Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 2,021,954 | C→A | 35.8% | E298D (GAG→GAT) | yedI ← | DUF808 family inner membrane protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 2,021,954 | 0 | C | A | 35.8% | 253.5 / 156.7 | 173 | E298D (GAG→GAT) | yedI | DUF808 family inner membrane protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (51/59); new base A (25/37); total (76/97) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.23e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.34e-01 |
Only 100 of 176 total aligned reads displayed.
GCCGCCCTCTTTAACCGTAACTTCCTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGGCGTGATGCAGCGGCGCAATTCCATGT > CP009273/2021807‑2022101 | gccCTCTTTAACCGTAACTTCCTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTctct < 1:841780/148‑1 (MQ=255) ctTTAACCGTAACTTCCTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGc < 1:1254013/148‑1 (MQ=255) ttAACCGTAACGTCCTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCtt < 1:3313636/148‑1 (MQ=255) aaCCGTAACTTCCTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTc > 1:3248561/1‑148 (MQ=255) aCCGTAACTTCCTCACTAACCATACAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCa < 1:2255062/148‑1 (MQ=255) ccGTAACTTCCTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCAc > 1:346990/1‑148 (MQ=255) tAACTTCCTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTcc < 2:1501876/148‑1 (MQ=255) tAACTTCCTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTcc < 2:774739/148‑1 (MQ=255) tAACTTCCTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTcc < 1:3461443/148‑1 (MQ=255) aaCTTCCTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTccc < 1:389833/148‑1 (MQ=255) aaCTTCCTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGGTCACCTTCGTTGAAGATGGCGAATGTTGCAGAAT‑AGCCAGTGCGCGTATTCCTGTGCCTGGCCGCGCCGTTGCTGTACGGCGTTCACTccc > 2:2548374/1‑148 (MQ=255) aCTTCCTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCa > 2:1881692/1‑148 (MQ=255) cTTCCTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAg > 1:435687/1‑148 (MQ=255) tCCTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGca > 2:3177416/1‑148 (MQ=255) tCCTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGca > 1:65725/1‑148 (MQ=255) cTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGcacc > 1:825301/1‑148 (MQ=255) cTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGcacc > 2:2883706/1‑148 (MQ=255) aaCCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATg < 2:1384713/148‑1 (MQ=255) aCCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATgc > 2:2365675/1‑148 (MQ=255) aCCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATgc > 1:619054/1‑148 (MQ=255) aCCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATgc < 1:484217/148‑1 (MQ=255) cATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATgccg > 2:569002/1‑148 (MQ=255) tAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATgccgcc > 1:2533336/1‑148 (MQ=255) aaaGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGccgccg > 1:1138194/1‑148 (MQ=255) aaGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCga < 2:733692/148‑1 (MQ=255) aGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCgat > 2:2644153/1‑148 (MQ=255) aGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCgat > 2:3546450/1‑148 (MQ=255) aGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCgat > 2:2980532/1‑148 (MQ=255) aGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCgat > 2:2980456/1‑148 (MQ=255) gCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCgatg < 1:1445222/148‑1 (MQ=255) aTACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATaa < 1:2242331/148‑1 (MQ=255) aTACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATaa < 1:3080235/148‑1 (MQ=255) tACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATaaa < 2:1168455/148‑1 (MQ=255) tACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATaaa < 2:2519636/148‑1 (MQ=255) aCTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAAt < 1:2294478/148‑1 (MQ=255) cTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGAAGGCGAATTTTGC‑TAATAAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATc > 1:3490017/1‑148 (MQ=255) cggctcctTTTTTCGAGTGTAACTTGTTCACCTTAGTTGTAGATGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCTAGTATTATTGTGCCTGACCGCGCATTTTGTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCa < 2:505286/145‑1 (MQ=255) cGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCa < 2:3033659/148‑1 (MQ=255) ctcctTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGa > 1:246373/1‑148 (MQ=255) ctactTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGa < 2:2134236/145‑1 (MQ=255) cctTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAAt < 2:2414042/148‑1 (MQ=255) cctTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAAt < 1:2372534/148‑1 (MQ=255) cctTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCAACTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAAt < 2:2414451/148‑1 (MQ=255) tttCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGAt < 1:3403900/148‑1 (MQ=255) tttCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGAt < 2:65725/148‑1 (MQ=255) tttCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGAGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGAt < 2:1331485/148‑1 (MQ=255) gAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTaa < 1:1067386/148‑1 (MQ=255) gAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTaa < 1:2604317/148‑1 (MQ=255) tGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAAc < 1:60812/148‑1 (MQ=255) tGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACTATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAAc > 2:1739907/1‑148 (MQ=255) tGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAAc > 1:2116176/1‑148 (MQ=255) gAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTTACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACa > 2:3477996/1‑148 (MQ=255) gAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACa < 1:1871963/148‑1 (MQ=255) aCTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTc < 1:3398611/148‑1 (MQ=255) aCTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTc < 1:1174171/148‑1 (MQ=255) aCTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTc < 1:985721/148‑1 (MQ=255) cTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCg > 2:161492/1‑148 (MQ=255) ttGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCgg > 1:2346235/1‑148 (MQ=255) tCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAat < 1:809262/148‑1 (MQ=255) tCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAat < 1:1888997/148‑1 (MQ=255) tAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATatcatc < 1:420097/148‑1 (MQ=255) tGAAGATGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCa > 1:1311355/1‑148 (MQ=255) aaGATGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCact < 2:1665233/148‑1 (MQ=255) aGATGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCacta < 2:1300709/148‑1 (MQ=255) gATGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCactac < 2:2127045/148‑1 (MQ=255) aTGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCactact > 1:123571/1‑148 (MQ=255) tGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCactacgg < 2:337856/148‑3 (MQ=255) tGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTg < 2:337807/148‑1 (MQ=255) tGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTg < 1:1037060/148‑1 (MQ=255) tGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACAACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTg < 2:3259867/148‑1 (MQ=255) cGAATTTTGCATAAG‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCAc < 2:2183746/148‑1 (MQ=255) gAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACt < 2:3203595/148‑1 (MQ=255) aTTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACttt > 1:985443/1‑148 (MQ=255) ttttGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTtg < 1:151015/148‑1 (MQ=255) ttttGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTtg > 2:3147872/1‑148 (MQ=255) ttttGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTtg > 2:1631877/1‑148 (MQ=255) ttttGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTtg < 2:479252/148‑1 (MQ=255) tGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCCCTTtgctg > 2:2431248/1‑148 (MQ=255) gCATAAT‑AGCCAGTGCGATTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGTTTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTtgctgc < 1:1581447/148‑1 (MQ=255) gCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTtgctgc < 1:156591/148‑1 (MQ=255) cATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGcc > 1:3147298/1‑148 (MQ=255) at‑aGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGc > 1:1998859/1‑148 (MQ=255) aGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGa > 2:1893036/1‑148 (MQ=255) ccAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGaaa > 1:1324449/1‑148 (MQ=255) aGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATg < 2:2761402/148‑1 (MQ=255) tGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTATCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGtt > 2:827201/1‑148 (MQ=255) gCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTc < 1:1589482/148‑1 (MQ=255) gCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAAAAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGACATGTTc > 2:1853309/1‑148 (MQ=255) tATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATgg > 2:437629/1‑148 (MQ=255) tAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGGCGt > 1:1422986/1‑148 (MQ=255) gtgCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGGCGTGATg > 1:1735132/1‑148 (MQ=255) gCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGGCGTGATGCa > 1:2567440/1‑148 (MQ=255) tGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGGCGTGATGCAgcg < 2:1929636/148‑1 (MQ=255) gcgcATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGGCGTGATGCAGCGGCGCa < 1:2850024/148‑1 (MQ=255) aTTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGGCGTGATGCAGCGGCGCAATTc > 2:1325176/1‑148 (MQ=255) aTTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGGCGTGATGCAGCGGCGCAATTc > 2:2620437/1‑148 (MQ=255) tttCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATTATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGGCGTGATGCAGCGGCGCAATTCCa < 1:2980532/148‑1 (MQ=255) tttCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGGCGTGATGCAGCGGCGCAATTCCa < 1:2980456/148‑1 (MQ=255) tttATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGGCGTGATGCAGCGGCGCAATTCCa < 2:686213/148‑1 (MQ=255) ctctACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAACTGGTCAATGGCGTGATGCAGCGGCGCACGTCCATGt > 2:3244721/1‑148 (MQ=255) | GCCGCCCTCTTTAACCGTAACTTCCTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAAT‑AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGGCGTGATGCAGCGGCGCAATTCCATGT > CP009273/2021807‑2022101 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |