| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,727,416 | C→A | 100% | L39L (CTG→CTT) | clpB ← | protein disaggregation chaperone |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,727,416 | 0 | C | A | 96.8% | 682.5 / 10.4 | 220 | L39L (CTG→CTT) | clpB | protein disaggregation chaperone |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (6/1); new base A (113/100); total (119/101) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.28e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 226 total aligned reads displayed.
CCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTT > CP009273/2727271‑2727558 | ccAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTaag > 1:2407155/1‑148 (MQ=255)ccAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTaag > 1:403952/1‑148 (MQ=255)ccAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTaag < 2:2609834/148‑1 (MQ=255) aTCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAgg > 2:735183/1‑148 (MQ=255) tCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAggg > 1:407342/1‑148 (MQ=255) ccTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGgc > 1:1879209/1‑148 (MQ=255) cTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGgcg > 1:3337726/1‑148 (MQ=255) cTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGgcg < 2:1099610/148‑1 (MQ=255) aTGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCAt < 2:2465465/148‑1 (MQ=255) cTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTaaa > 1:3143512/1‑148 (MQ=255) ggACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATg < 2:2208978/148‑1 (MQ=255) gACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGa > 2:1091357/1‑148 (MQ=255) aCATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAAGAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGaa > 1:1406594/1‑148 (MQ=255) cATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAg > 1:1769457/1‑148 (MQ=255) cATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAg < 1:346084/148‑1 (MQ=255) tCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTg < 2:3078827/148‑1 (MQ=255) caccacCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTgg > 2:861555/1‑148 (MQ=255) ccaccaGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGtt < 2:1654229/148‑1 (MQ=255) ccaccaGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGtt < 1:2330869/148‑1 (MQ=255) accaGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCg < 2:1757626/148‑1 (MQ=255) aGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATa > 2:572011/1‑148 (MQ=255) gTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATaa < 1:2057789/148‑1 (MQ=255) tACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATaaa > 2:2276507/1‑148 (MQ=255) tACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATaaa < 1:861555/148‑1 (MQ=255) aCCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAAt > 1:1723032/1‑148 (MQ=255) cTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTg < 1:964768/148‑1 (MQ=255) ttCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTgg < 1:3251261/148‑1 (MQ=255) ccTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTc > 1:1179618/1‑148 (MQ=255) cTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCg < 2:166981/148‑1 (MQ=255) tGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGt > 1:3018714/1‑148 (MQ=255) gCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTg > 2:3446221/1‑148 (MQ=255) tAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCg < 1:193474/148‑1 (MQ=255) tAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATCTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCg > 1:144135/1‑148 (MQ=255) aaaCGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGa < 1:2542624/148‑1 (MQ=255) aaCGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAg > 1:2149226/1‑148 (MQ=255) cGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTg < 2:1700183/148‑1 (MQ=255) ttAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAg < 1:2802702/148‑1 (MQ=255) ttAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAg < 1:1324783/148‑1 (MQ=255) actGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGTTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTg < 1:1040636/146‑1 (MQ=255) aaTGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTg < 1:1041419/148‑1 (MQ=255) aTGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGa < 2:1494804/148‑1 (MQ=255) aTGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGa < 2:3241808/148‑1 (MQ=255) aTGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGa > 1:1948221/1‑148 (MQ=255) tGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGAt < 2:3201449/148‑1 (MQ=255) gCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGAtt > 2:3342171/1‑148 (MQ=255) gCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGAtt > 2:2034518/1‑148 (MQ=255) cTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTgg < 2:2959433/148‑1 (MQ=255) tgattgatATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTggg > 1:2766653/1‑148 (MQ=255) gattgatATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGc > 1:2170027/1‑148 (MQ=255) attgatATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCa < 2:2091831/148‑1 (MQ=255) tatCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGc > 2:2938582/1‑148 (MQ=255) gtgCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAagag > 2:1895717/1‑148 (MQ=255) cgcAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCaa < 2:1141206/148‑1 (MQ=255) gcAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAg < 1:225510/148‑1 (MQ=255) cAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGc < 1:1622034/148‑1 (MQ=255) cTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTgg > 2:3530437/1‑148 (MQ=255) cTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGAGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTgg > 2:441549/1‑148 (MQ=255) ggCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGaa < 1:577729/148‑1 (MQ=255) ggCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGaa > 1:1485670/1‑148 (MQ=255) gCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAAt > 1:2841140/1‑148 (MQ=255) gCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGTGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAAt > 1:1103560/1‑148 (MQ=255) gCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAAt > 1:735575/1‑148 (MQ=255) aGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATtta > 2:1335607/1‑148 (MQ=255) cATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATttatt > 2:1115213/1‑148 (MQ=255) ttATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGt > 2:1207871/1‑148 (MQ=255) ttATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGt > 2:1848975/1‑148 (MQ=255) aTGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAATTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTaa > 1:2341644/1‑148 (MQ=255) tGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAg < 1:2276507/148‑1 (MQ=255) tGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAg < 2:2923944/148‑1 (MQ=255) tGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAg < 1:3228528/148‑1 (MQ=255) gCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGa > 2:1668788/1‑148 (MQ=255) aTGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCTAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAg < 1:3410817/148‑1 (MQ=255) ataaAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCAt < 2:2387896/148‑1 (MQ=255) ataaAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCAt < 2:2387242/148‑1 (MQ=255) aaGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAAc > 1:972581/1‑148 (MQ=255) aaGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAAc > 1:1751431/1‑148 (MQ=255) aaGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAAc > 2:2306153/1‑148 (MQ=255) aaGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAAc > 1:156235/1‑148 (MQ=255) gACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAActcc > 1:293895/1‑148 (MQ=255) aCTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAActcct > 1:663059/1‑148 (MQ=255) aaCCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTccc > 1:3275774/1‑148 (MQ=255) aCCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCa > 2:1151368/1‑148 (MQ=255) ccGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCAt > 1:514146/1‑148 (MQ=255) gAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATaa > 2:2752157/1‑148 (MQ=255) 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ccccTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGa < 2:1364085/148‑1 (MQ=255) cccTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGAt > 1:2046289/1‑148 (MQ=255) cccTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGAt < 2:76497/148‑1 (MQ=255) ccTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATc > 1:30773/1‑148 (MQ=255) ttCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCaa < 1:825687/148‑1 (MQ=255) ttCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCaa < 1:1131877/148‑1 (MQ=255) tCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCaaa < 2:2781975/148‑1 (MQ=255) ccTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAg < 1:389167/148‑1 (MQ=255) ccTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAg < 1:1287996/148‑1 (MQ=255) cTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGt < 2:3337719/148‑1 (MQ=255) tGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGtt < 1:3307131/148‑1 (MQ=255) | CCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTT > CP009273/2727271‑2727558 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |