Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 461,499 | G→T | 100% | R424S (CGC→AGC) | ybaE ← | putative ABC superfamily transporter periplasmic‑binding protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 461,499 | 0 | G | T | 98.0% | 756.8 / 5.8 | 244 | R424S (CGC→AGC) | ybaE | putative ABC superfamily transporter periplasmic‑binding protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/4); new base T (136/103); total (137/107) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.72e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.13e-01 | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 247 total aligned reads displayed.
AGAGTATATTCCGGTGCTTCGCCAATTAATCTGTCGCCCATCATGAGGTCTGCGTGTGCCTGTAGGGTCGTGTCGTCCCAGTTTTTTGCGTTATGAAAAATAATTGTGAGTTCACAGCCTTCCGCTGCCAGTGTCGCCTGTAGGCGTTCTGCCATGGTATGAAGTTCTATCGGTAGGTGATAAACCAGCGTCAAGGTTTTCGGTAGTTTGACTTCATCCGGTACCTGCCAATGCGGAATAGTCCAGCCTGGCAGTAATGCATGACTGGCGGTGATCAGGTTTTCTCCGAC > CP009273/461354‑461643 | agagTATATTCCGGTGCTTCGCCAATTAATCTGTCGCCCATCATGAGGTCTGCGTGTGCCTGTAGGGTCGTGTCGTCCCAGTTTTTTGCGTTATGAAAAATAATTGTGAGTTCACAGCCTTCCGCTGCCAGTGTCGCCTGTAGGCttt < 2:1394099/148‑1 (MQ=255) agagTATATTCCGGTGCTTCGCCAATTAATCTGTCGCCCATCATGAGGTCTGCGTGTGCCTGTAGGGTCGTGTCGTCCCAGTTTTTTGCGTTATGAAAAATAATTGTGAGTTCACAGCCTTCCGCTGCCAGTGTCGCCTGTAGGCttt < 1:1306390/148‑1 (MQ=255) gagTATATTCCGGTGCTTCGCCAATTAATCTGTCGCCCATCATGAGGTCTGCGTGTGCCTGTAGGGTCGTGTCGTCCCAGTTTTTTGCGTTATGAAAAATAATTGTGAGTTAACAGCCTTCCGCTGCCAGTGTCGCCTGTAGGCTTTc > 1:1513247/1‑148 (MQ=255) gagTATATTCCGGTGCTTCGCCAATTAATCTGTCGCCCATAATGAGGTCTGCGTGTGCCTGTAGGGTCGTGTCGTCCCAGTTTTTTGCGTTATGAAAAATAATTGTGAGTTCACAGCCTTCCGCTGCCTGTGTCGCCTGTAGGCGTTc < 1:1179498/148‑1 (MQ=255) agTATATTCCGGTGCTTCGCCAATTAATCTGTCGCCCATCATGAGGTCTGCGTGTGCCTGTAGGGTCGTGTCGTCCCAGTTTTTTGCGTTATGAAAAATAATTGTGAGTTCACAGCCTTCCGCTGCCAGTGTCGCCTGTAGGCTTTCt > 2:1332278/1‑148 (MQ=255) agTATATTCCGGTGCTTCGCCAATTAATCTGTCGCCCATCATGAGGTCTGCGTGTGCCTGTAGGGTCGTGTCGTCCCAGTTTTTTGCGTTATGAAAAATAATTGTGAGTTCACAGCCATACGCTGCCAGTGTCGCCTGTAGGCTTTCt > 1:655171/1‑148 (MQ=255) gTATATTCCGGTGCTTCGCCAATTAATCTGTCGCCCATCATGAGGTCTGCGTGTGCCTGTAGGGTCGTGTCGTCCCAGTTTTTTGCGTTATGAAAAATAATTGTGAGTTCACAGCCTTCCGCTGCCAGTGTCGCCTGTAGGCTTTCTg > 2:1558571/1‑148 (MQ=255) tatTCCGGTGCTTCGCCAATTAATCTGTCGCCCATCATGAGGTCTGCGTGTGCCTGTAGGGTCGTGTCGTCCCAGTTTTTTGCGTTATGAAAAATAATTGTGAGTTCACAGCCTTCCGCTGCCAGTGTCGCCTGTAGGCTTTCTGCCa < 1:1272444/148‑1 (MQ=255) ttCCGGTGCTTCGCCAATTAATCTGTCGCCCATCATGAGGTCTGCGTGTGCCTGTAGGGTCGTGTCGTCCCAGTTTTTTGCGTTATGAAAAATAATTGTGAGTTCACAGCCTTCCGCTGCCAGTGTCGCCTGTAGGCTTTCTGCCATg > 2:529393/1‑148 (MQ=255) tCCGGTGCTTCGCCAATTAATCTGTCGCCCATCATGAGGTCTGCGTGTGCCTGTAGGGTCGTGTCGTCCCAGTTTTTTGCGTTATGAAAAATAATTGTGAGTTCACAGCCTTCCGCTGCCAGTGTCGCCTGTAGGCTTTCTGcc > 2:686490/1‑144 (MQ=255) tCCGGTGCTTCGCCAATTAATCTGTCGCCCATCATGAGGTCTGCGTGTGCCTGTAGGGTCGTGTCGTCCCAGTTTTTTGCGTTATGAAAAATAATTGTGAGTTCACAGCCTTCCGCTGCCAGTGTCGCCTGTAGGCTTTCTGCCATgg < 2:1860324/148‑1 (MQ=255) tCCGGTGCTTCGCCAATTAATCTGTCGCCCATCATGAGGTCTGCGTGTGCCTGTAGGGTCGTGTCGTCCCAGTTTTTTGCGTTATGAAAAATAATTGTGAGTTCACAGCCTTCCGCTGCCAGTGTCGCCTGTAGGCTTTCTGCCATgg < 2:55283/148‑1 (MQ=255) tCCGGTGCTTCGCCAATTAATCTGTCGCCCATCATGAGGTCTGCGTGTGCCTGTAGGGTCGTGTCGTCCCAGTTTTTTGCGTTATGAAAAATAATTGTGAGTTCACAGCCTTCCGCTGCCAGTGTCGCCTGTAGGCTTTCTGCCATgg > 1:1725462/1‑148 (MQ=255) gCCAATTAATCTGTCGCCCATCATGAGGTCTGCGTGTGCCTGTAGGGTCGTGTCGTCCCAGTTTTTTGCGTTATGAAAAATAATTGTGAGTTCACAGCCTTCCGCTGCCAGTGTCGCCTGTAGGCTTTCTGCCATGGTATGAAGTTCt < 1:1884195/148‑1 (MQ=255) ccAATTAATCTGTCGCCCATCATGAGGTCTGCGTGTGCCTGTAGGGTCGTGTCGTCCCAGTTTTTTGCGTTATGAAAAATAATTGTGAGTTCACAGCCTTCCGCTGCCAGTGTCGCCTGTAGGCTTTCTGCCATGGTATGAAGTTCTa > 1:416203/1‑148 (MQ=255) ccAATTAATCTGTCGCCCATCATGAGGTCTGCGTGTGCCTGTAGGGTCGTGTCGTCCCAGTTTTTTGCGTTATGAAAAATAATTGTGAGTTCACAGCCTTCCGCTGCCAGTGTCGCCTGTAGGCTTTCTGCCATGGTATGAAGTTCTa > 2:352694/1‑148 (MQ=255) ccAATTAATCTGTCGCCCATCATGAGGTCTGCGTGTGCCTGTAGGGTCGTGTCGTCCCAGTTTTTTGCGTTATGAAAAATAATTGTGAGTTCACAGCCTTCCGCTGCCAGTGTCGCCTGTAGGCTTTCTGCCATGGTATGAAGTTCTa < 2:2561529/148‑1 (MQ=255) aTTAATCTGTCGCCCATCATGAGGTCTGCGTGTGCCTGTAGGGTCGTGTCGTCCCAGTTTTTTGCGTTATGAAAAATAATTGTGAGTTCACAGCCTTCCGCTGCCAGTGTCGCCTGTAGGCTTTCTGCCATGGTATGAAGTTCTATCg > 1:2638115/1‑148 (MQ=255) ttAATCTGTCGCCCATCATGAGGTCTGCGTGTGCCTGTAGGGTCGTGTCGTCCCAGTTTTTTGCGTTATGAAAAATAATTGTGAGTTCACAGCCTTCCGCTGCCAGTGTCGCCTGTAGGCTTTCTGCCATGGTATGAAGTTCTATCgg > 1:551176/1‑148 (MQ=255) ttAATCTGTCGCCCATCATGAGGTCTGCGTGTGCCTGTAGGGTCGTGTCGTCCCAGTTTTTTGCGTTATGAAAAATAATTGTGAGTTCACAGCCTTCCGCTGCCAGTGTCGCCTGTAGGCTTTCTGCCATGGTATGAAGTTCTATCgg > 1:2955798/1‑148 (MQ=255) aaTCTGTCGCCCATCATGAGGTCTGCGTGTGCCTGTAGGGTCGTGTCGTCCCAGTTTTTTGCGTTATGAAAAATAATTGTGAGTTCACAGCCTTCCGCTGCCAGTGTCGCCTGTAGGCTTTCTGCCATGGTATGAAGTTCTATCGGTa > 2:2282034/1‑148 (MQ=255) aaTCTGTCGCCCATCATGAGGTCTGCGTGTGCCTGTAGGGTCGTGTCGTCCCAGTTTTTTGCGTTATGAAAAATAATTGTGAGTTCACAGCCTTCCGCTGCCAGTGTCGCCTGTAGGCTTTCTGCCATGGTATGAAGTTCTATCGGTa < 1:3088911/148‑1 (MQ=255) aTCTGTCGCCCATCATGAGGTCTGCGTGTGCCTGTAGGGTCGTGTCGTCCCAGTTTTTTGCGTTATGAAAAATAATTGTGAGTTCACAGCCTTCCGCTGCCAGTGTCGCCTGTAGGCTTTCTGCCATGGTATGAAGTTCTATCGGTAg > 1:1002081/1‑148 (MQ=255) aTCTGTCGCCCATCATGAGGTCTGCGTGTGCCTGTAGGGTCGTGTCGTCCCAGTTTTTTGCGTTATGAAAAATAATTGTGAGTTCACAGCCTTCCGCTGCCAGTGTCGCCTGTAGGCTTTCTGCCATGGTATGAAGTTCTATCGGTAg > 1:3156421/1‑148 (MQ=255) tCTGTCGCCCATCATGAGGTCTGCGTGTGCCTGTAGGGTCGTGTCGTCCCAGTTTTTTGCGTTATGAAAAATAATTGTGAGTTCACAGCCTTCCGCTGCCAGTGTCGCCTGTAGGCTTTCTGCCATGGTATGAAGTTCTATCGGTAgg < 2:252165/148‑1 (MQ=255) gTCGCCCATCATGAGGTCTGCGTGTGCCTGTAGGGTCGTGTCGTCCCAGTTTTTTGCGTTATGAAAAATAATTGTGAGTTCACAGCCTTCCGCTGCCAGTGTCGCCTGTAGGCTTTCTGCCATGGTATGAAGTTCTATCGGTAGGTGa < 2:2425527/148‑1 (MQ=255) atcatGAGGTCTGCGTGTGCCTGTAGGGTCGTGTCGTCCCAGTTTTTTGCGTTATGAAAAATAATTGTGAGTTCACAGCCTTCCGCTGCCAGTGTCGCCTGTAGGCTTTCTGCCATGGTATGAAGTTCTATCGGTAGGTGATAAACCa > 1:2311521/1‑148 (MQ=255) tcatGAGGTCTGCGTGTGCCTGTAGGGTCGTGTCGTCCCAGTTTTTTGCGTTATGAAAAATAATTGTGAGTTCACAGCCTTCCGCTGCCAGTGTCGCCTGTAGGCTTTCTGCCATGGTATGAAGTTCTATCGGTAGGTGATAAACCAg > 2:88324/1‑148 (MQ=255) tcatGAGGTCTGCGTGTGCATGAAGGCTCGTGTCGTCCCACTTTTTTGCATTATGAAAAATAATTGTGAGTTCACACCCTTCCGCTGACAGTGTCGCCTGTATGCTTTATGCCATGGTATTAAGTTCTATCGGTATGTGATAAACCAg > 2:1639949/1‑148 (MQ=255) atGAGGTCTGCGTGTGCCTGTAGGGTCGTGTCGTCCCAGTTTTTTGCGTTATGAAAAATAATTGTGAGTTCACAGCCTTCCGCTGCCAGTGTCGCCTGTAGGCTTTCTGCCATGGTATGAAGTTCTATCGGTAGGTGATAAACCAGCg < 1:412422/148‑1 (MQ=255) aGGTCTGCGTGTGCCTGTAGGGTCGTGTCGTCCCAGTTTTTTGCGTTATGAAAAATAATTGTGAGTTCACAGCCTTCCGCTGCCAGTGTCGCCTGTAGGCTTTCTGCCCTGGTATGAAGTTCTATCGGTAGGTGATAAACCAGCGTCa > 1:1246215/1‑148 (MQ=255) aGGTCTGCGTGTGCCTGTAGGGTCGTGTCGTCCCAGTTTTTTGCGTTATGAAAAATAATTGTGAGTTCACAGCCTTCCGCTGCCAGTGTCGCCTGTAGGCTTTCTGCCATGGTATGAAGTTCTATCGGTAGGTGATAAACCAGCGTCa > 1:2110850/1‑148 (MQ=255) tCTGCGTGTGCCTGTAGGGTCGTGTCGTCCCAGTTTTTTGCGTTATGAAAAATAATTGTGAGTTCACAGCCTTCCGCTGCCAGTGTCGCCTGTAGGCTTTCTGCCATGGTATGAAGTTCTATCGGTAGGTGATAAACCAGCGTCAAgg > 2:2004534/1‑148 (MQ=255) tCTGCGTGTGCCTGTAGGGTCGTGTCGTCCCAGTTTTTTGCGTTATGAAAAATAATTGTGAGTTCACAGCCTTCCGCTGCCAGTGTCGCCTGTAGGCTTTCTGCCATGGTATGAAGTTCTATCGGTAGGTGATAAACCAGCGTCAAgg > 2:2691966/1‑148 (MQ=255) 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ccTGTAGGGTCGTGTCGTCCCAGTTTTTTGCGTTATGAAAAATAATTGTGAGTTCACAGCCTTCCGCTGCCAGTGTCGCCTGTAGGCTTTCTGCCATGGTATGAAGTTCTATCGGTAGGTGATAAACCAGCGTCAAGGTTTTCGGTAg < 2:1104198/148‑1 (MQ=255) cTGTAGGGTCGTGTCGTCCCAGTTTTTTGCGTTATGAAAAATAATTGTGAGTTCACAGCCTTCCGCTGCCAGTGTCGCCTGTAGGCTTTCTGCCATGGTATGAAGTTCTATCGGTAGGTGATAAACCAGCGTCAAGGTTTTCGGTAGt < 2:1766167/148‑1 (MQ=255) gTAGGGTCGTGTCGTCCCAGTTTTTTGCGTTATGAAAAATAATTGTGAGTTCACAGCCTTCCGCTGCCAGTGTCGCCTGTAGGCTTTCTGCCATGGTATGAAGTTCTATCGGTAGGTGATAAACCAGCGTCAAGGTTTTAGGTAGttt > 1:2833503/1‑148 (MQ=255) gggTCGTGTCGTCCCAGTTTTTTGCGTTATTAAAAATAAATTTGAGTTAACATCCTTACGCTGCCAGTGTCGCCTGTAGGCTTTCTGCCATGGTATGAAGTTATATCGGTAGGTGATAAACCAGCGTCAAGGTTTTCGGTAGTTTGAc > 1:30257/1‑148 (MQ=255) gggTCGTGTCGTCCCAGTTTTTTGCGTTATGAAAAATAATTGTGAGTTCACAGCCTTCCGCTGCCAGTGTCGCCTGTAGGCTTTCTGCCATGGTATGAAGTTCTATCGGTAGGTGATAAACCAGCGTCAAGGTTTTCGGTAGTTTGAc > 2:2437536/1‑148 (MQ=255) gggTCGTGTCGTCCCAGTTTTTTGCGTTATGAAAAATAATTGTGAGTTCACAGCCTTCCGCTGCCAGTGTCGCCTGTAGGCTTTCTGCCATGGTATGAAGTTCTATCGGTAGGTGATAAACCAGCGTCAAGGTTTTCGGTAGTTTGAc > 1:1803441/1‑148 (MQ=255) gggTCGTGTCGTCCCAGTTTTTTGCGTTATGAAAAATAATTGTGAGTTCACAGCCTTCCGCTGCCAGTGTCGCCTGTAGGCTTTCTGCCATGGTATGAAGTTCTATCGGTAGGTGATAAACCAGCGTCAAGGTTTTCGGTAGTTTGAc > 2:45344/1‑148 (MQ=255) ggTCGTGTCGTCCCAGTTTTTTGCGTTATGAAAAATAATTGTGAGTTCACAGCCTTCCGCTGCCAGTGTCGCCTGTAGGCTTTCTGCCATGGTATGAAGTTCTATCGGTAGGTGATAAACCAGCGTCAAGGTTTTCGGTAGTTTGACt > 2:629010/1‑148 (MQ=255) tcgtgtcgtCCCAGTTTTTTGCGTTATGAAAAATAATTGTGAGTTCACAGCCTTCCGCTGCCAGTGTCGCCTGTAGGCTTTCTGCCATGGTATGAAGTTCTATCGGTAGGTGATAAACCAGCGTCAAGGTTTTCGGTAGTTTGACTTc < 1:1828159/148‑1 (MQ=255) cgtgtcgtCCCAGTTTTTTGCGTTATGAAAAATAATTGTGAGTTCACAGCCTTCCGCTGCCAGTGTCGCCTGTAGGCTTTCTGCCATGGTATGAAGTTCTATCGGTAGGTGATAAACCAGCGTCAAGGTTTTCGGTAGTTTGACTTCa < 1:2929542/148‑1 (MQ=255) 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cccAGTTTTTTGCGTTATGAAAAATAATTGTGAGTTCACAGCCTTCCGCTGCCAGTGTCGCCTGTAGGCTTTCTGCCATGGTATGAAGTTCTATCGGTAGGTGATAAACCAGCGTCAAGGTTTTCGGTAGTTTGACTTCATCCGGTAc < 1:2030835/148‑1 (MQ=255) cccAGTTTTTTGCGTTATGAAAAATAATTGTGAGTTCACAGCCTTCCGCTGCCAGTGTCGCCTGTAGGCTTTCTGCCATGGTATGAAGTTCTATCGGTAGGTGATAAACCAGCGTCAAGGTTTTCGGTAGTTTGACTTCATCCGGTAc < 1:65362/148‑1 (MQ=255) cccAGTTTTTTGCGTTATGAAAAATAATTGTGAGTTCACAGCCTTCCGCTGCCAGTGTCGCCTGTAGGCTTTCTGCCATGGTATGAAGTTCTATCGGTAGGTGATAAACCAGCGTCAAGGTTTTCGGTAGTTTGACTTCATCCGGTAc < 1:529393/148‑1 (MQ=255) ccAGTTTTTTGCGTTATGAAAAATAATTGTGAGTTCACAGCCTTCCGCTGCCAGTGTCGCCTGTAGGCTTTCTGCCATGGTATGAAGTTCTATCGGTAGGTGATAAACCAGCGTCAAGGTTTTCGGTAGTTTGACTTCATCCGGTAcc > 2:2183940/1‑148 (MQ=255) ttttttGCGTTATGAAAAATAATTGTGAGTTCACAGCCTTCCGCTGCCAGTGTCGCCTGTAGGCTTTCTGCCATGGTATGAAGTTCTATCGGTAGGTGATAAACCAGCGTCAAGGTTTTCGGTAGTTTGACTTCATCCGGTACCTGcc > 1:2792031/1‑148 (MQ=255) 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gAGTTCACAGCCTTCCGCTGCCAGTGTCGCCTGTAGGCTTTCTGCCATGGTATGAAGTTCTATCGGTAGGTGATAAACCAGCGTCAAGGTTTTCGGTAGTTTGACTTCATCCGGTACCTGCCAATGCGGAATAGTCCAGCCTGGCAGt > 2:912756/1‑148 (MQ=255) tCACAGCCTTCCGCTGCCAGTGTCGCCTGTAGGCTTTCTGCCATGGTATGAAGTTCTATCGGTAGGTGATAAACCAGCGTCAAGGTTTTCGGTAGTTTGACTTCATCCGGTACCTGCCAATGCGGAATAGTCCAGCCTGGCAGTAATg > 1:1226428/1‑148 (MQ=255) cacaGCCTTCCGCTGCCAGTGTCGCCTGTAGGCTTTCTGCCATGGTATGAAGTTCTATCGGTAGGTGATAAACCAGCGTCAAGGTTTTCGGTAGTTTGACTTCATCCGGTACCTGCCAATGCGGAATAGTCCAGCCTGGCAGTAATGc < 1:3376869/148‑1 (MQ=255) caGCCTTCCGCTGCCAGTGTCGCCTGTAGGCTTTCTGCCATGGTATGAAGTTCTATCGGTAGGTGATAAACCAGCGTCAAGGTTTTCGGTAGTTTGACTTCATCCGGTACCTGCCAATGCGGAATAGTCCAGCCTGGCAGTAATGCAt > 2:1207931/1‑148 (MQ=255) gCCTTCCGCTGCCAGTGTCGCCTGTAGGCTTTCTGCCATGGTATGAAGTTCTATCGGTAGGTGATAAACCAGCGTCAAGGTTTTCGGTAGTTTGACTTCATCCGGTACCTGCCAATGCGGAATAGTCCAGCCTGGCAGTAATGCATGa < 1:1849419/148‑1 (MQ=255) ccTTCCGCTGCCAGTGTCGCCTGTAGGCTTTCTGCCATGGTATGAAGTTCTATCGGTAGGTGATAAACCAGCGTCAAGGTTTTCGGTAGTTTGACTTCATCCGGTACCTGCCAATGCGGAATAGTCCAGCCTGGCAGTAATGCATGAc < 2:2746889/148‑1 (MQ=255) ccTTCCGCTGCCAGTGTCGCCTGTAGGCTTTCTGCCATGGTATGAAGTTCTATCGGTAGGTGATAAACCAGCGTCAAGGTTTTCGGTAGTTTGACTTCATCCGGTACCTGCCAATGCGGAATAGTCCAGCCTGGCAGTAATGCATGAc < 1:88324/148‑1 (MQ=255) tCCGCTGCCAGTGTCGCCTGTAGGCTTTCTGCCATGGTATGAAGTTCTATCGGTAGGTGATAAACCAGCGTCAAGGTTTTCGGTAGTTTGACTTCATCCGGTACCTGCCAATGCGGAATAGTCCAGCCTGGCAGTAATGCATGACTgg < 2:623640/148‑1 (MQ=255) tCCGCTGCCAGTGTCGCCTGTAGGCTTTCTGCCATGGTATGAAGTTCTATCGGTAGGTGATAAACCAGCGTCAAGGTTTTCGGTAGTTTGACTTCATCCGGTACCTGCCAATGCGGAATAGTCCAGCCTGGCAGTAATGCATGACTgg > 1:2459450/1‑148 (MQ=255) tCCGCTGCCAGTGTCGCCTGTAGGCTTTCTGCCATGGTATGAAGTTCTATCGGTAGGTGATAAACCAGCGTCAAGGTTTTCGGTAGTTTGACTTCATCCGGTACCTGCCAATGCGGAATAGTCCAGCCTGGCAGTAATGCATGACTgg > 2:1491522/1‑148 (MQ=255) cTGCCAGTGTCGCCTGTAGGCTTTCTGCCATGGTATGAAGTTCTATCGGTAGGTGATAAACCAGCGTCAAGGTTTTCGGTAGTTTGACTTCATCCGGTACCTGCCAATGCGGAATAGTCCAGCCTGGCAGTAATGCATGACTGGCGGt < 1:2447602/148‑1 (MQ=255) gCCAGTGTCGCCTGTAGGCTTTCTGCCATGGTATGAAGTTCTCTCGGTAGGTGATAAACCAGCGTCAAGGTTTTCGGTAGTTTGACTTCATCCGGTACCTGCCAATGCGGAATAGTCCAGCCTGGCAGTAATGCATGACTGGCGGTGa < 1:3089600/148‑1 (MQ=255) ccAGTGTCGCCTGTAGGCGTTCTGCCATGGTATGAAGTTCTATCGGTAGGTGATAAACCAGCGTCAAGGTTTTCGGTAGTTTGACTTCATCCGGTACCTGCCAATGCGGAATAGTCCAGCCTGGCAGTAATGCATGACTGGCGGTGAt < 2:3563925/148‑1 (MQ=255) cAGTGTCGCCTGTAGGCTTTCTGCCATGGTATGAAGTTCTATCGGTAGGTGATAAACCAGCGTCAAGGTTTTCGGTAGTTTGACTTCATCCGGTACCTGCCAATGCGGAATAGTCCAGCCTGGCAGTAATGCATGACTGGCGGTGATc > 2:3214923/1‑148 (MQ=255) cAGTGTCGCCTGTAGGCTTTCTGCCATGGTATGAAGTTCTATCGGTAGGTGATAAACCAGCGTCAAGGTTTTCGGTAGTTTGACTTCATCCGGTACCTGCCAATGCGGAATAGTCCAGCCTGGCAGTAATGCATGACTGGCGGTGATc < 2:3148337/148‑1 (MQ=255) 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ggCTTTCTGCCATGGTATGAAGTTCTATCGGTAGGTGATAAACCAGCGTCAAGGTTTTCGGTAGTTTGACTTCATCCGGTACCTGCCAATGCGGAATAGTCCAGCCTGGCAGTAATGCATGACTGGCGGTGATCAGGTTTTCTCCGAc < 1:846266/148‑1 (MQ=255) | AGAGTATATTCCGGTGCTTCGCCAATTAATCTGTCGCCCATCATGAGGTCTGCGTGTGCCTGTAGGGTCGTGTCGTCCCAGTTTTTTGCGTTATGAAAAATAATTGTGAGTTCACAGCCTTCCGCTGCCAGTGTCGCCTGTAGGCGTTCTGCCATGGTATGAAGTTCTATCGGTAGGTGATAAACCAGCGTCAAGGTTTTCGGTAGTTTGACTTCATCCGGTACCTGCCAATGCGGAATAGTCCAGCCTGGCAGTAATGCATGACTGGCGGTGATCAGGTTTTCTCCGAC > CP009273/461354‑461643 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |