| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 372,581 | G→T | 100% | A118A (GCG→GCT) | yaiL → | DUF2058 family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 372,581 | 0 | G | T | 96.2% | 678.7 / 13.1 | 223 | A118A (GCG→GCT) | yaiL | DUF2058 family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (4/5); new base T (115/98); total (119/104) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.36e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 223 total aligned reads displayed.
AAAGCTCAGGTGAAGCAGCTTATTGAAATGAACCGAATCACCATTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCGATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGAC > CP009273/372435‑372725 | aaGCTCAGGTGAAGCAGCTTATTGAAATGAACCGAATCACCATTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTAt > 1:1002495/1‑148 (MQ=255) gCTCAGGTGAAGCAGCTTATTGAAATGAACCGAATCACCATTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTg > 2:2968712/1‑148 (MQ=255) cTCAGGTGAAGCAGCTTATTGAAATGAACCGAATCACCATTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCGATTGc > 1:2454175/1‑148 (MQ=255) cTCAGGTGAAGCAGCTTATTGAAATGAACCGAATCACCATTGCCAATGGCGAGATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTAtttc > 2:1519155/1‑146 (MQ=255) cAGGTGAAGCAGCTTATTGAAATGAACCGAATCACCATTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGccc > 2:39903/1‑148 (MQ=255) gcagcTTATTGAAATGAACCGAATCACCATTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCttgttg < 1:1053920/148‑1 (MQ=255) cTTATTGAAATGAACCGAATCACCATTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCg > 1:433519/1‑148 (MQ=255) tATTGAAATGAACCGAATCACCATTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGAt > 1:1350377/1‑148 (MQ=255) tATTGAAATGAACCGAATCACCATTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGAGTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGAt > 2:977484/1‑148 (MQ=255) aTTGAAATGAACCGAATCACCATTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATa > 1:1507938/1‑148 (MQ=255) ttGAAATGAACCGAATCACCATTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATaa < 1:2480664/148‑1 (MQ=255) aaaTGAACCGAATCACCATTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACaa > 2:42570/1‑148 (MQ=255) aaTGAACCGAATCACCATTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTAGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAAt > 1:2167138/1‑148 (MQ=255) aTGAACCGAATCACCATTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATa < 2:1329841/148‑1 (MQ=255) ccGAATCACCATTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGaa < 1:822679/148‑1 (MQ=255) cGAATCACCATTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAg > 1:1294674/1‑148 (MQ=255) aaTCTCCATTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGTCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACCCAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGt < 2:3339681/148‑1 (MQ=255) aTCACCATTGCCATTGGCGATATTGTTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGACGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTg < 2:183329/148‑1 (MQ=255) tCACCAGTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGa < 2:60233/148‑1 (MQ=255) cACCATTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGaa > 2:1014964/1‑148 (MQ=255) cACCATTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGaa > 2:1183395/1‑148 (MQ=255) aCCATTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAAt > 2:495510/1‑148 (MQ=255) cATTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATAc > 1:2141904/1‑148 (MQ=255) cATTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATAc > 1:1840825/1‑148 (MQ=255) aTTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACg > 2:3502963/1‑148 (MQ=255) cattGGCTATATTGTTTTTAACTTCACTGACGGCAATATGATTAAGAATATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCATTTTATTACTGGTCGTCTGGATATTGCCCGGTTGTTGGTCGAAAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCatt < 1:1207157/145‑1 (MQ=255) aaTGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTATTGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCatta < 2:3243528/148‑1 (MQ=255) aaTGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCatta < 1:487843/148‑1 (MQ=255) tGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCattatt > 2:3180031/1‑148 (MQ=255) tGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCattatt < 1:3412299/148‑1 (MQ=255) ggatatatTTGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGGGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTTTTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACTATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTc < 2:1654471/144‑1 (MQ=255) atTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCa > 1:1526024/1‑148 (MQ=255) ttGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAg > 2:2070206/1‑148 (MQ=255) tGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGc > 2:2850522/1‑148 (MQ=255) ttAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCGATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGc > 1:3331617/1‑148 (MQ=255) cTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGAt > 1:3379217/1‑148 (MQ=255) cACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATaaa < 2:3116637/148‑1 (MQ=255) cACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATaaa > 1:392608/1‑148 (MQ=255) cTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAAt > 2:3174587/1‑148 (MQ=255) tGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAAtt > 2:1987814/1‑148 (MQ=255) ggACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAAtt < 2:3408062/147‑1 (MQ=255) gACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTg > 2:976406/1‑148 (MQ=255) ggCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTc < 2:2481668/148‑1 (MQ=255) ggCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCCGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTc < 2:1120578/148‑1 (MQ=255) cactCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTGGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAg < 2:78905/145‑1 (MQ=255) cAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAg > 1:3237132/1‑148 (MQ=255) aTCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATACAATTGCTCAgcg > 2:914355/1‑148 (MQ=255) aTTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATg < 1:3521592/148‑1 (MQ=255) aTTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATg > 1:1683974/1‑148 (MQ=255) ttAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGc > 2:3058474/1‑148 (MQ=255) ttAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGc > 2:1287533/1‑148 (MQ=255) tAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGcc > 1:2418052/1‑148 (MQ=255) aagaagATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGcc < 2:3181618/147‑1 (MQ=255) agaagaTTTTTGTCGATAAGCTCACACCGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCcag < 1:999577/148‑1 (MQ=255) agaagaTTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCcag < 1:544355/148‑1 (MQ=255) agaagaTTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCcag > 1:3224052/1‑148 (MQ=255) gaagaTTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATCACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCcagc > 2:1848625/1‑148 (MQ=255) gaagaTTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCcagc > 2:1848758/1‑148 (MQ=255) gaagaTTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCcagc > 1:918741/1‑148 (MQ=255) aagaTTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCcagca > 2:2913642/1‑148 (MQ=255) gaTTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGt < 2:1543411/148‑1 (MQ=255) aTTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGta > 1:1760192/1‑148 (MQ=255) aTTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGta > 1:1423580/1‑148 (MQ=255) tttttGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGtat < 1:2498393/148‑1 (MQ=255) ttttGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGtata > 1:1487645/1‑148 (MQ=255) gTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAgtgt < 1:1983754/148‑1 (MQ=255) aTAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGca > 1:1203971/1‑148 (MQ=255) aTAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGca > 2:3010090/1‑148 (MQ=255) aaGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGcaca < 1:2625910/148‑1 (MQ=255) cTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAgcg < 1:3215949/148‑1 (MQ=255) cacacaGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAgcgcg > 1:708149/1‑148 (MQ=255) cacaGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCt < 2:951795/148‑1 (MQ=255) cacaGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCt > 1:57714/1‑148 (MQ=255) acaGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTc > 1:1146239/1‑148 (MQ=255) acaGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTc > 2:813173/1‑148 (MQ=255) gcgcAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAgcg < 2:2839113/148‑1 (MQ=255) cgcAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAgcgc > 2:1067373/1‑148 (MQ=255) gcAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGcc > 1:2084089/1‑148 (MQ=255) gcAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGATTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGcc < 2:2499359/148‑1 (MQ=255) aGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGa < 1:1464288/148‑1 (MQ=255) ttGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAag > 1:540765/1‑148 (MQ=255) gATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAagag > 1:313745/1‑148 (MQ=255) gATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAagag < 1:1253070/148‑1 (MQ=255) aTTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGc > 2:1155422/1‑148 (MQ=255) aTTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGc > 2:1942994/1‑148 (MQ=255) aTTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGc > 1:2794023/1‑148 (MQ=255) aTTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGGGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGc > 1:3049911/1‑148 (MQ=255) aTTAATGGTCGTCTGGCGATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGc < 2:2606887/148‑1 (MQ=255) aTTAATGGTCGTCTGGCGATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGc < 2:2605710/148‑1 (MQ=255) aTGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACACTAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATCAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGGATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGa > 2:187750/1‑148 (MQ=255) aTGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGa > 1:635051/1‑148 (MQ=255) aTGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGAGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGa < 2:1507929/148‑1 (MQ=255) tGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGAt > 2:2274548/1‑148 (MQ=255) tGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGAt > 1:1990214/1‑148 (MQ=255) tGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGAt < 2:1554610/148‑1 (MQ=255) gtcgtcTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGa > 2:2419768/1‑148 (MQ=255) gtcgtcTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGa < 1:2850522/148‑1 (MQ=255) tcgtcTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGaa < 1:1559461/148‑1 (MQ=255) cgtcTGGCTAGTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAg < 2:3097250/148‑1 (MQ=255) cTGGCAATTGCCCGCTTGTTGGTCGAGAACAATCGCGAAGGTGAATACGCCATTAGTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAgacg < 1:2818983/148‑1 (MQ=255) | AAAGCTCAGGTGAAGCAGCTTATTGAAATGAACCGAATCACCATTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCGATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGAC > CP009273/372435‑372725 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |