| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 329,372 | A→T | 100% | L258Q (CTG→CAG) | yahB ← | putative DNA‑bindng transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 329,372 | 0 | A | T | 95.5% | 710.3 / 16.7 | 223 | L258Q (CTG→CAG) | yahB | putative DNA‑bindng transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (8/2); new base T (131/82); total (139/84) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.26e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 225 total aligned reads displayed.
GTAAATCCTGATAGATCCCCGTTAATATGCCATTTGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCAGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGACATTTGGTGTTGAAATCTGGCACCAGAATTGACTCCTGCCCGTGCAGCAACCAGCCCACTTTTTTA > CP009273/329229‑329515 | tAAATCCTGATAGATCCCCGTTAATATGCCATTTGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAgg > 2:1076655/1‑148 (MQ=255) tAAATCCTGATAGATCCCCGTTAATATGCCATTTGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAgg > 1:375040/1‑148 (MQ=255) tAAATCCTGATAGATCCCCGTTAATATGCCATTTGGCGCAAATTGTTGTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGCGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGGAACCTGCAgg > 2:3038346/1‑148 (MQ=255) aaaTCCTGATAGATCCCCGTTAATATGCCATTTGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGACTCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAggg > 2:2262472/1‑148 (MQ=255) aaaTCCTGATAGATCCCCGTTAATATGCCATTTGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAggg > 1:416605/1‑148 (MQ=255) aTCCTGATAGATCCCCGTTAATATGCCATTTGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGAt > 2:1788732/1‑148 (MQ=255) aTCCTGATAGATCCCCGTTAATATGCCATTTGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGAt > 2:600977/1‑148 (MQ=255) ccTGATAGATCCCCGTTAATATGCCATTTGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTg > 2:3023548/1‑148 (MQ=255) ccTGATAGATCCCCGTTAATATGCCATTTGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTg > 2:3023560/1‑148 (MQ=255) gATAGATCCCCGTTAATATGCCATTTGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGt < 2:1375767/148‑1 (MQ=255) gATAGATCCCCGTTAATATGCCATTTGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGt > 1:2064230/1‑148 (MQ=255) aTAGATCCCCGTTAATATGCCATTTGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTc > 2:761197/1‑148 (MQ=255) aTAGATCCCCGTTAATATGCCATTTGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTc > 2:2061514/1‑148 (MQ=255) aTAGATCCCCGTTAATATGCCATTTGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTc > 2:2380151/1‑148 (MQ=255) tAGATCCCCGTTAATATGCCATTTGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCa > 2:2800382/1‑148 (MQ=255) aGATCCCCGTTAATATGCCATTTGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCAt < 2:2162050/148‑1 (MQ=255) aTCCCCGTTAATATGCCATTTGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCg > 1:2959888/1‑148 (MQ=255) tCCCCGTTAATATGCCATTTGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGc < 1:1490863/148‑1 (MQ=255) ccGTTAATATGCCATTTGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTc > 2:2692487/1‑148 (MQ=255) gTTAATATGCCATTTGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCAc > 2:2669566/1‑148 (MQ=255) gTTAATATGCCATTTGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCAc > 1:3162878/1‑148 (MQ=255) ttAATATGCCATTTGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACg > 1:487227/1‑148 (MQ=255) tAATATGCCATTTGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACgg > 1:3441278/1‑148 (MQ=255) atatGCCATTTGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGAc > 2:3275897/1‑148 (MQ=255) atatGCCATTTGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGAc > 1:3532637/1‑148 (MQ=255) tatGCCATTTGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCAGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGAcc > 1:903699/1‑148 (MQ=255) atGCCATTTGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCa > 2:1250936/1‑148 (MQ=255) gCCATTTGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATg > 1:2452841/1‑148 (MQ=255) cATTTGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTa > 2:3424815/1‑148 (MQ=255) cATTTGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTa < 1:490626/148‑1 (MQ=255) tttGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAAt < 1:3554931/148‑1 (MQ=255) ttGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATc > 1:2721757/1‑148 (MQ=255) tGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATcc < 1:2004162/148‑1 (MQ=255) ttGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCaaaaaa < 2:2966400/148‑1 (MQ=255) tGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAAc > 2:73263/1‑148 (MQ=255) tGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAAc < 2:1626049/148‑1 (MQ=255) tttttAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGACTCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCaa > 2:684809/1‑148 (MQ=255) tttttAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCaa > 2:611941/1‑148 (MQ=255) ttAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTc > 1:91752/1‑148 (MQ=255) ttAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTc > 1:92523/1‑148 (MQ=255) tAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTcc > 2:248513/1‑148 (MQ=255) aTCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCtt > 2:2142275/1‑148 (MQ=255) tCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTc < 1:1962654/148‑1 (MQ=255) tCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCAGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTc > 2:754413/1‑148 (MQ=255) cACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCAc > 1:1746697/1‑148 (MQ=255) cACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCAc > 1:983689/1‑148 (MQ=255) tGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTa > 1:844957/1‑148 (MQ=255) tGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTa > 1:3392581/1‑148 (MQ=255) tGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTa > 2:54989/1‑148 (MQ=255) gCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTaa < 2:2337427/148‑1 (MQ=255) gTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTaaaa < 1:1211754/148‑1 (MQ=255) tCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCAGGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAAt > 2:2853889/1‑148 (MQ=255) aCCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCt < 2:1864182/148‑1 (MQ=255) aCCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCt < 2:2732514/148‑1 (MQ=255) ccTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTg < 1:3426574/148‑1 (MQ=255) ccTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTg < 2:2308106/148‑1 (MQ=255) cTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTgg > 2:257717/1‑148 (MQ=255) gACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGTCCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCa > 2:40317/1‑148 (MQ=255) ccGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTg < 2:2218257/148‑1 (MQ=255) tAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGACa > 1:1548175/1‑148 (MQ=255) tAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGACa > 1:3308043/1‑148 (MQ=255) aGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGACAt < 2:3532637/148‑1 (MQ=255) gCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGACAtt > 2:3286859/1‑148 (MQ=255) cAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGACAttt < 2:755563/148‑1 (MQ=255) cAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGACAttt > 2:1445489/1‑148 (MQ=255) aaTGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGACATTTGgt > 2:1592968/1‑148 (MQ=255) aaTGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGACATTTGgt < 1:1834417/148‑1 (MQ=255) aTGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGACATTTGgtg < 2:3324960/148‑1 (MQ=255) gCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTACCCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGACATTTGGTGtt > 2:631665/1‑148 (MQ=255) gCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGACATTTGGTGtt < 1:189674/148‑1 (MQ=255) aGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGACATTTGGTGTTGaaa > 1:364693/1‑148 (MQ=255) aGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGACATTTGGTGTTGaaa < 1:2800382/148‑1 (MQ=255) gTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGACATTTGGTGTTGAAAt > 1:208450/1‑148 (MQ=255) gCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGACATTTGGTGTTGAAATCTg < 2:3459731/148‑1 (MQ=255) 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ccTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGACATTTGGTGTTGAAATCTGGCACCAGAATTGACTCCTg < 2:375040/148‑1 (MQ=255) ggCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGACATTTGGTGTTGAAATCTGGCACCAGAATTGACTCCTGccc > 2:2030548/1‑148 (MQ=255) aTTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGACATTTGGTGTTGAAATCTGGCACCAGAATTGACTCCTGCCCGTgcagc > 1:2816546/1‑148 (MQ=255) tATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGACATTTGGTGTTGAAATCTGGCACCAGAATTGACTCCTGCCCGTGCAGCaa > 1:1826735/1‑148 (MQ=255) tATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGACATTTGGTGTTGAAATCTGGCACCAGAATTGACTCCTGCCCGTGCAGCaa < 2:827684/148‑1 (MQ=255) 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tCGTGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGACATTTGGTGTTGAAATCTGGCACCAGAATTGACTCCTGCCCGTGCAGCAACCAGCCCACt < 1:1263796/148‑1 (MQ=255) cGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGACATTTGGTGTTGAAATCTGGCACCAGAATTGACTCCTGCCCGTGCAGCAACCAGCCCACtt < 2:190378/148‑1 (MQ=255) ggTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGACATTTGGTGTTGAAATCTGGCACCAGAATTGACTCCTGCCCGTGCAGCAACCAGCCCACtttt < 1:1076655/148‑1 (MQ=255) ggTAACCAGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAATAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGACATTTGGTGTTGAAATCTGGCACCAGAATTGACTCCTGCCCGTGCAGCAACCAGCCCACtttt > 1:3090288/1‑148 (MQ=255) tAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGACATTTGGTGTTGAAATCTGGCACCAGAATTGACTCCTGCCCGTGCAGCAACCAGCCCACtttttt > 1:1925970/1‑148 (MQ=255) tAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGACATTTGGTGTTGAAATCTGGCACCAGAATTGACTCCTGCCCGTGCAGCAACCAGCCCACtttttt > 1:2590479/1‑148 (MQ=255) | GTAAATCCTGATAGATCCCCGTTAATATGCCATTTGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCAGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGACATTTGGTGTTGAAATCTGGCACCAGAATTGACTCCTGCCCGTGCAGCAACCAGCCCACTTTTTTA > CP009273/329229‑329515 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |