| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,139,910 | G→T | 100% | R1055L (CGA→CTA) | yegE → | putative diguanylate cyclase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,139,910 | 0 | G | T | 100.0% | 647.8 / NA | 193 | R1055L (CGA→CTA) | yegE | putative diguanylate cyclase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (68/125); total (68/125) | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 193 total aligned reads displayed.
CAGGTGGGCCGCGATCTGCAAATCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCGACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAGTTATTTCGC > CP009273/2139765‑2140054 | cAGGTGGGCCGCGATCTGCAAATCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTCCTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTAc > 1:2162483/1‑148 (MQ=255) aGGTGGGCCGCGATCTGCAAATCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACt > 2:1887344/1‑148 (MQ=255) aGGTGGGCCGCGATCTGCAAATCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACt < 1:1535413/148‑1 (MQ=255) gTGGGCCGCGATCTGCAAATCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCg > 2:2918650/1‑148 (MQ=255) gTGGGCCGCGATCTGCAAATCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCg > 1:587208/1‑148 (MQ=255) cgcgATCTGCAAATCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGCTGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGa > 1:2285220/1‑148 (MQ=255) aTCTGCAAATCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAAc < 2:1971189/148‑1 (MQ=255) aTCTGCAAATCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGAGGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAAc > 1:2474365/1‑148 (MQ=255) tCTGCAAATCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAAcc < 2:3144323/148‑1 (MQ=255) cTGCAAATCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCa < 2:341427/148‑1 (MQ=255) cTGCAAATCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCa < 1:3259431/148‑1 (MQ=255) cTGCAAATCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCa < 2:1515628/148‑1 (MQ=255) tacAAATCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCAt < 1:792569/146‑1 (MQ=255) tGCAAATCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCAt < 1:1689891/148‑1 (MQ=255) gCAAATCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATc > 1:2942957/1‑148 (MQ=255) aaTCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGcc < 1:2707681/148‑1 (MQ=255) aTCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCg > 2:850881/1‑148 (MQ=255) aTCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCg > 1:2381256/1‑148 (MQ=255) cTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCggg < 2:1369318/148‑1 (MQ=255) 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aaaGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTAc > 1:3099530/1‑148 (MQ=255) aaGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTAcc < 1:2523822/148‑1 (MQ=255) aaGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTAcc < 2:2413918/148‑1 (MQ=255) aGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTAccc < 2:1274912/148‑1 (MQ=255) aGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTAccc > 2:1803929/1‑148 (MQ=255) cGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCtt < 1:3507929/148‑1 (MQ=255) atatGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGAGGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGt > 1:549374/1‑148 (MQ=255) tGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGAt < 1:2593317/148‑1 (MQ=255) gCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATgg < 1:2986094/148‑1 (MQ=255) gCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATgg < 1:1904391/148‑1 (MQ=255) gCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATgg < 2:64049/148‑1 (MQ=255) gCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATgg < 2:440123/148‑1 (MQ=255) cAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGa < 2:176677/148‑1 (MQ=255) gATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCCGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATa > 2:3305470/1‑148 (MQ=255) aTTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATAc > 2:128056/1‑148 (MQ=255) 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tGCGCCATCGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGa < 2:2647934/148‑1 (MQ=255) tGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGa < 1:731795/148‑1 (MQ=255) gcCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGAttt < 2:1758031/148‑1 (MQ=255) gcCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGAttt < 2:1123958/148‑1 (MQ=255) gcCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGAttt < 2:1123726/148‑1 (MQ=255) 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aaTTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTg < 2:2669443/148‑1 (MQ=255) tttGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATAAGCTTTCTGGCCTCGGCGGCGATCTGTTTTTTTGTGTGGTGATTGcc > 1:1264062/1‑148 (MQ=255) atgAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCa > 1:1373808/1‑148 (MQ=255) tgAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCaa < 1:2765310/148‑1 (MQ=255) gaTGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCg < 2:336483/148‑1 (MQ=255) 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gATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGAt < 1:842119/148‑1 (MQ=255) aTTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTGTTAACCGTAGTGGTGGATAAGCGTTATGGCAACGGCGTCGATGTGATTTATGGTGTGGTGTTTTGCGCTGCCCAACCCCAGGAtt > 1:3322094/1‑148 (MQ=255) tACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGTCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTg < 2:738109/148‑1 (MQ=255) tACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTg < 2:1146781/148‑1 (MQ=255) tACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCGTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTg > 2:2261672/1‑148 (MQ=255) attattCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTgg > 2:3175439/1‑148 (MQ=255) ttattCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCGTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGGTTTGCTGGt > 1:2634873/1‑148 (MQ=255) tattCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTg < 1:2773953/148‑1 (MQ=255) attCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCGTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGa > 2:2467473/1‑148 (MQ=255) tCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCCTCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCCACCGCTGGATTTGCTGGTGact > 2:3039080/1‑146 (MQ=255) tCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAAt < 1:2863334/148‑1 (MQ=255) tCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAAt < 2:3388535/148‑1 (MQ=255) tCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAAt < 1:1263242/148‑1 (MQ=255) gggCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTGTTACCCTTATTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTGGATGTGATTTATGGTGTGGTGGTTGCCGATGCCCAAACGCTGGGTTTTCTGGTGTAtagta > 1:1297083/1‑148 (MQ=255) ggCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAAtagtag < 2:2285220/148‑1 (MQ=255) cACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAGtt < 2:1566601/148‑1 (MQ=255) aCGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAGTTa < 1:535452/148‑1 (MQ=255) aCGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAGTTa < 1:3150135/148‑1 (MQ=255) cGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAGTTAt < 2:2782866/148‑1 (MQ=255) gCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAGTTAtt < 1:316246/148‑1 (MQ=255) aGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAGTTATTTcgc < 2:1568553/148‑1 (MQ=255) | CAGGTGGGCCGCGATCTGCAAATCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCGACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAGTTATTTCGC > CP009273/2139765‑2140054 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |