Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 4,245,537 | G→T | 100% | N286K (AAC→AAA) | plsB ← | glycerol‑3‑phosphate O‑acyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 4,245,537 | 0 | G | T | 97.4% | 591.9 / 6.4 | 192 | N286K (AAC→AAA) | plsB | glycerol‑3‑phosphate O‑acyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/4); new base T (76/111); total (77/115) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.50e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.39e-01 | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 199 total aligned reads displayed.
GGTTGATCCCGGCGGCGATATGCGGCGGCACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTCTGCTGCGCTTTTTCATGGGAGAT > CP009273/4245392‑4245680 | ggTTGATCCCGGCGGCGATATGCGGCGGCACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCttt < 1:2112690/148‑1 (MQ=255) ggTTGATCCCGGCGGCGATATGCGGCGGCACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGGGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCttt > 1:401654/1‑148 (MQ=255) tGATCCCGGCGGCGATATGCGGCGGCACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATg < 1:2364289/148‑1 (MQ=255) gATCCCGGCGGCGATATGCGGCGGCACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATgg < 2:1057620/148‑1 (MQ=255) aTCCCGGCGGCGATATGCGGCGGCACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGa < 1:2176097/148‑1 (MQ=255) aTCCCGGCGGCGATATGCGGCGGCACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGa > 2:2762366/1‑148 (MQ=255) aTCCCGGCGGCGATATGCGGCGGCACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGa < 1:2002458/148‑1 (MQ=255) tCCCGGCGGCGATATGCGGCGGCACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGAc > 2:400107/1‑148 (MQ=255) tCCCGGCGGCGATATGCGGCGGCACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGAc > 2:1137431/1‑148 (MQ=255) cccGGCGGCGATATGCGGCGGCACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACg < 1:1241040/148‑1 (MQ=255) gcggcgATATGCGGCGGCACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGa > 2:1613352/1‑148 (MQ=255) gcggcgATATGCGGCGGCACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGa > 2:1613739/1‑148 (MQ=255) ggcgATATGCGGCGGCACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATg < 1:2950959/148‑1 (MQ=255) tatGCGGCGGCACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTg < 2:777701/148‑1 (MQ=255) cggcggCACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTaa < 1:1465916/148‑1 (MQ=255) cggcACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGt > 1:951655/1‑148 (MQ=255) gcACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGACCGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCg > 2:2605565/1‑148 (MQ=255) gcACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCg < 1:2011421/148‑1 (MQ=255) gcACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCg > 2:818834/1‑148 (MQ=255) cACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCgg > 1:742694/1‑148 (MQ=255) aCCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGt < 2:613988/148‑1 (MQ=255) cAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGAAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGTCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTAAGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTc > 2:1857986/1‑148 (MQ=255) aGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTcc < 2:414232/148‑1 (MQ=255) tGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGc < 1:272694/148‑1 (MQ=255) gATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGcc < 2:2356218/148‑1 (MQ=255) aTACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGccc > 2:174482/1‑148 (MQ=255) aTACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGccc > 1:3511841/1‑148 (MQ=255) aTACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGccc > 1:3511681/1‑148 (MQ=255) aGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGaa > 2:1198284/1‑148 (MQ=255) gCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAAt > 1:1180370/1‑148 (MQ=255) cACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATa > 2:3142241/1‑148 (MQ=255) gTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACgg < 2:1174667/148‑1 (MQ=255) gTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGAGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACgg < 1:3236623/148‑1 (MQ=255) aaGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGgtc > 1:3100387/1‑148 (MQ=255) aaGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGgtc < 2:642536/148‑1 (MQ=255) aaaGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGgtcagt < 1:2587513/148‑1 (MQ=255) cagcagGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAgg > 2:3206023/1‑148 (MQ=255) cagGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGa > 1:2467267/1‑148 (MQ=255) ggTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGACGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAat > 1:3174075/1‑148 (MQ=255) gTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAatc < 1:1945909/148‑1 (MQ=255) gaGTCCATGGGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAatca < 1:1845940/147‑1 (MQ=255) aGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGCCCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTATAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCTGTCAGGCGAatcat < 2:2111270/148‑1 (MQ=255) aGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAatcat < 1:2629426/148‑1 (MQ=255) aGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAatcat < 1:842468/148‑1 (MQ=255) aGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAatcat < 2:1023035/148‑1 (MQ=255) gTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAatcatc < 1:1137431/148‑1 (MQ=255) cATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCg < 2:2021950/148‑1 (MQ=255) cATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCg < 1:3359204/148‑1 (MQ=255) aCTGCTGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAagag < 2:2428284/148‑1 (MQ=255) aCTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAagag > 1:2322152/1‑148 (MQ=255) aCTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAagag < 2:844711/148‑1 (MQ=255) tGCGGTGGCAAGGCACATAGACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGaa < 2:2562690/148‑1 (MQ=255) gCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGaaa > 2:2917106/1‑148 (MQ=255) cGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAAt < 2:193449/148‑1 (MQ=255) cAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTcgccg > 2:2181911/1‑148 (MQ=255) cAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTcgccg > 2:1579262/1‑148 (MQ=255) aGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCa < 2:3390407/148‑1 (MQ=255) aGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCa < 2:3390729/148‑1 (MQ=255) ggCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCaa < 1:2318739/148‑1 (MQ=255) gCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAAt < 1:215915/148‑1 (MQ=255) gCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAAt < 1:1759172/148‑1 (MQ=255) acaTATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTCTGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGAAACAGACATTCGCCCCAAtct > 2:3175663/1‑148 (MQ=255) atatACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATctct < 2:1101198/148‑1 (MQ=255) ataCCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTc < 2:3223601/148‑1 (MQ=255) ataCCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTc < 2:729834/148‑1 (MQ=255) ataCCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTc < 1:174495/148‑1 (MQ=255) ccAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCTGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCAt < 1:1595418/148‑1 (MQ=255) ccAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCAt < 1:1898789/148‑1 (MQ=255) ccAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCAt < 2:2234714/148‑1 (MQ=255) ccAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCAt > 1:1732103/1‑148 (MQ=255) ccAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCAt < 2:630774/148‑1 (MQ=255) gCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAg > 2:1032759/1‑148 (MQ=255) tCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTg > 2:356007/1‑148 (MQ=255) aTGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCa < 2:724670/148‑1 (MQ=255) tGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCaa < 2:6448/148‑1 (MQ=255) tGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCaa < 1:866480/148‑1 (MQ=255) tGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCaa < 2:7158/148‑1 (MQ=255) tGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCaa < 1:1109563/148‑1 (MQ=255) gACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAAt < 1:1647698/148‑1 (MQ=255) gtcgtGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATcgcg < 2:2666962/148‑1 (MQ=255) cgtGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGTAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGtt < 2:951651/148‑1 (MQ=255) gtGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTc < 2:1696980/148‑1 (MQ=255) gggCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTctg < 1:3409508/148‑1 (MQ=255) gggCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTctg < 1:609386/148‑1 (MQ=255) gggCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTctg < 1:623650/148‑1 (MQ=255) aGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGTCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTCTGCTgcg < 2:1235053/148‑1 (MQ=255) aGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTCTGCTgcg < 1:1448150/148‑1 (MQ=255) aGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTCTGCTgcg > 2:2400880/1‑148 (MQ=255) aGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTCTGCTgcg < 1:1188970/148‑1 (MQ=255) aGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTCTGCTgcg < 1:1654882/148‑1 (MQ=255) cTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTCTGCTGCGCt < 2:1460208/148‑1 (MQ=255) gCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTCTGCTGCGCtttt < 1:2762366/148‑1 (MQ=255) cGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTCTGCTGCGCttttt < 1:504472/148‑1 (MQ=255) aCGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTCTGCTGCGCTTTTTCAt > 2:2002236/1‑148 (MQ=255) cTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTCTGCTGCGCTTTTTCATGGgag > 2:2517551/1‑148 (MQ=255) cTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTCTGCTGCGCTTTTTCATGGgag > 2:2540362/1‑148 (MQ=255) cTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTCTGCTGCGCTTTTTCATGGgag > 1:2038547/1‑148 (MQ=255) tCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTCTGCTGCGCTTTTTCATGGgaga < 2:2786085/148‑1 (MQ=255) cAGCTTTATGGACTTTGATGCGCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGTAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTCTGCTGCGCTTTTTCCTGGGAGAt < 1:3440283/148‑1 (MQ=255) cAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTCTGCTGCGCTTTTTCATGGGAGAt < 2:1807710/148‑1 (MQ=255) | GGTTGATCCCGGCGGCGATATGCGGCGGCACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTCTGCTGCGCTTTTTCATGGGAGAT > CP009273/4245392‑4245680 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |