| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 1,713,571 | 0 | G | T | 37.1% | 268.4 / 179.3 | 191 | H97N (CAC→AAC) | anmK | anhydro‑N‑acetylmuramic acid kinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (53/67); new base T (29/42); total (82/109) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.62e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 194 total aligned reads displayed.
GTGCGCCTTGTCCTCCCAAGGCAATATCGCGACGGCGAAAATCACCGACAACCGTAATTCCGGTGCGTGCCACAATTTGATTGTTATCGCCAATCTGTAAAGTGTGTGGTGCCACGCCCGTCGGTTCATGCCAGACGGTTTGACCGTGACAACCGATCGCAACTATATCTCTTGCCTGCAGATTTTGTTCCTTAAGCAAGGCATTGACCGCATCAGCAAAAAGTTGCCCGAGTTGAGTATCAAGCTGTCCAAACTGCGAAAGTGTAAGCTGCTGGCCCTGGCAAATATCCA > CP009273/1713424‑1713714 | gTGCGCCTTGTCCTCCCAAGGCAATATCGCGACGGCGAAAATCACCGACAACCGTAATTCCGGTGCGTGCCACAATTTGATTGTTATCGCCAATCTGTAAAGTGTGTGGTGCCACGCCCGTCGGTTCATGCCAGACGGTTTGACCGTg < 2:945482/148‑1 (MQ=255)gTGCGCCTTGTCCTCCCAAGGCAATATCGCGACGGCGAAAATCACCGACAACCGTAATTCCGGTGCGTGCCACAATTTGATTGTTATCGCCAATCTGTAAAGTGTGTGGTGCCACGCCCGTCGGTTCATGCCAGACGGTTTGACCGTg < 1:666006/148‑1 (MQ=255) gcgcCTTGTCCTCCCAAGGCAATATCGCGACGGCGAAAATCACCGACAACCGTAATTCCGGTGCGTGCCACAATTTGATTGTTATCGCCAATCTGTAAAGTGTGTGGTGCCACGCCCGTCGGTTCATGCCAGACGGTTTGACCGTGAc > 1:2636786/1‑148 (MQ=255) gcCTTGTCCTCCCAAGGCAATATCGCGACGGCGAAAATCTCCGACAACCGTAATTCCGGTGCGTGCCACAATTTGATTGTTATCGCCAATCTGTTAAGTGTGTGGTGCCACGCCCGTCGGTTCATGCCAGACGGTTTGACCGTTACaa < 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ccGTTACAACCGATCGCAACTATATCTCTTGCCTGCAGATTTTGTTCCTTAAGCAAGGCATTGACCGCATCAGCAAAAAGTTGCCCGAGTTGAGTATCAAGCTGTCCAAACTGCGAAAGTGTAAGCTGCTGGCCCTGGCAAATATCCa > 2:1733609/1‑148 (MQ=255) | GTGCGCCTTGTCCTCCCAAGGCAATATCGCGACGGCGAAAATCACCGACAACCGTAATTCCGGTGCGTGCCACAATTTGATTGTTATCGCCAATCTGTAAAGTGTGTGGTGCCACGCCCGTCGGTTCATGCCAGACGGTTTGACCGTGACAACCGATCGCAACTATATCTCTTGCCTGCAGATTTTGTTCCTTAAGCAAGGCATTGACCGCATCAGCAAAAAGTTGCCCGAGTTGAGTATCAAGCTGTCCAAACTGCGAAAGTGTAAGCTGCTGGCCCTGGCAAATATCCA > CP009273/1713424‑1713714 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |