| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,736,714 | C→A | 100% | R325S (CGC→AGC) | yfiN → | putative membrane‑anchored diguanylate cyclase with an N‑terminal periplasmic domain |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,736,714 | 0 | C | A | 95.6% | 687.0 / 19.1 | 227 | R325S (CGC→AGC) | yfiN | putative membrane‑anchored diguanylate cyclase with an N‑terminal periplasmic domain |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (5/5); new base A (125/92); total (130/97) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.48e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 227 total aligned reads displayed.
CCGAAAAACGTCGGCGTTACTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGACATTAAGCA > CP009273/2736569‑2736858 | aaaaCGTCGGCGTTACTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTgg > 2:2834784/1‑148 (MQ=255) aaaaCGTCGGCGTTACTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTgg < 1:232258/148‑1 (MQ=255) aCGTCGGCGTTACTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAATCATACAGCCAGggcg > 2:923342/1‑148 (MQ=255) tCGGCGTTACTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGgcggcg < 1:1569732/148‑1 (MQ=255) cGTTACTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGa > 1:652056/1‑148 (MQ=255) cGTTACTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGa > 1:3322064/1‑148 (MQ=255) ttACTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAAt > 1:3493861/1‑148 (MQ=255) aCTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTc > 1:656971/1‑148 (MQ=255) cTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCg < 2:132895/148‑1 (MQ=255) cTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCg < 2:2561509/148‑1 (MQ=255) cTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCg > 1:1661704/1‑148 (MQ=255) tATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGc > 2:1826028/1‑148 (MQ=255) aTTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCt < 1:3149455/148‑1 (MQ=255) aTTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCt > 2:2232378/1‑148 (MQ=255) cTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATgg < 2:1065874/148‑1 (MQ=255) cTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATgg > 2:2621543/1‑148 (MQ=255) gATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGc < 2:2907457/148‑1 (MQ=255) aTGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGct < 2:2025789/148‑1 (MQ=255) aTGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGct < 2:2027403/148‑1 (MQ=255) aTGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGct < 2:125914/148‑1 (MQ=255) aTGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGct < 2:1060490/148‑1 (MQ=255) aTGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGct < 1:1284411/148‑1 (MQ=255) aTGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGct > 2:2676950/1‑148 (MQ=255) tGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGctc < 2:352236/148‑1 (MQ=255) tGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGctc > 2:3127336/1‑148 (MQ=255) gCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTa < 1:546215/148‑1 (MQ=255) gATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTatg < 2:1535732/148‑1 (MQ=255) gATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTatg > 2:1099817/1‑148 (MQ=255) aTTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGt < 2:3355111/148‑1 (MQ=255) aTTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGt > 2:2504928/1‑148 (MQ=255) ttCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTAc > 2:262753/1‑148 (MQ=255) tACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCgg > 1:1009910/1‑148 (MQ=255) aTCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAAt < 1:1144126/148‑1 (MQ=255) tCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATc > 1:1546887/1‑148 (MQ=255) tCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGATGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATc > 2:1015186/1‑148 (MQ=255) cAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAATCGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCt < 2:3457110/148‑1 (MQ=255) aaTGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTg > 2:43135/1‑148 (MQ=255) gATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAg > 2:3553022/1‑148 (MQ=255) aTACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGt > 1:3283313/1‑148 (MQ=255) tACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTg < 2:1342550/148‑1 (MQ=255) tACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTg > 2:2196560/1‑148 (MQ=255) aCCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTgc > 2:975786/1‑148 (MQ=255) aCCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTgc > 1:2985023/1‑148 (MQ=255) cTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTgcag < 1:2626259/148‑1 (MQ=255) ggggTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTgcagca > 2:2196882/1‑148 (MQ=255) gggTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGcagcag < 1:2529639/148‑1 (MQ=255) aTGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATg > 1:2953736/1‑148 (MQ=255) aTGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATg < 1:2324311/148‑1 (MQ=255) gCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGtt > 1:1876659/1‑148 (MQ=255) aCGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAg < 2:652147/148‑1 (MQ=255) ggCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCAc > 1:1346337/1‑148 (MQ=255) cGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTg < 2:746322/148‑1 (MQ=255) cGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTg < 2:98954/148‑1 (MQ=255) aTAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGac > 2:1474604/1‑148 (MQ=255) aTAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGac < 2:1442009/148‑1 (MQ=255) aTAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGac > 2:3240256/1‑148 (MQ=255) aTAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGac < 2:3222883/148‑1 (MQ=255) tAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGaca > 2:47534/1‑148 (MQ=255) agagTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGacac < 2:872407/148‑1 (MQ=255) tCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAAt > 2:1149175/1‑148 (MQ=255) cTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATc > 1:1220396/1‑148 (MQ=255) cTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATc > 1:1974899/1‑148 (MQ=255) ttgattgaAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCt < 1:3454345/148‑1 (MQ=255) tgattgaAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCtt > 2:556315/1‑148 (MQ=255) attgaAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTa > 2:227258/1‑148 (MQ=255) ttgaAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTaa > 2:3534613/1‑148 (MQ=255) aaaTCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAAtct < 1:1104328/148‑1 (MQ=255) aaaTCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAAtct < 2:2998080/148‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAAtctc < 2:3446613/148‑1 (MQ=255) aTCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCAGCCAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTGTAAGCTcc > 2:2764660/1‑148 (MQ=255) tCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTccc > 2:535748/1‑148 (MQ=255) tCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTccc > 2:2065348/1‑148 (MQ=255) cGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCg > 1:2070580/1‑148 (MQ=255) aaaaCGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGttt > 1:3024354/1‑148 (MQ=255) aaCGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGa > 1:2814210/1‑148 (MQ=255) aaCGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGa > 1:1854531/1‑148 (MQ=255) aCGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGAt > 1:486626/1‑148 (MQ=255) cGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATc < 1:764392/148‑1 (MQ=255) cGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATc < 2:3353351/148‑1 (MQ=255) ggTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCt < 2:1569611/148‑1 (MQ=255) gTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCtt > 1:3535229/1‑148 (MQ=255) gTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCtt > 1:1693323/1‑148 (MQ=255) ttAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTc < 2:441613/148‑1 (MQ=255) ttAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTc > 2:1870418/1‑148 (MQ=255) gAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATg < 2:180774/148‑1 (MQ=255) aaTTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATgg < 1:203183/148‑1 (MQ=255) aaTTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATgg < 1:2232378/148‑1 (MQ=255) tttGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGcc > 1:731931/1‑148 (MQ=255) tttGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGcc > 2:3322939/1‑148 (MQ=255) ggCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATc < 2:2448741/148‑1 (MQ=255) gCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGacc > 2:3418859/1‑148 (MQ=255) aCATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATg > 2:2770224/1‑148 (MQ=255) cATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGa > 2:848403/1‑148 (MQ=255) aTAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATATCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGAc > 2:957129/1‑148 (MQ=255) cATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGACATTAAg > 1:1795662/1‑148 (MQ=255) aTACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGACATTAAGc < 2:679751/148‑1 (MQ=255) tACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGACATTAAGCa < 1:923550/148‑1 (MQ=255) tACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGACATTAAGCa < 1:2676950/148‑1 (MQ=255) tACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGACATTAAGCa < 1:923146/148‑1 (MQ=255) tACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGACATTAAGCa < 2:1661704/148‑1 (MQ=255) | CCGAAAAACGTCGGCGTTACTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGACATTAAGCA > CP009273/2736569‑2736858 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |