| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 3,796,526 | 0 | A | T | 23.4% | 599.6 / 195.2 | 286 | I324I (ATT→ATA) | waaB | UDP‑D‑galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide‑1, 6‑D‑galactosyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (122/97); new base T (40/27); total (162/124) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.77e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 288 total aligned reads displayed.
AATTAAGAAACTCAGTTTCCTGGAAAAACACCTGCTGCATTATTTCCTCCGGGAAATAGCAGAAATAATTACCTTATGTAATCTATCGTAATACTTCGATTGGTAAAATTCATCGATCGACGCAGGAATTTTTTCATGTTCGATATGAATTTCACCTGCTATATATTTATTTAGAAGAGTTACAAAACCAGCAATATCTCCCGGTTGATACAGATGGCCATTGACATCAGGTTGAATAATGTCAGCAGGCCCGGAGACACAATCGGCACTGATACAAGGAATCCCCCACGACA > CP009273/3796379‑3796671 | aaTTAAGAAACTCAGTTTCCTGGAAAAACTCCTGCTGCATTATTTCCTCCGGGAAATAGCAGAAATAATTACCTTATGTAATCTATCGTAATACTTCGATTGGTAAAATTCATCGATCGACGCAGGAATTTTTTCATGTTCGATATGa < 2:3554951/148‑1 (MQ=255) aGAAACTCAGTTTCCTGGAAAAACACCTGCTGCATTATTTCCTCCGGGAAATAGCAGAAATAATTACCTTATGTAATCTATCGTAATACTTCGATTGGTAAAATTCATCGATCGACGCAGGAATTTTTTCATGTTCGATATGAATTTc > 1:740653/1‑148 (MQ=255) aGAAACTCAGTTTCCTGGAAAAACACCTGCTGCATTATTTCCTCCGGGAAATAGCAGAAATAATTACCTTATGTAATCTATCGTAATACTTCGATTGGTAAAATTCATCGATCGACGCAGGAATTTTTTCATGTTCGATATGAATTTc < 2:1429945/148‑1 (MQ=255) gAAACTCAGTTTCCTGGAAAAACACCTGCTGCATTATTTCCTCCGGGAAATAGCAGAAATAATTACCTTATGTAATCTATCGTAATACTTCGATTGGTAAAATTCATCGATCGACGCAGGAATTTTTTCATGTTCGATATGAATTTCa > 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atGAATTTCACCTGCTATATATTTATTTAGAAGAGTTACAAAACCAGCAATATCTCCCGGTTGATACAGATGGCCATTGACATCAGGTTGAATAATGTCAGCAGGCCCGGAGACACAATCGGCACTGATACAAGGAATCCCCCACGAc > 1:2419865/1‑148 (MQ=255) | AATTAAGAAACTCAGTTTCCTGGAAAAACACCTGCTGCATTATTTCCTCCGGGAAATAGCAGAAATAATTACCTTATGTAATCTATCGTAATACTTCGATTGGTAAAATTCATCGATCGACGCAGGAATTTTTTCATGTTCGATATGAATTTCACCTGCTATATATTTATTTAGAAGAGTTACAAAACCAGCAATATCTCCCGGTTGATACAGATGGCCATTGACATCAGGTTGAATAATGTCAGCAGGCCCGGAGACACAATCGGCACTGATACAAGGAATCCCCCACGACA > CP009273/3796379‑3796671 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |