| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 1,469,700 | T→A | 5.8% | N100K (AAT→AAA) | ydbD → | PF10971 family putative periplasmic methylglyoxal resistance protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 1,469,700 | 0 | T | A | 5.8% | 852.6 / 26.4 | 269 | N100K (AAT→AAA) | ydbD | PF10971 family putative periplasmic methylglyoxal resistance protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (131/122); new base A (11/5); total (142/127) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.08e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 278 total aligned reads displayed.
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |