| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 329,372 | A→T | 100% | L258Q (CTG→CAG) | yahB ← | putative DNA‑bindng transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 329,372 | 0 | A | T | 96.2% | 747.1 / 14.0 | 236 | L258Q (CTG→CAG) | yahB | putative DNA‑bindng transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/8); new base T (107/120); total (108/128) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.15e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.95e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 242 total aligned reads displayed.
CAGTAAATCCTGATAGATCCCCGTTAATATGCCATTTGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCAGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGACATTTGGTGTTGAAATCTGGCACCAGAATTGACTCCTGCCCGTGCAGCAACCAGCCCACTTTTTTAT > CP009273/329227‑329516 | cAGTAAATCCTGATAGATCCCCGTTAATATGCCATTTGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACctgc < 2:1201894/148‑1 (MQ=255) gTAAATCCTGATAGATCCCCGTTAATATGCCATTTGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACctgcag > 1:3564148/1‑148 (MQ=255) aaTCCTGATAGATCCCCGTTAATATGCCATTTGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGa < 1:3348133/148‑1 (MQ=255) aaTCCTGATAGATCCCCGTTAATATGCCATTTGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGa < 1:2200505/148‑1 (MQ=255) aaTCCTGATAGATCCCCGTTAATATGCCATTTGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGa > 1:1946588/1‑148 (MQ=255) aaTCCTGATAGATCCCCGTTAATATGCCATTTGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCAGCAGGGa > 2:2808053/1‑148 (MQ=255) aTCCTGATAGATCCCCGTTAATATGCCATTTGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGAt < 2:733/148‑1 (MQ=255) aTCCTGATAGATCCCCGTTAATATGCCATTTGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGAt > 2:510939/1‑148 (MQ=255) aTCCTGATAGATCCCCGTTAATATGCCATTTGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGAt < 2:606925/148‑1 (MQ=255) tCCTGATAGATCCCCGTTAATATGCCATTTGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGAtt > 1:1745750/1‑148 (MQ=255) tCCTGATAGATCCCCGTTAATATGCCATTTGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGAtt > 2:1289226/1‑148 (MQ=255) tCCTGATAGATCCCCGTTAATATGCCATTTGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCAGCAGGGAtt < 1:244308/148‑1 (MQ=255) tGATAGATCCCCGTTAATATGCCATTTGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCg > 1:1257991/1‑148 (MQ=255) gATAGATCCCCGTTAATATGCCATTTGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGt > 2:2507102/1‑148 (MQ=255) aTAGATCCCCGTTAATATGCCATTTGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTc > 2:2363126/1‑148 (MQ=255) aTAGATCCCCGTTAATATGCCATTTGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTc > 2:3066569/1‑148 (MQ=255) aGATCCCCGTTAATATGCCATTTGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCAt > 1:1546101/1‑148 (MQ=255) tCCCCGTTAATATGCCATTTGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGc < 1:3121824/148‑1 (MQ=255) cccGTTAATATGCCATTTGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCt > 2:335192/1‑148 (MQ=255) cccGTTAATATGCCATTTGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCt < 1:543872/148‑1 (MQ=255) cccGTTAATATGCCATTTGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTAAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCt > 2:583835/1‑148 (MQ=255) cccttAATATTCCATTAGGCGCAAATTGTTTTTTAATCAACTGCGACACAAGACCCGTAGCAGAAAGCTGAGTACCCAGTAAAATGCGCGAATCCAGGCGCGCATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGCATACCGACATCGCCTc > 2:3194390/4‑148 (MQ=255) gTTAATATGCCATTTGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCAc < 2:2482327/148‑1 (MQ=255) tAATATGCCATTTGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACgg > 2:223561/1‑148 (MQ=255) atatGCCATTTGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGAc > 2:611647/1‑148 (MQ=255) atatGCCATTTGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGAc > 1:652899/1‑148 (MQ=255) atGCCATTTGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCa > 1:2016874/1‑148 (MQ=255) tGCCATTTGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCAt < 2:1402632/148‑1 (MQ=255) cATTTGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTa < 2:2092814/148‑1 (MQ=255) aTTTGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTaa < 1:3516446/148‑1 (MQ=255) tttGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAAt > 2:1575767/1‑148 (MQ=255) tttGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAAt > 2:3343506/1‑148 (MQ=255) tGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATcc < 2:1512542/148‑1 (MQ=255) gcgcAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCgg < 1:2702611/148‑1 (MQ=255) gcgcAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCgg > 2:2559777/1‑148 (MQ=255) cgcAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGc > 1:3121511/1‑148 (MQ=255) aTTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCaaaaa > 2:1559727/1‑148 (MQ=255) aTTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCaaaaa > 1:3478356/1‑148 (MQ=255) aTTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCaaaaa < 2:1888331/148‑1 (MQ=255) ttGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCaaaaaa > 1:119693/1‑148 (MQ=255) ttGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCaaaaaa > 1:268903/1‑148 (MQ=255) ttttAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAAt < 1:3047206/148‑1 (MQ=255) tttAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAAtt < 1:39845/148‑1 (MQ=255) ttAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTc < 1:1651387/148‑1 (MQ=255) ttAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTc < 2:1434207/148‑1 (MQ=255) ttAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTc < 2:1118642/148‑1 (MQ=255) aTCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCtt < 1:1765443/148‑1 (MQ=255) aTCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCtt < 1:323284/148‑1 (MQ=255) tCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTc > 2:250347/1‑148 (MQ=255) tCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTc > 2:801451/1‑148 (MQ=255) cACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCAGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCAc < 2:2782967/148‑1 (MQ=255) aCTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCAcc < 2:1210975/148‑1 (MQ=255) cGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTaaa < 1:22262/148‑1 (MQ=255) cGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTaaa < 1:22431/148‑1 (MQ=255) tCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAAt > 1:2975917/1‑148 (MQ=255) cACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGTTAACCTGCATGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATc > 1:503025/1‑148 (MQ=255) cACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATc < 1:188482/148‑1 (MQ=255) cTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTgg > 1:3562549/1‑148 (MQ=255) gACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCa < 1:3033580/148‑1 (MQ=255) gACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCa < 2:191204/148‑1 (MQ=255) aCCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCAc > 1:2926450/1‑148 (MQ=255) aCCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCAc > 1:2926316/1‑148 (MQ=255) cGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGa > 1:2504771/1‑148 (MQ=255) cGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGa < 2:2727563/148‑1 (MQ=255) gTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGAc > 1:1046647/1‑148 (MQ=255) tAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGACa < 2:898021/148‑1 (MQ=255) aGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCAGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGACAt < 2:3122621/148‑1 (MQ=255) gCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGACAtt < 2:1605920/148‑1 (MQ=255) gCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGACAtt > 1:3510192/1‑148 (MQ=255) cAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGACAttt < 2:2791672/148‑1 (MQ=255) cAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGACAttt < 2:1009902/148‑1 (MQ=255) aGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGACATTTg < 1:898146/148‑1 (MQ=255) gAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGACATTTgg < 2:3538963/148‑1 (MQ=255) gAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGACATTTgg > 1:832781/1‑148 (MQ=255) aTGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGACAGTTGgtg > 2:3272764/1‑148 (MQ=255) tGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGACATTTGgtgt < 2:490349/148‑1 (MQ=255) gAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGACATTTGGTGTTGaa < 1:1575767/148‑1 (MQ=255) gTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGACATTTGGTGTTGAAAt < 1:2264344/148‑1 (MQ=255) tCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGACATTTGGTGTTGAAATc < 2:1998048/148‑1 (MQ=255) cGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGACATTTGGTGTTGAAATCt < 1:2648571/148‑1 (MQ=255) ccAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGACATTTGGTGTTGAAATCTgg > 1:2165074/1‑148 (MQ=255) aGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGACATTTGGTGTTGAAATCTGGCa > 2:1759014/1‑148 (MQ=255) tGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGACATTTGGTGTTGAAATCTGGCACCAGAAt < 2:2290582/148‑1 (MQ=255) gcgAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGACATTTGGTGTTGAAATCTGGCACCAGAATTGa < 1:1834673/148‑1 (MQ=255) aTCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGACATTTGGTGTTGAAATCTGGCACCAGAATTGACTcc > 2:2854304/1‑148 (MQ=255) cTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGACATTTGGTGTTGAAATCTGGCACCAGAATTGACTCCTGc < 1:2344612/148‑1 (MQ=255) cTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGACATTTGGTGTTGAAATCTGGCACCAGAATTGACTCCTGc < 2:2341501/148‑1 (MQ=255) tGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGACATTTGGTGTTGAAATCTGGCACCAGAATTGACTCCTGcc > 2:98218/1‑148 (MQ=255) cgcgGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGACATTTGGTGTTGAAATCTGGCACCAGAATTGACTCCTGCCCGt > 1:3401568/1‑148 (MQ=255) gcgGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGACATTTGGTGTTGAAATCTGGCACCAGAATTGACTCATGCCCGTg > 2:2699949/1‑148 (MQ=255) cgGATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGACATTTGGTGTTGAAATCTGGCACCAGAATTGACTCCTGCCCGTgc < 2:3564148/148‑1 (MQ=255) gATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGACATTTGGTGTTGAAATCTGGCACCAGAATTGACTCCTGCCCGTgcag > 2:346815/1‑148 (MQ=255) gATTATGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGACATTTGGTGTTGAAATCTGGCACCAGAATTGACTCCTGCCCGTgcag < 1:746971/148‑1 (MQ=255) tGGATTTGTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGACATTTGGTGTTGAAATCTGGCACCAGAATTGACTCCTGCCCGTGCAGCAAcc > 1:2487151/1‑148 (MQ=255) gTCGGGTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGACATTTGGTGTTGAAATCTGGCACCAGAATTGACTCCTGCCCGTGCAGCAACCAGCCCAc < 1:2363126/148‑1 (MQ=255) ggTAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGACATTTGGTGTTGAAATCTGGCACCAGAATTGACTCCTGCCCGTGCAGCAACCAGCCCACtttt < 1:2748899/148‑1 (MQ=255) tAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGACATTTGGTGTTGAAATCTGGCACCAGAATTGACTCCTGCCCGTGCAGCAACCAGCCCACtttttt < 2:3510192/148‑1 (MQ=255) tAACCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGACATTTGGTGTTGAAATCTGGCACCAGAATTGACTCCTGCCCGTGCAGCAACCAGCCCACtttttt < 2:268903/148‑1 (MQ=255) aaCCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGACATTTGGTGTTGAAATCTGGCACCAGAATTGACTCCTGCCCGTGCAGCAACCAGCCCACTTTTtta < 2:40333/148‑1 (MQ=255) aaCCTGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGACATTTGGTGTTGAAATCTGGCACCAGAATTGACTCCTGCCCGTGCAGCAACCAGCCCACTTTTtta < 2:2967561/148‑1 (MQ=255) | CAGTAAATCCTGATAGATCCCCGTTAATATGCCATTTGGCGCAAATTGTTTTTTAATCCACTGCGTCACCTGACCCGTAGCAGAATGCTGAGTCGCCAGTAACATGCGCGAATCCTGGCGCGGATTATGGATTTGTCGGGTAACCAGCAGGGATTGCGTCATCGCCTCACGGACCATGTAATCCGGCAAAAAACCAATTCCTTCACCTAAAATCTGGCACTGACATTTGGTGTTGAAATCTGGCACCAGAATTGACTCCTGCCCGTGCAGCAACCAGCCCACTTTTTTAT > CP009273/329227‑329516 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |