| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 1,118,591 | C→A | 50.2% | G47C (GGT→TGT) | yceB ← | lipoprotein, DUF1439 family |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 1,118,591 | 0 | C | A | 50.2% | 76.3 / 311.7 | 183 | G47C (GGT→TGT) | yceB | lipoprotein, DUF1439 family |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (45/46); new base A (37/55); total (82/101) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.36e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.49e-01 | |||||||||||
Only 100 of 185 total aligned reads displayed.
TTTCATGGTCGCTTTCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTT‑GGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAAACTTGTTCATGGTAGTCC > CP009273/1118445‑1118737 | tttCATGGTCGCTTTCTGACTAACGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTTGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTAGGCTCATCGCGCCCAATTT‑TGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATAAGGGCGTCAGCCACGCCCGGTAAACCg > 2:673916/1‑148 (MQ=255) ttCATGGTCGCTTTCGGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATGGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTT‑GGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGa < 2:2546197/148‑1 (MQ=255) tCATGGTCGCTTTCTGACTCCCGACCAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTCGGGTAACCTTAGTCGGCTCTTCGCGACCAATTT‑GGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGat < 2:499897/148‑1 (MQ=255) aTGGTCGCTTTCTGACTACCGACCAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTT‑GGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGatat < 2:2377805/148‑1 (MQ=255) tCGCTTTCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTT‑GGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCttt < 2:2536466/148‑1 (MQ=255) cGCTTTCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATGGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTT‑GGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCtttt < 2:431259/148‑1 (MQ=255) cTTTCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTT‑GGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTga > 2:2653280/1‑148 (MQ=255) cTTTCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTT‑GGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTga > 2:867290/1‑148 (MQ=255) cTTTCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTT‑GGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTga > 2:2236962/1‑148 (MQ=255) tttCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTT‑GGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGCCACCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTgag < 2:1241060/148‑1 (MQ=255) ttCTTAATACCTAACTGGGTGTTATTGTCCAGTTTGGCGTGTCGGTTTTGGGTAACATTATTCGGCTCTGCGCGACAATTTG‑GGGTGGTCTGTTTTGAAACAACAATTTGGGCGACACCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTgaga < 1:2797408/148‑1 (MQ=255) ttCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTT‑GGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTgaga < 2:2200539/148‑1 (MQ=255) tCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATGGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTT‑GGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGaa < 2:1721921/148‑1 (MQ=255) tCTGACTACCGAACAGGGAGTTCAGGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTT‑GGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGaa < 2:1128081/148‑1 (MQ=255) cTGACTACCGAACCGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGTTTTGGTTAACATTATTCGGCTCTTCGCCACCATTTT‑GGGTGGTCTGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGACAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGaaa < 1:2601081/148‑1 (MQ=255) aCTACCGAACAGGGTGTTCATGTCCAGTTTGGCGTCTCCTGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTT‑GGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAatta < 2:2939638/148‑1 (MQ=255) aCTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTT‑GGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAatta < 2:2939853/148‑1 (MQ=255) cTACCGAACTGGGAGTTCATGTCCATTTTGGCGTCTCCGGTTTGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACAAATTT‑GGGTGGTATGTTTTGTCACAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAattat < 1:2881920/148‑1 (MQ=255) tACCGAACTGGGAGTTCATGTCCAGTTGGGCGTCTCGGTTTTGGTTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCATTTT‑GGGTGGTCTGGTTTGTCACAAAAATTTGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAattatt < 1:2238392/148‑1 (MQ=255) ccGAACTGGTTGTTCTTGTCCTGATTGGGGTCTCGGGTTTGGGTAACCTTTTTCGGCTCTTCGCGACCAATTG‑GGCTGGTCAGGTTTTTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATtattat < 1:2219279/148‑1 (MQ=255) cGAACTGGTAGTTCTTGGCCATATTGGCGTCTCCGGTTTGGGTAACGTTATGCGGCTCTTCGCGACCAATTT‑GGGTGGTCTGTTTTGTCATAAAAATATGGGCGTCACCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATg < 1:2776492/148‑1 (MQ=255) cGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTT‑GGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATAGCTTTTGAGAAATTATTATg > 2:2845821/1‑148 (MQ=255) gAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTT‑GGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGt < 2:1693047/148‑1 (MQ=255) aaCAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTT‑GGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGtt > 1:1576678/1‑148 (MQ=255) aCAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTT‑GGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGttt > 1:2820390/1‑148 (MQ=255) gggAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTT‑GGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGc > 2:2004417/1‑148 (MQ=255) aGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTT‑GGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAg < 2:2238017/148‑1 (MQ=255) gTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTT‑GGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGc > 2:1789973/1‑148 (MQ=255) gTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTT‑GGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGc > 2:136477/1‑148 (MQ=255) tCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTT‑GGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGa > 2:143943/1‑148 (MQ=255) cATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTT‑GGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGAc < 2:2903284/148‑1 (MQ=255) gTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTT‑GGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCTCCGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTAGTATGTTTCGCAAGCGACTgg > 1:3296094/1‑148 (MQ=255) gTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTT‑GGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTgg > 1:1624791/1‑148 (MQ=255) gTCCAGATTGGCGTCGCGGGTTAGGTTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACAATTTT‑GGCTGGTATGTTTTGTCATAACATTTGGGGCTTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTgg < 2:1040961/148‑1 (MQ=255) cctttttGGCTTCTCGGTTTTGGTTAACTTTTTTGGGATCTTCGCGACAAATTT‑GGGTGTTCTGTTTTTTCATAAAATTTTGGGGTTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGATAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGtt < 1:2311026/143‑1 (MQ=255) aGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCATTTT‑GGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATAGGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTaa < 2:576530/148‑1 (MQ=255) taTTGGGGTCTCCGGTTAGGTTAACCTTATTCGGCTCTTCGCCACAAATTT‑GGCTGGTCTGTTTTGTAATAAAAATTTGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAAt < 2:1581213/147‑1 (MQ=255) aTTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTT‑GGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAAtt > 1:1692982/1‑148 (MQ=255) gcgcCTCGGTTTTGGGTAACCTTATTCGCCTCTCCGCCACAATTTG‑GGCTGGTCTGTTTTTTCAAAACATTTGGGGCGTCCCCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCtt < 1:2239587/148‑1 (MQ=255) gCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTT‑GGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCtt > 1:693532/1‑148 (MQ=255) gCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTT‑GGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCtt > 1:892491/1‑148 (MQ=255) cGTCTCCGTTTAGGTTAACATTTTTCGGATCTGCGCCACAATTTG‑GGGTGGTCTGTTTTGTAATAACATTATGGGCTACAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTg < 2:23348/148‑1 (MQ=255) ctcCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTT‑GGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTc > 1:1032475/1‑148 (MQ=255) ctcCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTT‑GGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTc > 1:955933/1‑148 (MQ=255) tcCGGTTTGGGTAACATTATGCGGCTCTTCGCGACCAATTT‑GGCTGGTCTGTTTTGTCACAACAATATGGGCGTCCGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCg < 1:279305/148‑1 (MQ=255) tcCGGTTAGGGTAACCTTATCCGGCTCTTCGCGACCATTTT‑GGCGGGTCAGGTTTGTCATAACAATTTGGGCGACAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCg < 2:893321/148‑1 (MQ=255) ccGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTT‑GGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCgg > 2:2563090/1‑148 (MQ=255) ttAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTT‑GGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGAt > 1:3117055/1‑148 (MQ=255) tAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTT‑GGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATg > 1:2233992/1‑148 (MQ=255) gggTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCATTTT‑GGCTGGTCCGTTTTGTAATAACAATCGGGGCGTCACCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGgt < 2:357732/148‑1 (MQ=255) tAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTT‑GGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTa > 1:1916714/1‑148 (MQ=255) ccTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTT‑GGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTg > 1:702575/1‑148 (MQ=255) ttATTCGGCTCTTCGCGACCAATTT‑GGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTggg > 2:2989237/1‑148 (MQ=255) tATGCGGCTCTTCGCGACCAATTT‑GGGTGGTCAGGTTTGTCACAAAAATAGGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGt < 2:1274563/148‑1 (MQ=255) aTTCGGCTCTTCGCGACCAATTT‑GGCTGGACAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTg < 2:1142140/148‑1 (MQ=255) tCGGCTCTTCGCGACCAATTT‑GGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAg > 2:831273/1‑148 (MQ=255) gCTCTTCGCGACCAATTT‑GGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTg < 2:1916714/148‑1 (MQ=255) ctctCCGCGACAATTTG‑GGGTGTTCTGGTTTTTCAAAACATTCGGGGCGACCGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGa < 1:3391964/148‑1 (MQ=255) tctTCGCGACCAATTT‑GGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGAt > 2:692660/1‑148 (MQ=255) tCGCTACCTTTTG‑GGGTGGTCAGTTTTGACATAAAATTGGGGGCGACCCCCACGCCGGTTAAACCTATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGAAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTAc < 1:62783/148‑1 (MQ=255) tCGCGACCAATTT‑GGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTAc > 1:2184394/1‑148 (MQ=255) aCCAATTT‑GGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCa > 1:1277725/1‑148 (MQ=255) acAATTTGGGGTGGTCAGGTTTGACACAAAAATTGGGGCTTCACCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGATAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCa < 1:439959/147‑1 (MQ=255) aTTT‑GGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAACGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGa > 2:297460/1‑148 (MQ=255) gCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAgg > 1:808835/1‑148 (MQ=255) gCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATAGGGGCGTCCGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAgg < 1:2305653/148‑1 (MQ=255) cTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGc < 2:1701404/148‑1 (MQ=255) cTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGc > 1:2188319/1‑148 (MQ=255) ggTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCa > 2:2606564/1‑148 (MQ=255) ggTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCa > 1:1086656/1‑148 (MQ=255) ggTAAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCa < 2:1489871/148‑1 (MQ=255) gTCAGTTTTGTCATAACAATTTGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCAc < 2:695199/148‑1 (MQ=255) cAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTg > 1:800960/1‑148 (MQ=255) tttGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGa > 1:161521/1‑148 (MQ=255) ttGACATAACAATAGGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGAt < 1:2975937/148‑1 (MQ=255) tGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATc < 2:2568185/148‑1 (MQ=255) gTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCa < 2:544431/148‑1 (MQ=255) gTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCa < 1:2092811/148‑1 (MQ=255) gTCAGAACAAGTTGGGCGCCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCa < 2:1531194/148‑1 (MQ=255) gTCAAAACAATTGGGGCGTCACCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCa < 1:347002/148‑1 (MQ=255) gAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGc > 1:1985060/1‑148 (MQ=255) aCAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAg < 2:3117055/148‑1 (MQ=255) aCAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAg > 2:1942008/1‑148 (MQ=255) tatGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGc > 1:99009/1‑148 (MQ=255) tatGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGc > 1:2148310/1‑148 (MQ=255) gggCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCaaa < 1:1460914/148‑1 (MQ=255) gggCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATGGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCaaa > 1:2535998/1‑148 (MQ=255) cGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATaa < 2:2045513/148‑1 (MQ=255) aGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAAAc < 2:3312844/148‑1 (MQ=255) cACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAAACTTg > 1:516860/1‑148 (MQ=255) cACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAAACTTg > 1:2308732/1‑148 (MQ=255) gCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAAACTTGTTc < 2:3501533/148‑1 (MQ=255) ccGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAAACTTGTTCa < 2:724786/148‑1 (MQ=255) cGGTTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAAACTTGTTCAt < 1:2989237/148‑1 (MQ=255) gggTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCAGCAAATAAAAACTTGTTCATg < 1:265882/148‑1 (MQ=255) gggTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCAGCAAATAAAAACTTGTTCATg < 1:2836790/148‑1 (MQ=255) gggTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAAACTTGTGCATg > 2:3050744/1‑148 (MQ=255) ggTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAAACTTGTTCATgg > 2:2787464/1‑148 (MQ=255) aaCCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAAACTTGTTCATGGTAGt < 1:1118678/148‑1 (MQ=255) ccGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAAACTTGTTGATGGTAGTcc < 1:2378473/148‑1 (MQ=255) | TTTCATGGTCGCTTTCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTT‑GGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAAACTTGTTCATGGTAGTCC > CP009273/1118445‑1118737 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |