Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 4,584,775 | C→A | 100% | E298D (GAG→GAT) | yjjM ← | yjjMN operon transcriptional activator |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 4,584,775 | 0 | C | A | 98.7% | 716.0 / 0.4 | 228 | E298D (GAG→GAT) | yjjM | yjjMN operon transcriptional activator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/2); new base A (121/104); total (122/106) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.99e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.50e-01 | |||||||||||
Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 233 total aligned reads displayed.
TACTACCGCTCACAAAAACATTTTTAGTCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTGGCATCAAGGTCACTGCGGCAAATCAGAGCGCTGAGAATGGTCATATGCTCATCGACGGCAATGATATTGCGCTGTTTAAGA > CP009273/4584630‑4584919 | tactacCGCTCACAAAAACATTTTTAGTCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTtatc > 1:680121/1‑148 (MQ=255) tactacCGCTCACAAAAACATTTTTAGTCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTtatc < 1:2506412/148‑1 (MQ=255) actacCGCTCACAAAAACATTTTTAGTCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCa < 2:92214/148‑1 (MQ=255) actacCGCTCACAAAAACATTTTTAGTCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCa < 2:2321332/148‑1 (MQ=255) tCACAAAAACATTTTTAGTCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGa < 2:1225601/148‑1 (MQ=255) tCACAAAAACATTTTTAGTCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGa < 2:1225199/148‑1 (MQ=255) cacaAAAACATTTTTAGTCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGAt > 2:1632434/1‑148 (MQ=255) cacaAAAACATTTTTAGTCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGAt < 1:3168660/148‑1 (MQ=255) cacaAAAACATTTTTAGTCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGAt > 2:116507/1‑148 (MQ=255) caAAAACATTTTTAGTCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCg > 2:807600/1‑148 (MQ=255) aaaaCATTTTTAGTCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGaa < 2:680121/148‑1 (MQ=255) aaaCATTTTTAGTCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAAt > 2:1073269/1‑148 (MQ=255) aaaCATTTTTAGTCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAAt > 2:2627557/1‑148 (MQ=255) aaaCATTTTTAGTCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAAt > 2:1964183/1‑148 (MQ=255) aCATTTTTAGTCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCa < 1:2144528/148‑1 (MQ=255) aCATTTTTAGTCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCa < 2:1480690/148‑1 (MQ=255) aCATTTTTAGTCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCa > 2:2919138/1‑148 (MQ=255) aTTTTTAGTCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCatt < 1:2740813/148‑1 (MQ=255) tttttAGTCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCattg > 2:1940695/1‑148 (MQ=255) tttttAGTCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCattg > 2:2094465/1‑148 (MQ=255) tttAGTCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCattgat < 2:1578089/148‑1 (MQ=255) tttAGTCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCattgat < 1:1416506/148‑1 (MQ=255) aGTCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGt < 1:3447434/148‑1 (MQ=255) tCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGttt < 1:2131552/148‑1 (MQ=255) tCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGttt < 1:3082900/148‑1 (MQ=255) tCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGttt < 2:121947/148‑1 (MQ=255) tCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGttt < 2:3208422/148‑1 (MQ=255) gACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAg > 1:1247425/1‑148 (MQ=255) gATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGa < 1:2023036/148‑1 (MQ=255) gATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGa > 1:745063/1‑148 (MQ=255) tgtgAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAAtt > 1:1833558/1‑148 (MQ=255) gAGCAGAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCaa < 1:2444244/148‑1 (MQ=255) gCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAAt < 1:793758/148‑1 (MQ=255) cATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATg > 2:2413804/1‑148 (MQ=255) aTAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATgg < 1:3549224/148‑1 (MQ=255) tAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGt > 1:853198/1‑148 (MQ=255) tAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGt > 2:2287214/1‑148 (MQ=255) tAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGt > 1:3557191/1‑148 (MQ=255) tAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGt > 1:1613455/1‑148 (MQ=255) tAGGGAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTGGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTGATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGt < 1:1936090/148‑1 (MQ=255) ggTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTa > 1:47549/1‑148 (MQ=255) gTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTAc > 2:2485220/1‑148 (MQ=255) gCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAg > 1:598651/1‑148 (MQ=255) ggAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAgcgc > 2:251952/1‑148 (MQ=255) ggAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAgcgc > 2:643296/1‑148 (MQ=255) ttCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCGAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAAAGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAggg > 1:1781254/1‑148 (MQ=255) ccGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTgg > 1:2808763/1‑148 (MQ=255) ggTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTGGCa > 2:518424/1‑148 (MQ=255) gTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTGGCAt > 1:3526626/1‑148 (MQ=255) tATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTGGCATc > 1:1023070/1‑148 (MQ=255) tATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTGGCATc > 1:1021561/1‑148 (MQ=255) tttATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTGGCATCaa < 1:8061/148‑1 (MQ=255) aTCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTGGCATCAAGGt > 1:2345701/1‑148 (MQ=255) cTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTGGCATCAAGGTCa > 2:3055546/1‑148 (MQ=255) cTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTGGCATCAAGGTCa < 1:1964183/148‑1 (MQ=255) aTAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTGGCATCAAGGTCACTGCgg > 1:1470117/1‑148 (MQ=255) aaaaCCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTGGCATCAAGGTCACTGCGGCa > 1:1072527/1‑148 (MQ=255) aaaCCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATAGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTGGCATCAAGGTCACTGCGGCaa < 2:598085/148‑1 (MQ=255) aaCCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTGGCATCAAGGTCACTGCGGCaaa > 1:3268439/1‑148 (MQ=255) aCCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTGGCATCAAGGTCACTGCGGCAAAt < 1:279065/148‑1 (MQ=255) aCCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTGGCATCAAGGTCACTGCGGCAAAt > 2:83994/1‑148 (MQ=255) aCCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTGGCATCAAGGTCACTGCGGCAAAt > 2:1287344/1‑148 (MQ=255) ccGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTGGCATCAAGGTCACTGCGGCAAATc < 2:1833558/148‑1 (MQ=255) cGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTGGCATCAAGGTCACTGCGGCAAATCa < 2:97884/148‑1 (MQ=255) gTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTGGCATCAAGGTCACTGCGGCAAATCag < 1:2314201/148‑1 (MQ=255) gTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTGGCATCAAGGTCACTGCGGCAAATCag < 2:2439043/148‑1 (MQ=255) gTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTGGCATCAAGGTCACTGCGGCAAATCag < 1:394318/148‑1 (MQ=255) ccGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGGTATCATTAATGGATCGAATCAGTGATTGTGTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAGGGGTGGCATCATGGTCACTGCGGCAATTCAGAGCGCt > 2:1808802/1‑148 (MQ=255) cGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTGGCATCAAGGTCACTGCGGCAAATCAGAGCGCTg < 1:2201712/148‑1 (MQ=255) cTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTGGCATCAAGGTCACTGCGGCAAATCAGAGCGCTgag > 1:1073473/1‑148 (MQ=255) tAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTGGCATCAAGGTCACTGCGGCAAATCAGAGCGCTgaga < 1:1287344/148‑1 (MQ=255) aaTAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTGGCATCAAGGTCACTGCGGCAAATCAGAGCGCTGAGaa > 1:852774/1‑148 (MQ=255) aaTAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTGGCATCAAGGTCACTGCGGCAAATCAGAGCGCTGAGaa > 1:2462617/1‑148 (MQ=255) aaTAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTGGCATCAAGGTCACTGCGGCAAATCAGAGCGCTGAGaa < 2:3004039/148‑1 (MQ=255) aTAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTGGCATCAAGGTCACTGCGGCAAATCAGAGCGCTGAGAAt > 1:3403384/1‑148 (MQ=255) tAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTGGCATCAAGGTCACTGCGGCAAATCAGAGCGCTGAGACTg > 2:3232503/1‑148 (MQ=255) tAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTGGCATCAAGGTCACTGCGGCAAATCAGAGCGCTGAGAATg > 2:2111435/1‑148 (MQ=255) tAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTGGCATCAAGGTCACTGCGGCAAATCAGAGCGCTGAGAATg > 2:2967703/1‑148 (MQ=255) tAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTGGCATCAAGGTCACTGCGGCAAATCAAAGCGCTGAGAATg > 2:1721774/1‑148 (MQ=255) tttGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTGGCATCAAGGTCACTGCGGCAAATCAGAGCGCTGAGAATGGTc > 2:3453719/1‑148 (MQ=255) tttGCTGTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTGGCATCAAGGTCACTGCGGCAAATCAGAGCGCTGAGAATGGTc < 1:2132861/148‑1 (MQ=255) gTTTTTAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTGGCATCAAGGTCACTGCGGCAAATCAGAGCGCTGAGAATGGTCATATGc > 2:2836491/1‑148 (MQ=255) ttttAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTGGCATCAAGGTCACTGCGGCAAATCAGAGCGCTGAGAATGGTCATATGCTc < 2:1990210/148‑1 (MQ=255) ttttAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTGGCATCAAGGTCACTGCGGCAAATCAGAGCGCTGAGAATGGTCATATGCTc < 2:1021561/148‑1 (MQ=255) ttttAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTGGCATCAAGGTCACTGCGGCAAATCAGAGCGCTGAGAATGGTCATATGCTc < 2:1023070/148‑1 (MQ=255) ttAATCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTACCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTGGCATCAAGGTCACTGCGGCAAATCAGAGCGCTGAGAATGGTCATATGCTCAt < 2:3439972/148‑1 (MQ=255) aTCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTGGCATCAAGGTCACTGCGGCAAATCAGAGCGCTGAGAATGGTCATATGCTCATCGa > 1:3106768/1‑148 (MQ=255) tCCGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTGGCATCAAGGTCACTGCGGCAAATCAGAGCGCTGAGAATGGTCATATGCTCATCGAc > 1:2888612/1‑148 (MQ=255) ccGTACTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTGGCATCAAGGTCACTGCGGCAAATCAGAGCGCTGAGAATGGTCATATGCTCATCGACg > 2:3512828/1‑148 (MQ=255) cTTTATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTGGCATCAAGGTCACTGCGGCAAATCAGAGCGCTGAGAATGGTCATATGCTCATCGACGGCAAt < 1:2416378/148‑1 (MQ=255) tttaTGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGNGCGCAAGGGTGGCATCAAGGTCACTGCGGCAAATCAGAGCGCTGAGAATGGTCATATGCTCATCGACGGCAATg > 1:1811565/4‑148 (MQ=255) taTGAGCATAACGCGTTTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTAAGGAGCGCAAGGGTGGCATCAAGGTCACTGCGGCAAATCAGAGCGCTGAGAATGGTCATATGCTCATCGACTGCAATGat > 1:2628248/2‑148 (MQ=255) aTGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTGGCATCAAGGTCACTGCGGCAAATCAGAGCGCTGAGAATGGTCATATGCTCATCGACGGCAATGata > 2:2860994/1‑148 (MQ=255) aTGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTGGCATCAAGGTCACTGCGGCAAATCAGAGCGCTGAGAATGGTCATATGCTCATCGACGGCAATGata < 1:1569139/148‑1 (MQ=255) cATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTGGCATCAAGGTCACTGCGGCAAATCAGAGCGCTGAGAATGGTCATATGCTCATCGACGGCAATGATATTgcg > 2:786740/1‑148 (MQ=255) aTAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTGGCATCAAGGTCACTGCGGCAAATCAGAGCGCTGAGAATGGTCATATGCTCATCGACGGCAATGATATTgcgc < 1:580499/148‑1 (MQ=255) tAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTGGCATCAAGGTCACTGCGGCAAATCAGAGCGCTGAGAATGGTCATATGCTCATCGACGGCAATGATATTGCGCt > 1:2515788/1‑148 (MQ=255) aCGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTGGCATCAAGGTCACTGCGGCAAATCAGAGCGCTGAGAATGGTCATATGCTCATCGACGGCAATGATATTGCGCTGt > 2:3163106/1‑148 (MQ=255) cgcgTGTTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTGGCATCAAGGTCACTGCGGCAAATCAGAGCGCTGAGAATGGTCATATGCTCATCGACGGCAATGATATTGCGCTGtt > 2:1167393/1‑148 (MQ=255) gtTATCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTGGCATCAAGGTCACTGCGGCAAATCAGAGCGCTGAGAATGGTCATATGCTCATCGACGGCAATGATATTGCGCTGTTTAAGa < 1:2714479/148‑1 (MQ=255) | TACTACCGCTCACAAAAACATTTTTAGTCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTGGCATCAAGGTCACTGCGGCAAATCAGAGCGCTGAGAATGGTCATATGCTCATCGACGGCAATGATATTGCGCTGTTTAAGA > CP009273/4584630‑4584919 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |