Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 319,024 | C→A | 100% | R326S (CGC→AGC) | ykgF → | ferridoxin‑like LutB family protein; putative electron transport chain YkgEFG component |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 319,024 | 0 | C | A | 96.4% | 584.9 / 11.8 | 193 | R326S (CGC→AGC) | ykgF | ferridoxin‑like LutB family protein; putative electron transport chain YkgEFG component |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/6); new base A (69/117); total (70/123) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.25e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.75e-01 | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 194 total aligned reads displayed.
GCGCGAAGCTGGGCACGTTGATGGTCCTGAAGAGTTTCATCTGGTTATTGTCGATAACGGGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATCGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGCCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTATAAAGATTTTAAAGATTTACCCTACGCCTGCTCTTTATGCACAGCTTGTGACAACGTGTGTCCGG > CP009273/318879‑319168 | gcgcgAAGCTGGGCACGTTGATGGTCCTGAAGAGTTTCATCTGGTTATTGTCGATAACGGGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATAGc < 2:1523845/148‑1 (MQ=255) cgAAGCTGGGCACGTTGATGGTCCTGAAGAGTTTCATCTGGTTATTGTCGATAACGGGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATAGCCat < 1:429653/148‑1 (MQ=255) gAAGCTGGGCACGTTGATGGTCCTGAAGAGTTTCATCTGGTTATTGTCGATAACGGGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATAGCCata < 1:3241054/148‑1 (MQ=255) aaGCTGGGCACGTTGATGGTCCTGAAGAGTTTCATCTGGTTATTGTCGATAACGGGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATAGCCatat < 2:13613/148‑1 (MQ=255) gCTGGGCACGTTGATGGTCCTGAAGAGTTTCATCTGGTTATTGTCGATAACGGGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATAGCCATATTg < 2:1662872/148‑1 (MQ=255) gCACGTTGATGGTCCTGAAGAGTTTCATCTGGTTATTGTCGATAACGGGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATAGCCATATTGGCGGt < 1:1582799/148‑1 (MQ=255) cACGTTGATGGTCCTGAAGAGTTTCATCTGGTTATTGTCGATAACGGGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATAGCCATATTGGCGGTc > 1:1828614/1‑148 (MQ=255) cACGTTGATGGTCCTGAAGAGTTTCATCTGGTTATTGTCGATAACGGGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATAGCCATATTGGCGGTc < 2:789916/148‑1 (MQ=255) gttgttGGTCCTGAAGAGTTTCATCTGGTTATTGTCGATATCTGGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTTAGATGTATTAGCTGCGGGGCTTGTATGATTACTTGTACGGCATATAGCCATATTGGCGGTCAtt < 1:118011/148‑2 (MQ=255) gTTGATGGTCCTGAAGAGTTTCATCTGGTTATTGTCGATAACGGGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATAGCCATATTGGCGGTCATg < 1:117128/148‑1 (MQ=255) ttGATGGTCCTGAAGAGTTTCATCTGGTTATTGTCGATAACGGGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATAGCCATATTGGCGGTCATgg > 1:2996888/1‑148 (MQ=255) aTGGTCCTGAAGAGTTTCATCTGGTTATTGTCGATAACGGGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATAGCCATATTGGCGGTCATGGata > 1:2523807/1‑148 (MQ=255) tGGTCCTGAAGAGTTTCATCTGGTTATTGTCGATAACGGGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATAGCCATATTGGCGGTCATGGatat < 1:1957095/148‑1 (MQ=255) tGGTCCTGAAGAGTTTCATCTGGTTATTGTCGATAACGGGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATAGCCATATTGGCGGTCATGGatat < 2:965406/148‑1 (MQ=255) tGAAGAGTTTCATCTGGTTATTGTCGATAACGGGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATAGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGctct > 2:2351581/1‑148 (MQ=255) gAAGAGTTTCATCTGGTTATTGTCGATAACGGGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATAGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTa < 2:1147151/148‑1 (MQ=255) gAAGAGTTTCATCTGGTTATTGTCGATAACGGGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATAGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTa < 1:2276701/148‑1 (MQ=255) agTTTCATCTGGTTATTGTCGATAACGGGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATAGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTa < 2:3252730/148‑1 (MQ=255) agTTTCATCTGGTTATTGTCGATAACGGGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATAGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTa > 2:638928/1‑148 (MQ=255) tttCATCTGGTTATTGTCGATAACGGGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATAGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATc > 2:2772725/1‑148 (MQ=255) tttCATCTGGTTATTGTCGATAACGGGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATAGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATc > 2:2980148/1‑148 (MQ=255) tCATCTGGTTATTGTCGATAACGGGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATAGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCa > 1:1071701/1‑148 (MQ=255) tCATCTGGTTATTGTCGATAACGGGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATAGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCa > 2:1241970/1‑148 (MQ=255) cATCTGGTTATTGTCGATAACGGGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATAGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAg < 1:2217521/148‑1 (MQ=255) cATCTGGTTATTGTCGATAACGGGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGGATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATAGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAg < 1:1857449/148‑1 (MQ=255) ggTTATTGTCGATAACGGGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGTCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATAGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGCCa > 1:785959/1‑148 (MQ=255) ttATTGTCGATAACGGGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATAGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATcc > 2:1687047/1‑139 (MQ=255) ttATTGTCGATAACGGGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATAGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATcc < 1:1687059/139‑1 (MQ=255) ttATTGTCGATAACGGGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATAGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGCCAAt < 1:1023485/148‑1 (MQ=255) ttATTGTCGATAACGGGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATAGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGCCAAt > 2:975411/1‑148 (MQ=255) ttATTGTCGATAACGGGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATAGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGCCAAt < 1:1023756/148‑1 (MQ=255) ttATTGTCGATAACGGGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATAGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGCCAAt < 1:1024238/148‑1 (MQ=255) tATTGTCGATAACGGGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATAGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGCCAAtt < 2:3448440/148‑1 (MQ=255) ttGTCGATAACGGGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATAGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGCCAATTgg < 1:1208251/148‑1 (MQ=255) ttGTCGATAACGGGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATAGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGCCAATTgg < 2:1168160/148‑1 (MQ=255) ttGTCGATAACGGGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATAGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGCCAATTgg < 1:2543304/148‑1 (MQ=255) gTCGATAACGGGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATAGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGCCAATTGGTg < 1:3281183/148‑1 (MQ=255) tCGATAACGGGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATAGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGCCAATTGGTGc > 2:1437880/1‑148 (MQ=255) cGATAACGGGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATAGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGCCAATTGGTGCg < 1:1490541/148‑1 (MQ=255) gATAACGGGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATAGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGCCAATTGGTGCgg < 1:2013777/148‑1 (MQ=255) aTAACGGGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATAGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGCCAATTGGTGCGGt < 2:3006763/148‑1 (MQ=255) aCGGGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATAGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGCCAATTGGTGCGGTGAt < 2:1993438/148‑1 (MQ=255) cGGGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATAGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGCCAATTGGTGCGGTGAtt < 1:3513626/148‑1 (MQ=255) gggCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAAGACTTGTCCGGCATATAGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGCCAATTGGTGCGGTGAttt < 2:2218129/148‑1 (MQ=255) gggCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCAGAAATTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTAGCTGCGGGGCTTGTATGAATACATTTCCGGCATATATCCATATTTGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGCCAATTGGTGCGGTGAttt > 1:802351/1‑148 (MQ=255) ggCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATAGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGCCAATTGGTGCGGTGATTtc < 1:2611331/148‑1 (MQ=255) ggCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATAGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGCCAATTGGTGCGGTGATTtc > 2:1869401/1‑148 (MQ=255) ttCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATAGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGCCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCg > 1:56498/1‑148 (MQ=255) cTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATCGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGCCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCt < 2:3008252/148‑1 (MQ=255) aGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATAGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGCCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACt < 2:486967/148‑1 (MQ=255) ggTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATAGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGCCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACtt < 2:2501317/148‑1 (MQ=255) gTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATAGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGCCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTg < 1:1156471/148‑1 (MQ=255) ggCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATAGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGCCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTggcggc > 2:2167188/1‑148 (MQ=255) gCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATCGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGCCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCt < 2:681471/148‑1 (MQ=255) 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tttCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATAGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGCCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTAtaaagatt < 2:661136/148‑1 (MQ=255) tCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATAGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGCCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTAtaaagatttt < 1:213784/148‑1 (MQ=255) cGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATAGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGCCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTAtaaagatttta > 2:3468981/1‑148 (MQ=255) cGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATAGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGCCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTAtaaagatttta > 1:1501773/1‑148 (MQ=255) ggATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATAGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGCCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTAtaaagattttaaa > 2:620439/1‑148 (MQ=255) ggATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATAGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGCCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTAtaaagattttaaa > 2:2152239/1‑148 (MQ=255) ggATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATAGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGCCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTAtaaagattttaaa > 2:2152444/1‑148 (MQ=255) tgtgCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATAGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGCCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTAtaaagattttaaagat < 2:2177979/148‑1 (MQ=255) tgctgcGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATAGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGCCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTAtaaagattttaaagattt > 2:2588788/1‑148 (MQ=255) gctgcGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATAGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGCCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTATAAAGATTTTAAAGATTTa > 2:1004736/1‑148 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |