Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 93,391 | G→T | 100% | T301T (ACG→ACT) | mraY → | phospho‑N‑acetylmuramoyl‑pentapeptide transferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 93,391 | 0 | G | T | 95.9% | 503.5 / 12.7 | 169 | T301T (ACG→ACT) | mraY | phospho‑N‑acetylmuramoyl‑pentapeptide transferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (2/5); new base T (76/86); total (78/91) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.53e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.50e-01 | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 171 total aligned reads displayed.
TCCTGTGGTTTAACACCTATCCGGCGCAGGTCTTTATGGGCGATGTAGGTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACGCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATGGCACCGATTCATCACCACTATGAACTGAAAGGCTGGCCGGAACCGCGCGTCATTGTGCGTTTCTGGATTATTTCGCTGATGCT > CP009273/93246‑93534 | tCCTGTGGTTTAACACCTATCCGGCGCAGGTCTTTATGGGCGATGTAGGTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAActct > 1:1995715/1‑148 (MQ=255) ccTGTGGTTTAACACCTATCCGGCGCAGGTCTTTATGGGCGATGTAGGTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCtt > 1:1002386/1‑148 (MQ=255) cTGTGGTTTAACACCTATCCGGCGCAGGTCTTTATGGGCGATGTAGGTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCttt < 1:3162214/148‑1 (MQ=255) cTGTGGTTTAACACCTATCCGGCGCAGGTCTTTATGGGCGATGTAGGTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACGCttt < 1:710255/148‑1 (MQ=255) gTTTAACACCTATCCGGCGCAGGTCTTTATGGGCGATGTAGGTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTc < 1:2246346/148‑1 (MQ=255) tAACACCTATCCGGCGCAGGTCTTTATGGGCGATGTAGGTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATc < 1:2293137/148‑1 (MQ=255) tAACACCTATCCGGCGCAGGTCTTTATGGGCGATGTAGGTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATc < 1:134275/148‑1 (MQ=255) aaCACCTATCCGGCGCAGGTCTTTATGGGCGATGTAGGTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACGCTTTCTGTCATcc < 2:1170008/148‑1 (MQ=255) acacCTATCCGGCGCAGGTCTTTATGGGCGATGTAGGTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCt > 1:1644558/1‑148 (MQ=255) cacCTATCCGGCGCAGGTCTTTATGGGCGATGTAGGTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTg > 1:2541922/1‑148 (MQ=255) cacCTATCCGGCGCAGGTCTTTATGGGCGATGTAGGTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTg < 2:2787160/148‑1 (MQ=255) acCTATCCGGCGCAGGTCTTTATGGGCGATGTAGGTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGc > 1:2979047/1‑148 (MQ=255) tATCCGGCGCAGGTCTTTATGGGCGATGTAGGTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAgg > 1:3421329/1‑148 (MQ=255) aTCCGGCGCAGGTCTTTATGGGCGATGTAGGTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGt > 1:513371/1‑148 (MQ=255) aTCCGGCGCAGGTCTTTATGGGCGATGTAGGTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGt < 2:563885/148‑1 (MQ=255) ccGGCGCAGGTCTTTATGGGCGATGTAGGTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCg > 2:2151785/1‑148 (MQ=255) cGGCGCAGGTCTTTATGGGCGATGTAGGTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCgg > 2:3264830/1‑148 (MQ=255) cgcAGGTCTTGATGGGCGATGTAGGTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTc < 2:3466792/148‑1 (MQ=255) cAGGTCTTTATGGGCGATGTAGGTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCt < 1:564550/148‑1 (MQ=255) cAGGTCTTTATGGGCGATGTAGGTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACGCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCt < 1:392008/148‑1 (MQ=255) ggTCTTTATGGGCGATGTAGGTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCttt > 1:3359375/1‑148 (MQ=255) ggTCTTTATGGGCGATGTAGGTTCGCTGGCGGTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTCTGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCttt > 2:167392/1‑148 (MQ=255) tCTTTATGGGCGATGTAGGTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTaa > 2:2886796/1‑148 (MQ=255) tCTTTATGGGCGATGTAGGTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTaa < 2:2590185/148‑1 (MQ=255) cTTTATGGGCGATGTAGGTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTaaa > 2:687052/1‑148 (MQ=255) gggCGATGTAGGTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTgcgc > 1:2303265/1‑148 (MQ=255) gggCGATGTAGGTTCGCTGGCGTGAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTgcgc < 1:2703651/148‑1 (MQ=255) ggCGATGTAGGTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGcgcg > 1:764972/1‑148 (MQ=255) tGTAGGTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACaa > 1:1394752/1‑148 (MQ=255) tGTAGGTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACGCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACaa < 1:140511/148‑1 (MQ=255) aGGTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGt < 1:3207622/148‑1 (MQ=255) ggTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTa > 2:2425121/1‑148 (MQ=255) ggTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACGCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTa > 2:914690/1‑148 (MQ=255) ggTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTAGTGGTAGAAACTATTTATGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCATTAAAATGAGCCGACAACGTa > 2:386574/1‑148 (MQ=255) gTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAGACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTAt < 1:1504932/148‑1 (MQ=255) cGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTAtttt < 1:1991245/148‑1 (MQ=255) gCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTc < 1:2917101/148‑1 (MQ=255) tGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCCTCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCg > 2:338542/1‑148 (MQ=255) tGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCg > 2:2129442/1‑148 (MQ=255) gCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCa < 2:2764554/148‑1 (MQ=255) gTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATg < 1:960364/148‑1 (MQ=255) ggtgCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATGGCACCGa > 2:3054441/1‑148 (MQ=255) gtgCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATGGCACCGAt < 2:2567129/148‑1 (MQ=255) gtgCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATGGCACCGAt < 1:1543536/148‑1 (MQ=255) tgCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATGGCACCGAtt < 2:1044679/148‑1 (MQ=255) tgCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATGGCACCGAtt < 2:1044377/148‑1 (MQ=255) tgCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATGGCACCGAtt < 1:702083/148‑1 (MQ=255) tgCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATGGCACCGAtt > 1:520422/1‑148 (MQ=255) tgCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATGGCACCGAtt < 1:399832/148‑1 (MQ=255) 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gCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATGGCACCGATTCATcacca < 1:642955/148‑1 (MQ=255) gCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATGGCACCGATTCATcacca < 1:1173265/148‑1 (MQ=255) gCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATGGCACCGATTCATcacca > 2:3452744/1‑148 (MQ=255) gCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATGGCACCGATTCATcacca < 2:1427493/148‑1 (MQ=255) aTTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATGGCACCGATTCATCACCACt < 1:1673450/148‑1 (MQ=255) tATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACGCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATGGCACCGATTCATCACCACTAt > 2:238942/1‑148 (MQ=255) aTCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATGGCACCGATTCATCACCACTATg > 1:2466015/1‑148 (MQ=255) aTCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATGGCACCGATTCATCACCACTATg > 1:608286/1‑148 (MQ=255) tCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATGGCACCGATTCATCACCACTATGa < 2:1176105/148‑1 (MQ=255) cGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATGGCACCGATTCATCACCACTATGaa < 1:386574/148‑1 (MQ=255) cGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATGGCACCGATTCATCACCACTATGaa > 2:1501694/1‑148 (MQ=255) tACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATGGCACCGATTCATCACCACTATGAACTGaa < 2:1937834/148‑1 (MQ=255) tACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATGGCACCGATTCATCACCACTATGAACTGaa < 1:2364989/148‑1 (MQ=255) tACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATGGCACCGATTCATCACCACTATGAACTGaa > 2:2645460/1‑148 (MQ=255) aCTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATGGCACCGATTCATCACCACTATGAACTGaaa < 2:1074896/148‑1 (MQ=255) cTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATGGCACCGATTCATCACCACTATGAACTGAAAg > 1:3508307/1‑148 (MQ=255) gCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATGGCACCGATTCATCACCACTATGAACTGAAAGGc < 1:2424582/148‑1 (MQ=255) gCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATGGCACCGATTCATCACCACTATGAACTGAAAGGc < 1:3070876/148‑1 (MQ=255) cGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATGGCACCGATTCATCACCACTATGAACTGAAAGGCTGGc > 1:1010962/1‑148 (MQ=255) cAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATGGCACCGATTCATCACCACTATGAACTGAAAGGCTGGCCgg > 2:652706/1‑148 (MQ=255) 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ggTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATGGCACCGATTCATCACCACTATGAACTGAAAGGCTGGCCGGAACCGCGCGTCAtt > 1:1458308/1‑148 (MQ=255) gTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATGGCACCGATTCATCACCACTATGAACTGAAAGGCTGGCCGGAACCGCGCGTCATtg < 2:1995715/148‑1 (MQ=255) gATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATGGCACCGATTCATCACCACTATGAACTGAAAGGCTGGCCGGAACCGCGCGTCATtgtg > 1:1093802/1‑148 (MQ=255) tATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATGGCACCGATTCATCACCACTATGAACTGAAAGGCTGGCCGGAACCGCGCGTCATTGTGCGt > 2:2587496/1‑148 (MQ=255) tATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATGGCACCGATTCATCACCACTATGAACTGAAAGGCTGGCCGGAACCGCGCGTCATTGTGCGt < 2:75434/148‑1 (MQ=255) 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aaaCTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATGGCACCGATTCATCACCACTATGAACTGAAAGGCTGGCCGGAACCGCGCGTCATTGTGCGTTTCTGGATTATTTCGCTGATGCt > 2:1284206/1‑148 (MQ=255) | TCCTGTGGTTTAACACCTATCCGGCGCAGGTCTTTATGGGCGATGTAGGTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACGCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATGGCACCGATTCATCACCACTATGAACTGAAAGGCTGGCCGGAACCGCGCGTCATTGTGCGTTTCTGGATTATTTCGCTGATGCT > CP009273/93246‑93534 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |