Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 4,406,553 | C→A | 100% | R12L (CGG→CTG) | bsmA ← | bioflm peroxide resistance protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 4,406,553 | 0 | C | A | 97.1% | 807.9 / 8.8 | 257 | R12L (CGG→CTG) | bsmA | bioflm peroxide resistance protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (4/4); new base A (118/131); total (122/135) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 257 total aligned reads displayed.
GCTTACGCTACCTATTCGCTGTAACCCTTGCGTCTGGTCGCGGCGAATCTCTTGCGGATGGTCCGTTACTGGCGGTGCTGGCTGTGGCGTACCTTGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACCGGTAAATAACGCTATTACGTTTCCTGCTAACCATAGTGTAGTGCCTTATTAATTTAACTTTGGGGGAATGTTCCCGAATTGTTACCTGGTACGCGATTTTCGAATGAAAACGTGACGAAAGCGTAACCCACATCTCAACATTAT > CP009273/4406408‑4406697 | gCTTACGCTACCTATTCGCTGTAACCCTTGCGTCTGGTCGCGGCGAATCTCTTGCGGATGGTCCGTTACTGGCGGTGCTGGCTGTGGCGTACCTTGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAgg < 2:50490/148‑1 (MQ=255) cTTACGCTACCTATTCGCTGTAACCCTTGCGTCTGGTCGCGGCGAATCTCTTGCGGATGGTCCGTTACTGGCGGTGCTGGCTGTGGCGTACCTTGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGt < 1:658893/148‑1 (MQ=255) cGCTACCTATTCGCTGTAACCCTTGCGTCTGGTCGCGGCGAATCTCTTGCGGATGGTCCGTTACTGGCGGTGCTGGCTGTGGCGTACCTTGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGTAAAt < 1:1787759/148‑1 (MQ=255) tACCTATTCGCTGTAACCCTTGCGTCTGGTCGCGGCGAATCTCTTGCGGATGGTCCGTTACTGGCGGTGCTGGCTGTGGCGTACCTTGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGTAAATAAc < 1:2275287/148‑1 (MQ=255) ccTATTCGCTGTAACCCTTGCGTCTGGTCGCGGCGAATCTCGTGCGGATGGTCCGTTACTGGCGGTGCTGGCTGTGGCGTACCTTGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGTAAATAACGc < 2:327511/148‑1 (MQ=255) cTATTCGCTGTAACCCTTGCGTCTGGTCGCGGCGAATCTCTTGCGGATGGTCCGTTACTGGCGGTGCTGGCTGTGGCGTACCTTGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACCGGTAAATAACGCt < 2:522001/148‑1 (MQ=255) ttCGCTGTAACCCTTGCGTCTGGTCGCGGCGAATCTCTTGCGGATGGTCCGTTACTGGCGGTGCTGGCTGTGGCGTACCTTGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGTAAATAACGCTAtt > 2:229322/1‑148 (MQ=255) ttCGCTGTAACCCTTGCGTCTGGTCGCGGCGAATCTCTTGCGGATGGTCCGTTACTGGCGGTGCTGGCTGTGGCGTACCTTGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGTAAATAACGCTAtt < 2:2288213/148‑1 (MQ=255) ttCGCTGTAACCCTTGCGTCTGGTCGCGGCGAATCTCTTGCGGATGGTCCGTTACTGGCGGTGCTGGCTGTGGCGTACCTTGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGTAAATAACGCTAtt < 2:2149412/148‑1 (MQ=255) ttCGCTGTAACCCTTGCGTCTGGTCGCGGCGAATCTCTTGCGGATGGTCCGTTACTGGCGGTGCTGGCTGTGGCGTACCTTGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGTAAATAACGCTAtt > 1:412771/1‑148 (MQ=255) tCGCTGTAACCCTTGCGTCTGGTCGCGGCGAATCTCTTGCGGATGGTCCGTTACTGGCGGTGCTGGCTGTGGCGTACCTTGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGTAAATAACGCTATTa > 1:266119/1‑148 (MQ=255) tCGCTGTAACCCTTGCGTCTGGTCGCGGCGAATCTCTTGCGGATGGTCCGTTACTGGCGGTGCTGGCTGTGGCGTACCTTGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGTAAATAACGCTATTa < 2:2051696/148‑1 (MQ=255) cTGTAACCCTTGCGTCTGGTCGCGGCGAATCTCTTGCGGATGGTCCGTTACTGGCGGTGCTGGCTGTGGCGTACCTTGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGTAAATAACGCTATTACGt > 1:1731699/1‑148 (MQ=255) cTGTAACCCTTGCGTCTGGTCGCGGCGAATCTCTTGCGGATGGTCCGTTACTGGCGGTGCTGGCTGTGGCGTACCTTGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGTAAATAACGCTATTACGt > 2:3510218/1‑148 (MQ=255) tGTAACCCTTGCGTCTGGTCGCGGCGAATCTCTTGCGGATGGTCCGTTACTGGCGGTGCTGGCTGTGGCGTACCTTGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGTAAATAACGCTATTACGtt > 1:1338807/1‑148 (MQ=255) cccTTGCGTCTGGTCGCGGCGAATCTCTTGCGGATGGTCCGTTACTGGCGGTGCTGGCTGTGGCGTACCTTGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGTAAATAACGCTATTACGTTTCCTg < 2:1632973/148‑1 (MQ=255) cccTTGCGTCTGGTCGCGGCGAATCTCTTGCGGATGGTCCGTTACTGGCGGTGCTGGCTGTGGCGTACCTTGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGTAAATAACGCTATTACGTTTCCTg > 1:877999/1‑148 (MQ=255) ccTTGCGTCTGGTCGCGGCGAATCTCTTGCGGATGGTCCGTTACTGGCGGTGCTGGCTGTGGCGTACCTTGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGTAAATAACGCTATTACGTTTCCTGc < 2:1053659/148‑1 (MQ=255) ttGCGTCTGGTCGCGGCGAATCTCTTGCGGATGGTCCGTTACTGGCGGTGCTGGCTGTGGCGTACCTTGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGTAAATAACGCTATTACGTTTCCTGCTa < 2:144799/148‑1 (MQ=255) tGCGTCTGGTCGCGGCGAATCTCTTGCGGATGGTCCGTTACTGGCGGTGCTGGCTGTGGCGTACCTTGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGTAAATAACGCTATTACGTTTCCTGCTaa > 1:2273527/1‑148 (MQ=255) cGTCTGGTCGCGGCGAATCTCTTGCGGATGGTCCGTTACTGGCGGTGCTGGCTGTGGCGTACCTTGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGTAAATAACGCTATTACGTTTCCTGCTAAcc < 2:269662/148‑1 (MQ=255) tCTGGTCGCGGCGAATCTCTTGCGGATGGTCCGTTACTGGCGGTGCTGGCTGTGGCGTACCTTGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGTAAATAACGCTATTACGTTTCCTGCTAACCAt < 1:1017157/148‑1 (MQ=255) cTGGTCGCGGCGAATCTCTTGCGGATGGTCCGTTACTGGCGGTGCTGGCTGTGGCGTACCTTGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGTAAATAACGCTATTACGTTTCCTGCTAACCAta > 1:3488964/1‑148 (MQ=255) cTGGTCGCGGCGAATCTCTTGCGGATGGTCCGTTACTGGCGGTGCTGGCTGTGGCGTACCTTGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGTAAATAACGCTATTACGTTTCCTGCTAACCAta > 1:725223/1‑148 (MQ=255) ggTCGCGGCGAATCTCTTGCGGATGGTCCGTTACTGGCGGTGCTGGCTGTGGCGTACCTTGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGTAAATAACGCTATTACGTTTCCTGCTAACCAtagt > 2:3027253/1‑148 (MQ=255) gTCGCGGCGAATCTCTTGCGGATGGTCCGTTACTGGCGGTGCTGGCTGTGGCGTACCTTGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGTAAATAACGCTATTACGTTTCCTGCTAACCAtagtg < 1:1483858/148‑1 (MQ=255) tCGCGGCGAATCTCTTGCGGATGGTCCGTTACTGGCGGTGCTGGCTGTGGCGTACCTTGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGTAAATAACGCTATTACGTTTCCTGCTAACCAtagtgt > 1:1935699/1‑148 (MQ=255) cgcgGCGAATCTCTTGCGGATGGTCCGTTACTGGCGGTGCTGGCTGTGGCGTACCTTGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGTAAATAACGCTATTACGTTTCCTGCTAACCAtagtgta < 2:1125540/148‑1 (MQ=255) ggcgAATCTCTTGCGGATGGTCCGTTACTGGCGGTGCTGGCTGTGGCGTACCTTGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGTAAATAACGCTATTACGTTTCCTGCTAACCAtagtgtagtg < 1:239632/148‑1 (MQ=255) ggcgAATCTCTTGCGGATGGTCCGTTACTGGCGGTGCTGGCTGTGGCGTACCTTGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGTAAATAACGCTATTACGTTTCCTGCTAACCAtagtgtagtg < 1:3220583/148‑1 (MQ=255) ggcgAATCTCTTGCGGATGGTCCGTTACTGGCGGTGCTGGCTGTGGCGTACCTTGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGTAAATAACGCTATTACGTTTCCTGCTAACCAtagtgtagtg < 1:3124807/148‑1 (MQ=255) cgAATCTCTTGCGGATGGTCCGTTACTGGCGGTGCTGGCTGTGGCGTACCTTGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGTAAATAACGCTATTACGTTTCCTGCTAACCATAGTGTAGTGcc < 1:2579469/148‑1 (MQ=255) aTCTCTTGCGGATGGTCCGTTACTGGCGGTGCTGGCTGTGGCGTACCTTGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACCGGTAAATAACGCTATTACGTTTCCTGCTAACCATAGTGTAGTGCCtta > 1:128525/1‑148 (MQ=255) aTCTCTTGCGGATGGTCCGTTACTGGCGGTGCTGGCTGTGGCGTACCTTGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGTAAATAACGCTATTACGTTTCCTGCTAACCATAGTGTAGTGCCtta < 1:638177/148‑1 (MQ=255) aTCTCTTGCGGATGGTCCGTTACTGGCGGTGCTGGCTGTGGCGTACCTTGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGTAAATAACGCTATTACGTTTCCTGCTAACCATAGTGTAGTGCCtta < 2:2097047/148‑1 (MQ=255) aTCTCTTGCGGATGGTCCGTTACTGGCGGTGCTGGCTGTGGCGTACCTTGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGTAAATAACGCTATTACGTTTCCTGCTAACCATAGTGTAGTGCCtta > 1:2549696/1‑148 (MQ=255) aTCTCTTGCGGATGGTCCGTTACTGGCGGTGCTGGCTGTGGCGTACCTTGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGTAAATAACGCTATTACGTTTCCTGCTAACCATAGTGTAGTGCCtta > 1:185748/1‑148 (MQ=255) aTCTCTTGCGGATGGTCCGTTACTGGCGGTGCTGGCTGTGGCGTACCTTGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGTAAATAACGCTATTACGTTTCCTGCTAACCATAGTGTAGTGCCtta > 2:2751907/1‑148 (MQ=255) tctcTTGCGGATGGTCCGTTACTGGCGGTGCTGGCTGTGGCGTACCTTGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGTAAATAACGCTATTACGTTTCCTGCTAACCATAGTGTAGTGCCttat < 2:2675923/148‑1 (MQ=255) tctTGCGGATGGTCCGTTACTGGCGGTGCTGGCTGTGGCGTACCTTGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGTAAATAACGCTATTACGTTTCCTGCTAACCATAGTGTAGTGCCttatta < 2:2435845/148‑1 (MQ=255) tctTGCGGATGGTCCGTTACTGGCGGTGCTGGCTGTGGCGTACCTTGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGTAAATAACGCTATTACGTTTCCTGCTAACCATAGTGTAGTGCCttatta < 1:2121423/148‑1 (MQ=255) ttGCGGATGGTCCGTTACTGGCGGTGCTGGCTGTGGCGTACCTTGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGTAAATAACGCTATTACGTTTCCTGCTAACCATAGTGTAGTGCCTTATTAAt < 1:2421615/148‑1 (MQ=255) tGCGGATGGTCCGTTACTGGCGGTGCTGGCTGTGGCGTACCTTGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGTAAATAACGCTATTACGTTTCCTGCTAACCATAGTGTAGTGCCTTATTAAtt > 2:3410131/1‑148 (MQ=255) ggATGGTCCGTTACTGGCGGTGCTGGCTGTGGCGTACCTTGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGTAAATAACGCTATTACGTTTCCTGCTAACCATAGTGTAGTGCCTTATTAATTTaa < 1:1296893/148‑1 (MQ=255) ggATGGTCCGTTACTGGCGGTGCTGGCTGTGGCGTACCTTGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGTAAATAACGCTATTACGTTTCCTGCTAACCATAGTGTAGTGCCTTATTAATTTaa < 2:3376856/148‑1 (MQ=255) gATGGTCCGTTACTGGCGGTGCTGGCTGTGGCGTACCTTGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGTAAATAACGCTATTACGTTTCCTGCTAACCATAGTGTAGTGCCTTATTAATTTAAc < 2:2547377/148‑1 (MQ=255) aTGGTCCGTTACTGGCGGTGCTGGCTGTGGCGTACCTTGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGTAAATAACGCTATTACGTTTCCTGCTAACCATAGTGTAGTGCCTTATTAATTTAACt > 1:2173658/1‑148 (MQ=255) aTGGTCCGTTACTGGCGGTGCTGGCTGTGGCGTACCTTGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGTAAATAACGCTATTACGTTTCCTGCTAACCATAGTGTAGTGCCTTATTAATTTAACt < 1:3411847/148‑1 (MQ=255) tGGTCCGTTACTGGCGGTGCTGGCTGTGGCGTACCTTGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGTAAATAACGCTATTACGTTTCCTGCTAACCATAGTGTAGTGCCTTATTAATTTAACtt < 2:2820211/148‑1 (MQ=255) tGGTCCGTTACTGGCGGTGCTGGCTGTGGCGTACCTTGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGTAAATAACGCTATTACGTTTCCTGCTAACCATAGTGTAGTGCCTTATTAATTTAACtt < 1:2443828/148‑1 (MQ=255) ggTCCGTTACTGGCGGTGCTGGCTGTGGCGTACCTTGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGTAAATAACGCTATTACGTTTCCTGCTAACCATAGTGTAGTGCCTTATTAATTTAACttt > 1:2892280/1‑148 (MQ=255) ggTCCGTTACTGGCGGTGCTGGCTGTGGCGTACCTTGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGTAAATAACGCTATTACGTTTCCTGCTAACCATAGTGTAGTGCCTTATTAAGTTAACttt > 2:2264172/1‑148 (MQ=255) gTCCGTTACTGGCGGTGCTGGCTGTGGCGTACCTTGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGTAAATAACGCTATTACGTTTCCTGCTAACCATAGTGTAGTGCCTTATTAATTTAACTTTg < 2:2019797/148‑1 (MQ=255) ccGTTACTGGCGGTGCTGGCTGTGGCGTACCTTGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGTAAATAACGCTATTACGTTTCCTGCTAACCATAGTGTAGTGCCTTATTAATTTAACTTTggg > 2:193104/1‑148 (MQ=255) 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ggTGCTGGCTGTGGCGTACCTTGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGTAAATAACGCTATTACGTTTCCTGCTAACCATAGTGTAGTGCCTTATTAATTTAACTTTGGGGGAATGTTccc < 2:714238/148‑1 (MQ=255) gTGCTGGCTGTGGCGTACCTTGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGTAAATAACGCTATTACGTTTCCTGCTAACCATAGTGTAGTGCCTTATTAATTTAACTTTGGGGGAATGTTCCCg > 1:2337349/1‑148 (MQ=255) gctgTGGCGTACCTTGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGTAAATAACGCTATTACGTTTCCTGCTAACCATAGTGTAGTGCCTTATTAATTTAACTTTGGGGGAATGTTCCCGAATTGt < 1:2698902/148‑1 (MQ=255) gctgTGGCGTACCTTGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGTAAATAACGCTATTACGTTTCCTGCTAACCATAGTGTAGTGCCTTATTAATTTAACTTTGGGGGAATGTTCCCGAATTGt < 2:130294/148‑1 (MQ=255) gctgTGGCGTACCTTGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGTAAATAACGCTATTACGTTTCCTGCTAACCATAGTGTAGTGCCTTATTAATTTAACTTTGGGGGAATGTTCCCGAATTGt > 1:1289979/1‑148 (MQ=255) gtgGCGTACCTTGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGTAAATAACGCTATTACGTTTCCTGCTAACCATAGTGTAGTGCCTTATTAATTTAACTTTGGGGGAATGTTCCCGAATTGTTAc > 1:1189217/1‑148 (MQ=255) tgGCGTACCTTGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGTAAATAACGCTATTACGTTTCCTGCTAACCATAGTGTAGTGCCTTATTAATTTAACTTTGGGGGAATGTTCCCGAATTGTTAcc > 2:2345605/1‑148 (MQ=255) ccTTGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGTAAATAACGCTATTACGTTTCCTGCTAACCATAGTGTAGTGCCTTATTAATTTAACTTTGGGGGAATGTTCCCGAATTGTTACCTGGTAcg < 1:3177256/148‑1 (MQ=255) ccTTGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGTAAATAACGCTATTACGTTTCCTGCTAACCATAGTGTAGTGCCTTATTAATTTAACTTTGGGGGAATGTTCCCGAATTGTTACCTGGTAcg < 1:491906/148‑1 (MQ=255) ttGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGTAAATAACGCTATTACGTTTCCTGCTAACCATAGTGTAGTGCCTTATTAATTTAACTTTGGGGGAATGTTCCCGAATTGTTACCTGGTAcgcg < 2:1744310/148‑1 (MQ=255) ttGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGTAAATAACGCTATTACGTTTCCTGCTAACCATAGTGTAGTGCCTTATTAATTTAACTTTGGGGGAATGTTCCCGAATTGTTACCTGGTAcgcg < 2:2929673/148‑1 (MQ=255) gCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGTAAATAACGCTATTACGTTTCCTGCTAACCATAGTGTAGTGCCTTATTAATTTAACTTTGGGGGAATGTTCCCGAATTGTTACCTGGTACGCGAt < 2:2988838/148‑1 (MQ=255) cgcTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGTAAATAACGCTATTACGTTTCCTGCTAACCATAGTGTAGTGCCTTATTAATTTAACTTTGGGGGAATGTTCCCGAATTGTTACCTGGTACGCGATTTTCGa > 1:2241661/1‑148 (MQ=255) aGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGTAAATAACGCTATTACGTTTCCTGCTAACCATAGTGTAGTGCCTTATTAATTTAACTTTGGGGGAATGTTCCCGAATTGTTACCTGGTACGCGATTTTCGAATGaaa < 1:3068688/148‑1 (MQ=255) gCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACAGGTAAATAACGCTATTACGTTTCCTGCTAACCATAGTGTAGTGCCTTATTAATTTAACTTTGGGGGAATGTTCCCGAATTGTTACCTGGTACGCGATTTTCGAATGAAAAc > 1:2306991/1‑148 (MQ=255) 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aaCAGGTAAATAACGCTATTACGTTTCCTGCTAACCATAGTGTAGTGCCTTATTAATTTAACTTTGGGGGAATGTTCCCGAATTGTTACCTGGTACGCGATTTTCGAATGAAAACGTGACGAAAGCGTAACCCACATCTCAACATTAt < 1:193104/148‑1 (MQ=255) | GCTTACGCTACCTATTCGCTGTAACCCTTGCGTCTGGTCGCGGCGAATCTCTTGCGGATGGTCCGTTACTGGCGGTGCTGGCTGTGGCGTACCTTGCAGTGCGCTACAGGCACTTAACATCAACACCAATAATAAACTGGCAAACCGGTAAATAACGCTATTACGTTTCCTGCTAACCATAGTGTAGTGCCTTATTAATTTAACTTTGGGGGAATGTTCCCGAATTGTTACCTGGTACGCGATTTTCGAATGAAAACGTGACGAAAGCGTAACCCACATCTCAACATTAT > CP009273/4406408‑4406697 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |