| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 4,372,375 | 0 | C | A | 5.7% | 752.1 / 13.6 | 200 | intergenic (‑240/‑85) | frdA/epmA | fumarate reductase (anaerobic) catalytic and NAD/flavoprotein subunit/Elongation Factor P Lys34 lysyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (107/81); new base A (8/4); total (115/85) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.63e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 203 total aligned reads displayed.
TATAGGTACAACAGTATAGTCTGATGGATAAGTCTGAAATTTGACGAGATCGATTTTTTTAGTGCGCAAGAGGGCTAAATTATCACTGAAGATGATTAATTTAATTACTAAACCATCAGATCGTGCTTTTTTTAGTCACTGCCCACCGCTGTTTGATTCCTGCGTAAAATTTGTCTCGCCGTCGCGTTGCGAGTAGACTTCGTGCCCTTGTCAAAAACTGGAGATTTAACTATGAGCGAAACGGCATCCTGGCAGCCGAGCGCATCCATTCCTAACTTATTAAAACGCGCGGCG > CP009273/4372229‑4372522 | tataGGTACAACAGTATAGTCTGATGGATAAGTCTGAAATTTGACGAGATCGATTTTTTTAGTGCGCAAGAGGGCTAAATTATCACTGAAGATGATTAATTTAATTACTAAACCATCAGATCGTGCTTTTTTTAGTCACTGCCCACCg < 2:2214115/148‑1 (MQ=255) ataGGTACAACAGTATAGTCTGATGGATAAGTCTGAAATTTGACGAGATCGATTTTTTTAGTGCGCAAGAGGGCTAAATTATCACTGAAGATGATTAATTTAATTACTAAACCATCAGATCGTGCTTTTTTTAGTCACTGCCCACCGc > 2:595702/1‑148 (MQ=255) taGGTACAACAGTATAGTCTGATGGATAAGTCTGAAATTTGACGAGATCGATTTTTTTAGTGCGCAAGAGGGCTAAATTATCACTGAAGATGATTAATTTAATTACTAAACCATCAGATCGTGCTTTTTTTAGTCACTGCCCACCGCt < 1:1241163/148‑1 (MQ=255) taGGTACAACAGTATAGTCTGATGGATAAGTCTGAAATTTGACGAGATCGATTTTTTTAGTGCGCAAGAGGGCTAAATTATCACTGAAGATGATTAATTTAATTACTAAACCATCAGATCGTGCTTTTTTTAGTCACTGCCCACCGCt < 1:1494486/148‑1 (MQ=255) ggTACAACAGTATAGTCTGATGGATAAGTCTGAAATTTGACGAGATCGATTTTTTTAGTGCGCAAGAGGGCTAAATTATCACTGAAGATGATTAATTTAATTACTAAACCATCAGATCGTGCTTTTTTTAGTCACTGCCCACCGCTGt > 1:2632402/1‑148 (MQ=255) ggTACAACAGTATAGTCTGATGGATAAGTCTGAAATTTGACGAGATCGATTTTTTTAGTGCGCAAGAGGGCTAAATTATCACTGAAGATGATTAATTTAATTACTAAACCATCAGATCGTGCTTTTTTTAGTCACTGCCCACCGCTGt < 2:1874811/148‑1 (MQ=255) ggTACAACAGTATAGTCTGATGGATAAGTCTGAAATTTGACGAGATCGATTTTTTTAGTGCGCAAGAGGGCTAAATTATCACTGAAGATGATTAATTTAATTACTAAACCATCAGATCGTGCTTTTTTTAGTCACTGCCCACCGCTGt < 2:2518951/148‑1 (MQ=255) tACAACAGTATAGTCTGATGGATAAGTCTGAAATTTGACGAGATCGATTTTTTTAGTGCGCAAGAGGGCTAAATTATCACTGAAGATGATTAATTTAATTACTAAACCATCAGATCGTGCTTTTTTTAGTCACTGCCCACCGCTGttt > 2:3466830/1‑148 (MQ=255) tACAACAGTATAGTCTGATGGATAAGTCTGAAATTTGACGAGATCGATTTTTTTAGTGCGCAAGAGGGCTAAATTATCACTGAAGATGATTAATTTAATTACTAAACCATCAGATCGTGATTTTTTTAGTAACTGACCACAGCTGtat > 2:1704053/1‑146 (MQ=255) acaacaGTATAGTCTGATGGATAAGTCTGAAATTTGACGAGATCGATTTTTTTAGTGCGCAAGAGGGCTAAATTATCACTGAAGATGATTAATTTAATTACTAAACCATCAGATCGTGCTTTTTTTAGTCACTGCCCACCGCTGTTTg > 2:1515154/1‑148 (MQ=255) caacaGTATAGTCTGATGGATAAGTCTGAAATTTGACGAGATCGATTTTTTTAGTGCGCAAGAGGGCTAAATTATCACTGAAGATGATTAATTTAATTACTAAACCATCAGATCGTGCTTTTTTTAGTCACTGCCCACCGCTGTTTGa < 1:601776/148‑1 (MQ=255) tataGTCTGATGGATAAGTCTGAAATTTGACGAGATCGATTTTTTTAGTGCGCAAGAGGGCTAAATTATCACTGAAGATGATTAATTTAATTACTAAACCATCAGATCGTGCTTTTTTTAGTCACTGCCCACCGCTGTTTGATTCCTg > 2:1386786/1‑148 (MQ=255) ataGTCTGATGGATAAGTCTGAAATTTGACGAGATCGATTTTTTTAGTGCGCAAGAGGGCTAAATTATCACTGAAGATGATTAATTTAATTACTAAACCATCAGATCGTGCTTTTTTTAGTCACTGCCCACCGCTGTTTGATTCCTGc > 2:2415523/1‑148 (MQ=255) aGTCTGATGGATAAGTCTGAAATTTGACGAGATCGATTTTTTTAGTGCGCAAGAGGGCTAAATTATCACTGAAGATGATTAATTTAATTACTAAACCATCAGATCGTGCTTTTTTTAGTCACTGCCCACCGCTGTTTGATTCCTGCGt > 1:2465557/1‑148 (MQ=255) 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tttttttAGTCACTGCCCACCGCTGTTTGATTCCTGCGTAAAATTTGTCTCGCCGTCGCGTTGCGAGTAGACTTCGTGCCCTTGTCAAAAACTGGAGATTTAACTATGAGCGAAACGGCATCCTGGCAGCCGAGCGCATCCATTCCTa > 1:879927/1‑148 (MQ=255) ttttttAGTCACTGCCCACCGCTGTTTGATTCCTGCGTAAAATTTGTCTCGCCGTCGCGTTGCGAGTAGACTTCGTGCCCTTGTCAAAAACTGGAGATTTAACTATGAGCGAAACGGCATCCTGGCAGCCGAGCGCATCCATTCCTaa < 1:3249821/148‑1 (MQ=255) ttttttAGTCACTGCCCACCGCTGTTTGATTCCTGCGTAAAATTTGTCTCGCCGTCGCGTTGCGAGTAGACTTCGTGCCCTTGTCAAAAACTGGAGATTTAACTATGAGCGAAACGGCATCCTGGCAGCCGAGCGCATCCATTCCTaa > 2:3179271/1‑148 (MQ=255) ttttttAGTCACTGCCCACCGCTGTTTGATTCCTGCGTAAAATTTGTCTCGCCGTCGCGTTGCGAGTAGACTTCGTGCCCTTGTCAAAAACTGGAGATTTAACTATGAGCGAAACGGCATCCTGGCAGCCGAGCGCATCCATTCCTaa > 2:1404914/1‑148 (MQ=255) tAGTCACTGCCCACCGCTGTTTGATTCCTGCGTAAAATTTGTCTCGCCGTCGCGTTGCGAGTAGACTTCGTGCCCTTGTCAAAAACTGGAGATTTAACTATGAGCGAAACGGCATCCTGGCAGCCGAGCGCATCCATTCCTAACttat < 1:2853769/148‑1 (MQ=255) gTCACTGCCCACCGCTGTTTGATTCCTGCGTAAAATTTGTCTCGCCGTCGCGTTGCGAGTAGACTTCGTGCCCTTGTCAAAAACTGGAGATTTAACTATGAGCGAAACGGCATCCTGGCAGCCGAGCGCATCCATTCCTAACttatta > 2:2726068/1‑148 (MQ=255) cACTGCCCACCGCTGTTTGATTCCTGCGTAAAATTTGTCTCGCCGTCGCGTTGCGAGTAGACTTCGTGCCCTTGTCAAAAACTGGAGATTTAACTATGAGCGAAACGGCATCCTGGCAGCCGAGCGCATCCATTCCTAACTTATTaaa > 2:1505731/1‑148 (MQ=255) aCTGCCCACCGCTGTTTGATTCCTGCGTAAAATTTGTCTCGCCGTCGCGTTGCGAGTAGACTTCGTGCCCTTGTCAAAAACTGGAGATTTAACTATGAGCGAAACGGCATCCTGGCAGCCGAGCGCATCCATTCCTAACTTATTaaaa < 2:2574007/148‑1 (MQ=255) cTGCCCACCGCTGTTTGATTCCTGCGTAAAATTTGTCTCGCCGTCGCGTTGCGAGTAGACTTCGTGCCCTTGTCAAAAACTGGAGATTTAACTATGAGCGAAACGGCATCCTGGCAGCCGAGCGCATCCATTCCTAACTTATTAAAAc > 1:1371938/1‑148 (MQ=255) cccACAGCTGTTTGATTCCTGCGTAAAATTTGTCTCGCCGTCGCGTTGCGAGTAGACTTCGTGCCCTTGTCAAAAACTGGAGATTTAACTATGAGCGAAACGGCATCCTGGCAGCCGAGCGCATCCATTCCTAACTTATTAAAAcgcg < 1:3514853/148‑1 (MQ=255) cGCTGTTTGATTCCTGCGTAAAATTTGTCTCGCCGTCGCGTTGCGAGTAGACTTCGTGCCCTTGTCAAAAACTGGAGATTTAACTATGAGCGAAACGGCATCCTGGCAGCCGAGCGCATCCATTCCTAACTTATTAAAACGCgcggcg > 2:1884115/1‑148 (MQ=255) | TATAGGTACAACAGTATAGTCTGATGGATAAGTCTGAAATTTGACGAGATCGATTTTTTTAGTGCGCAAGAGGGCTAAATTATCACTGAAGATGATTAATTTAATTACTAAACCATCAGATCGTGCTTTTTTTAGTCACTGCCCACCGCTGTTTGATTCCTGCGTAAAATTTGTCTCGCCGTCGCGTTGCGAGTAGACTTCGTGCCCTTGTCAAAAACTGGAGATTTAACTATGAGCGAAACGGCATCCTGGCAGCCGAGCGCATCCATTCCTAACTTATTAAAACGCGCGGCG > CP009273/4372229‑4372522 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |