| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 4,207,552 | G→T | 100% | M172I (ATG→ATT) | aceA → | isocitrate lyase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 4,207,552 | 0 | G | T | 98.8% | 575.5 / ‑1.7 | 180 | M172I (ATG→ATT) | aceA | isocitrate lyase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/2); new base T (84/93); total (85/95) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 183 total aligned reads displayed.
TCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATGAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTGGTCGCGGCGCGTCTGGCAGCT > CP009273/4207407‑4207696 | caacaaCACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTaaa > 2:2227644/1‑148 (MQ=255) aacaacACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAg < 1:1065107/148‑1 (MQ=255) caacaCCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCg < 2:404028/148‑1 (MQ=255) aacaCCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCga > 1:1494625/1‑148 (MQ=255) cacCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCgatg > 1:899656/1‑148 (MQ=255) cTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGAtt > 1:1102444/1‑148 (MQ=255) cTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGAtt < 1:2563382/148‑1 (MQ=255) cTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGAtt < 1:2117214/148‑1 (MQ=255) ttCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTg < 1:342065/148‑1 (MQ=255) ccGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGaa > 1:425012/1‑148 (MQ=255) ccGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGaa < 1:2734728/148‑1 (MQ=255) ccGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGaa > 1:1365011/1‑148 (MQ=255) ccGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGaa < 2:3048650/148‑1 (MQ=255) tcgtGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGcc > 2:1480999/1‑148 (MQ=255) tcgtGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGcc < 2:384987/148‑1 (MQ=255) ccGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGc > 1:3464949/1‑148 (MQ=255) gATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAg < 2:2052550/148‑1 (MQ=255) tCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCg > 2:2565940/1‑148 (MQ=255) gATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCa < 2:2687268/148‑1 (MQ=255) ccAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGtt < 1:1255158/148‑1 (MQ=255) ccAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGtt < 2:2605640/148‑1 (MQ=255) aaTGGGCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGTAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCa < 2:3156050/148‑1 (MQ=255) aTGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCAc > 1:1350939/1‑148 (MQ=255) tGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACt < 2:1640379/148‑1 (MQ=255) gTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTc > 2:2296770/1‑148 (MQ=255) cgGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCCCCAGTTCACTTCGAAGa > 1:653119/1‑148 (MQ=255) gggCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGAt < 1:1007662/148‑1 (MQ=255) ggCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATc < 1:2184561/148‑1 (MQ=255) ggCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATc < 2:634507/148‑1 (MQ=255) cATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAg < 2:1103965/148‑1 (MQ=255) ttGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCt < 1:855082/148‑1 (MQ=255) tGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTg > 2:196148/1‑148 (MQ=255) aTCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTgaa > 1:1965513/1‑148 (MQ=255) tCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTgaag > 1:2397556/1‑148 (MQ=255) ccGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTgaaga > 1:3106358/1‑148 (MQ=255) tATGTCGATTACTTACTGCCGATCGTTTCCCATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAAATGATTAAAGCGATGATTGAATCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGAACAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCg > 1:2839898/1‑148 (MQ=255) aTGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCgg < 1:2103279/148‑1 (MQ=255) aTGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCgg < 2:3106358/148‑1 (MQ=255) aTGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCgg > 1:2561570/1‑148 (MQ=255) gTCGATTACTTCCCGCCGAGCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTc < 2:2902323/148‑1 (MQ=255) gATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTcaca < 2:645003/148‑1 (MQ=255) gATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTcaca > 2:2987172/1‑148 (MQ=255) aTTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACAt < 2:2057762/148‑1 (MQ=255) aCTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATggg < 2:2753764/148‑1 (MQ=255) tGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCaa > 2:2371412/1‑148 (MQ=255) ccGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAg < 1:945563/148‑1 (MQ=255) ccGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAg < 2:1664809/148‑1 (MQ=255) gATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGtt > 2:3006046/1‑148 (MQ=255) aTCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGttt > 2:673178/1‑148 (MQ=255) tCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTTCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGtttt > 1:1544071/1‑148 (MQ=255) tCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGtttt > 1:712195/1‑148 (MQ=255) cGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTa < 2:1835299/148‑1 (MQ=255) cGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTa > 2:979472/1‑148 (MQ=255) cGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTa < 2:1168066/148‑1 (MQ=255) gTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAg < 2:1401405/148‑1 (MQ=255) tGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTcaca > 2:569784/1‑128 (MQ=255) tGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTcaca < 1:569784/128‑1 (MQ=255) tGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTg > 1:3170495/1‑148 (MQ=255) tGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTg > 1:2708656/1‑148 (MQ=255) tGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTg > 1:2708543/1‑148 (MQ=255) tGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTg > 1:1845927/1‑148 (MQ=255) aTGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAAc > 2:1090600/1‑148 (MQ=255) aTGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAAc > 2:469447/1‑148 (MQ=255) aTGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAAc > 2:1090744/1‑148 (MQ=255) gCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTc < 2:757708/148‑1 (MQ=255) cGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCa > 1:732356/1‑148 (MQ=255) cGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCa < 2:425012/148‑1 (MQ=255) cGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCa < 1:3357506/148‑1 (MQ=255) cGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCa < 2:1365011/148‑1 (MQ=255) cGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCa < 2:1365010/148‑1 (MQ=255) gAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAgg > 2:3395961/1‑148 (MQ=255) aaGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGa < 2:438994/148‑1 (MQ=255) aaGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGa < 2:438986/148‑1 (MQ=255) aaGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATGAAAGCTATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGa < 2:2160785/148‑1 (MQ=255) gCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAg > 1:1114122/1‑148 (MQ=255) ggTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTa < 1:979472/148‑1 (MQ=255) ttttGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACGTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCtctg > 2:3396950/1‑145 (MQ=255) tttGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTc < 2:93941/148‑1 (MQ=255) tttGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTc < 2:2704271/148‑1 (MQ=255) cGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGaaa > 2:1799594/1‑148 (MQ=255) cGGTGTCCTGAATGACTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGaaa < 2:3301489/148‑1 (MQ=255) gtgtCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACt > 1:3283517/1‑148 (MQ=255) tgtCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTg < 2:2887872/148‑1 (MQ=255) tgtCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTg > 1:2703620/1‑148 (MQ=255) tgtCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTg < 2:1015070/148‑1 (MQ=255) tgtCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAAATg > 2:90659/1‑148 (MQ=255) tCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTGGt < 1:2857369/148‑1 (MQ=255) tCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTGGt < 2:13077/148‑1 (MQ=255) tGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTGGTcgc > 1:1257784/1‑148 (MQ=255) cTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTGGTCGCGGCGCGt > 1:2239182/1‑148 (MQ=255) cTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTGGTCGCGGCGCGt < 1:1702518/148‑1 (MQ=255) cTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTGGTCGCGGCGCGt > 1:3239785/1‑148 (MQ=255) cTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTGGTCGCGGCGCGt > 2:2808358/1‑148 (MQ=255) ttGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTGGTCGCGGCGCGTCt > 1:621991/1‑148 (MQ=255) ttGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTGGTCGCGGCGCGTCt > 1:2266127/1‑148 (MQ=255) gAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTGGTCGCGGCGCGTCTgg < 2:608075/148‑1 (MQ=255) gAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTGGTCGCGGCGCGTCTgg < 2:1201263/148‑1 (MQ=255) cTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTGGTCGCGGCGCGTCTGGCAg < 2:3464949/148‑1 (MQ=255) cTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTGGTCGCGGCGCGTCTGGCAg > 1:1220848/1‑148 (MQ=255) gattaAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTGGTCGCGGCGCGTCTGGCAGCt > 2:222322/1‑148 (MQ=255) | TCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATGAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTGGTCGCGGCGCGTCTGGCAGCT > CP009273/4207407‑4207696 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |