| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,993,699 | C→A | 100% | intergenic (‑449/‑5) | ygeR ← / → xdhA | LysM domain‑containing M23 family putative peptidase; septation lipoprotein/xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,993,699 | 0 | C | A | 99.4% | 551.6 / ‑4.2 | 167 | intergenic (‑449/‑5) | ygeR/xdhA | LysM domain‑containing M23 family putative peptidase; septation lipoprotein/xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base A (86/80); total (86/81) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.85e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 184 total aligned reads displayed.
TCACACTTCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAATGATGAACAAGC > CP009273/2993556‑2993843 | tcaCACTTCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTGTGGCGTAAATCGTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTTCCATAAGAACCCAATGTTAAAATCGAGGGGCTTTGTATGGAAGCGCGGGAAGCCACCGCGACGGGGGAATaatgc > 1:1299355/1‑148 (MQ=255)tcaCACTTCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTTCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATaatgc > 1:227710/1‑148 (MQ=255)tcaCACTTCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATaatgc < 1:78783/148‑1 (MQ=255)tcaCACTTCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATaatgc < 2:3239310/148‑1 (MQ=255)tcaCACTTCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCGTGCCTGCTTAGACTAAATATTTTCCATAAGAACCAACAGTTCAAATCGTGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGCATaatgc > 1:227249/1‑148 (MQ=255) cacaCTTCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATaatgca > 2:134959/1‑148 (MQ=255) acacTTCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATaatgcat < 1:2568669/148‑1 (MQ=255) acacTTCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAAACAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATaatgcat > 2:675049/1‑148 (MQ=255) cacTTCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATaatgcatg < 1:1361972/148‑1 (MQ=255) cTTCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATgcg < 1:1330116/148‑1 (MQ=255) ttCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTGTGTGGCGTAAATCATGCCTGCGTAGACTAAATCTTTGGCCTAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGCTTTCTATGGGAGCGCGGGACGCAACCGCTACGGGTGAATAATTCATgcgc > 1:1592637/1‑148 (MQ=255) tACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATATTGCCTGCTTAGACTAAAACTTTGCCATAAGAAACAAATTTTAAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCg > 1:3038183/1‑148 (MQ=255) ccTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTTCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCAt > 2:1926012/1‑148 (MQ=255) tAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTg < 2:1606440/148‑1 (MQ=255) gCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTaa < 2:1430562/148‑1 (MQ=255) tATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGt < 2:2294336/148‑1 (MQ=255) aTCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTAAGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTc > 2:570613/1‑148 (MQ=255) aTCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCAGCTTAGACTAAATCTTTGCCAAAAGAACCAAATGTTCAAATCCAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAACCAACCCCAACGGGTGAATAATTCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTc > 2:570254/1‑148 (MQ=255) cgtcgtTTCTGGCGTAAATCGTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCAc < 1:3394518/148‑1 (MQ=255) tttCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACcgggc > 2:2761961/1‑148 (MQ=255) tttCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTCGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACcgggc > 2:946580/1‑148 (MQ=255) ttCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACcgggcg < 1:2975798/148‑1 (MQ=255) cGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACg < 1:2661978/148‑1 (MQ=255) cGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACg > 1:2313052/1‑148 (MQ=255) gTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGa < 1:3208781/148‑1 (MQ=255) gTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGa < 1:3293661/148‑1 (MQ=255) aTCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGAtata > 2:2207094/1‑148 (MQ=255) aTCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGAtata < 1:3497663/148‑1 (MQ=255) aTCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGAtata < 2:1937580/148‑1 (MQ=255) aTCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGAtata < 1:1567382/148‑1 (MQ=255) ttGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTg < 2:803945/148‑1 (MQ=255) ccTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACg > 1:2801315/1‑148 (MQ=255) ccTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACg < 2:2374009/148‑1 (MQ=255) tGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGAt < 1:587780/148‑1 (MQ=255) gCTTAGACTAAATCTTTGACATAAGAACCAAATGTTCAAATAGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGTGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGAtt < 1:2896277/148‑1 (MQ=255) cTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGAtta > 1:3208265/1‑148 (MQ=255) cTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGAtta < 1:446456/148‑1 (MQ=255) ttAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGAttat > 1:1081833/1‑148 (MQ=255) ttAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGAttat > 1:1082320/1‑148 (MQ=255) gACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGAttatgtt > 2:1042949/1‑148 (MQ=255) gACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGAttatgtt < 1:3355573/148‑1 (MQ=255) aCTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGAttatgtta > 1:399489/1‑148 (MQ=255) tAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGAttatgttatg < 2:312253/148‑1 (MQ=255) aaaTCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGTGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATgg < 2:1259744/148‑1 (MQ=255) aaaTCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATgg < 2:1259780/148‑1 (MQ=255) tCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCgg > 1:2740744/1‑148 (MQ=255) cTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATAGTGACGATTATGTTATGGCggg > 1:953875/1‑148 (MQ=255) cTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCggg > 1:953808/1‑148 (MQ=255) aTAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATCCTGACGATTATGTTATGGCGGGCATgtgt > 1:2155932/1‑148 (MQ=255) aTAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATgtgt < 1:2249087/148‑1 (MQ=255) tAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGtt > 2:2720534/1‑148 (MQ=255) tAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGAATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTGATGGCGGGCATGTGtt > 2:2248968/1‑148 (MQ=255) aaGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTa > 1:1284750/1‑148 (MQ=255) aaGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTa < 2:2154692/148‑1 (MQ=255) aaCCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGc > 2:757056/1‑148 (MQ=255) aaCCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGc > 1:1072415/1‑148 (MQ=255) ccAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGa > 2:1860993/1‑148 (MQ=255) cAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGaa < 1:423103/148‑1 (MQ=255) aTGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAata > 1:183346/1‑148 (MQ=255) aTGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAata < 2:40921/148‑1 (MQ=255) aTGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAata > 1:248926/1‑148 (MQ=255) gTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATg < 1:1019776/148‑1 (MQ=255) gTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATg > 1:2239288/1‑148 (MQ=255) ttCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGt < 1:844763/148‑1 (MQ=255) tCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTa > 2:2470619/1‑148 (MQ=255) cAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTAc > 2:1536075/1‑148 (MQ=255) cAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTAc > 1:3014800/1‑148 (MQ=255) cAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTAc > 2:3312848/1‑148 (MQ=255) aaTCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGt < 1:674814/148‑1 (MQ=255) aTCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTa > 2:2408777/1‑148 (MQ=255) gAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGcc < 1:3042240/148‑1 (MQ=255) ggggATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCt > 1:1766677/1‑148 (MQ=255) ggggATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCAGTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCt > 2:154735/1‑148 (MQ=255) gggATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGTCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTa < 2:2008468/148‑1 (MQ=255) ggATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTAt > 2:1715967/1‑148 (MQ=255) aTTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCg > 2:1486520/1‑148 (MQ=255) ttCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGca > 2:2883207/1‑148 (MQ=255) cTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGcaca > 2:1928226/1‑148 (MQ=255) tATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACAt < 2:3038183/148‑1 (MQ=255) tGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATgg < 1:799606/148‑1 (MQ=255) tGGAAGCGCGGGAAGCAACAGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTAGATGCCATTGCTAAGGTAACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCTGTCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTATCCCTATCGCACATgg < 1:2595992/148‑1 (MQ=255) gcgcGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATg > 2:294704/1‑148 (MQ=255) gAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTaa < 1:3005977/148‑1 (MQ=255) gAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTaa > 2:1887641/1‑148 (MQ=255) aGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGt < 1:176360/148‑1 (MQ=255) aGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGt < 2:1082317/148‑1 (MQ=255) gCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTa < 2:3545207/148‑1 (MQ=255) cAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTAt > 1:2608925/1‑148 (MQ=255) cAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATAGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTag > 1:2608404/1‑147 (MQ=255) cGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAat < 1:1258271/148‑1 (MQ=255) gCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATTTACTTACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCTTAAGTATTAatg < 2:1288911/148‑1 (MQ=255) cTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAatga < 2:66482/148‑1 (MQ=255) aCGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAatgatg > 2:510117/1‑148 (MQ=255) cGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAAtgatga < 1:73356/148‑1 (MQ=255) cGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAAtgatga < 2:248926/148‑1 (MQ=255) cGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAAtgatga < 1:1119229/148‑1 (MQ=255) gAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAATGATGAACAAg > 2:2911494/1‑148 (MQ=255) gAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAATGATGAACAAg > 2:1988931/1‑148 (MQ=255) aataatGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAATGATGAACAAGc > 1:1897236/1‑148 (MQ=255) aataatGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAATGATGAACAAGc > 1:1897185/1‑148 (MQ=255) | TCACACTTCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAATGATGAACAAGC > CP009273/2993556‑2993843 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |