| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 4,037,484 | T→A | 100% | intergenic (+80/‑75) | dsbA → / → yihF | periplasmic protein disulfide isomerase I/DUF945 family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 4,037,484 | 0 | T | A | 96.1% | 637.0 / 11.6 | 204 | intergenic (+80/‑75) | dsbA/yihF | periplasmic protein disulfide isomerase I/DUF945 family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (4/4); new base A (111/85); total (115/89) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.31e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.90e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 204 total aligned reads displayed.
AGCAATATGGATGTTTTTGTTCAGCAGTATGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAATGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAGCCGTAATCTGGGGTGGTGGCACATGGTACA > CP009273/4037339‑4037628 | aGCAATATGGATGTTTTTGTTCAGCAGTATGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGc > 1:2118335/1‑148 (MQ=255) cAATATGGATGTTTTTGTTCAGCAGTATGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCAt < 2:1408064/148‑1 (MQ=255) tatGGATGTTTTTGTTCAGCAGTATGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATAAATTCTGATAAAGCATCCt > 1:2773234/1‑148 (MQ=255) tGGATGTTTTTGTTCAGCAGTATGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAAAACATTATTATAAAGCATACTGc > 1:1632750/1‑148 (MQ=255) tGTTTTTGTTCAGCAGTATGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCt < 2:52722/148‑1 (MQ=255) gTTTTTGTTCAGCAGTATGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATACTGCCGCTg > 1:1010956/1‑148 (MQ=255) ttCAGCAGTATGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACatta > 2:1513753/1‑148 (MQ=255) ttCAGCAGTATGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACatta > 2:2215986/1‑148 (MQ=255) tCAGCAGTATGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGTCattat > 2:2143368/1‑148 (MQ=255) cagcagTATGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACattatt < 2:1931262/148‑1 (MQ=255) agcagTATGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTAttt > 1:588803/1‑148 (MQ=255) tATGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCCGCa > 2:2910127/1‑148 (MQ=255) tATGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCa < 1:790373/148‑1 (MQ=255) tATGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCa < 2:678458/148‑1 (MQ=255) tATGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCa < 1:2846194/148‑1 (MQ=255) cTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAg < 2:203916/148‑1 (MQ=255) tGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGt < 1:3264273/148‑1 (MQ=255) aTACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTgg < 1:2364230/148‑1 (MQ=255) tACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCAAGGGCTTTATTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGACGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGa > 2:1116021/1‑148 (MQ=255) cAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGata < 2:1398264/148‑1 (MQ=255) aGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGatat < 2:1299557/148‑1 (MQ=255) gAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCa > 1:1129962/1‑148 (MQ=255) aaaTATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCaa > 1:292000/1‑148 (MQ=255) tatCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGt > 1:2978563/1‑148 (MQ=255) tatCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTATGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTAATCATAAGTGGATATTCaaatt > 1:187032/1‑146 (MQ=255) cTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCCAAGgttt > 2:671406/1‑148 (MQ=255) gTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTATATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGc < 2:2463651/148‑1 (MQ=255) gagaAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAATGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTg > 1:1040173/1‑146 (MQ=255) gaAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGtttt < 1:2314049/148‑1 (MQ=255) gaAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGtttt < 2:1682544/148‑1 (MQ=255) aaaaaaTAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAATGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTa < 2:1029347/148‑1 (MQ=255) aaaaaTAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTGAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTAt > 1:694175/1‑148 (MQ=255) aaaaaTAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTAt > 1:2479963/1‑148 (MQ=255) taatTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAggg < 2:801040/148‑1 (MQ=255) aatTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGa < 2:284571/148‑1 (MQ=255) ttCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAat < 2:421292/148‑1 (MQ=255) tCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATACCCATAAATACATTCTGATAATGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAata < 2:2096539/148‑1 (MQ=255) tGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTta > 2:2956676/1‑148 (MQ=255) tGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTta > 2:1178036/1‑148 (MQ=255) gTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTtat < 1:839462/148‑1 (MQ=255) aTTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGa > 1:1443457/1‑148 (MQ=255) tACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATa > 1:219984/1‑148 (MQ=255) tACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATa > 1:521047/1‑148 (MQ=255) aCATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGTTAc > 2:1868719/1‑148 (MQ=255) cATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGGTATTCAAAGTTTTGGTGTTTTATGAGGGAATATTTATATGATaag > 1:1878309/1‑146 (MQ=255) tAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTa < 2:2773234/148‑1 (MQ=255) aaaGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGCCATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATAAGGGACTATTTATATGATACGTaa > 1:2809030/1‑148 (MQ=255) aaaGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATAAATTATGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTTGTGTTTTATCATGGAATATTTATATGATAAGTaa > 1:3464332/1‑148 (MQ=255) aaGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAg > 2:2597083/1‑148 (MQ=255) gCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTc > 2:1823376/1‑148 (MQ=255) cccGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCa > 1:1369510/1‑148 (MQ=255) ccGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAg < 1:2604982/148‑1 (MQ=255) cGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGc < 1:3355110/148‑1 (MQ=255) cGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTGTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATTCGTAAGTCAGc > 2:2517120/1‑148 (MQ=255) gTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCt < 1:2489990/148‑1 (MQ=255) gTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCt < 1:1157534/148‑1 (MQ=255) gAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTAc > 2:3021534/1‑148 (MQ=255) aaTATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACa > 2:3067524/1‑148 (MQ=255) atatTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAg > 2:3470089/1‑148 (MQ=255) atTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGgt > 2:3126540/1‑148 (MQ=255) atTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGgt > 2:1648632/1‑148 (MQ=255) ttCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGgtg > 1:2032552/1‑148 (MQ=255) tCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGgtgt < 2:2311722/148‑1 (MQ=255) tCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGgtgt > 1:1441958/1‑148 (MQ=255) ggCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTAttg > 1:1664615/1‑148 (MQ=255) gCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATAAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTAttgt > 1:632285/1‑148 (MQ=255) cTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTAttgtt > 1:2506366/1‑148 (MQ=255) tttttttATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTAttgttg > 1:1926947/1‑148 (MQ=255) ttttttATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGc > 1:1192588/1‑148 (MQ=255) ttttttATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGc > 1:539734/1‑148 (MQ=255) ttttttATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGc < 1:1678231/148‑1 (MQ=255) tttttATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCg < 2:3345342/148‑1 (MQ=255) ttattaTTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTa > 1:340980/1‑148 (MQ=255) tattatTTAATAAATATAAATACATTCTGATAATGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAg > 1:3204805/1‑148 (MQ=255) attattTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAGc > 1:1774862/1‑148 (MQ=255) ttattTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAGcc > 1:2077931/1‑148 (MQ=255) ttattTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAGcc < 1:3096795/148‑1 (MQ=255) tattTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAGCCg > 2:105206/1‑148 (MQ=255) tattTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAGCCg > 2:1904130/1‑148 (MQ=255) tttAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAGCCGTa < 2:3059227/148‑1 (MQ=255) tttAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAGCCGTa < 1:255726/148‑1 (MQ=255) ttAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAGCCGTaa > 2:2654736/1‑148 (MQ=255) ttAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAGCCGTaa > 2:1728402/1‑148 (MQ=255) taataaATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAGCCGTAAt < 1:2324727/148‑1 (MQ=255) taaatataaataCATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAGCCGTAATCTg < 1:2433244/148‑1 (MQ=255) atataaataCATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAGCCGTAATCTgggg < 1:1264796/148‑1 (MQ=255) tataaataCATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAGCCGTAATCTGGggt > 2:449922/1‑148 (MQ=255) taaataCATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAGCCGTAATCTGGggtgg < 2:2867198/148‑1 (MQ=255) aaataCATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAGCCGTAATCTGGggtggt < 2:2677557/148‑1 (MQ=255) aaataCATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAGCCGTAATCTGGggtggt > 2:3549191/1‑148 (MQ=255) aCATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAGCCGTAATCTGGGGtggtggaa > 2:2319519/1‑146 (MQ=255) aCATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAGCCGTAATCTGGGGTGGTGGca > 2:515259/1‑148 (MQ=255) cATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAGCCGTAATCTGGGGTGGTGGcac < 2:1810715/148‑1 (MQ=255) ttCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAGCCGTAATCTGGGGTGGTGGCACAt > 1:432817/1‑148 (MQ=255) ttCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAGCCGTAATCTGGGGTGGTGGCACAt < 1:33418/148‑1 (MQ=255) tCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAGCCGTAATCTGGGGTGGTGGCACATg > 1:1116861/1‑148 (MQ=255) cTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAGCCGTAATCTGGGGTGGTGGCACATgg < 2:240232/148‑1 (MQ=255) gATAATGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAGCCGTAATCTGGGGTGGTGGCACATGGTa > 1:1239045/1‑148 (MQ=255) gATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAGCCGTAATCTGGGGTGGTGGCACATGGTa > 1:3009900/1‑148 (MQ=255) tAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAGCCGTAATCTGGGGTGGTGGCACATGGTaca > 1:3452298/1‑148 (MQ=255) | AGCAATATGGATGTTTTTGTTCAGCAGTATGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAATGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAGCCGTAATCTGGGGTGGTGGCACATGGTACA > CP009273/4037339‑4037628 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |