Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 4,245,537 | G→T | 91.4% | N286K (AAC→AAA) | plsB ← | glycerol‑3‑phosphate O‑acyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 4,245,537 | 0 | G | T | 91.4% | 526.3 / 43.3 | 199 | N286K (AAC→AAA) | plsB | glycerol‑3‑phosphate O‑acyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (9/8); new base T (67/115); total (76/123) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.02e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.93e-01 |
Only 100 of 203 total aligned reads displayed.
GGTTGATCCCGGCGGCGATATGCGGCGGCACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTCTGCTGCGCTTTTTCATGGGAGATT > CP009273/4245392‑4245681 | ggTTGATCCCGGCGGCGATATGCGGCGGCACCAGCCCCTGGTTATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCttt < 2:810620/148‑1 (MQ=255) ggTTGATCCCGGCGGCGATATGCGGCGGCACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCttt > 2:2887703/1‑148 (MQ=255) ttGATCCCGGCGGCGATATGCGGCGGCACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTAt < 2:2433909/148‑1 (MQ=255) tGATCCCGGCGGCGATATGCGGCGGCACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATg > 1:386502/1‑148 (MQ=255) gATCCCGGCGGCGATATGCGGCGGCACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATgg < 2:2345945/148‑1 (MQ=255) gATCCCGGCGGCGATATGCGGCGGCACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATgg < 1:84356/148‑1 (MQ=255) aTCCCGGCGGCGATATGCGGCGGCACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGa < 1:3427421/148‑1 (MQ=255) aTCCCGGCGGCGATATGCGGCGGCACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGa < 2:3414938/148‑1 (MQ=255) ggcggcGATATGCGGCGGCACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTg < 1:3324191/148‑1 (MQ=255) gcgATATGCGGCGGCACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGc > 1:391646/1‑148 (MQ=255) cgATATGCGGCGGCACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGcg < 1:2841373/148‑2 (MQ=255) atatGCGGCGGCACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCt < 2:2614201/148‑1 (MQ=255) atatGCGGCGGCACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCt < 2:2812572/148‑1 (MQ=255) atatGCGGCGGCACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCt > 1:2548359/1‑148 (MQ=255) tatGCGGCGGCACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTg < 2:1288123/148‑1 (MQ=255) cggcggCACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCGAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTaa < 2:2255764/148‑1 (MQ=255) ggcggcACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTaaa < 2:1908844/148‑1 (MQ=255) gcACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCg < 1:3089811/148‑1 (MQ=255) cACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCgg > 2:1621402/1‑148 (MQ=255) cACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCAAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCgg < 2:2619646/148‑1 (MQ=255) aGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTcc < 1:1918855/148‑1 (MQ=255) gCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCa < 2:1391383/148‑1 (MQ=255) gCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCa < 2:1091622/148‑1 (MQ=255) ccccTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAg > 1:844427/1‑148 (MQ=255) cTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTg < 1:3151878/148‑1 (MQ=255) tGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCatgctc > 1:1405953/1‑143 (MQ=255) tGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGa < 2:482829/148‑1 (MQ=255) gTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAg > 1:1251317/1‑148 (MQ=255) gATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGcc > 1:1690977/1‑148 (MQ=255) gATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGcc > 1:2440289/1‑148 (MQ=255) aTACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGccc < 1:3139749/148‑1 (MQ=255) aCAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAg > 1:1146494/1‑148 (MQ=255) cAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCTTGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGa < 2:408489/148‑1 (MQ=255) aGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGaa < 1:2906917/148‑1 (MQ=255) cACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATa < 1:3480144/148‑1 (MQ=255) aCGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATAc < 2:1865999/148‑1 (MQ=255) aaGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGgtc < 1:1911216/148‑1 (MQ=255) gAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGgtcag > 1:157941/1‑148 (MQ=255) cagcagGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAgg < 2:2556383/148‑1 (MQ=255) ggTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAat < 2:1545129/148‑1 (MQ=255) tAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAatca < 2:1636588/148‑1 (MQ=255) tAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAatca < 1:3455937/148‑1 (MQ=255) tAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAatca < 1:2216409/148‑1 (MQ=255) aGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAatcat < 1:682203/148‑1 (MQ=255) tCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCAtct > 1:361054/1‑148 (MQ=255) aTGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGt > 2:3503901/1‑148 (MQ=255) tgtgACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTa > 2:3297615/1‑148 (MQ=255) aCTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAagag < 1:268217/148‑1 (MQ=255) cTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAgaga > 2:2999515/1‑148 (MQ=255) tGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGaa < 1:2755382/148‑1 (MQ=255) tGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGaa < 1:2755606/148‑1 (MQ=255) cGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAAt < 2:232193/148‑1 (MQ=255) cGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAAt < 1:2314756/148‑1 (MQ=255) ggTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAAtt < 2:14221/148‑1 (MQ=255) tGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTcg < 1:2439474/148‑1 (MQ=255) aGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCa < 2:2291888/148‑1 (MQ=255) aGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCa < 2:2273364/148‑1 (MQ=255) gCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAAt > 1:1470253/1‑148 (MQ=255) gCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAAt < 2:2979796/148‑1 (MQ=255) gCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAAt > 1:87106/1‑148 (MQ=255) gCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAAt > 2:1386623/1‑148 (MQ=255) caTATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAAtctc < 1:2660528/148‑1 (MQ=255) caTATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAAtctc > 1:2174976/1‑148 (MQ=255) tataCCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCtt > 2:2896613/1‑148 (MQ=255) ataCCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTc < 2:1323597/148‑1 (MQ=255) ataCCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTc > 1:2656652/1‑148 (MQ=255) cAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATc < 1:3244571/148‑1 (MQ=255) aGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCa < 2:1212891/148‑1 (MQ=255) gCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAg < 2:386502/148‑1 (MQ=255) gCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAg < 2:380895/148‑1 (MQ=255) cTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGt > 1:2625308/1‑148 (MQ=255) tCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAGGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTg > 2:3060780/1‑148 (MQ=255) tCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTg < 1:722902/148‑1 (MQ=255) tGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCaa < 2:2382929/148‑1 (MQ=255) tGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCaa < 2:2832776/148‑1 (MQ=255) tGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCaa < 1:2533927/148‑1 (MQ=255) gACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAAt > 1:1320157/1‑148 (MQ=255) gACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAAt < 1:2225081/148‑1 (MQ=255) gACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAAt < 1:2942971/148‑1 (MQ=255) gACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAAt < 2:2987825/148‑1 (MQ=255) gtcgtGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATcgcg < 2:3382091/148‑1 (MQ=255) tcgtGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGt < 1:229028/148‑1 (MQ=255) cgtGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGtt > 1:3001574/1‑148 (MQ=255) ggCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTctgc < 1:3073506/148‑1 (MQ=255) cTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTCTGCTGCGCt > 1:3367048/1‑148 (MQ=255) gAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTCTGCTGCGCTTTTTc < 2:2332641/148‑1 (MQ=255) aaCGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTCTGCTGCGCTTTTTCa < 2:2637004/148‑1 (MQ=255) aCGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTCTGCGGCGCTTTTTCAt > 1:2325072/1‑148 (MQ=255) cgcgCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTCTGCTGCGCTTTTTCATg > 1:1085694/1‑148 (MQ=255) cgcTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTCTGCTGCGCTTTTTCATggg > 2:1957381/1‑148 (MQ=255) cgcTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTCTGCTGCGCTTTTTCATggg < 1:3422642/148‑1 (MQ=255) cTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTCTGCTGCGCTTTTTCATGGgag > 2:94562/1‑148 (MQ=255) tCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTCTGCTGCGCTTTTTCATGGgaga > 1:492629/1‑148 (MQ=255) tCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTCTGCTGCGCTTTTTCATGGgaga > 1:3060941/1‑148 (MQ=255) cAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTCTGCTGCGCTTTTTCATGGGAGAt < 1:1870234/148‑1 (MQ=255) cAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTCTGCTGCGCTTTTTCATGGGAGAt > 2:2122962/1‑148 (MQ=255) cAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTCTGCTGCGCTTTTTCATGGGAGAt > 2:2121634/1‑148 (MQ=255) cAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTCTGCTGCGCTTTTTCATGGGAGAt < 2:1718010/148‑1 (MQ=255) cAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTCTGCTGCGCTTTTTCATGGGAGAt < 1:804477/148‑1 (MQ=255) cAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTCTGCTGCGCTTTTTCATGGGAGAt < 2:943216/148‑1 (MQ=255) | GGTTGATCCCGGCGGCGATATGCGGCGGCACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTCTGCTGCGCTTTTTCATGGGAGATT > CP009273/4245392‑4245681 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |