| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 4,173,179 | G→T | 100% | P669P (CCG→CCT) | rpoB → | RNA polymerase, beta subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 4,173,179 | 0 | G | T | 95.5% | 722.4 / 22.8 | 243 | P669P (CCG→CCT) | rpoB | RNA polymerase, beta subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (6/5); new base T (117/115); total (123/120) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.26e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 243 total aligned reads displayed.
AACTTGGATGAAGAAGGCCACTTCGTAGAAGACCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTGGTATGGAACGTGCTGTTGCCGTTGACTCCGGTGTAACTGCGGTAG > CP009273/4173036‑4173324 | aaCTTGGATGAAGAAGGCCACTTCGTAGAAGACCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTcc < 1:3278041/148‑1 (MQ=255) cTTGGATGAAGAAGGCCACTTCGTAGAAGACCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTg > 1:3163784/1‑148 (MQ=255) ggATGAAGAAGGCCACTTCGTAGAAGACCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGaa < 1:3321813/148‑1 (MQ=255) ggATGAAGAAGGCCACTTCGTAGAAGACCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGaa < 2:1810397/148‑1 (MQ=255) ggATGAAGAAGGCCACTTCGTAGAAGACCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGaa < 2:1810211/148‑1 (MQ=255) gATGAAGAAGGCCACTTCGTAGAAGACCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAac < 1:1653209/148‑1 (MQ=255) tGAAGAAGGCCACTTCGTAGAAGACCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAacac > 1:1846153/1‑148 (MQ=255) gaagaaGGCCACTTCGTAGAAGACCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACg > 2:3306516/1‑148 (MQ=255) agaagGCCACTTCGTAGAAGACCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGAt < 1:168204/148‑1 (MQ=255) aagGCCACTTCGTAGAAGACCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGa < 1:1567055/148‑1 (MQ=255) aagGCCACTTCGTAGAAGACCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGa > 2:74168/1‑148 (MQ=255) aagGCCACTTCGTAGAAGACCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGa > 1:2394631/1‑148 (MQ=255) agGCCACTTCGTAGAAGACCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGAc > 1:13137/1‑148 (MQ=255) tAGAAGACCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGc > 2:2603905/1‑148 (MQ=255) agaagaCCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCa < 1:1888806/148‑1 (MQ=255) agaagaCCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCa < 2:1574260/148‑1 (MQ=255) agaagaCCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCa > 2:1501183/1‑148 (MQ=255) agaagaCCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGAAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCa < 2:22872/148‑1 (MQ=255) gaagaCCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCAt > 2:249073/1‑148 (MQ=255) gaagaCCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCAt > 2:248792/1‑148 (MQ=255) gaagaCCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCAt > 2:337569/1‑148 (MQ=255) gaagaCCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCAt > 2:881455/1‑148 (MQ=255) aagaCCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCAtt > 1:2424493/1‑148 (MQ=255) gaCCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGa < 1:561768/148‑1 (MQ=255) aCCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGAt > 2:841470/1‑148 (MQ=255) ccTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATg < 1:291337/148‑1 (MQ=255) cTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATgg > 2:3431022/1‑148 (MQ=255) ggTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGt > 1:251915/1‑148 (MQ=255) gTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTg < 2:562014/148‑1 (MQ=255) tAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGc < 1:986227/148‑1 (MQ=255) aCTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGa < 2:1895413/148‑1 (MQ=255) aCTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGa < 2:3112425/148‑1 (MQ=255) ttGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAAc > 2:480601/1‑148 (MQ=255) ttGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAAc < 1:914538/148‑1 (MQ=255) tGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGACCa > 2:1076020/1‑148 (MQ=255) gTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCa < 2:581325/148‑1 (MQ=255) aGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAAc > 1:2108832/1‑148 (MQ=255) gCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACg > 2:3384080/1‑148 (MQ=255) cAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGt > 1:379166/1‑148 (MQ=255) aaaGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTc > 2:3035374/1‑148 (MQ=255) aaaGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTc < 2:1292141/148‑1 (MQ=255) aaGGAGAATCCATCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCAGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCa < 2:3095756/148‑1 (MQ=255) aGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAg < 1:2174705/148‑1 (MQ=255) aGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAg > 1:842105/1‑148 (MQ=255) ggCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGTGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAgg > 2:2398202/1‑148 (MQ=255) ggCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAgg > 2:757788/1‑148 (MQ=255) gCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGc > 1:486990/1‑148 (MQ=255) cAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCg > 1:2153448/1‑148 (MQ=255) aGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGa < 1:2159809/148‑1 (MQ=255) cTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGAct < 1:1035628/148‑1 (MQ=255) gCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTgcgcgc < 1:2828459/148‑1 (MQ=255) gCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGGGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTgcgcgc < 2:469022/148‑1 (MQ=255) cgcgACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTg < 2:2400422/148‑1 (MQ=255) gcgACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGa < 1:2327891/148‑1 (MQ=255) cgACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGAt > 2:667798/1‑148 (MQ=255) cgACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGAt > 2:2450863/1‑148 (MQ=255) ccAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAg > 2:3492069/1‑148 (MQ=255) gTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCTTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGc < 2:1004354/148‑1 (MQ=255) gTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCTTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGc < 2:2780611/148‑1 (MQ=255) 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aCATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCtggttgg > 2:2436361/1‑148 (MQ=255) cATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCtggttggt < 1:820383/148‑1 (MQ=255) cATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCtggttggt < 1:2603905/148‑1 (MQ=255) aTGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTa > 1:2640023/1‑148 (MQ=255) ggACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACt > 1:2753010/1‑148 (MQ=255) 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ggtggtATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTGGTATGGAACGTGCTGtt > 2:3530868/1‑148 (MQ=255) tggtATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTGGTATGGAACGTGCTGTTGc > 2:272000/1‑148 (MQ=255) gtATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTGGTATGGAACGTGCTGTTGCCg < 2:40215/148‑1 (MQ=255) tATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTGGTATGGAACGTGCTGTTGCCGt < 1:249144/148‑1 (MQ=255) tATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTGGTATGGAACGTGCTGTTGCCGt < 1:248792/148‑1 (MQ=255) 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tCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTGGTATGGAACGTGCTGTTGCCGTTGACTCCGGTGTAACTGCGGt > 1:1215532/1‑148 (MQ=255) | AACTTGGATGAAGAAGGCCACTTCGTAGAAGACCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTGGTATGGAACGTGCTGTTGCCGTTGACTCCGGTGTAACTGCGGTAG > CP009273/4173036‑4173324 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |