Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 4,458,254 | T→A | 100% | V271V (GTT→GTA) | mgtA → | magnesium transporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 4,458,254 | 0 | T | A | 100.0% | 687.5 / ‑6.7 | 211 | V271V (GTT→GTA) | mgtA | magnesium transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (102/108); minor base C (1/0); total (103/108) | |||||||||||
Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 211 total aligned reads displayed.
CTACCACTCGCCAGCCGGAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTTAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAAAGGCGACTGGTGGGAAGCGGCGCTG > CP009273/4458109‑4458398 | cTACCACTCGCCAGCCGGAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAg < 2:2639137/148‑1 (MQ=255) aCCACTCGCCAGCCGGAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTg > 2:592236/1‑148 (MQ=255) aCCACTCGCCAGCCGGAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTg < 2:1913822/148‑1 (MQ=255) cACTCGCCAGCCGGAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAg > 1:1168939/1‑148 (MQ=255) aCTCGCCAGCCGGAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGc > 1:2831576/1‑148 (MQ=255) cTCGCCAGCCGGAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCa > 1:1095234/1‑148 (MQ=255) cTCGCCAGCCGGAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCa > 1:3213600/1‑148 (MQ=255) cAGCCGGAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGaaa < 2:1533494/148‑1 (MQ=255) gCCGGAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGc > 1:577587/1‑148 (MQ=255) gCCGGAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGc > 1:3199244/1‑148 (MQ=255) ggAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAg < 1:1311931/148‑1 (MQ=255) gCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCg > 2:692749/1‑148 (MQ=255) gCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGGGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCg > 2:2481423/1‑148 (MQ=255) cacaGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGa < 2:3192591/148‑1 (MQ=255) cacaCCAATCCGCAGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACAGTGTTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTAAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGa > 2:1680573/1‑148 (MQ=255) acaGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGaa > 1:642657/1‑148 (MQ=255) acaGCAATCCGCTGGAGTGAGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGaa < 2:2070106/148‑1 (MQ=255) aGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATg > 1:3049270/1‑148 (MQ=255) gCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGc < 1:123901/148‑1 (MQ=255) aTCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCtt < 1:479479/148‑1 (MQ=255) aTCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCtt < 1:1762737/148‑1 (MQ=255) tCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCttt < 1:596829/148‑1 (MQ=255) ccGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTc < 2:1214064/148‑1 (MQ=255) cGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCa < 1:908865/148‑1 (MQ=255) cTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGc > 1:1113770/1‑148 (MQ=255) gAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAg > 1:16246/1‑148 (MQ=255) gAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAg > 1:14775/1‑148 (MQ=255) aGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAgg < 2:307374/148‑1 (MQ=255) aGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAgg < 2:2896674/148‑1 (MQ=255) tGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGa > 2:2304206/1‑148 (MQ=255) gCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGAt < 2:2006783/148‑1 (MQ=255) gCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGAt < 1:1903780/148‑1 (MQ=255) gACACGCTGTGTTTTATGGGCACCCCCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCa < 2:728747/148‑1 (MQ=255) acacGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAg < 2:204589/148‑1 (MQ=255) gtgtTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTc < 1:2542518/148‑1 (MQ=255) ttttATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGt > 2:2321588/1‑148 (MQ=255) tgttATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCACTGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGt > 2:2321216/3‑148 (MQ=255) ttATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTAt < 1:1505406/148‑1 (MQ=255) tATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTAtg < 1:123536/148‑1 (MQ=255) aTGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTAtgc < 1:3147883/148‑1 (MQ=255) tGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCAAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTAtgct > 2:2756607/1‑148 (MQ=255) gggCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTAtgctg < 1:2262948/148‑1 (MQ=255) ccaccGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGAt > 1:3476198/1‑148 (MQ=255) caccGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTCAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGAtt > 2:2733787/1‑148 (MQ=255) caccGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGAtt < 2:334359/148‑1 (MQ=255) cGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGc < 1:152984/148‑1 (MQ=255) cGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGc < 1:2389367/148‑1 (MQ=255) tggtgAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCtt < 2:2461060/148‑1 (MQ=255) tggtgAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCtt < 2:2380478/148‑1 (MQ=255) tggtgAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCtt < 1:251586/148‑1 (MQ=255) ggtgAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCttt < 2:2831576/148‑1 (MQ=255) gAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATg < 2:1113770/148‑1 (MQ=255) gAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATg < 1:2115133/148‑1 (MQ=255) cggcacAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGAt > 2:502834/1‑148 (MQ=255) ggcacAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATg < 1:390986/148‑1 (MQ=255) ggcacAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATg < 1:2817478/148‑1 (MQ=255) gcacAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATgg > 2:1531686/1‑148 (MQ=255) gcacAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATgg > 2:1644040/1‑148 (MQ=255) caAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCAc < 2:2211510/148‑1 (MQ=255) aGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCg > 1:1351170/1‑148 (MQ=255) cAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCggt > 2:487597/1‑148 (MQ=255) tGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCggtggt > 2:832657/1‑148 (MQ=255) tGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCggtggt < 2:1721373/148‑1 (MQ=255) tGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGAGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCggtggt > 2:84332/1‑148 (MQ=255) ggTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGgtggtg < 2:1568033/148‑1 (MQ=255) ggTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGgtggtg < 2:642657/148‑1 (MQ=255) gTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGTTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGc < 2:2748781/148‑1 (MQ=255) gATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTg < 2:1821857/148‑1 (MQ=255) gATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTg > 1:1028230/1‑148 (MQ=255) gATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTg > 2:3152885/1‑148 (MQ=255) aTTGCTACAGGTGCCAAGACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGt < 1:1671304/148‑1 (MQ=255) tGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTa > 2:1060088/1‑148 (MQ=255) tGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTa > 1:2489446/1‑148 (MQ=255) cTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAAt < 2:3400923/148‑1 (MQ=255) aCAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCa < 1:2376485/148‑1 (MQ=255) cAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCaa < 2:1168939/148‑1 (MQ=255) ggTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATg > 1:3544183/1‑148 (MQ=255) ggTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATg > 1:3280491/1‑148 (MQ=255) gTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATgg < 1:2440827/148‑1 (MQ=255) gTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATgg > 2:2473967/1‑148 (MQ=255) gTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATgg > 1:2575030/1‑148 (MQ=255) tGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGt < 1:836417/148‑1 (MQ=255) ccAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTa > 1:267595/1‑148 (MQ=255) aCCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCa > 2:1968487/1‑148 (MQ=255) ccTGGTTTGGTCAACTGGCGTGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGTGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCaa < 1:3525928/148‑1 (MQ=255) ccTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCaa < 2:1363054/148‑1 (MQ=255) cTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCaaa < 1:1334272/148‑1 (MQ=255) cTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCaaa < 1:3461683/148‑1 (MQ=255) ggTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAAAgg > 1:2991330/1‑148 (MQ=255) ggTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAAAgg < 2:2683343/148‑1 (MQ=255) tttGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCGTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAAAGGCg > 1:1513905/1‑148 (MQ=255) tGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAAAGGCGAc > 1:504965/1‑148 (MQ=255) tGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAAAGGCGAc < 1:3002803/148‑1 (MQ=255) ggTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAAAGGCGACt < 1:3562995/148‑1 (MQ=255) cAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAAAGGCGACtggt > 2:2132429/1‑148 (MQ=255) cTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAAAGGCGACTGGTggg > 2:2460582/1‑148 (MQ=255) cTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAAAGGCGACTGGTggg > 1:2310321/1‑148 (MQ=255) gCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAAAGGCGACTGGTGGGAAg > 2:2186427/1‑148 (MQ=255) cGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAAAGGCGACTGGTGGGAAgc < 2:594273/148‑1 (MQ=255) cGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAAAGGCGACTGGTGGGAAGCGgcgc < 2:3213600/148‑1 (MQ=255) | CTACCACTCGCCAGCCGGAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTTAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAAAGGCGACTGGTGGGAAGCGGCGCTG > CP009273/4458109‑4458398 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |