTGTCCTCTAACTACAGAAGGCCCTACACCATGaa 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gAAGGCCCTACACCATGAAAATAAAGAACATTCTACTCACCCTTTGCACCTCACTCCTGCTTACCAACGTTGCTGCACACGCCAAAGAAGTCAAAATAGGTATGGCGATTGATGATCTCCGTCTTGAACGCTGGCAAAAAGATCgaga > 1:2460409/1‑148 (MQ=255) aGGCCCTACACCATGAAAATAAAGAACATTCTACTCACCCTTTGCACCTCACTCCTGCTTACCAACGTTGCTGCACACGCCAACGAAGTCAAAATAGGTATGGCGATTGATGATCTCCGTCTTGAACGCTGGCAAAAAGATCGAGata < 2:3456173/148‑1 (MQ=255) aGGCCCTACACCATGAAAATAAAGAACATTCTACTCACCCTTTGCACCTCACTCCTGCTTACCAACGTTGCTGCACACGCCAAAGAAGTCAAAATAGGTATGGCGATTGATGATCTCCGTCTTGAACGCTGGCAAAAAGATCGAGata > 2:1426244/1‑148 (MQ=255) ggCCCTACACCATGAAAATAAAGAACATTCTACTCACCCTTTGCACCTCACTCCTGCTTACCAACGTTGCTGCACACGCCAAAGAAGTCAAAATAGGTATGGCGATTGATGATCTCCGTCTTGAACGCTGGCAAAAAGATCGAGatat > 2:1670346/1‑148 (MQ=255) gCCCTACACCATGAAAATAAAGAACATTCTACTCACCCTTTGCACCTCACTCCTGCTTACCAACGTTGCTGCACACGCCAAAGAAGTCAAAATAGGTATGGCGATTGATGATCTCCGTCTTGAACGCTGGCAAAAAGATCGAGATATc < 1:2537348/148‑1 (MQ=255) 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tACACCATGAAAATAAAGAACATTCTACTCACCCTTTGCACCTCACTCCTGCTTACCAACGTTGCTGCACACGCCAAAGAAGTCAAAATAGGTATGGCGATTGATGATCTCCGTCTTGAACGCTGGCAAAAAGATCGAGATATCTTtg < 1:1920626/148‑1 (MQ=255) | GTCATAAATCAAGAAATAAACCAAAAATCGTAATCGAAAGATAAAAATCTGTAATTGTTTTCCCCTGTTTAGTTGCTAAAAATTGGTTACGTTTATCGCGGTGATTGTTACTTATTAAAACTGTCCTCTAACTACAGAAGGCCCTACACCATGAAAATAAAGAACATTCTACTCACCCTTTGCACCTCACTCCTGCTTACCAACGTTGCTGCACACGCCAAAGAAGTCAAAATAGGTATGGCGATTGATGATCTCCGTCTTGAACGCTGGCAAAAAGATCGAGATATCTTTGTG > CP009273/3724341‑3724634 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |