New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | CP009273 | 3744959 = | 197 (0.970) | 453 (2.230) | 175/274 | NT | 72.2% | coding (270/741 nt) | yiaT | putative outer membrane protein |
? | CP009273 | = 3752673 | 152 (0.750) | coding (549/1845 nt) | selB | selenocysteinyl‑tRNA‑specific translation factor |
Only 100 of 488 total aligned reads displayed.
GAAAATACGAAGGCAATTCCGCTGATTAGTTATGAAGGTGATACTTTTTATGTTCGTCAGACCACGTTAGGTTTTATTCTGTCGCAAAGTGAAAAAAATGAACTTAGCCTGACCGCATCCTGGATGCCGCTGGAATTTGACCCTACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/3745105‑3744959 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCGTAAAAGGTGCCGGGCTGGTCGTCACCGGTACGGCGTTAAGCGGGGAAGTGAAGGTAGGCGATTCACTCTGGCTGACTGGTGTAAATAAACCGATGCGTGTACGTGCGCTGCATGCGCAAAACCAGCCAACAGAAACCGCCAA < CP009273/3752673‑3752527 AAATACGAAGGCAATTCCGCTGATTAGTTATGAAGGTGATACTTTTTATGTTCGTCAGACCACGTTAGGTTTTATTCTGTCGCAAAGTGAAAAAAATGAACTTAGCCTGACCGCATCCTGGATGCCGCTGGAATTTGACCCTACCTAC < 2:1561565/148‑1 ATACGAAGGCAATTCCGCTGATTAGTTATGAAGGTGATACTTTTTATGTTCGTCAGACCACGTTAGGTTTTATTCTGTCGCAAAGTGAAAAAAATGAACTTAGCCTGACCGCATCCTGGATGCCGCTGGAATTTGACCCTACCTACCG < 1:3207199/148‑1 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CCGCTGGAATTTGACCCTACCTACCGTAAAAGGTGCCGGGCTGGTCGTCACCGGTACGGCGTTAAGCGGGGAAGTGAAGGTAGGCGATTCACTCTGGCTGACTGGTGTAAATAAACCGATGCGTGTACGTGCGCTGCATGCGCAAAAC < 1:1084772/148‑1 CTGGAATTTGACCCTACCTACCGTAAAAGGTGCCGGGCTGGTCGTCACCGGTACGGCGTTAAGCGGGGAAGTGAAGGTAGGCGATTCACTCTGGCTGACTGGTGTAAATAAACCGATGCGTGTACGTGCGCTGCATGCGCAAAACCAG < 2:667632/148‑1 GAATTTGACCCTACCTACCGTAAAAGGTGCCGGGCTGGTCGTCACCGGTACGGCGTTAAGCGGGGAAGTGAAGGTAGGCGATTCACTCTGGCTGACTGGTGTAAATAAACCGATGCGTGTACGTGCGCTGCATGCGCAAAACCAGCCA > 1:2236024/1‑148 GACCCTACCTACCGTAAAAGGTGCCGGGCTGGTCGTCACCGGTACGGCGTTAAGCGGGGAAGTGAAGGTAGGCGATTCACTCTGGCTGACTGGTGTAAATAAACCGATGCGTGTACGTGCGCTGCATGCGCAAAACCAGCCAACAGAA < 1:906757/148‑1 GACCCTACCTACCGTAAAAGGTGCCGGGCTGGTCGTCACCGGTACGGCGTTAAGCGGGGAAGTGAAGGTAGGCGATTCACTCTGGCTGACTGGTGTAAATAAACCGATGCGTGTACGTGCGCTGCATGCGCAAAACCAGCCAACAGAA < 2:3475871/148‑1 ACCCTACCTACCGTAAAAGGTGCCGGGCTGGTCGTCACCGGTACGGCGTTAAGCGGGGAAGTGAAGGTAGGCGATTCACTCTGGCTGACTGGTGTAAATAAACCGATGCGTGTACGTGCGCTGCATGCGCAAAACCAGCCAACAGAAA < 1:1960918/148‑1 ACCCTACCTACCGTAAAAGGTGCCGGGCTGGTCGTCACCGGTACGGCGTTAAGCGGGGAAGTGAAGGTAGGCGATTCACTCTGGCTGACTGGTGTAAATAAACCGATGCGTGTACGTGCGCTGCATGCGCAAAACCAGCCAACAGAAA > 1:3511561/1‑148 CCCTACCTACCGTAAAAGGTGCCGGGCTGGTCGTCACCGGTACGGCGTTAAGCGGGGAAGTGAAGGTAGGCGATTCACTCTGGCTGACTGGTGTAAATAAACCGATGCGTGTACGTGCGCTGCATGCGCAAAACCAGCCAACAGAAAC > 2:444256/1‑148 CCCTACCTACCGTAAAAGGTGCCGGGCTGGTCGTCACCGGTACGGCGTTAAGCGGGGAAGTGAAGGTAGGCGATTCACTCTGGCTGACTGGTGTAAATAAACCGATGCGTGTACGTGCGCTGCATGCGCAAAACCAGCCAACAGAAAC < 1:3403652/148‑1 cgACCTACCGTAAAAGGTGCCGGGCTGGTCGTCACCGGTACGGCGTTAAGCGGGGAAGTGAAGGTAGGCGATTCACTCTGGCTGACTGGTGTAAATAAACCGATGCGTGTACGTGCGCTGCATGCGCAAAACCAGCCAACAGAAACCG > 2:1959158/3‑148 CTACCTACCGTAAAAGGTGCCGGGCTGGTCGTCACCGGTACGGCGTTAAGCGGGGAAGTGAAGGTAGGCGATTCACTCTGGCTGACTGGTGTAAATAAACCGATGCGTGTACGTGCGCTGCATGCGCAAAACCAGCCAACAGAAACCG < 2:55403/148‑1 CTACCTACCGTAAAAGGTGCCGGGCTGGTCGTCACCGGTACGGCGTTAAGCGGGGAAGTGAAGGTAGGCGATTCACTCTGGCTGACTGGTGTAAATAAACCGATGCGTGTACGTGCGCTGCATGCGCAAAACCAGCCAACAGAAACCG < 1:3134706/148‑1 TACCTACCGTAAAAGGTGCCGGGCTGGTCGTCACCGGTACGGCGTTAAGCGGGGAAGTGAAGGTAGGCGATTCACTCTGGCTGACTGGTGTAAATAAACCGATGCGTGTACGTGCGCTGCATGCGCAAAACCAGCCAACAGAAACCGC < 2:330195/148‑1 TACCTACCGTAAAAGGTGCCGGGCTGGTCGTCACCGGTACGGCGTTAAGCGGGGAAGTGAAGGTAGGCGATTCACTCTGGCTGACTGGTGTAAATAAACCGATGCGTGTACGTGCGCTGCATGCGCAAAACCAGCCAACAGAAACCGC > 2:3382665/1‑148 TACCTACCGTAAAAGGTGCCGGGCTGGTCGTCACCGGTACGGCGTTAAGCGGGGAAGTGAAGGTAGGCGATTCACTCTGGCTGACTGGTGTAAATAAACCGATGCGTGTACGTGCGCTGCATGCGCAAAACCAGCCAACAGAAACCGC > 1:3448637/1‑148 CCTACCGTAAAAGGTGCCGGGCTGGTCGTCACCGGTACGGCGTTAAGCGGGGAAGTGAAGGTAGGCGATTCACTCTGGCTGACTGGTGTAAATAAACCGATGCGTGTACGTGGGCTGCATGCGCAAAACCAGCCAACAGAAACCGCCA < 1:660231/148‑1 CCTACCGTAAAAGGTGCCGGGCTGGTCGTCACCGGTACGGCGTTAAGCGGGGAAGTGAAGGTAGGCGATTCACTCTGGCTGACTGGTGTAAATAAACCGATGCGTGTACGTGCGCTGCATGCGCAAAACCAGCCAACAGAAACCGCCA > 2:2065297/1‑148 CCTACCGTAAAAGGTGCCGGGCTGGTCGTCACCGGTACGGCGTTAAGCGGGGAAGTGAAGGTAGGCGATTCACTCTGGCTGACTGGTGTAAATAAACCGATGCGTGTACGTGCGCTGCATGCGCAAAACCAGCCAACAGAAACCGCCA > 2:768862/1‑148 CCTACCGTAAAAGGTGCCGGGCTGGTCGTCACCGGTACGGCGTTAAGCGGGGAAGTGAAGGTAGGCGATTCACTCTGGCTGACTGGTGTAAATAAACCGATGCGTGTACGTGCGCTGCATGCGCAAAACCAGCCAACAGAAACCGCCA < 2:2006474/148‑1 CTACCGTAAAAGGTGCCGGGCTGGTCGTCACCGGTACGGCGTTAAGCGGGGAAGTGAAGGTAGGCGATTCACTCTGGCTGACTGGTGTAAATAAACCGATGCGTGTACGTGCGCTGCATGCGCAAAACCAGCCAACAGAAACCGCCAA < 2:3244899/148‑1 CTACCGTAAAAGGTGCCGGGCTGGTCGTCACCGGTACGGCGTTAAGCGGGGAAGTGAAGGTAGGCGATTCACTCTGGCTGACTGGTGTAAATAAACCGATGCGTGTACGTGCGCTGCATGCGCAAAACCAGCCAACAGAAACCGCCAA > 2:2458673/1‑148 GAAAATACGAAGGCAATTCCGCTGATTAGTTATGAAGGTGATACTTTTTATGTTCGTCAGACCACGTTAGGTTTTATTCTGTCGCAAAGTGAAAAAAATGAACTTAGCCTGACCGCATCCTGGATGCCGCTGGAATTTGACCCTACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/3745105‑3744959 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCGTAAAAGGTGCCGGGCTGGTCGTCACCGGTACGGCGTTAAGCGGGGAAGTGAAGGTAGGCGATTCACTCTGGCTGACTGGTGTAAATAAACCGATGCGTGTACGTGCGCTGCATGCGCAAAACCAGCCAACAGAAACCGCCAA < CP009273/3752673‑3752527 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |