| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,931,021 | C→A | 100% | A123E (GCG→GAG) | rbsK → | ribokinase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,931,021 | 0 | C | A | 97.1% | 739.5 / 11.3 | 239 | A123E (GCG→GAG) | rbsK | ribokinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (4/3); new base A (143/89); total (147/92) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.75e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 244 total aligned reads displayed.
CAGCAGCTCGCCACTGATAACATTGATATTACTCCGGTCAGCGTGATCAAAGGCGAATCAACAGGTGTGGCGCTGATTTTTGTTAATGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGCGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCAACGCGTCAGCATTATTAATGCAGCTGGAATCACCACTCGAAAGTGTGATGGCAGCGGCGAAAATCGCCCATCAAAATAAGACTATCGTTGCGCTTAACCCGGCTCCGGCTC > CP009273/3930876‑3931164 | cagcagCTCGCCACTGATAACATTGATATTACTCCGGTCAGCGTGATCAAAGGCGAATCAACAGGTGTGGCGCTGATTTTTGTTAATGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGgagc < 1:2803181/148‑1 (MQ=255)cagcagCTCGCCACTGATAACATTGATATTACTCCGGTCAGCGTGATCAAAGGCGAATCAACAGGTGTGGCGCTGATTTTTGTTAATGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGgagc < 1:3459576/148‑1 (MQ=255) agcagcTCGCCACTGATAACATTGATATTACTCCGGTCAGCGTGATCAAAGGCGAATCAACAGGTGTGGCGCTGATTTTTGTTAATGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCt > 2:1932040/1‑148 (MQ=255) cagcTCGCCACTGATAACATTGATATTACTCCGGTCAGCGTGATCAAAGGCGAATCAACAGGTGTGGCGCTGATTTTTGTTAATGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCtgg < 2:2055934/148‑1 (MQ=255) gcTCGCCACTGATAACATTGATATTACTCCGGTCAGCGTGATCAAAGGCGAATCAACAGGTGTGGCGCTGATTTTTGTTAATGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCtggtg > 1:2701711/1‑148 (MQ=255) gcTCGCCACTGATAACATTGATATTACTCCGGTCAGCGTGATCAAAGGCGAATCAACAGGTGTGGCGCTGATTTTTGTTAATGGCGAAGGGGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCtggtg > 1:1585476/1‑148 (MQ=255) cGCCACTGATAACATTGATATTACTCCGGTCAGCGTGATCAAAGGCGAATCAACAGGTGTGGCGCTGATTTTTGTTAATGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGaa > 2:1925765/1‑148 (MQ=255) cACTGATAACATTGATATTACTCCGGTCAGCGTGATCAAAGGCGAATCAACAGGTGTGGCGCTGATTTTTGTTAATGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAgcg < 2:3450623/148‑1 (MQ=255) aCTGATAACATTGATATTACTCCGGTCAGCGTGATCAAAGGCGAATCAACAGGTGTGGCGCTGATTTTTGTTAATGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCGGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAgcgc > 2:958501/1‑148 (MQ=255) aCTGATAACATTGATATTACTCCGGTCAGCGTGATCAAAGGCGAATCAACAGGTGTGGCGCTGATTTTTGTTAATGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCGGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAgcgc > 2:958492/1‑148 (MQ=255) aCTGATAACATTGATATTACTCCGGTCAGCGTGATCAAAGGCGAATCAACAGGTGTGGCGCTGATTTTTGTTAATGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAgcgc > 2:2268093/1‑148 (MQ=255) aTAACATTGATATTACTCCGGTCAGCGTGATCAAAGGCGAATCAACAGGTGTGGCGCTGATTTTTGTTAATGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACg < 1:1293448/148‑1 (MQ=255) aTAACATTGATATTACTCCGGTCAGCGTGATCAAAGGCGAATCAACAGGTGTGGCGCTGATTTTTGTTAATGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACg > 2:2605110/1‑148 (MQ=255) aaCATTGATATTACTCCGGTCAGCGTGATCAAAGGCGAATCAACAGGTGTGGCGCTGATTTTTGTTAATGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTg > 2:3236283/1‑148 (MQ=255) aCATTGATATTACTCCGGTCAGCGTGATCAAAGGCGAATCAACAGGTGTGGCGCTGATTTTTGTTAATGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGa > 1:670554/1‑148 (MQ=255) aCATTGATATTACTCCGGTCAGCGTGATCAAAGGCGAATCAACAGGTGTGGCGCTGATTTTTGTTAATGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGa < 1:924442/148‑1 (MQ=255) aCATTGATATTACTCCGGTCAGCGTGATCAAAGGCGAATCAACAGGTGTGGCGCTGATTTTTGTTAATGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGa < 1:2598094/148‑1 (MQ=255) aCATTGATATTACTCCGGTCAGCGTGATCAAAGGCGAATCAACAGGTGTGGCGCTGATTTTTGTTAATGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGa > 1:1994653/1‑148 (MQ=255) cATTGATATTACTCCGGTCAGCGTGATCAAAGGCGAATCAACAGGTGTGGCGCTGATTTTTGTTAATGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAg > 1:2247564/1‑148 (MQ=255) cATTGATATTACTCCGGTCAGCGTGATCAAAGGCGAATCAACAGGTGTGGCGCTGATTTTTGTTAATGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAg > 2:320835/1‑148 (MQ=255) aTTGATATTACTCCGGTCAGCGTGATCAAAGGCGAATCAACAGGTGTGGCGCTGATTTTTGTTAATGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGc > 1:3320605/1‑148 (MQ=255) ttGATATTACTCCGGTCAGCGTGATCAAAGGCGAATCAACAGGTGTGGCGCTGATTTTTGTTAATGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCg > 2:1099494/1‑148 (MQ=255) tGATATTACTCCGGTCAGCGTGATCAAAGGCGAATCAACAGGTGTGGCGCTGATTTTTGTTAATGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGt > 1:964558/1‑148 (MQ=255) gATATTACTCCGGTCAGCGTGATCAAAGGCGAATCAACAGGTGTGGCGCTGATTTTTGTTAATGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTa < 1:2661576/148‑1 (MQ=255) atatTACTCCGGTCAGCGTGATCAAAGGCTAATCAACAGGTGTGGCGCTGATTTTTGTTAATGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTAt > 1:938842/1‑148 (MQ=255) aCTCCGGTCAGCGTGATCAAAGGCGAATCAACAGGTGTGGCGCTGATTTTTGTTAATGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCa < 1:4632/148‑1 (MQ=255) aCTCCGGTCAGCGTGATCAAAGGCGAATCAACAGGTGTGGCGCTGATTTTTGTTAATGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCa < 1:467741/148‑1 (MQ=255) cTCCGGTCAGCGTGATCAAAGGCGAATCAACAGGTGTGGCGCTGATTTTTGTTAATGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCaa < 2:2212466/148‑1 (MQ=255) cTCCGGTCAGCGTGATCAAAGGCGAATCAACAGGTGTGGCGCTGATTTTTGTTAATGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCaa > 1:1138436/1‑148 (MQ=255) tCCGGTCAGCGTGATCAAAGGCGAATCAACAGGTGTGGCGCTGATTTTTGTTAATGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCAAc > 1:2544247/1‑148 (MQ=255) tCAGCGTGATCAAAGGCGAATCAACAGGTGTGGCGCTGATTTTTGTTAATGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCAACGCGTc < 1:3034928/148‑1 (MQ=255) cAGCGTGATCAAAGGCGAATCAACAGGTGTGGCGCTGATTTTTGTTAATGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCAACGCGTCa < 2:284532/148‑1 (MQ=255) cAGCGTGATCAAAGGCGAATCAACAGGTGTGGCGCTGATTTTTGTTAATGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCAACGCGTCa > 1:2030217/1‑148 (MQ=255) gCGTGATCAAAGGCGAATCAACAGGTGTGGCGCTGATTTTTGTTAATGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCAACGCGTCAGc < 2:1563614/148‑1 (MQ=255) gCGTGATCAAAGGCGAATCAACAGGTGTGGCGCTGATTTTTGTTAATGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCAACGCGTCAGc < 2:721990/148‑1 (MQ=255) cGTGATCAAAGGCGAATCAACAGGTGTGGCGCTGATTTTTGTTAATGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCAACGCGTCAGCa > 2:1379705/1‑148 (MQ=255) gTGATCAAAGGCGAATCAACAGGTGTGGCGCTGATTTTTGTTAATGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCAACGCGTCAGCat < 1:1663961/148‑1 (MQ=255) gATCAAAGGCGAATCAACAGGTGTGGCGCTGATTTTTGTTACTGGCGCAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCAACGCGTCAGCatta < 2:443476/148‑1 (MQ=255) cAAAGGCGAATCAACAGGTGTGGCGCTGATTTTTGTTAATGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCAACGCGTCAGCAttatta < 1:2951471/148‑1 (MQ=255) aaaGGCGAATCAACAGGTGTGGCGCTGATTTTTGTTAATGGCGAAGGTGAGACTGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCAACGCGTCAGCATTATTaa < 1:1908655/148‑1 (MQ=255) gCGAATCAACAGGTGTGGCGCTGATTTTTGTTAATGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCAACGCGTCAGCATTATTAATGCa > 2:2946991/1‑148 (MQ=255) gCGAATCAACAGGTGTGGCGCTGATTTTTGTTAATGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCAACGCGTCAGCATTATTAATGCa > 2:881183/1‑148 (MQ=255) gAATCAACAGGTGTGGCGCTGATTTTTGTTAATGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCAACGCGTCAGCATTATTAATGCAGc < 1:2138291/148‑1 (MQ=255) cAACAGGTGTGGCGCTGATTTTTGTTAATGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCAACGCGTCAGCATTATTAATGCAGCTGGa > 1:1025640/1‑148 (MQ=255) aaCAGGTGTGGCGCTGATTTTTGTTAATGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCAACGCGTCAGCATTATTAATGCAGCTGGaa < 1:815647/148‑1 (MQ=255) cAGGTGTGGCGCTGATTTTTGTTAATGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCAACGCGTCAGCATTATTAATGCAGCTGGAATc > 1:103692/1‑148 (MQ=255) ggTGTGGCGCTGATTTTTGTTAATGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCAACGCGTCAGCATTATTAATGCAGCTGGAATcac > 1:2012737/1‑148 (MQ=255) gtgtGGCGCTGATTTTTGTTAATGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCAACGCGTCAGCATTATTAATTCAGCTGGAATcacc > 1:1867204/1‑148 (MQ=255) gtgtGGCGCTGATTTTTGTTAATGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCAACGCGTCAGCATTATTAATGCAGCTGGAATcacc > 2:594335/1‑148 (MQ=255) gtgtGGCGCTGATTTTTGTTAATGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCAACGCGTCAGCATTATTAATGCAGCTGGAATcacc > 1:2354972/1‑148 (MQ=255) gtgtGGCGCTGATTTTTGTTAATGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCAACGCGTCAGCATTATTAATGCAGCTGGAATcacc > 1:1088602/1‑148 (MQ=255) gtgtGGCGCTGATTTTTGTTAATGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCAACGCGTCAGCATTATTAATGCAGCTGGAATcacc < 1:2463090/148‑1 (MQ=255) tgtgGCGCTGATTTTTGTTAATGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCAACGCGTCAGCATTATTAATGCAGATGGAATcacca < 1:1963853/148‑1 (MQ=255) cTGATTTTTGTTAATGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCAACGCGTCAGCATTATTAATGCAGCTGGAATCACCACTCGaaa > 1:149413/1‑148 (MQ=255) tGATTTTTGTTAATGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCAACGCGTCAGCATTATTAATGCAGCTGGAATCACCACTCGAAAg > 1:354259/1‑148 (MQ=255) gATTTTTGTTAATGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCAACGCGTCAGCATTATTAATGCAGCTGGAATCACCACTCGAAAgt > 1:3425425/1‑148 (MQ=255) gATTTTTGTTAATGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCAACGCGTCAGCATTATTAATGCAGCTGGAATCACCACTCGAAAgt > 1:427315/1‑148 (MQ=255) aTTTTTGTTAATGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCAACGCGTCAGCATTATTAATGCAGCTGGAATCACCACTCGAAAgtg > 2:3039268/1‑148 (MQ=255) ttttGTTAATGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCAACGCGTCAGCATTATTAATGCAGCTGGAATCACCACTCGAAAGtgtg < 2:1512005/148‑1 (MQ=255) tttGTTAATGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCAACGCGTCAGCATTATTAATGCAGCTGGAATCACCACTCGAAAGTGTGa > 1:2639795/1‑148 (MQ=255) tGTTAATGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCAACGCGTCAGCATTATTAATGCAGCTGGAATCACCACTCGAAAGTGTGATg > 1:611770/1‑148 (MQ=255) ttAATGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCAACGCGTCAGCATTATTAATGCAGCTGGAATCACCACTCGAAAGTGTGATGGc < 1:3306620/148‑1 (MQ=255) tAATGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCAACGCGTCAGCATTATTAATGCAGCTGGAATCACCACTCGAAAGTGTGATGGCa > 2:1763856/1‑148 (MQ=255) aaTGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCAACGCGTCAGCATTATTAATGCAGCTGGAATCACCACTCGAAAGTGTGATGGCAg < 1:320835/148‑1 (MQ=255) aTGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCAACGCGTCAGCATTATTAATGCAGCTGGAATCACCACTCGAAAGTGTGATGGCAgc > 1:1173612/1‑148 (MQ=255) tGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCAACGCGTCAGCATTATTAATGCAGCTGGAATCACCACTCGAAAGTGTGATGGCAgcg > 2:1215616/1‑148 (MQ=255) tGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCAACGCGTCAGCATTATTAATGCAGCTGGAATCACCACTCGAAAGTGTGATGGCAgcg > 2:3006965/1‑148 (MQ=255) tGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCAACGCGTCAGCATTATTAATGCAGCTGGAATCACCACTCGAAAGTGTGATGGCAgcg < 2:2362188/148‑1 (MQ=255) gCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCAACGCGTCAGCATTATTAATGCAGCTGGAATCACCACTCGAAAGTGTGATGGCAgcggc > 1:1697503/1‑148 (MQ=255) 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gTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCAACGCGTCAGCATTATTAATGCAGCTGGAATCACCACTCGAAAGTGTGATGGCAGCGGCGAAAAt > 1:243576/1‑148 (MQ=255) gagaATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCAACGCGTCAGCATTATTAATGCAGCTGGAATCACCACTCGAAAGTGTGATGGCAGCGGCGAAAATCg > 2:3320867/1‑148 (MQ=255) agaATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCAACGCGTCAGCATTATTAATGCAGCTGGAATCACCACTCGAAAGTGTGATGGCAGCGGCGAAAATCGc > 1:1533158/1‑148 (MQ=255) aaTGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCAACGCGTCAGCATTATTAATGCAGCTGGAATCACCACTCGAAAGTGTGATGGCAGCGGCGAAAATCGccc < 2:3100304/148‑1 (MQ=255) aaTGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCAACGCGTCAGCATTATTAATGCAGCTGGAATCACCACTCGAAAGTGTGATGGCAGCGGCGAAAATCGccc < 2:1164284/148‑1 (MQ=255) aaTGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCAACGCGTCAGCATTATTAATGCAGCTGGAATCACCACTCGAAAGTGTGATGGCAGCGGCGAAAATCGccc < 2:2666838/148‑1 (MQ=255) cATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCAACGCGTCAGCATTATTAATGCAGCTGGAATCACCACTCGAAAGTGTGATGGCAGCGGCGAAAATCGCCCATCaa > 1:2225570/1‑148 (MQ=255) cGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCAACGCGTCAGCATTATTAATGCAGCTGGTATCACCACTCGAAAGTGTGATGGCAGCGGCGAAAATCGCCCATCAAAAt > 1:1059508/1‑148 (MQ=255) cGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCAACGCGTCAGCATTATTAATGCAGCTGGAATCACCACTCGAAAGTGTGATGGCAGCGGCGAAAATCGCCCATCAAAAt < 2:1194397/148‑1 (MQ=255) tATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCAACGCGTCAGCATTATTAATGCAGCTGGAATCACCACTCGAAAGTGTGATGGCAGCGGCGAAAATCGCCCATCAAAATAAg > 2:2106569/1‑148 (MQ=255) 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tAATGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCAACGCGTCAGCATTATTAATGCAGCTGGAATCACCACTCGAAAGTGTGATGGCAGCGGCGAAAATCGCCCATCAAAATAAGACTATCGTTGCGCtt > 2:1064910/1‑148 (MQ=255) aaTGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCAACGCGTCAGCATTATTAATGCAGCTGGAATCACCACTCGAAAGTGTGATGGCAGCGGCGAAAATCGCCCATCAAAATAAGACTATCGTTGCGCTTa < 2:3352925/148‑1 (MQ=255) aaTGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCAACGCGTCAGCATTATTAATGCAGCTGGAATCACCACTCGAAAGTGTGATGGCAGCGGCGAAAATCGCCCATCAAAATAAGACTATCGTTGCGCTTa < 2:1585476/148‑1 (MQ=255) aTGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCAACGCGTCAGCATTATTAATGCAGCTGGAATCACCACTCGAAAGTGTGATGGCAGCGGCGAAAATCGCCCATCAAAATAAGACTATCGTTGCGCTTaa > 2:1839880/1‑148 (MQ=255) aTGCTGCCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCAACGCGTCAGCATTATTAATGCAGCTGGAATCACCACTCGAAAGTGTGAAGGCAGCGGCGAAAATCGCCCATCAAAATAAGACTATCGTTGCGCTTaa > 2:811372/1‑148 (MQ=255) gctgcCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCAACGCGTCAGCATTATTAATGCAGCTGGAATCACCACTCGAAAGTGTGATGGCAGCGGCGAAAATCGCCCATCAAAATAAGACTATCGTTGCGCTTAAcc < 2:2806176/148‑1 (MQ=255) ctgcCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCAACGCGTCAGCATTATTAATGCAGCTGGAATCACCACTCGAAAGTGTGATGGCAGCGGCGAAAATCGCCCATCAAAATAAGACTATCGTTGCGCTTAAccc > 2:3563977/1‑148 (MQ=255) ctgcCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCAACGCGTCAGCATTATTAATGCAGCTGGAATCACCACTCGAAAGTGTGATGGCAGCGGCGAAAATCGCCCATCAAAATAAGACTATCGTTGCGCTTAAccc > 1:714875/1‑148 (MQ=255) ctgcCCTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCAACGCGTCAGCATTATTAATGCAGCTGGAATCACCACTCGAAAGTGTGATGGCAGCGGCGAAAATCGCCCATCAAAATAAGACTATCGTTGCGCTTAAccc > 2:2894820/1‑148 (MQ=255) cccTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCAACGCGTCAGCATTATTAATGCAGCTGGAATCACCACTCGAAAGTGTGATGGCAGCGGCGAAAATCGCCCATCAAAATAAGACTATCGTTGCGCTTAACccggc > 2:258028/1‑148 (MQ=255) cTTTCCCCGGAGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCAACGCGTCAGCATTATTAATGCAGCTGGAATCACCACTCGAAAGTGTGATGGCAGCGGCGAAAATCGCCCATCAAAATAAGACTATCGTTGCGCTTAACccggctc < 2:1728207/148‑1 (MQ=255) | CAGCAGCTCGCCACTGATAACATTGATATTACTCCGGTCAGCGTGATCAAAGGCGAATCAACAGGTGTGGCGCTGATTTTTGTTAATGGCGAAGGTGAGAATGTCATCGGTATTCATGCCGGCGCTAATGCTGCCCTTTCCCCGGCGCTGGTGGAAGCGCAACGTGAGCGTATTGCCAACGCGTCAGCATTATTAATGCAGCTGGAATCACCACTCGAAAGTGTGATGGCAGCGGCGAAAATCGCCCATCAAAATAAGACTATCGTTGCGCTTAACCCGGCTCCGGCTC > CP009273/3930876‑3931164 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |