| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 1,689,180 | T→G | 100% | E383D (GAA→GAC) | uidA ← | beta‑D‑glucuronidase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 1,689,180 | 0 | T | G | 96.7% | 835.5 / 5.1 | 210 | E383D (GAA→GAC) | uidA | beta‑D‑glucuronidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (4/3); new base G (103/100); total (107/103) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.95e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 210 total aligned reads displayed.
TTGCTTCCGCCAGTGGCGCGAAATATTCCCGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTTTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCT > CP009273/1689035‑1689324 | ttGCTTCCGCCAGTGGCGCGAAATATTCCCGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTc > 2:2228762/1‑148 (MQ=255) tGCTTCCGCCAGTGGCGCGAAATATTCCCGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTcc < 1:2940897/148‑1 (MQ=255) tCCGCCAGTGGCGCGAAATATTCCCGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGt < 1:244784/148‑1 (MQ=255) ccGCCAGTGGCGCGAAATATTCCCGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGtt > 1:533444/1‑148 (MQ=255) ccAGTGGCGCGAAATATTCCCGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTTTCCCCGTTGAc > 1:1375683/1‑148 (MQ=255) ccAGTGGCGCGAAATATTCCCGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGAc < 1:1504018/148‑1 (MQ=255) cAGTGGCGCGAAATATTCCCGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACt > 2:859567/1‑148 (MQ=255) aGTGGCGCGAAATATTCCCGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTg > 1:2566434/1‑148 (MQ=255) tGGCGCGAAATATTCCCGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGcc < 2:1333698/148‑1 (MQ=255) ggCGCGAAATATTCCCGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCct < 2:2163213/148‑1 (MQ=255) ggCGCGAAATATTCCCGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCct < 2:3033745/148‑1 (MQ=255) cgcgAAATATTCCCGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCctct > 2:3305360/1‑148 (MQ=255) gcgAAATATTCCCGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCtt < 1:1453334/148‑1 (MQ=255) aaTATTCCCGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCt > 1:164502/1‑148 (MQ=255) atatTCCCGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTg > 1:1799396/1‑148 (MQ=255) tatTCCCGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGt > 1:297099/1‑148 (MQ=255) ttCCCGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTAc > 1:2022053/1‑148 (MQ=255) tCCCGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACa > 1:3001388/1‑148 (MQ=255) cGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGtt < 2:1108871/148‑1 (MQ=255) gTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCGCATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTc < 1:1577543/148‑1 (MQ=255) gTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTc < 1:2045610/148‑1 (MQ=255) tGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCt < 2:1314279/148‑1 (MQ=255) cACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCttt < 2:656391/148‑1 (MQ=255) ccTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCg > 1:377991/1‑148 (MQ=255) gCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCtt < 1:2633782/148‑1 (MQ=255) ggACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTTTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCttgt < 2:559899/148‑1 (MQ=255) aCGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCttgttg > 1:1147613/1‑148 (MQ=255) aCGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCttgttg < 1:1221038/148‑1 (MQ=255) aCGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCttgttg < 1:80880/148‑1 (MQ=255) aCGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCttgttg > 1:3518044/1‑148 (MQ=255) aCGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCttgttg < 1:2805654/148‑1 (MQ=255) aCGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCttgttg > 1:1760707/1‑148 (MQ=255) gTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCg > 2:2616990/1‑148 (MQ=255) gTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCg < 2:1281878/148‑1 (MQ=255) ggTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGa < 1:752528/148‑1 (MQ=255) ttCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGaaa > 1:2736551/1‑148 (MQ=255) ttCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGaaa < 2:2022053/148‑1 (MQ=255) ttCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGaaa > 2:227142/1‑148 (MQ=255) ttCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGaaa > 2:3232650/1‑148 (MQ=255) ttCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGaaa < 2:3090974/148‑1 (MQ=255) gCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGc < 2:1929587/148‑1 (MQ=255) cAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGcc < 1:1681404/148‑1 (MQ=255) aTACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTTTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTa > 1:1978709/1‑148 (MQ=255) aTACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTa > 2:408473/1‑148 (MQ=255) tACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTaa < 2:3193707/148‑1 (MQ=255) ccACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAagag > 1:2744321/1‑148 (MQ=255) acaTCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAagagag < 1:2374511/148‑1 (MQ=255) acaTCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAagagag > 1:538629/1‑148 (MQ=255) acaTCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAagagag < 2:766991/148‑1 (MQ=255) caTCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAgg < 2:337117/148‑1 (MQ=255) caTCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGAGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACAAATGCCTAAAGAGAgg > 2:3323478/1‑148 (MQ=255) accacGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTaa < 1:1083801/148‑1 (MQ=255) accacGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTaa > 2:1454379/1‑148 (MQ=255) cGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGcc > 1:2447986/1‑148 (MQ=255) gCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCg < 2:1760707/148‑1 (MQ=255) gCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCg < 2:3518044/148‑1 (MQ=255) gCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCg < 2:1147663/148‑1 (MQ=255) ttGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTACTCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGAc < 1:607669/148‑1 (MQ=255) ggtggtTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGAcagc > 2:666356/1‑148 (MQ=255) 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cAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCGTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACg < 2:472402/148‑1 (MQ=255) aGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGa > 1:481372/1‑148 (MQ=255) gCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGAt > 1:853607/1‑148 (MQ=255) ctctTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGATg > 1:3113810/1‑148 (MQ=255) ctctTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGATg > 1:1343003/1‑148 (MQ=255) ctctTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTACCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGATg > 1:2125348/1‑148 (MQ=255) ttAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGATGCCAt > 2:3376077/1‑148 (MQ=255) aaTCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGATGCCATGt < 2:1514943/148‑1 (MQ=255) aTCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGATGCCATGtt < 2:2736551/148‑1 (MQ=255) aTCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGATGCCATGtt < 1:325323/148‑1 (MQ=255) cGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCa < 1:2769312/148‑1 (MQ=255) tGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTg < 1:2663447/148‑1 (MQ=255) gTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGc < 1:705770/148‑1 (MQ=255) tAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGcc > 2:2705314/1‑148 (MQ=255) aaGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGccc > 1:2284368/1‑148 (MQ=255) aGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCa > 1:1167649/1‑148 (MQ=255) tGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGt < 1:401345/148‑1 (MQ=255) cgcTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCg < 1:2769067/148‑1 (MQ=255) tGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCa < 1:2616990/148‑1 (MQ=255) tGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCa > 1:132885/1‑148 (MQ=255) 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aGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATctct > 1:117075/1‑148 (MQ=255) | TTGCTTCCGCCAGTGGCGCGAAATATTCCCGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTTTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCT > CP009273/1689035‑1689324 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |