| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 4,428,092 | G→T | 100% | G190V (GGA→GTA) | ytfI → | uncharacterized protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 4,428,092 | 0 | G | T | 97.8% | 829.6 / 7.9 | 271 | G190V (GGA→GTA) | ytfI | uncharacterized protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (5/1); new base T (120/145); total (125/146) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.81e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.93e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 273 total aligned reads displayed.
TTCTACAGAAAAAACAGTCTGACATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAGGGGATGAACGTTTTCGTAATGGTTCCTCTGTTGTTT > CP009273/4427948‑4428235 | tCTACAGAAAAAACAGTCTGACATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGt < 1:1743030/148‑1 (MQ=255) aCAGAAAAAACAGTCTGACATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGa > 2:3080806/1‑148 (MQ=255) cAGAAAAAACAGTCTGACATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGaa < 2:1364899/148‑1 (MQ=255) cAGAAAAAACAGTCTGACATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGaa < 2:2582304/148‑1 (MQ=255) cAGAAAAAACAGTCTGACATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGaa > 2:1032393/1‑148 (MQ=255) gAAAAAACAGTCTGACATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAAtt < 2:45871/148‑1 (MQ=255) aaaCAGTCTGACATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAg > 1:3562173/1‑148 (MQ=255) aaCAGTCTGACATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGa > 2:105869/1‑148 (MQ=255) gTCTGACATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGc < 2:329666/148‑1 (MQ=255) tCTGACATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCg < 1:716573/148‑1 (MQ=255) tCTGACATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCg > 1:2701909/1‑148 (MQ=255) tCTGACATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCg < 2:571580/148‑1 (MQ=255) tCTGACATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCg < 2:6267/148‑1 (MQ=255) tCTGACATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCg > 1:1150659/1‑148 (MQ=255) gACATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCgatg > 2:1990582/1‑148 (MQ=255) cATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCgatgga < 2:3472605/148‑1 (MQ=255) aTACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCgatggat < 2:522695/148‑1 (MQ=255) aTACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCgatggat < 2:1779986/148‑1 (MQ=255) aCCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGatggatgg > 1:2432689/1‑148 (MQ=255) gAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGAAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGtat < 2:238707/148‑1 (MQ=255) aaaaGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGtata > 1:2042196/1‑148 (MQ=255) aaaaGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGtata > 2:1140063/1‑148 (MQ=255) aaaGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTatat > 2:549950/1‑148 (MQ=255) aaaGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTatat < 1:3351978/148‑1 (MQ=255) aaaGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTatat > 2:3401681/1‑148 (MQ=255) aGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATAttt < 2:3116396/148‑1 (MQ=255) aGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATAttt < 1:1375447/148‑1 (MQ=255) aGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATAttt < 2:2049183/148‑1 (MQ=255) aGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGaaaaa < 2:405575/148‑1 (MQ=255) ggTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGaaaaaa > 1:1222125/1‑148 (MQ=255) gTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAaat < 1:2493070/148‑1 (MQ=255) tataTTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAaataa > 1:2754044/1‑148 (MQ=255) atatTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAaataat > 2:3536613/1‑148 (MQ=255) atatTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAaataat < 2:1641726/148‑1 (MQ=255) tatTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAAtt > 2:974085/1‑148 (MQ=255) atTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATtg < 1:1722409/148‑1 (MQ=255) ttCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATtga > 2:3150436/1‑148 (MQ=255) tCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATtgat > 2:3238274/1‑148 (MQ=255) tCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATtgat > 2:92478/1‑148 (MQ=255) tCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATtgat > 1:1018967/1‑148 (MQ=255) aacAGGAGATTGGTGTAGTGTATTTAGTTTATGCCTTTTTTGAGGATATAGTATTCAAATTAAAACTGGTTAAATTTGAACTACAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAATAAATAATtgatga < 1:2959652/146‑1 (MQ=255) aGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATaa > 2:2324215/1‑148 (MQ=255) gCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAAtt > 1:1001646/1‑148 (MQ=255) aTTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTg > 1:3273709/1‑148 (MQ=255) ttGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGc > 2:1844756/1‑148 (MQ=255) ggTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCa < 2:690576/148‑1 (MQ=255) gTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCAt < 2:756809/148‑1 (MQ=255) gtCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATa > 1:1606838/1‑148 (MQ=255) ttAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAAt < 2:725246/148‑1 (MQ=255) tAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATc > 1:1667926/1‑148 (MQ=255) gTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCttt < 1:509286/148‑1 (MQ=255) tATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCtttag < 2:3219956/148‑3 (MQ=255) tGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGc < 2:2442619/148‑1 (MQ=255) gCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCt > 2:2138833/1‑148 (MQ=255) aTTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTgcg < 2:1573432/148‑1 (MQ=255) tGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCt > 1:2691803/1‑148 (MQ=255) tGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCt > 2:3265006/1‑148 (MQ=255) ggaggaTATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCtt > 1:878996/1‑148 (MQ=255) aggaTATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTaa > 1:2011314/1‑148 (MQ=255) taGTAAGCAAATTAAAACGGGTTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTa < 2:2668193/148‑1 (MQ=255) taGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTa < 2:2087723/148‑1 (MQ=255) aGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTAt < 2:2981026/148‑1 (MQ=255) aaGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGa > 1:2857660/1‑148 (MQ=255) gCAAATTAAAACGGGGTAAATTTTAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATATTGCCATAGACATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGTAgg > 2:3212941/1‑148 (MQ=255) gCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAgg < 1:595647/148‑1 (MQ=255) aTTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAGGGGAt > 1:1449006/1‑148 (MQ=255) aTTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAGGGGAt < 1:3426920/148‑1 (MQ=255) ttAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAGGGGATg > 2:478211/1‑148 (MQ=255) tAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAGGGGATGa < 1:1329794/148‑1 (MQ=255) aaaaCGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAGGGGATGaa < 1:1846582/148‑1 (MQ=255) aaCGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAGGGGATGAACg < 2:2754044/148‑1 (MQ=255) aCGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGTTGGAATTAAATAATGCGATGGATGGTATATATACTAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCCTAGTCATAGAATCTTTGTGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAGGGGATGaaatt > 2:2485607/1‑145 (MQ=255) aCGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAGGGGATGAACGt < 1:1240073/148‑1 (MQ=255) aCGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAGGGGATGAACGt > 1:44195/1‑148 (MQ=255) cGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAGGGGATGAACGtt > 1:2908655/1‑148 (MQ=255) cGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAGGGGATGAACGtt > 1:3226005/1‑148 (MQ=255) cGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTCGAATTAAAGAATGCGATGGATTGTATATTTACGAAAAAATAATTTATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGATTAAAATCTATGGAGGGGATGAACttt > 1:672730/1‑148 (MQ=255) ggggTAAATTTTAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAGGGGATGAACGttt < 2:2302502/148‑1 (MQ=255) aaaTTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAGTCTATGGAGGGGATGAACGTTTTCGTa < 1:187150/148‑1 (MQ=255) aaaTTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAGGGGATGAACGTTTTCGTa < 2:2042030/148‑1 (MQ=255) aaaTTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAGGGGATGAACGTTTTCGTa < 1:971436/148‑1 (MQ=255) aaaTTTGAACTCCAAATAACAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAGGGGATGAACGTTTTCGTa < 2:2160994/148‑1 (MQ=255) aaTTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAGGGGATGAACGTTTTCGTaa < 1:347369/148‑1 (MQ=255) aTTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAGGGGATGAACGTTTTCGTAAt > 2:1965921/1‑148 (MQ=255) aCTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAGGGGATGAACGTTTTCGTAATGGTTcc < 2:2925376/148‑1 (MQ=255) cTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAGGGGATGAACGTTTTCGTAATGGTTCct < 2:1464230/148‑1 (MQ=255) cTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAGGGGATGAACGTTTTCGTAATGGTTCct < 2:132538/148‑1 (MQ=255) cTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAGGGGATGAACGTTTTCGTAATGGTTCct < 2:1341141/148‑1 (MQ=255) cTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAGGGGATGAACGTTTTCGTAATGGTTCct > 1:2227841/1‑148 (MQ=255) ccAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAGGGGATGAACGTTTTCGTAATGGTTCctct < 1:2553430/148‑1 (MQ=255) cAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAGGGGATGAACGTTTTCGTAATGGTTCCTCtg < 2:493848/148‑1 (MQ=255) cAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAGGGGATGAACGTTTTCGTAATGGTTCCTCtg < 2:1765208/148‑1 (MQ=255) aaaTACCAGTAGGTGTAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAGGGGATGAACGTTTTCGTAATGGTTCCTCtgt < 2:2707786/148‑1 (MQ=255) aaTACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAGGGGATGAACGTTTTCGTAATGGTTCCTCtgtt > 1:2120043/1‑148 (MQ=255) aTACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAGGGGATGAACGTTTTCGTAATGGTTCCTCtgttg < 1:2341937/148‑1 (MQ=255) aTACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAGGGGATGAACGTTTTCGTAATGGTTCCTCtgttg > 2:2862155/1‑148 (MQ=255) aTACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAGGGGATGAACGTTTTCGTAATGGTTCCTCtgttg < 1:549950/148‑1 (MQ=255) aCCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAGGGGATGAACGTTTTCGTAATGGTTCCTCTgttgtt > 1:1539805/1‑148 (MQ=255) aCCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAGGGGATGAACGTTTTCGTAATGGTTCCTCTgttgtt < 1:1272427/148‑1 (MQ=255) ccAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAGGGGATGAACGTTTTCGTAATGGTTCCTCTGTTGttt < 2:1524691/148‑1 (MQ=255) | TTCTACAGAAAAAACAGTCTGACATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAGGGGATGAACGTTTTCGTAATGGTTCCTCTGTTGTTT > CP009273/4427948‑4428235 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |