Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 4,249,117 | G→T | 100% | intergenic (+68/‑48) | dinF → / → yjbJ | oxidative stress resistance protein; putative MATE family efflux pump; UV and mitomycin C inducible protein/stress‑induced protein, UPF0337 family |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 4,249,117 | 0 | G | T | 98.4% | 604.5 / ‑0.8 | 188 | intergenic (+68/‑48) | dinF/yjbJ | oxidative stress resistance protein; putative MATE family efflux pump; UV and mitomycin C inducible protein/stress‑induced protein, UPF0337 family |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (2/1); new base T (97/88); total (99/89) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 191 total aligned reads displayed.
TGGCGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATGGGGCAAACTGACCGATGATGATATGACGATCATTG > CP009273/4248973‑4249261 | tGGCGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATaaa > 1:368346/1‑148 (MQ=255) ggCGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATaaaa < 1:2496618/148‑1 (MQ=255) gCGTTGCTCGGGCTTTCTGTGGCTGCTATCTTGCGGCGTGACTGTCTCTATGGTACCTGGTTTGCCGCATCGTTACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAATTTGCTGAATAAACTTTATCTCACTTTCAGATTAAAAg < 2:751397/148‑1 (MQ=255) ttGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGa < 1:589560/148‑1 (MQ=255) ttGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGa < 1:1777347/148‑1 (MQ=255) ttGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGa < 2:560716/148‑1 (MQ=255) tttCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACtctc < 1:757067/148‑1 (MQ=255) tttCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACtctc < 2:1706177/148‑1 (MQ=255) tttCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACtctc > 2:1370473/1‑148 (MQ=255) ttCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCa > 2:3153380/1‑148 (MQ=255) tctcTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCAt < 2:3006415/148‑1 (MQ=255) tctGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTc < 2:2278010/148‑1 (MQ=255) tctGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTc < 2:2277722/148‑1 (MQ=255) ctGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTca > 2:3469579/1‑148 (MQ=255) tGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTcac > 1:3467759/1‑148 (MQ=255) ggcTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAAcc < 2:948030/148‑1 (MQ=255) cTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTa < 1:808687/148‑1 (MQ=255) cTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTa < 2:2610184/148‑1 (MQ=255) tATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTaa < 1:2702831/148‑1 (MQ=255) cTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGa > 2:3060408/1‑148 (MQ=255) tGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGAt < 1:674567/148‑1 (MQ=255) ggcggcGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATg < 1:2801964/148‑1 (MQ=255) gcggcgTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGa < 1:2536031/148‑1 (MQ=255) ggcgTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAgg > 2:1528455/1‑148 (MQ=255) cACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTg > 1:3500920/1‑148 (MQ=255) cACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTg > 1:1678901/1‑148 (MQ=255) cTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGAt > 1:589647/1‑148 (MQ=255) gcgcAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTAt < 2:412620/148‑1 (MQ=255) cAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGaa < 2:2109185/148‑1 (MQ=255) cAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGaa > 1:2732575/1‑148 (MQ=255) cAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGaa < 2:606799/148‑1 (MQ=255) aTGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATa > 1:1209850/1‑148 (MQ=255) aTGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATa > 1:1212123/1‑148 (MQ=255) ccTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATg < 2:2834896/148‑1 (MQ=255) ccTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATg < 2:1879658/148‑1 (MQ=255) ccTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATg > 2:1040795/1‑148 (MQ=255) cTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGa > 1:2080785/1‑148 (MQ=255) tGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGaa > 1:1821987/1‑148 (MQ=255) ggTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAg < 2:1964408/148‑1 (MQ=255) gTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGc < 1:979151/148‑1 (MQ=255) ttGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCcg > 1:2388051/1‑148 (MQ=255) ccGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTACTCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCcggcg < 1:2604301/148‑1 (MQ=255) cGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCcggcgg < 1:2168205/148‑1 (MQ=255) cAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTa < 2:2513957/148‑1 (MQ=255) cAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTa < 2:1980732/148‑1 (MQ=255) cAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGAATACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCAAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATTAAGCcggagtaa > 1:3246310/1‑143 (MQ=255) cGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGaaa > 2:1830399/1‑148 (MQ=255) ttAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAg > 2:193035/1‑148 (MQ=255) tAAAAATTCTGAATAAATAATCCTACGCCAACTTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTGGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGt < 2:2720561/148‑1 (MQ=255) tAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGt > 2:480186/1‑148 (MQ=255) aaaTTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTa < 2:1700834/148‑1 (MQ=255) ttCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGACGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAg > 2:224641/1‑148 (MQ=255) tCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAgg < 1:1590875/148‑1 (MQ=255) gAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGACGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTaa > 2:2216252/1‑148 (MQ=255) gAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTaa > 2:2780131/1‑148 (MQ=255) aataaataATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTaaa > 1:3061017/1‑148 (MQ=255) ataaataaTCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAg > 1:1073312/1‑148 (MQ=255) aaataaTCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTg > 1:3446185/1‑148 (MQ=255) ataatCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGaa > 2:1597886/1‑148 (MQ=255) ataatCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGaa > 2:1139960/1‑148 (MQ=255) taatCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGaaa < 2:717495/148‑1 (MQ=255) atCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAaga > 1:1877710/1‑148 (MQ=255) atCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAaga > 1:614298/1‑148 (MQ=255) tCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAagag > 2:3250750/1‑148 (MQ=255) ccTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGc > 2:135480/1‑148 (MQ=255) ccTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGc > 2:3543622/1‑148 (MQ=255) ccTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGc > 1:1636864/1‑148 (MQ=255) ccTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGc > 2:388902/1‑148 (MQ=255) cTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCa > 2:2926493/1‑148 (MQ=255) aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAAt > 2:848747/1‑148 (MQ=255) gCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATgg < 1:360476/148‑1 (MQ=255) aaaTTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATGGGGc < 2:2753672/148‑1 (MQ=255) aaaTTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATGGGGc > 1:2624481/1‑148 (MQ=255) aaTTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATGGGGCa > 2:1204932/1‑148 (MQ=255) aTTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATGGGGCaa < 2:1212072/148‑1 (MQ=255) aTTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATGGGGCaa > 2:2604955/1‑148 (MQ=255) aTTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATGGGGCaa > 2:1692511/1‑148 (MQ=255) ttGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATGGGGCaaa > 2:693977/1‑148 (MQ=255) ttGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATGGGGCaaa < 1:2913970/148‑1 (MQ=255) tGCTGACTACACTTACTCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATGGGGCAAAc < 2:1252014/148‑1 (MQ=255) tGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATGGGGCAAAc < 2:1251966/148‑1 (MQ=255) tGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATGGGGCAAACTGa > 2:2455593/1‑148 (MQ=255) cTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGACGCCGTCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATGGGGCAAACTGACCg > 2:2942744/1‑148 (MQ=255) acacTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATGGGGCAAACTGACCgat > 1:1015185/1‑148 (MQ=255) cacTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATGGGGCAAACTGACCgatg < 1:193035/148‑1 (MQ=255) cacTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATGGGGCAAACTGACCgatg < 1:193899/148‑1 (MQ=255) acTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATGGGGCAAACTGACCgatga > 1:463951/1‑148 (MQ=255) aTCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATGGGGCAAACTGACCGATGATGata < 2:379650/148‑1 (MQ=255) aTCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATGGGGCAAACTGACCGATGATGata < 2:410977/148‑1 (MQ=255) aTCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATGGGGCAAACTGACCGATGATGata < 2:1015185/148‑1 (MQ=255) aTCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATGGGGCAAACTGACCGATGATGata < 2:3320317/148‑1 (MQ=255) cGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATGGGGCAAACTGACCGATGATGATATGACGa > 1:3312256/1‑148 (MQ=255) tCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATGGGGCAAACTGACCGATGATGATATGACGATCa < 2:652391/148‑1 (MQ=255) tCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATGGGGCAAACTGACCGATGATGATATGACGATCa > 2:2416660/1‑148 (MQ=255) tCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATGGGGCAAACTGACCGATGATGATATGACGATCa > 2:72971/1‑148 (MQ=255) tCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGAAATGGGGCAAACTGACCGATGATGATATTACGATCa > 1:1290319/1‑148 (MQ=255) cAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATGGGGCAAACTGACCGATGATGATATGACGATCag > 2:1060802/1‑147 (MQ=255) cAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATGGGGCAAACTGACCGATGATGATATGACGATCAt < 1:135480/148‑1 (MQ=255) gaataaAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATGGGGCAAACTGACCGATGATGATATGACGATCATTg > 1:1867440/1‑148 (MQ=255) gaataaAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATGGGGCAAACTGACCGATGATGATATGACGATCATTg > 1:1468372/1‑148 (MQ=255) | TGGCGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATGGGGCAAACTGACCGATGATGATATGACGATCATTG > CP009273/4248973‑4249261 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |