Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 2,077,698 | A→T | 43.5% | intergenic (+34/+9) | sbcB → / ← yeeD | exodeoxyribonuclease I; exonuclease I/putative TusA family sulfurtransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 2,077,698 | 0 | A | T | 43.5% | 76.6 / 223.9 | 163 | intergenic (+34/+9) | sbcB/yeeD | exodeoxyribonuclease I; exonuclease I/putative TusA family sulfurtransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (54/37); new base T (37/34); total (92/71) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.25e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 165 total aligned reads displayed.
TTTTTGCAGGGTTATGCTGATGAATTGCAGATGCTGGTACAACAATATGCCGATGACAAAGAGAAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACAATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATGTCCTTCTTCTGCCGCCCACTGTGGGATTGCTTCAGTTGCCTGGGTGCAATCAAACTCAATCACTAACTCAT > CP009273/2077551‑2077843 | tttttGCAGGGTTATGCTGATGAATTGCAGATGCTGGTACAACAATATGCCGATGACAAAGAGAAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACa < 1:513996/148‑1 (MQ=255) tttttGCAGGGTTATGCTGATGAATTGCAGATGCTGGTACAACAATATGCCGATGACAAAGAGAAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACa > 2:1762009/1‑148 (MQ=255) ttGCAGGGTTATGCTGATGAATTGCAGATGCTGGTACAACAATATGCCGATGACAAAGAGAAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACAATg < 1:420029/148‑1 (MQ=255) tGCAGGGTTATGCTGATGAATTGCAGATGCTGGTACAACAATATGCCGATGACAAAGAGAAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACAATGt < 1:2007248/148‑1 (MQ=255) cAGGGTTATGCTGATGAAGTGCAGATGCTGGTACAACAATATGCCGATGACAAAGAGAAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTATGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACTATGTTg < 2:448549/148‑1 (MQ=255) aGGGTTATGCTGATGAATTGCAGATGCTGGTACAACAATATGCCGATGACAAAGAGAAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACAATGTTGa < 1:2538907/148‑1 (MQ=255) gggTTATGCTGATGAATTGCAGATGCTGGTACAACAATATGCCGATGACAAAGAGAAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACAATGTTGAg > 1:1680249/1‑148 (MQ=255) ggTTATGCTGATGAATTGCAGATGCTGGTACAACAATATGCCGATGACAAAGAGAAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACTATGTTGAGt > 1:2314099/1‑148 (MQ=255) ggTTATGCTGATGAATTGCAGATGCTGGTACAACAATATGCCGATGACAAAGAGAAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACTATGTTGAGt > 2:2531525/1‑148 (MQ=255) ggTTATGCTGATGAATTGCAGATGCTGGTACAACAATATGCCGATGACAAAGAGAAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACAATGTTGAGt > 2:3516332/1‑148 (MQ=255) gCTGATGAATTGCAGATGCTGGTACAACAATATGCCGATGACAAAGAGAAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACAATGTTGAGTCAGGCt > 1:1195182/1‑148 (MQ=255) atgaATTGCAGATGCTGGTACAACAATATGCCGATGACAAAGAGAAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACAATGTTGAGTCAGGCttttt > 1:3484940/1‑148 (MQ=255) gaATTGCAGATGCTGGTACAACAATATGCCGATGACAAAGAGAAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACTATGTTGAGTCAGGCTTTTTGa > 1:2995849/1‑148 (MQ=255) aTTGCAGATGCTGGTACAACAATATGCCGATGACAAAGAGAAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAAGTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACTATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAAc > 2:3505236/1‑148 (MQ=255) ttGCAGATGCTGGTACAACAATATGCCGATGACAAAGAGAAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACTATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACg > 2:264251/1‑148 (MQ=255) tGCAGATGCTGGTACAACAATATGCCGATGACAAAGAGAAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACTATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACgg > 2:2735617/1‑148 (MQ=255) tGCAGATGCTGGTACAACAATATGCCGATGACAAAGAGAAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACAATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACgg < 2:817158/148‑1 (MQ=255) cAGATGCTGGTACAACAATATGCCGATGACAAAGAGAAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACTATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTg < 1:322363/148‑1 (MQ=255) cAGATGCTGGTACAACAATATGCCGATGACAAAGAGAAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACTATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTg < 1:90834/148‑1 (MQ=255) gATGCTGGTACAACAATATGCCGATGACAAAGAGAAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACTATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGAt > 1:944488/1‑148 (MQ=255) gATGCTGGTACAACAATATGCCGATGACAAAGAGAAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACAATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGAt > 1:2369356/1‑148 (MQ=255) aTGCTGGTACAACAATATGCCGATGACAAAGAGAAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACAATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATg > 1:2622574/1‑148 (MQ=255) aTGCTGGTACAACAATATGCCGATGACAAAGAGAAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACAATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATg > 2:89867/1‑148 (MQ=255) gCTGGTACAACAATATGCCGATGACAAAGAGAAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACTATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCt < 1:1283639/148‑1 (MQ=255) gCTGGTACAACAATATGCCGATGACAAAGAGAAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACAATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCt > 1:697799/1‑148 (MQ=255) cTGGTACAACAATATGCCGATGACAAAGAGAAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACAATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTc > 1:2945485/1‑148 (MQ=255) tGGTACAACAATATGCCGATGACAAAGAGAAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACAATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTcc < 2:1025678/148‑1 (MQ=255) tACAACAATATGCCGATGACAAAGAGAAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACTATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACg > 2:1462381/1‑148 (MQ=255) tACAACAATATGCCGATGACAAAGAGAAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACAATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACg < 2:75354/148‑1 (MQ=255) acaacaATATGCCGATGACAAAGAGAAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACTATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGc > 1:2520152/1‑148 (MQ=255) acaacaATATGCCGATGACAAAGAGAAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACAATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGc > 1:371888/1‑148 (MQ=255) acaacaATATGCCGATGACAAAGAGAAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACAATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGc > 1:2786102/1‑148 (MQ=255) caaTATGCCGATGACAAAGAGAAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACTATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCa < 1:1106696/148‑1 (MQ=255) caaTATGCCGATGACAAAGAGAAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACAATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCa > 2:2207023/1‑148 (MQ=255) tatGCCGATGACAAAGAGAAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACTATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCg > 1:1361336/1‑148 (MQ=255) tatGCCGATGACAAAGAGAAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACAATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCg < 1:2022210/148‑1 (MQ=255) gCCGATGACAAAGAGAAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACTATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCa > 1:3154774/1‑148 (MQ=255) cGATGACAAAGAGAAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACTATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAAt < 2:1154024/148‑1 (MQ=255) gATGACAAAGAGAAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACTATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATc < 2:1799022/148‑1 (MQ=255) gATGACAAAGAGAAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACAATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATc < 1:294720/148‑1 (MQ=255) tGACAAAGAGAAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACCATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCACTctg > 1:1158687/1‑148 (MQ=255) tGACAAAGAGAAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACAATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATctg > 1:1158717/1‑148 (MQ=255) aCAAAGAGAAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACAATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATctgct > 2:2952507/1‑148 (MQ=255) aaaGAGAAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACTATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGa < 1:1011750/148‑1 (MQ=255) aaaGAGAAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACTATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGa > 1:748316/1‑148 (MQ=255) aaGAGAAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACAATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGAt < 2:2385886/148‑1 (MQ=255) agagAAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACAATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATa > 2:2055600/1‑148 (MQ=255) gagaAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACTATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATaa < 2:2325240/148‑1 (MQ=255) gagaAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACAATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATaa > 2:3226826/1‑148 (MQ=255) gagaAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACAATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATaa > 2:3226827/1‑148 (MQ=255) gagaAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACAATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATaa < 2:1518057/148‑1 (MQ=255) agaAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACTATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAAt > 1:1282972/1‑148 (MQ=255) gaAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACAATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATc > 1:1940936/1‑148 (MQ=255) aGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACTATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGt < 1:1408492/148‑1 (MQ=255) aGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACAATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGt > 2:1534087/1‑148 (MQ=255) tGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACAATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGa < 1:686626/148‑1 (MQ=255) cTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACAATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCa < 2:352659/148‑1 (MQ=255) gTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTTCGGCGGAGGACTATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATg < 2:1371638/148‑1 (MQ=255) gTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACTATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATg < 2:3139225/148‑1 (MQ=255) aaaaGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACAATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATGTcc > 2:1444645/1‑148 (MQ=255) aaaGCACTTTGGCAGTACGCGGACGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACAATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATGTCct > 1:948531/1‑148 (MQ=255) aaGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACTATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATGTCctt > 2:3074435/1‑148 (MQ=255) aaGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACTATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATGTCctt > 1:1615591/1‑148 (MQ=255) aaGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACAATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATGTCctt < 2:3484940/148‑1 (MQ=255) aGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACAATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATGTCcttc > 2:2041007/1‑148 (MQ=255) ttGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACTATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATGTCCTTCTTCTgc > 1:2302936/1‑148 (MQ=255) tACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACTATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATGTCCTTCTTCTGCCGCCCAc > 2:3492590/1‑148 (MQ=255) cgGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACAATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATGTCCTTCTTCTGCCGCCCACtgtg < 1:2118946/148‑1 (MQ=255) gAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACTATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATGTCCTTCTTCTGCCGCCCACTGTggg < 2:2602641/148‑1 (MQ=255) agagATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACAATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATGTCCTTCTTCTGCCGCCCACTGTGGGAt > 1:1530157/1‑148 (MQ=255) gagaTTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACTATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATGTCCTTCTTCTGCCGCCCACTGTGGGAtt > 2:2372528/1‑148 (MQ=255) gaTTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACTATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATGTCCTTCTTCTGCCGCCCACTGTGGGATTGc > 1:1833769/1‑148 (MQ=255) tGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACAATGTTGGGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATGTCCTTCTTCTGCCGCCCACTGTGGGATTGCTTc > 1:3385320/1‑148 (MQ=255) aaTTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACTATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATGTCCTTCTTCTGCCGCCCACTGTGGGATTGCTTCAGTTg > 1:488446/1‑148 (MQ=255) aaTTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACTATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATGTCCTTCTTCTGCCGCCCACTGTGGGATTGCTTCAGTTg > 1:488134/1‑148 (MQ=255) aTTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACTATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATGTCCTTCTTCTGCCGCCCACTGTGGGATTGCTTCAGTTGc < 1:1462381/148‑1 (MQ=255) tttGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACAATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATGTCCTTCTTCTGCCGCCCACTGTGGGATTGCTTCAGTTGcc > 1:3060482/1‑148 (MQ=255) tttGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACAATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATGTCCTTCTTCTGCCGCCCACTGTGGGATTGCTTCAGTTGcc > 1:3060409/1‑148 (MQ=255) ccTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACAATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATGTCCTTCTTCTGCCGCCCACTGTGGGATTGCTTCAGTTGCCTGGGTGc > 2:3078001/1‑148 (MQ=255) cTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACTATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATGTCCTTCTTCTGCCGCCCACTGTGGGATTGCTTCAGTTGCCTGGGTGCa < 2:748300/148‑1 (MQ=255) cTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACTATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATGTCCTTCTTCTGCCGCCCACTGTGGGATTGCTTCAGTTGCCTGGGTGCa < 2:2353687/148‑1 (MQ=255) cTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACAATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATGTCCTTCTTCTGCCGCCCACTGTGGGATTGCTTCAGTTGCCTGGGTGCa > 2:1108234/1‑148 (MQ=255) tCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACTATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATGTCCTTCTTCTGCCGCCCACTGTGGGATTGCTTCAGTTGCCTGGGTGCaa < 2:1307295/148‑1 (MQ=255) tCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACAATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATGTCCTTCTTCTGCCGCCCACTGTGGGATTGCTTCAGTTGCCTGGGTGCaa > 2:581000/1‑148 (MQ=255) tCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACAATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATGTCCTTCTTCTGCCGCCCACTGTGGGATTGCTTCAGTTGCCTGGGTGCaa > 2:570213/1‑148 (MQ=255) tCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACAATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATGTCCTTCTTCTGCCGCCCACTGTGGGATTGCTTCAGTTGCCTGGGTGCaa > 1:1770312/1‑148 (MQ=255) ccgccgCTGGTACGGCGGAGGACAATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATGTCCTTCTTCTGCCGCCCACTGTGGGATTGCTTCAGTTGCCTGGGTGCAAt < 2:1703873/148‑1 (MQ=255) cgcTGGTACGGCGGAGGACAATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATGTCCTTCTTCTGCCGCCCACTGTGGGATTGCTTCAGTTGCCTGGGTGCAATCaaa < 2:1907728/148‑1 (MQ=255) ggTACGGCGGAGGACAATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATGTCCTTCTTCTGCCGCCCACTGTGGGATTGCTTCAGTTGCCTGGGTGCAATCAAACTCa < 1:1895265/148‑1 (MQ=255) ggTACGGCGGAGGACAATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATGTCCTTCTTCTGCCGCCCACTGTGGGATTGCTTCAGTTGCCTGGGTGCAATCAAACTCa < 2:1155032/148‑1 (MQ=255) tACGGCGGAGGACTATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATGTCCTTCTTCTGCCGCCCACTGTGGGATTGCTTCAGTTGCCTGGGTGCAATCAAACTCAAt < 2:807294/148‑1 (MQ=255) aCGGCGGAGGACAATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATGTCCTTCTTCTGCCGCCCACTGTGGGATTGCTTCAGTTGCCTGGGTGCAATCAAACTCAATc > 2:499243/1‑148 (MQ=255) aCGGCGGAGGACAATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATGTCCTTCTTCTGCCGCCCACTGTGGGATTGCTTCAGTTGCCTGGGTGCAATCAAACTCAATc > 2:2580745/1‑148 (MQ=255) gcggAGGACTATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATGTCCTTCTTCTGCCGCCCACTGTGGGATTGCTTCAGTTGCCTGGGTGCAATCAAACTCAATCACt > 1:2618451/1‑148 (MQ=255) gcggAGGACAATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATGTCCTTCTTCTGCCGCCCACTGTGGGATTGCTTCAGTTGCCTGGGTGCAATCAAACTCAATCACt < 1:2810204/148‑1 (MQ=255) ggaggaCAATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATGTCCTTCTTCTGCCGCCCACTGTGGGATTGCTTCAGTTGCCTGGGTGCAATCAAACTCAATCACTaa < 2:653925/148‑1 (MQ=255) aggaCTATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATGTCCTTCTTCTGCCGCCCACTGTGGGATTGCTTCAGTTGCCTGGGTGCAATCAAACTCAATCACTAACt < 2:3492553/148‑1 (MQ=255) aggaCTATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATGTCCTTCTTCTGCCGCCCACTGTGGGATTGCTTCAGTTGCCTGGGTGCAATCAAACTCAATCACTAACt > 1:1499725/1‑148 (MQ=255) gaCTATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATGTCCTTCTTCTGCCGCCCACTGTGGGATTGCTTCAGTTGCCTGGGTGCAATCAAACTCAATCACTAACTCa < 1:2146941/148‑1 (MQ=255) aCAATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATGTCCTTCTTCTGCCGCCCACTGTGGGATTGCTTCAGTTGCCTGGGTGCAATCAAACTCAATCACTAACTCAt < 2:2907021/148‑1 (MQ=255) | TTTTTGCAGGGTTATGCTGATGAATTGCAGATGCTGGTACAACAATATGCCGATGACAAAGAGAAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACAATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATGTCCTTCTTCTGCCGCCCACTGTGGGATTGCTTCAGTTGCCTGGGTGCAATCAAACTCAATCACTAACTCAT > CP009273/2077551‑2077843 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |