Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 1,706,839 | 0 | C | T | 42.1% | 166.5 / 310.1 | 235 | intergenic (+424/‑187) | nth/dtpA | DNA glycosylase and apyrimidinic (AP) lyase (endonuclease III)/dipeptide and tripeptide permease A |
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.92e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.97e-01 |
Only 100 of 238 total aligned reads displayed.
ACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCACCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAGTTATATGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGATAGTGAACATTACCTGCCGTTTCCCCTCCCACTATAACAATTGCGCGTATGTTTTTTATACATAACGCGAGAAA > CP009273/1706692‑1706986 | tATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCACCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGaa < 2:1522956/148‑1 (MQ=255) ttttCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCACCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTTCCGGAATgg > 1:457958/1‑148 (MQ=255) tttCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCACCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTTCCGGAATGGt < 1:3079882/148‑1 (MQ=255) aaaCTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCACCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTTCCGGAATGGTTGAAtt 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |