Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 3,789,381 | C→A | 100% | L15I (CTC→ATC) | waaC → | ADP‑heptose:LPS heptosyl transferase I |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 3,789,381 | 0 | C | A | 95.0% | 507.6 / 15.7 | 171 | L15I (CTC→ATC) | waaC | ADP‑heptose:LPS heptosyl transferase I |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (4/5); new base A (93/69); total (97/74) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.03e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 172 total aligned reads displayed.
AGGTGACGCTGCGGAGGGTTATCACCAGAGCTTAATCGACATTACTCCCCAGCGCGTACTGGAAGAACTCAACGCGCTATTGTTACAAGAGGAAGCCTGACGGATGCGGGTTTTGATCGTTAAAACATCGTCGATGGGCGATGTTCTCCATACGTTGCCCGCACTCACTGATGCCCAGCAGGCAATCCCAGGGATTAAGTTTGACTGGGTGGTGGAAGAAGGGTTCGCACAGATTCCTTCCTGGCACGCTGCCGTTGAGCGAGTTATTCCTGTGGCAATACGTCGCTGG > CP009273/3789236‑3789524 | aGGTGACGCTGCGGAGGGTTATCACCAGAGCTTAATCGACATTACTCCCCAGCGCGTACTGGAAGAACTCAACGCGCTATTGTTACAAGAGGAAGCCTGACGGATGCGGGTTTTGATCGTTAAAACATCGTCGATGGGCGATGTtatc > 1:2937934/1‑148 (MQ=255) ggTGACGCTGCGGAGGGTTATCACCAGAGCTTAATCGACATTACTCCCCAGCGCGTACTGGAAGAACTCAACGCGCTATTGTTACAAGAGGAAGCCTGACGGATGCGGGTTTTGATCGTTAAAACATCGTCGATGGGCGATGTTCTcc > 1:1708574/1‑148 (MQ=255) gTGACGCTGCGGAGGGTTATCACCAGAGCTTAATCGACATTACTCCCCAGCGCGTACTGGAAGAACTCAACGCGCTATTGTTACAAGAGGAAGCCTGACGGATGCGGGTTTTGATCGTTAAAACATCGTCGATGGGCGATGTTATCCa > 2:3453964/1‑148 (MQ=255) tGACGCTGCGGAGGGTTATCACCAGAGCTTAATCGACATTACTCCCCAGCGCGTACTGGAAGAACTCAACGCGCTATTGTTACAAGAGGAAGCCTGACGGATGCGGGTTTTGATCGTTAAAACATCGTCGATGGGCGATGTTATCCAt > 2:982056/1‑148 (MQ=255) tGACGCTGCGGAGGGTTATCACCAGAGCTTAATCGACATTACTCCCCAGCGCGTACTGGAAGAACTCAACGCGCTATTGTTACAAGAGGAAGCCTGACGGATGCGGGTTTTGATCGTTAAAACATCGTCGATGGGCGATGTTATCCAt > 1:846366/1‑148 (MQ=255) cGCTGCGGAGGGTTATCACCAGAGCTTAATCGACATTACTCCCCAGCGCGTACTGGAAGAACTCAACGCGCTATTGTTACAAGAGGAAGCCTGACGGATGCGGGTTTTGATCGTTAAAACATCGTCGATGGGCGATGTTATCCATACg < 2:1988327/148‑1 (MQ=255) cGCTGCGGAGGGTTATCACCAGAGCTTAATCGACATTACTCCCCAGCGCGTACTGGAAGAACTCAACGCGCTATTGTTACAAGAGGAAGCCTGACGGATGCGGGTTTTGATCGTTAAAACATCGTCGATGGGCGATGTTATCCATACg < 2:191906/148‑1 (MQ=255) tGCGGAGGGTTATCACCAGAGCTTAATCGACATTACTCCCCAGCGCGTACTGGAAGAACTCAACGCGCTATTGTTACAAGAGGAAGCCTGACGGATGCGGGTTTTGATCGTTAAAACATCGTCGATGGGCGATGTTATCCATACGTTg < 1:1085704/148‑1 (MQ=255) tGCGGAGGGTTATCACCAGAGCTTAATCGACATTACTCCCCAGCGCGTACTGGAAGAACTCAACGCGCTATTGTTACAAGAGGAAGCCTGACGGATGCGGGTTTTGATCGTTAAAACATCGTCGATGGGCGATGTTATCCATACGTTg < 1:1085466/148‑1 (MQ=255) tGCGGAGGGTTATCACCAGAGCTTAATCGACATTACTCCCCAGCGCGTACTGGAAGAACTCAACGCGCTATTGTTACAAGAGGAAGCCTGACGGATGCGGGTTTTGATCGTTAAAACATCGTCGATGGGCGATGTTATCCATACGTTg < 2:1828504/148‑1 (MQ=255) gAGGGTTATCACCAGAGCTTAATCGACATTACTCCCCAGCGCGTACTGGAAGAACTCAACGCGCTATTGTTACAAGAGGAAGCCTGACGGATGCGGGTTTTGATCGTTAAAACATCGTCGATGGGCGATGTTATCCATACGTTGCCCg > 2:966607/1‑148 (MQ=255) aGGGTTATCACCAGAGCTTAATCGACATTACTCCCCAGCGCGTACTGGAAGAACTCAACGCGCTATTGTTACAAGAGGAAGCCTGACGGATGCGGGTTTTGATCGTTAAAACATCGTCGATGGGCGATGTTATCCATACGTTGCCCGc > 2:3131031/1‑148 (MQ=255) aGGGTTATCACCAGAGCTTAATCGACATTACTCCCCAGCGCGTACTGGAAGAACTCAACGCGCTATTGTTACAAGAGGAAGCCTGACGGATGCGGGTTTTGATCGTTAAAACATCGTCGATGGGCGATGTTATCCATACGTTGCCCGc > 2:2998747/1‑148 (MQ=255) gggTTATCACCAGAGCTTAATCGACATTACTCCCCAGCGCGTACTGGAAGAACTCAACGCGCTATTGTTACAAGAGGAAGCCTGACGGATGCGGGTTTTGATCGTTAAAACATCGTCGATGGGCGATGTTATCCATACGTTGCCCGca > 1:467664/1‑148 (MQ=255) ggTTATCACCAGAGCTTAATCGACATTACTCCCCAGCGCGTACTGGAAGAACTCAACGCGCTATTGTTACAAGAGGAAGCCTGACGGATGCGGGTTTTGATCGTTAAAACATCGTCGATGGGCGATGTTATCCATACGTTGCCCGcac > 2:1324016/1‑148 (MQ=255) ggTTATCACCAGAGCTTAATCGACATTACTCCCCAGCGCGTACTGGAAGAACTCAACGCGCTATTGTTACAAGAGGAAGCCTGACGGATGCGGGTTTTGATCGTTAAAACATCGTCGATGGGCGATGTTATCCATACGTTGCCCGcac > 2:1323869/1‑148 (MQ=255) tCACCAGAGCTTAATCGACATTACTCCCCAGCGCGTACTGGAAGAACTCAACGCGCTATTGTTACAAGAGGAAGCCTGACGGATGCGGGTTTTGATCGTTAAAACATCGTCGATGGGCGATGTTATCCATACGTTGCCCGcactcact > 1:1514132/1‑148 (MQ=255) aCCAGAGCTTAATCGACATTACTCCCCAGCGCGTACTGGAAGAACTCAACGCGCTATTGTTACAAGAGGAAGCCTGACGGATGCGGGTTTTGATCGTTAAAACATCGTCGATGGGCGATGTTATCCATACGTTGCCCGCACTCACTGa < 2:2102462/148‑1 (MQ=255) aCCAGAGCTTAATCGACATTACTCCCCAGCGCGTACTGGAAGAACTCAACGCGCTATTGTTACAAGAGGAAGCCTGACGGATGCGGGTTTTGATCGTTAAAACATCGTCGATGGGCGATGTTATCCATACGTTGCCCGCACTCACTGa < 2:1449842/148‑1 (MQ=255) agagCTTAATCGACATTACTCCCCAGCGCGTACTGGAAGAACTCAACGCGCTATTGTTACAAGAGGAAGCCTGACGGATGCGGGTTTTGATCGTTAAAACATCGTCGATGGGCGATGTTATCCATACGTTGCCCGCACTCACTGATGc > 1:3239193/1‑148 (MQ=255) cTTAATCGACATTACTCCCCAGCGCGTACTGGAAGAACTCAACGCGCTATTGTTACAAGAGGAAGCCTGACGGATGCGGGTTTTGATCGTTAAAACATCGTCGATGGGCGATGTTATCCATACGTTGCCCGCACTCACTGATGCCcag < 2:1064741/148‑1 (MQ=255) tAATCGACATTACTCCCCAGCGCGTACTGGAAGAACTCAACGCGCTATTGTTACAAGAGGAAGCCTGACGGATGCGGGTTTTGATCGTTAAAACATCGTCGATGGGCGATGTTATCCATACGTTGCCCGCACTCACTGATGCCcagca < 2:727192/148‑1 (MQ=255) aaTCGACATTACTCCCCAGCGCGTACTGGAAGAACTCAACGCGCTATTGTTACAAGAGGAAGCCTGACGGATGCGGGTTTTGATCGTTAAAACATCGTCGATGGGCGATGTTCTCCATACGTTGCCCGCACTCACTGATGCCcagcag > 2:761032/1‑148 (MQ=255) aaTCGACATTACTCCCCAGCGCGTACTGGAAGAACTCAACGCGCTATTGTTACAAGAGGAAGCCTGACGGATGCGGGTTTTGATCGTTAAAACATCGTCGATGGGCGATGTTATCCATACGTTGCCCGCACTCACTGATGCCcagcag > 2:2523309/1‑148 (MQ=255) aaTCGACATTACTCCCCAGCGCGTACTGGAAGAACTCAACGCGCTATTGTTACAAGAGGAAGCCTGACGGATGCGGGTTTTGATCGTTAAAACATCGTCGATGGGCGATGTTATCCATACGTTGCCCGCACTCACTGATGCCcagcag > 2:761002/1‑148 (MQ=255) aTCGACATTACTCCCCAGCGCGTACTGGAAGAACTCAACGCGCTATTGTTACAAGAGGAAGCCTGACGGATGCGGGTTTTGATCGTTAAAACATCGTCGATGGGCGATGTTATCCATACGTTGCCCGCACTCACTGATGCCCAGCAgg > 1:464597/1‑148 (MQ=255) tCGACATTACTCCCCAGCGCGTACTGGAAGAACTCAACGCGCTATTGTTACAAGAGGAAGCCTGACGGATGCGGGTTTTGATCGTTAAAACATCGTCGATGGGCGATGTTATCCATACGTTGCCCGCACTCACTGATGCCCAGCAGGc > 1:247059/1‑148 (MQ=255) cTCCCCAGCGCGTACTGGAAGAACTCAACGCGCTATTGTTACAAGAGGAAGCCTGACGGATGCGGGTTTTGATCGTTAAAACATCGTCTATGGGCGATGTTATCCATACGTTGCCCGCACTCACTGATGCCCAGCAGGCAATCCCAgg > 1:2414179/1‑148 (MQ=255) tCCCCAGCGCGTACTGGAAGAACTCAACGCGCTATTGTTACAAGAGGAAGCCTGACGGATGCGGGTTTTGATCGTTAAAACATCGTCGATGGGCGATGTTCTCCATACGTTGCCCGCACTCACTGATGCCCAGCAGGCAATCCCAggg < 2:1167771/148‑1 (MQ=255) ccccAGCGCGTACTGGAAGAACTCAACGCGCTATTGTTACAAGAGGAAGCCTGACGGATGCGGGTTTTGATCGTTAAAACATCGTCGATGGGCGATGTTATCCATACGTTGCCCGCACTCACTGATGCCCAGCAGGCAATCCCAGGGa < 1:2741732/148‑1 (MQ=255) ccccAGCGCGTACTGGAAGAACTCAACGCGCTATTGTTACAAGAGGAAGCCTGACGGATGCGGGTTTTGATCGTTAAAACATCGTCGATGGGCGATGTTATCCATACGTTGCCCGCACTCACTGATGCCCAGCAGGCAATCCCAGGGa > 1:3097883/1‑148 (MQ=255) ccAGCGCGTACTGGAAGAACTCAACGCGCTATTGTTACAAGAGGAAGCCTGACGGATGCGGGTTTTGATCGTTAAAACATCGTCGATGGGCGATGTTATCCATACGTTGCCCGCACTCACTGATGCCCAGCAGGCAATCCCAGGGAtt > 1:729339/1‑148 (MQ=255) aGCGCGTACTGGAAGAACTCAACGCGCTATTGTTACAAGAGGAAGCCTGACGGATGCGGGTTTTGATCGTTAAAACATCGTCGATGGGCGATGTTATCCATACGTTGCCCGCACTCACTGATGCCCAGCAGGCAATCCCAGGGATTaa < 1:1321818/148‑1 (MQ=255) gcgcGTACTGGAAGAACTCAACGCGCTATTGTTACAAGAGGAAGCCTGACGGATGCGGGTTTTGATCGTTAAAACATCGTCGATGGGCGATGTTATCCATACGTTGCCCGCACTCACTGATGCCCAGCAGGCAATCCCAGGGATTAAg > 2:2492124/1‑148 (MQ=255) gcgcGTACTGGAAGAACTCAACGCGCTATTGTTACAAGAGGAAGCCTGACGGATGCGGGTTTTGATCGTTAAAACATCGTCGATGGGCGATGTTATCCATACGTTGCCCGCACTCACTGATGCCCAGCAGGCAATCCCAGGGATTAAg < 1:2199932/148‑1 (MQ=255) gcgTACTGGAAGAACTCAACGCGCTATTGTTACAAGAGGAAGCCTGACGGATGCGGGTTTTGATCGTTAAAACATCGTCGATGGGCGATGTTATCCATACGTTGCCCGCACTCACTGATGCCCAGCAGGCAATCCCAGGGATTAAGtt < 1:3353473/148‑1 (MQ=255) tACTGGAAGAACTCAACGCGCTATTGTTACAAGAGGAAGCCTGACGGATGCGGGTTTTGATCGTTAAAACATCGTCGATGGGCGATGTTATCCATACGTTGCCCGCACTCACTGATGCCCAGCAGGCAATCCCAGGGATTAAGTTTGa < 1:587905/148‑1 (MQ=255) tACTGGAAGAACTCAACGCGCTATTGTTACAAGAGGAAGCCTGACGGATGCGGGTTTTGATCGTTAAAACATCGTCGATGGGCGATGTTATCCATACGTTGCCCGCACTCACTGATGCCCAGCAGGCAATCCCAGGGATTAAGTTTGa < 2:2689897/148‑1 (MQ=255) tACTGGAAGAACTCAACGCGCTATTGTTACAAGAGGAAGCCTGACGGATGCGGGTTTTGATCGTTAAAACATCGTCGATGGGCGATGTTATCCATACGTTGCCCGCACTCACTGATGCCCAGCAGGCAATCCCAGGGATTAAGTTTGa > 2:1749980/1‑148 (MQ=255) tACTGGAAGAACTCAACGCGCTATTGTTACAAGAGGAAGCCTGACGGATGCGGGTTTTGATCGTTAAAACATCGTCGATGGGCGATGTTATCCATACGTTGCCCGCACTCACTGATGCCCAGCAGGCAATCCCAGGGATTAAGTTTGa > 2:2059580/1‑148 (MQ=255) tGGAAGAACTCAACGCGCTATTGTTACAAGAGGAAGCCTGACGGATGCGGGTTTTGATCGTTAAAACATCGTCGATGGGCGATGTTATCCATACGTTGCCCGCACTCACTGATGCCCAGCAGGCAATCCCAGGGATTAAGTTTGACTg < 2:207666/148‑1 (MQ=255) ggAAGAACTCAACGCGCTATTGTTACAAGAGGAAGCCTGACGGATGCGGGTTTTGATCGTTAAAACATCGTCGATGGGCGATGTTCTCCATACGTTGCCCGCACTCACTGATGCCCAGCAGGCAATCCCAGGGATTAAGTTTGACTgg < 1:2799762/148‑1 (MQ=255) aagaaCTCAACGCGCTATTGTTACAAGAGGAAGCCTGACGGATGCGGGTTTTGATCGTTAAAACATCGTCGATGGGCGATGTTATCCATACGTTGCCCGCACTCACTGATGCCCAGCAGGCAATCCCAGGGATTCAGTTTGACTGggt > 1:886305/1‑148 (MQ=255) agaaCTCAACGCGCTATTGTTACAAGAGGAAGCCTGACGGATGCGGGTTTTGATCGTTAAAACATCGTCGATGGGCGATGTTATCCATACGTTGCCCGCACTCACTGATGCCCAGCAGGCAATCCCAGGGATTAAGTTTGACTGggtg < 2:358336/148‑1 (MQ=255) aaCTCAACGCGCTATTGTTACAAGAGGAAGCCTGACTGATGCGGGTTTTGATCGTTAAAACATCGTCGATGGGCGATGTTATCCATACGTTGCCCGCACTCACTGATGCCCAGCAGGCAATCCCAGGGATTAAGTTTGACTGggtggt < 1:1560030/148‑1 (MQ=255) aaCTCAACGCGCTATTGTTACAAGAGGAAGACTGACTGATGCGGGTTTTGATCGTTAAAACATCGTCGATGTGCGATGTTATCCATACGTTGCCCGCACTCACTGATGCCCATCAGGCAATCCCAGGGATTAAGTTTGACTTggtggt < 2:2229378/148‑1 (MQ=255) aCTCAACGCGCTATTGTTACAAGAGGAAGCCTGACGGATGCGGGTTTTGATCGTTAAAACATCGTCGATGGGCGATGTTATCCATACGTTGCCCGCACTCACTGATGCCCAGCAGGCAATCCCAGGGATTAAGTTTGACTGGgtggtg < 2:3069037/148‑1 (MQ=255) cTCAACGCGCTATTGTTACAAGAGGAAGCCTGACGGATGCGGGTTTTGATCGTTAAAACATCGTCGATGGGCGATGTTATCCATACGTTGCCCGCACTCACTGATGCCCAGCAGGCAATCCCAGGGATTAAGTTTGACTGGGtggtgg > 1:1604294/1‑148 (MQ=255) aCGCGCTATTGTTACAAGAGGAAGCCTGACGGATGCGGGTTTTGATCGTTAAAACATCGTCGATGGGCGATGTTATCCATACGTTGCCCGCACTCACTGATGCCCAGCAGGCAATCCCAGGGATTAAGTTTGACTGGGTGGTGgaaga < 1:2059580/148‑1 (MQ=255) aCGCGCTATTGTTACAAGAGGAAGCCTGACGGATGCGGGTTTTGATCGTTAAAACATCGTCGATGGGCGATGTTATCCATACGTTGCCCGCACTCACTGATGCCCAGCAGGCAATCCCAGGGATTAAGTTTGACTGGGTGGTGgaaga > 2:1820512/1‑148 (MQ=255) cgcgCTATTGTTACAAGAGGAAGCCTGACGGATGCGGGTTTTGATCGTTAAAACATCGTCGATGGGCGATGTTATCCATACGTTGCCCGCACTCACTGATGCCCAGCAGGCAATCCCAGGGATTAAGTTTGACTGGGTGGTGgaagaa > 2:2631439/1‑148 (MQ=255) cTATTGTTACAAGAGGAAGCCTGACGGATGCGGGTTTTGATCGTTAAAACATCGTCGATGGGCGATGTTATCCATACGTTGCCCGCACTCACTGATGCCCAGCAGGCAATCCCAGGGATTAAGTTTGACTGGGTGGTGGAAGAAGGGt < 1:3418389/148‑1 (MQ=255) cTATTGTTACAAGAGGAAGCCTGACGGATGCGGGTTTTGATCGTTAAAACATCGTCGATGGGCGATGTTATCCATACGGTGCCCGCACTCACTGATGCCCAGCAGGCAATCCCAGGGATTAAGTTTGACTGGGTGGTGGAAGAAGGGt < 1:3419876/148‑1 (MQ=255) tATTGTTACAAGAGGAAGCCTGACGGATGCGGGTTTTGATCGTTAAAACATCGTCGATGGGCGATGTTATCCATACGTTGCCCGCACTCACTGATGCCCAGCAGGCAATCCCAGGGATTAAGTTTGACTGGGTGGTGGAAGAAGGGtt > 2:2011251/1‑148 (MQ=255) 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aTCGTTAAAACATCGTCGATGGGCGATGTTATCCATAAGTTGCCCGCACTCACTGATGCCCAGCAGGCAATCCCAGGGATTAAGTTTGACTGGGTGGTGGAAGAAGGGTTCGCACAGATTCCTTCCTGGCACGCTGCCGTTGAGCGAg > 2:2591629/1‑148 (MQ=255) cGTTAAAACATCGTCGATGGGCGATGTTATCCATACGTTGCCCGCACTCACTGATGCCCAGCAGGCAATCCCAGGGATTAAGTTTGACTGGGTGGTGGAAGAAGGGTTCGCACAGATTCCTTCCTGGCACGCTGCCGTTGAGCGAGtt < 2:2937934/148‑1 (MQ=255) tAAAACATCGTCGATGGGCGATGTTATCCATACGTTGCCCGCACTCACTGATGCCCAGCAGGCAATCCCAGGGATTAAGTTTGACTGGGTGGTGGAAGAAGGGTTCGCACAGATTCCTTCCTGGCACGCTGCCGTTGAGCGAGTTAtt > 1:994641/1‑148 (MQ=255) tAAAACATCGTCGATGGGCGATGTTATCCATAAGTTGCCCGCACTCACTGATGCCCAGCAGGCAATACCAGGGATTAAGTTTGACTGGGTGGTGGAAGAAGGGTTCGCACAGATTCCTTCCTGGCACGCTGACGTTGAGCGAGTTAtt > 1:1836277/1‑148 (MQ=255) aaaCATCGTCGATGGGCGATGTTATCCATACGTTGCCCGCACTCACTGATGCCCAGCAGGCAATCCCAGGGATTAAGTTTGACTGGGTGGTGGAAGAAGGGTTCGCACAGATTCCTTCCTGGCACGCTGCCGTTGAGCGAGTTATTcc < 2:371627/148‑1 (MQ=255) 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cgATGGGCGATGTTATCCATACGTTGCCCGCACTCACTGATGCCCAGCAGGCAATCCCAGGGATTAAGTTTGACTGGGTGGTGGAAGAAGGGTTCGCACAGATTCCTTCCTGGCACGCTGCCGTTGAGCGAGTTATTCCTGTGGCAAt > 1:1498529/1‑148 (MQ=255) cgATGGGCGATGTTATCCATACGTTGCCCGCACTCACTGATGCCCAGCAGGCAATCCCAGGGATTAAGTTTGACTGGGTGGTGGAAGAAGGGTTCGCACAGATTCCTTCCTGGCACGCTGCCGTTGAGCGAGTTATTCCTGTGGCAAt > 2:400833/1‑148 (MQ=255) cgATGGGCGATGTTATCCATACGTTGCCCGCACTCACTGATGCCCAGCAGGCAATCCCAGGGATTAAGTTTGACTGGGTGGTGGAAGAAGGGTTCGCACAGATTCCTTCCTGGCACGCTGCCGTTGAGCGAGTTATTCCTGTGGCAAt > 2:400834/1‑148 (MQ=255) cgATGGGCGATGTTATCCATACGTTGCCCGCACTCACTGATGCCCAGCAGGCAATCCCAGGGATTAAGTTTGACTGGGTGGTGGAAGAAGGGTTCGCACAGATTCCTTCCTGGCACGCTGCCGTTGAGCGAGTTATTCCTGTGGCAAt > 1:409849/1‑148 (MQ=255) cgATGGGCGATGTTATCCATACGTTGCCCGCACTCACTGATGCCCAGCAGGCAATCCCAGGGATTAAGTTTGACTGGGTGGTGGAAGAAGGGTTCGCACAGATTCCTTCCTGGCACGCTGCCGTTGAGCGAGTTATTCCTGTGGCAAt > 1:1050993/1‑148 (MQ=255) 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tGTTATCCATACGTTGCCCGCACTCACTGATGCCCAGCAGGCAATCCCAGGGATTAAGTTTGACTGGGTGGTGGAAGAAGGGTTCGCACAGATTCCTTCCTGGCACGCTGCCGTTGAGCGAGTTATTCCTGTGGCAATACGTCGCTgg > 1:516061/1‑148 (MQ=255) | AGGTGACGCTGCGGAGGGTTATCACCAGAGCTTAATCGACATTACTCCCCAGCGCGTACTGGAAGAACTCAACGCGCTATTGTTACAAGAGGAAGCCTGACGGATGCGGGTTTTGATCGTTAAAACATCGTCGATGGGCGATGTTCTCCATACGTTGCCCGCACTCACTGATGCCCAGCAGGCAATCCCAGGGATTAAGTTTGACTGGGTGGTGGAAGAAGGGTTCGCACAGATTCCTTCCTGGCACGCTGCCGTTGAGCGAGTTATTCCTGTGGCAATACGTCGCTGG > CP009273/3789236‑3789524 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |