| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 1,993,530 | C→A | 100% | E113* (GAG→TAG) | fliY ← | cystine transporter subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 1,993,530 | 0 | C | A | 97.1% | 535.2 / 6.6 | 171 | E113* (GAG→TAG) | fliY | cystine transporter subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (3/2); new base A (76/90); total (79/92) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.63e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 177 total aligned reads displayed.
TCATAGTTGGTGCCCAGACCGACCCCCACTTTTTTGCCTTTCAGATCATCGGCTGTTTTAATGGTGCCTTCGTTACCTTTTTTCACCAGCGCCTGAATACCAGAAATGGTGTACGGGGTTGAGAAATCGTATTTTTTCTTGCGCTCATCAGAAATGGTGACCTGATTAATCACCACATCAATACGTTTAGAGTCCAGCGACGCCAGCATACCGTCCCATTTGGTCGGTTTTAGTGACGCCTCAACGCCAAGATGTTTTGCCAGCTGTTGGGCAAATTCCACTTCAAAACC > CP009273/1993385‑1993674 | tCATAGTTGGTGCCCAGACCGACCCCCACTTTTTTGCCTTTCAGATCATCGGCTGTTTTAATGGTGCCTTCGTTACCTTTTTTCACCAGCGCCTGAATACCAGAAATGGTGTACGGGGTTGAGAAATCGTATTTTTTCTTGCGCtaat < 2:1387098/148‑1 (MQ=255) cATAGTTGGTGCCCAGACCGACCCCCACTTTTTTGCCTTTCAGATCATCGGCTGTTTTAATGGTGCCTTCGTTACCTTTTTTCACCAGCGCCTGAATACCAGAAATGGTGTACGGGGTTGAGAAATCGTATTTTTTCTTGCGCtaatc > 2:1547408/1‑148 (MQ=255) cATAGTTGGTGCCCAGACCGACCCCCACTTTTTTGCCTTTCAGATCATCGGCTGTTTTAATGGTGCCTTCGTTACCTTTTTTCACCAGCGCCTGAATACCAGAAATGGTGTACGGGGTTGAGAAATCGTATTTTTTCTTGCGCtaatc < 1:3322388/148‑1 (MQ=255) cATAGTTGGTGCCCAGACCGACCCCCAATTTTTTGCCTTTCAGATCATCGGCTGTTTTAATGGTGCCTTCGTTACCTTTTTTCACCAGCGCCTGAATACCAGAAATGGTGTACGGGGTTGAGAAATCGTATTTTTTCTTGCGCtaatc < 1:2636201/148‑1 (MQ=255) aGTTGGTGCCCAGACCGACCCCCACTTTTTTGCCTTTCAGATCATCGGCTGTTTTAATGGTGCCTTCGTTACCTTTTTTCACCAGCGCCTGAATACCAGAAATGGTGTACGGGGTTGAGAAATCGTATTTTTTCTTGCGCTAATCAGa > 1:531549/1‑148 (MQ=255) aGTTGGTGCCCAGACCGACCCCCACTTTTTTGCCTTTCAGATCATCGGCTGTTTTAATGGTGCCTTCGTTACCTTTTTTCACCAGCGCCTGAATACCAGAAATGGTGTACGGGGTTGAGAAATCGTATTTTTTCTTGCGCTAATCAGa > 1:955082/1‑148 (MQ=255) gTTGGTGCCCAGACCGACCCCCACTTTTTTGCCTTTCAGATCATCGGCTGTTTTAATGGTGCCTTCGTTACCTTTTTTCACCAGCGCCTGAATACCAGAAATGGTGTACGGGGTTGAGAAATCGTATTTTTTCTTGCGCTAATCAGaa < 1:3487067/148‑1 (MQ=255) gTTGGTGCCCAGACCGACCCCCACTTTTTTGCCTTTCAGATCATCGGCTGTTTTAATGGTGCCTTCGTTACCTTTTTTCACCAGCGCCTGAATACCAGAAATGGTGTACGGGGTTGAGAAATCGTATTTTTTCTTGCGCTAATCAGaa > 1:1486258/1‑148 (MQ=255) ttGGTGCCCAGACCGACCCCCACTTTTTTGCCTTTCAGATCATCGGCTGTTTTAATGGTGCCTTCGTTACCTTTTTTCACCAGCGCCTGAATACCAGAAATGGTGTACGGGGTTGAGAAATCGTATTTTTTCTTGCGCTAATCAGaaa < 2:319881/148‑1 (MQ=255) tGGTGCCCAGACCGACCCCCACTTTTTTGCCTTTCAGATCATCGGCTGTTTTAATGGTGCCTTCGTTACCTTTTTTCACCAGCGCCTGAATACCAGAAATGGTGTACGGGGTTGAGAAATCGTATTTTTTCTTGCGCTAATCAGAAAt < 1:1028854/148‑1 (MQ=255) ggTGCCCAGACCGACCCCCACTTTTTTGCCTTTCAGATCATCGGCTGTTTTAATGGTGCCTTCGTTACCTTTTTTCACCAGCGCCTGAATACCAGAAATGGTGTACGGGGTTGAGAAATCGTATTTTTTCTTGCGCTAATCAGAAATg < 1:1008134/148‑1 (MQ=255) gTGCCCAGACCGACCCCCACTTTTTTGCCTTTCAGATCATCGGCTGTTTTAATGGTGCCTTCGTTACCTTTTTTCACCAGCGCCTGAATACCAGAAATGGTGTACGGGGTTGAGAAATCGTATTTTTTCTTGCGCTAATCAGAAATgg > 1:1099577/1‑148 (MQ=255) gTGCCCAGACCGACCCCCACTTTTTTGCCTTTCAGATCATCGGCTGTTTTAATGGTGCCTTCGTTACCTTTTTTCACCAGCGCCTGAATACCAGAAATGGTGTACGGGGTTGAGAAATCGTATTTTTTCTTGCGCTAATCAGAAATgg > 1:1503995/1‑148 (MQ=255) gTGCCCAGACCGACCCCCACTTTATTGCCTTTCAGATCATCGGCTGTTTTAATGGTGCCTTCGTTACCTTTTTTCACCAGCGCCTGAATACCAGAAATGGTGTACGGGGTTGAGAAATCGTATTTTTTCTTGCGCTAATCAGAAATgg < 2:2564092/148‑1 (MQ=255) gCCCAGACCGACCCCCACTTTTTTGCCTTTCAGATCATCGGCTGTTTTAATGGTGCCTTCGTTACCTTTTTTCACCAGCGCCTGAATACCAGAAATGGTGTACGGGGTTGAGAAATCGTATTTTTTCTTGCGCTAATCAGAAATGGTg < 1:2111661/148‑1 (MQ=255) cccAGACCGACCCCCACTTTTTTGCCTTTCAGATCATCGGCTGTTTTAATGGTGCCTTCGTTACCTTTTTTCACCAGCGCCTGAATACCAGAAATGGTGTACGGGGTTGAGAAATCGTATTTTTTCTTGCGCTAATCAGAAATGGTGa < 2:1606126/148‑1 (MQ=255) ccAGACCGACCCCCACTTTTTTGCCTTTCAGATCATCGGCTGTTTTAATGGTGCCTTCGTTACCTTTTTTCACCAGCGCCTGAATACCAGAAATGGTGTACGGGGTTGAGAAATCGTATTTTTTCTTGCGCTAATCAGAAATGGTGAc < 1:202889/148‑1 (MQ=255) cAGACCGACCCCCACTTTTTTGCCTTTCAGATCATCGGCTGTTTTAATGGTGCCTTCGTTACCTTTTTTCACCAGCGCATGAATACCAGAAATGGTGTACGGGGTTGAGAAATCGTATTTTTTCTTGCGCTAATCAGAAATTGTGAcc > 2:2524702/1‑148 (MQ=255) gaccgaccCCCACTTTTTTGCCTTTCAGATCATCGGCTGTTTTAATGGTGCCTTCGTTACCTTTTTTCACCAGCGCCTGAATACCAGAAATGGTGTACGGGGTTGAGAAATCGTATTTTTTCTTGCGCTCATCAGAAATGGTGACCTg < 2:397427/148‑1 (MQ=255) gaccgaccCCCACTTTTTTGCCTTTCAGATCATCGGCTGTTTTAATGGTGCCTTCGTTACCTTTTTTCACCAGCGCCTGAATACCAGAAATGGTGTACGGGGTTGAGAAATCGTATTTTTTCTTGCGCTAATCAGAAATGGTGACCTg < 2:1587822/148‑1 (MQ=255) accgaccCCCACTTTTTTGCCTTTCAGATCATCGGCTGTTTTAATGGTGCCTTCGTTACCTTTTTTCACCAGCGCCTGAATACCAGAAATGGTGTACGGGGTTGAGAAATCGTATTTTTTCTTGCGCTAATCAGAAATGGTGACCTGa < 1:1021435/148‑1 (MQ=255) cgaccCCCACTTTTTTGCCTTTCAGATCATCGGCTGTTTTAATGGTGCCTTCGTTACCTTTTTTCACCAGCGCCTGAATACCAGAAATGGTGTACGGGGTTGAGAAATCGTATTTTTTCTTGCGCTAATCAGAAATGGTGACCTGAtt < 1:252401/148‑1 (MQ=255) gaccCCCACTTTTTTGCCTTTCAGATCATCGGCTGTTTTAATGGTGCCTTCGTTACCTTTTTTCACCAGCGCCTGAATACCAGAAATGGTGTACGGGGTTGAGAAATCGTATTTTTTCTTGCGCTAATCAGAAATGGTGACCTGATTa < 1:292472/148‑1 (MQ=255) ccccACTTTTTTGCCTTTCAGATCATCGGCTGTTTTAATGGTGCCTTCGTTACCTTTTTTCACCAGCGCCTGAATACCAGAAATGGTGTACGGGGTTGAGAAATCGTATTTTTTCTTGCGCTAATCAGAAATGGTGACCTGATTAATc < 1:3387467/148‑1 (MQ=255) cccACTTTTTTGCCTTTCAGATCATCGGCTGTTTTAATGGTGCCTTCGTTACCTTTTTTCACCAGCGCCTGAATACCAGAAATGGTGTACGGGGTTGAGAAATCGTATTTTTTCTTGCGCTAATCAGAAATGGTGACCTGATTAATca < 1:3547922/148‑1 (MQ=255) cACTTTTTTGCCTTTCAGATCATCGGCTGTTTTAATGGTGCCTTCGTTACCTTTTTTCACCAGCGCCTGAATACCAGAAATGGTGTACGGGGTTGAGAAATCGTATTTTTTCTTGCGCTAATCAGAAATGGTGACCTGATTAATcacc < 1:227895/148‑1 (MQ=255) cACTTTTTTGCCTTTCAGATCATCGGCTGTTTTAATGGTGCCTTCGTTACCTTTTTTCACCAGCGCCTGAATACCAGAAATGGTGTACGGGGTTGAGAAATCGTATTTTTTCTTGCGCTAATCAGAAATGGTGACCTGATTAATaacc > 1:1836654/1‑148 (MQ=255) aCTTTTTTGCCTTTCAGATCATCGGCTGTTTTAATGGTGCCTTCGTTACCTTTTTTCACCAGCGCCTGAATACCAGAAATGGTGTACGGGGTTGAGAAATCGTATTTTTTCTTGCGCTAATCAGAAATGGTGACCTGATTAATcacca < 1:2087921/148‑1 (MQ=255) cTTTTTTGCCTTTCAGATCATCGGCTGTTTTAATGGTGCCTTCGTTACCTTTTTTCACCAGCGCCTGAATACCAGAAATGGTGTACGGGGTTGAGAAATCGTATTTTTTCTTGCGCTAATCAGAAATGGTGACCTGATTAATcaccac > 2:2079442/1‑148 (MQ=255) cTTTTTTGCCTTTCAGATCATCGGCTGTTTTAATGGTGCCTTCGTTACCTTTTTTCACCAGCGCCTGAATACCAGAAATGGTGTACGGGGTTGAGAAATCGTATTTTTTCTTGCGCTAATCAGAAATGGTGACCTGATTAATcaccac < 2:1663685/148‑1 (MQ=255) ttttttGCCTTTCAGATCATCGGCTGTTTTAATGGTGCCTTCGTTACCTTTTTTCACCAGCGCCTGAATACCAGAAATGGTGTACGGGGTTGAGAAATCGTATTTTTTCTTGCGCTAATCAGAAATGGTGACCTGATTAATCACcaca > 2:1911698/1‑148 (MQ=255) ttttGCCTTTCAGATCATCGGCTGTTTTAATGGTGCCTTCGTTACCTTTTTTCACCAGCGCCTGAATACCAGAAATGGTGTACGGGGTTGATAAATCGTATTTTTTCTTGCGCTAATCAGAAATGGTGACCTGATTAATCACCACATc < 2:2629197/148‑1 (MQ=255) ttttGCCTTTCAGATCATCGGCTGTTTTAATGGTGCCTTCGTTACCTTTTTTCACCAGCGCCTGAATACCAGAAATGGTGTACGGGGTTGAGAAATCGTATTTTTTCTTGCGCTAATCAGAAATGGTGACCTGATTAATCACCACATc < 2:3513954/148‑1 (MQ=255) ttGCCTTTCAGATCATCGGCTGTTTTAATGGTGCCTTCGTTACCTTTTTTCACCAGCGCCTGAATACCAGAAATGGTGTACGGGGTTGAGAAATCGTATTTTTTCTTGCGCTAATCAGAAATGGTGACCTGATTAATCACCACATCaa > 1:826945/1‑148 (MQ=255) tttCAGATCATCGGCTGTTTTAATGGTGCCTTCGTTACCTTTTTTCACCAGCGCCTGAATACCAGAAATGGTGTACGGGGTTGAGAAATCGTATTTTTTCTTGCGCTAATCAGAAATGGTGACCTGATTAATCACCACATCAATACGt < 1:3206531/148‑1 (MQ=255) ttCAGATCATCGGCTGTTTTAATGGTGCCTTCGTTACCTTTTTTCACCAGCGCCTGAATACCAGAAATGGTGTACGGGGTTGAGAAATCGTATTTTTTCTTGCGCTAATCAGAAATGGTGACCTGATTAATCACCACATCAATACGtt < 1:3511092/148‑1 (MQ=255) aGATCATCGGCTGTTTTAATGGTGCCTTCGTTACCTTTTTTCACCAGCGCCTGAATACCAGAAATGGTGTACGGGGTTGAGAAATCGTATTTTTTCTTGCGCTAATCAGAAATGGTGACCTGATTAATCACCACATCAATACGTTTag > 2:187450/1‑148 (MQ=255) aGATCATCGGCTGTTTTAATGGTGCCTTCGTTACCTTTTTTCACCAGCGCCTGAATACCAGAAATGGTGTACGGGGTTGAGAAATCGTATTTTTTCTTGCGCTAATCAGAAATGGTGACCTGATTAATCACCACATCAATACGTTTag > 2:927401/1‑148 (MQ=255) gATCATCGGCTGTTTTAATGGTGCCTTCGTTACCTTTTTTCACCAGCGCCTGAATACCAGAAATGGTGTACGGGGTTGAGAAATCGTATTTTTTCTTGCGCTAATCAGAAATGGTGACCTGATTAATCACCACATCAATACGTTTaga < 1:187633/148‑1 (MQ=255) atcatcGGCTGTTTTAATGGTGCCTTCGTTACCTTTTTTCACCAGCGCCTGAATACCAGAAATGGTGTACGGGGTTGAGAAATCGTATTTTTTCTTGCGCTAATCAGAAATGGTGACCTGATTAATCACCACATCAATACGTTTagag > 1:2214456/1‑148 (MQ=255) atcatcGGCTGTTTTAATGGTGCCTTCGTTACCTTTTTTCACCAGCGCCTGAATACCAGAAATGGTGTACGGGGTTGAGAAATCGTATTTTTTCTTGCGCTAATCAGAAATGGTGACCTGATTAATCACCACATCAATACGTTTagag < 1:385995/148‑1 (MQ=255) tcatcGGCTGTTTTAATGGTGCCTTCGTTACCTTTTTTCACCAGCGCCTGAATACCAGAAATGGTGTACGGGGTTGAGAAATCGTATTTTTTCTTGCGCTAATCAGAAATGGTGACCTGATTAATCACCACATCAATACGTTTAGAGt > 2:1393912/1‑148 (MQ=255) cTGTTTTAATGGTGCCTTCGTTACCTTTTTTCACCAGCGCCTGAATACCAGAAATGGTGTACGGGGTTGAGAAATCGTATTTTTTCTTGCGCTCATCAGAAATGGTGACCTGATTAATCACCACATCAATACGTTTAGAGTCCAGCGa < 2:1317805/148‑1 (MQ=255) cTGTTTTAATGGTGCCTTCGTTACCTTTTTTCACCAGCGCCTGAATACCAGAAATGGTGTACGGGGTTGAGAAATCGTATTTTTTCTTGCGCTAATCAGAAATGGTGACCTGATTAATCACCACATCAATACGTTTAGAGTCCAGCGa > 1:2771694/1‑148 (MQ=255) cTGTTTTAATGGTGCCTTCGTTACCTTTTTTCACCAGCGCCTGAATACCAGAAATGGTGTACGGGGTTGAGAAATCGTATTTTTTCTTGCGCTAATCAGAAATGGTGACCTGATTAATCACCACATCAATACGTTTAGAGTCCAGCGa > 1:2673494/1‑148 (MQ=255) gTTTTAATGGTGCCTTCGTTACCTTTTTTCACCAGCGCCTGAATACCAGAAATGGTGTACGGGGTTGAGAAATCGTATTTTTTCTTGCGCTAATCAGAAATGGTGACCTGATTAATCACCACATCAATACGTTTAGAGTCCAGCGACg < 2:2344095/148‑1 (MQ=255) gTTTTAATGGTGCCTTCGTTACCTTTTTTCACCAGCGCCTGAATACCAGAAATGGTGTACGGGGTTGAGAAATCGTATTTTTTCTTGCGCTAATCAGAAATGGTGACCTGATTAATCACCACATCAATACGTTTAGAGTCCAGCGACg > 1:57250/1‑148 (MQ=255) gTTTTAATGGTGCCTTCGTTACCTTTTTTCACCAGCGCCTGAATACCAGAAATGGTGTACGGGGTTGAGAAATCGTATTTTTTCTTGCGCTAATCAGAAATGGTGACCTGATTAATCACCACATCAATACGTTTAGAGTCCAGCGACg > 1:2798227/1‑148 (MQ=255) gTTTTAATGGTGCCTTCGTTACCTTTTTTCACCAGCGCCTGAATACCAGAAATGGTGTACGGGGTTGAGAAATCGTATTTTTTCTTGCGCTAATCAGAAATGGTGACCTGATTAATCACCACATCAATACGTTTAGAGTCCAGCGACg > 1:3383992/1‑148 (MQ=255) tttAATGGTGCCTTCGTTACCTTTTTTCACCAGCGCCTGAATACCAGAAATGGTGTACGGGGTTGAGAAATCGTATTTTTTCTTGCGCTAATCAGAAATGGTGACCTGATTAATCACCACATCAATACGTTTAGAGTCCAGCGACGcc > 1:792859/1‑148 (MQ=255) aaTGGTGCCTTCGTTACCTTTTTTCACCAGCGCCTGAATACCAGAAATGGTGTACGGGGTTGAGAAATCGTATTTTTTCTTGCGCTAATCAGAAATGGTGACCTGATTAATCACCACATCAATACGTTTAGAGTCCAGCGACGCCaac < 2:3270420/148‑3 (MQ=255) aTGGTGCCTTCGTTACCTTTTTTCACCAGCGCCTGAATACCAGAAATGGTGTACGGGGTTGAGAAATCGTATTTTTTCTTGCGCTAATCAGAAATGGTGACCTGATTAATCACCACATCAATACGTTTAGAGTCCAGCGACGCCAGCa > 1:3462233/1‑148 (MQ=255) ccTTCGTTACCTTTTTTCACCAGCGCCTGAATACCAGAAATGGTGTACGGGGTTGAGAAATCGTATTTTTTCTTGCGCTAATCAGAAATGGTGACCTGATTAATCACCACATCAATACGTTTAGAGTCCAGCGACGCCAGCATACCGt < 2:2742797/148‑1 (MQ=255) cTTCGTTACCTTTTTTCACCAGCGCCTGAATACCAGAAATGGTGTACGGGGTTGAGAAATCGTATTTTTTCTTGCGCTAATCAGAAATGGTGACCTGATTAATCACCACATCAATACGTTTAGAGTCCAGCGACGCCAGCATACCGTc > 1:2367766/1‑148 (MQ=255) 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aCCTTTTTTCACCAGCGCCTGAATACCAGAAATGGTGTACGGGGTTGAGAAATCGTATTTTTTCTTGCGCTAATCAGAAATGGTGACCTGATTAATCACCACATCAATACGTTTAGAGTCCAGCGACGCCAGCATACCGTCCCATTTg > 1:2623231/1‑148 (MQ=255) ttttttCACCAGCGCCTGAATACCAGAAATGGTGTACGGGGTTGAGAAATCGTATTTTTTCTTGCGCTAATCAGAAATGGTGACCTGATTAATCACCACATCAATACGTTTAGAGTCCAGCGACGCCAGCATACCGTCCCATTTGGTc > 2:278824/1‑148 (MQ=255) tttttCACCAGCGCCTGAATACCAGAAATGGTGTACGGGGTTGAGAAATCGTATTTTTTCTTGCGCTAATCAGAAATGGTGACCTGATTAATCACCACATCAATACGTTTAGAGTCCAGCGACGCCAGCATACCGTCCCATTTGGTCg > 1:1244148/1‑148 (MQ=255) tttttCACCAGCGCCTGAATACCAGAAATGGTGTACGGGGTTGAGAAATCGTATTTTTTCTTGCGCTAATCAGAAATGGTGACCTGATTAATCACCACATCAATACGTTTAGAGTCCAGCGACGCCAGCATACCGTCCCATTTGGTCg < 2:757763/148‑1 (MQ=255) tttCACCAGCGCCTGAATACCAGAAATGGTGTACGGGGTTGAGAAATCGTATTTTTTCTTGCGCTAATCAGAAATGGTGACCTGATTAATCACCACATCAATACGTTTAGAGTCCAGCGACGCCAGCATACCGTCCCATTTGGTCGGt < 1:391318/148‑1 (MQ=255) 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tttCTTGCGCTAATCAGAAATGGTGACCTGATTAATCACCACATCAATACGTTTAGAGTCCAGCGACGCCAGCATACCGTCCCATTTGGTCGGTTTTAGTGACGCCTCAACGCCAAGATGTTTTGCCAGCTGTTGGGCAAATTCCACt < 1:27133/148‑1 (MQ=255) ttCTTGCGCTAATCAGAAATGGTGACCTGATTAATCACCACATCAATACGTTTAGAGTCCAGCGACGCCAGCATACCGTCCCATTTGGTCGGTTTTAGTGACGCCTCAACGCCAAGATGTTTTGCCAGCTGTTGGGCAAATTCCACtt > 2:2812992/1‑148 (MQ=255) ttCTTGCGCTAATCAGAAATGGTGACCTGATTAATCACCACATCAATACGTTTAGAGTCCAGCGACGCCAGCATACCGTCCCATTTGGTCGGTTTTAGTGACGCCTCAACGCCAAGATGTTTTGCCAGCTGTTGGGCAAATTCCACtt > 2:1037622/1‑148 (MQ=255) tGCGCTAATCAGAAATGGTGACCTGATTAATCACCACATCAATACGTTTAGAGTCCAGCGACGCCAGCATACCGTCCCATTTGGTCGGTTTTAGTGACGCCTCAACGCCAAGATGTTTTGCCAGCTGTTGGGCACATTCCACTTCaaa > 1:1733659/1‑148 (MQ=255) gcTAATCAGAAATGGTGACCTGATTAATCACCACATCAATACGTTTAGAGTCCAGCGACGCCAGCATACCGTCCCATTTGGTCGGTTTTAGTGACGCCTCAACGCCAAGATGTTTTGCCAGCTGTTGGGCAAATTCCACTTCAAAAcc > 1:1653373/1‑148 (MQ=255) gcTAATCAGAAATGGTGACCTGATTAATCACCACATCAATACGTTTAGAGTCCAGCGACGCCAGCATACCGTCCCATTTGGTCGGTTTTAGTGACGCCTCAACGCCAAGATGTTTTGCCAGCTGTTGGGCAAATTCCACTTCAAAAcc > 1:1653432/1‑148 (MQ=255) | TCATAGTTGGTGCCCAGACCGACCCCCACTTTTTTGCCTTTCAGATCATCGGCTGTTTTAATGGTGCCTTCGTTACCTTTTTTCACCAGCGCCTGAATACCAGAAATGGTGTACGGGGTTGAGAAATCGTATTTTTTCTTGCGCTCATCAGAAATGGTGACCTGATTAATCACCACATCAATACGTTTAGAGTCCAGCGACGCCAGCATACCGTCCCATTTGGTCGGTTTTAGTGACGCCTCAACGCCAAGATGTTTTGCCAGCTGTTGGGCAAATTCCACTTCAAAACC > CP009273/1993385‑1993674 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |