| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 619,048 | C→A | 100% | A307S (GCC→TCC) | fepB ← | iron‑enterobactin transporter subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 619,048 | 0 | C | A | 96.2% | 559.1 / 12.0 | 184 | A307S (GCC→TCC) | fepB | iron‑enterobactin transporter subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/5); new base A (94/83); total (96/88) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.62e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.79e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 184 total aligned reads displayed.
GGTTTTGGTTTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGCGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCGGCATCTTTCTGATCACCGGCGAACAGGAATAGTGACTCGCC > CP009273/618905‑619192 | ggTTTTGGTTTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTg < 2:2155756/148‑1 (MQ=255) gTTTTGGTTTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTgt < 2:2215144/148‑1 (MQ=255) ttttGGTTTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTgta > 1:566804/1‑148 (MQ=255) ttttGGTTTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTgta < 2:3532178/148‑1 (MQ=255) ggTTTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTaa < 1:2364191/148‑1 (MQ=255) gTTTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAAt < 1:1378034/148‑1 (MQ=255) tttGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTTTAGTAATc < 2:2039238/148‑1 (MQ=255) ttgttgATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATTCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATcc > 1:321561/1‑148 (MQ=255) ttgttgATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATcc > 2:1884166/1‑148 (MQ=255) ttgttgATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATcc > 2:2300596/1‑148 (MQ=255) ttgttgATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATcc > 2:256142/1‑148 (MQ=255) ttgATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGa < 1:2749848/148‑1 (MQ=255) ttgATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGa < 1:1513310/148‑1 (MQ=255) tgATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGAc > 2:2021481/1‑148 (MQ=255) tgATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGAc > 2:2020433/1‑148 (MQ=255) aTTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACgg > 2:3426442/1‑148 (MQ=255) ttATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGa > 2:2633912/1‑148 (MQ=255) ttATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGa > 1:2510537/1‑148 (MQ=255) tATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGaa > 1:799060/1‑148 (MQ=255) tCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACg < 1:2433049/148‑1 (MQ=255) tCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACg > 2:1820952/1‑148 (MQ=255) ggCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGtc < 1:1936384/148‑1 (MQ=255) ggCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGtc < 1:3414924/148‑1 (MQ=255) gCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGCGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGtct > 2:551279/1‑148 (MQ=255) gtgtTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGCGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCg < 2:963638/148‑1 (MQ=255) gttgttATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGt > 1:2282451/1‑148 (MQ=255) ttgttATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGtt > 1:2160906/1‑148 (MQ=255) tATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCa > 2:1133763/1‑148 (MQ=255) ttGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAgc > 2:1203205/1‑148 (MQ=255) ctggtgctggtgGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCa < 2:2251599/148‑1 (MQ=255) ctggtgctggtgGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCa < 2:454071/148‑1 (MQ=255) ctggtgctggtgGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCa < 2:960880/148‑1 (MQ=255) tgctggtgGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATaaa < 2:1883671/148‑1 (MQ=255) tgctggtgGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATaaa < 2:2613569/148‑1 (MQ=255) ggtggAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTg < 1:2960457/148‑1 (MQ=255) gtggAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGc > 1:2628125/1‑148 (MQ=255) gAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTg < 2:3431985/148‑1 (MQ=255) gTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGtt < 1:3291205/148‑1 (MQ=255) gTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGtt < 2:1008584/148‑1 (MQ=255) gTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCGATACAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCCGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATTAACCTGCTTGtt < 2:2784127/148‑1 (MQ=255) ttGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGACTATCAAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGACCGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGttt > 1:2733543/1‑148 (MQ=255) tGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGtttt < 1:2791021/148‑1 (MQ=255) tGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGtttt > 2:132086/1‑148 (MQ=255) cGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGt > 2:806022/1‑148 (MQ=255) 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aTTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTg > 2:2314675/1‑148 (MQ=255) ttttCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTgc > 2:3457221/1‑148 (MQ=255) tttCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTgca < 2:260611/148‑1 (MQ=255) ccAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTgcaggcag > 1:2288993/1‑148 (MQ=255) ccAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTgcaggcag > 2:3181967/1‑148 (MQ=255) 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ttAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATc > 1:1026174/1‑148 (MQ=255) tAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCg > 2:1722299/1‑148 (MQ=255) tAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCg > 1:3382048/1‑148 (MQ=255) tAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCg < 2:1041439/148‑1 (MQ=255) aaTGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCgg < 1:2773346/148‑1 (MQ=255) ttAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCGGCATCt < 2:260288/148‑1 (MQ=255) ttAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCGGCATCt < 2:316351/148‑1 (MQ=255) aaaCAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCGGCATCTTTc > 1:193721/1‑148 (MQ=255) aCAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCGGCATCTTTCTg > 1:919660/1‑148 (MQ=255) gcgcCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCGGCATCTTTCTGATc > 2:1758276/1‑148 (MQ=255) 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tAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCGGCATCTTTCTGATCACCGGc > 1:1391033/1‑148 (MQ=255) cTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCGGCATCTTTCTGATCACCGGCGAACa < 2:753395/148‑1 (MQ=255) aTCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCGGCATCTTTCTGATCACCGGCGAACAgg > 1:826467/1‑148 (MQ=255) tCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCGGCATCTTTCTGATCACCGGCGAACAGGa < 1:2020448/148‑1 (MQ=255) ccAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCGGCATCTTTCTGATCACCGGCGAACAGGaa > 1:1189612/1‑148 (MQ=255) 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aTGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCGGCATCTTTCTGATCACCGGCGAACAGGAATAGTGACTCGc > 1:1371772/1‑148 (MQ=255) | GGTTTTGGTTTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGCGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCGGCATCTTTCTGATCACCGGCGAACAGGAATAGTGACTCGCC > CP009273/618905‑619192 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |