| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 1,140,834 | A→T | 40.7% | T147S (ACC→TCC) | rluC → | 23S rRNA pseudouridine(955,2504,2580) synthase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 1,140,834 | 0 | A | T | 40.7% | 145.6 / 245.3 | 201 | T147S (ACC→TCC) | rluC | 23S rRNA pseudouridine(955,2504,2580) synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (45/74); new base T (36/46); total (81/120) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.65e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 207 total aligned reads displayed.
GATGATCACATCCTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGCGGTACATGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGAGCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTGCGCGGTCAGTGGCAGTCGCATGTGAAGAGCGTTCAAGCACCGTTAC > CP009273/1140690‑1140981 | gatgatCACATCCTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGCGGTACATGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCt < 2:1687934/148‑1 (MQ=255) atgatCACATCCTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGCGGTACATGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGActcctc < 2:487780/148‑1 (MQ=255) atgatCACATCCTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGCGGTACATGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGActcctc < 1:912946/148‑1 (MQ=255) atCACATCCTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGCGGTACATGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACTCCTCAgg > 2:1017903/1‑148 (MQ=255) tCACATCCTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGCGGTACATGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGgt < 1:2417976/148‑1 (MQ=255) caTCCTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGCGGTACATGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGtt < 2:642104/148‑1 (MQ=255) caTCCTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGCGGTACATGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGtt < 2:3218691/148‑1 (MQ=255) aTCCTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGCGGTACATGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACTCCTCAGGTGttt < 1:1586887/148‑1 (MQ=255) aTCCTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGCGGTACATGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGttt > 2:2198982/1‑148 (MQ=255) ccTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGCGGTACATGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTg < 2:709164/148‑1 (MQ=255) cTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGCGGTACATGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGc < 1:949833/148‑1 (MQ=255) cTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGCGGTACATGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGc < 1:950821/148‑1 (MQ=255) tGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGCGGTACATGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGt < 1:3139790/148‑1 (MQ=255) cTGAATAAACCTTCCGGTACGGCGGTACATGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACTCCTCAGGTGTTTTGCTGGTAg > 1:2367695/1‑148 (MQ=255) gAATAAACCTTCCGGTACGGCGGTACATGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGGTGGTAGCg > 1:3044188/1‑148 (MQ=255) aaTAAACCTTCCGGTACGGCGGTACATGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGa > 1:2533280/1‑148 (MQ=255) ccTTCCGGTACGGCGGTACATGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAAc > 1:1123907/1‑148 (MQ=255) tCCGGTACGGCGGTACATGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCt > 2:2307322/1‑148 (MQ=255) ccGGTACGGCGGTACATGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACTCCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTc < 2:1335774/148‑1 (MQ=255) cGGTACGGCGGTACATGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACTCCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCg < 1:2052033/148‑1 (MQ=255) tACGGCGGTACATGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGgcg < 1:715670/148‑1 (MQ=255) tACGGCGGTACATGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGgcg > 2:749788/1‑148 (MQ=255) aCGGCGGTACATGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACTCCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGgcgt < 2:1032352/148‑1 (MQ=255) ggcggTACATGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGGTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGgcgttg < 1:620540/148‑1 (MQ=255) gcggTACATGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACTCCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGgcgttgc > 2:1525120/1‑148 (MQ=255) gcggTACATGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGgcgttgc > 1:452426/1‑148 (MQ=255) cggTACATGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGGTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGgcgttgcg < 2:3099293/148‑1 (MQ=255) ggTACATGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACTCCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGgcgttgcgt < 2:3016597/148‑1 (MQ=255) ggTACATGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGgcgttgcgt < 2:2046288/148‑1 (MQ=255) ggTACATGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGgcgttgcgt < 1:1950512/148‑1 (MQ=255) ggTACATGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGgcgttgcgt < 1:149320/148‑1 (MQ=255) gTACATGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACTCCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGgcgttgcgtt < 2:567596/148‑1 (MQ=255) tACATGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACTCCTCAGGTGTTTTTCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTtc > 1:2460847/1‑148 (MQ=255) tACATGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTtc < 1:2695134/148‑1 (MQ=255) aTGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACTCCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTctct > 2:1763879/1‑148 (MQ=255) ggcAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACTCCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATg < 1:1430146/148‑1 (MQ=255) ggcAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACTCCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATg < 2:396777/148‑1 (MQ=255) gcAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTGATTGAAGGTTTGCCGGCGTTGCGCCCGGAATCCCGCTTCCTTGAACAGGTTCATAGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGa > 1:2574744/1‑148 (MQ=255) cAGTGGTGTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACTCCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGAg > 1:2663490/1‑148 (MQ=255) gTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACTCCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGAGCa < 1:1228819/148‑1 (MQ=255) gTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGAGCa < 2:1981657/148‑1 (MQ=255) gTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGAGCa < 2:617297/148‑1 (MQ=255) gTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGGTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACTCCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGAGCa > 1:584172/1‑148 (MQ=255) tGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACTCCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGAGCaa < 2:1492001/148‑1 (MQ=255) tGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGAGCaa < 1:1787940/148‑1 (MQ=255) tGGTTTAAGCTTCGGCGTTATCGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTAAGGTGTTTTGCTGGTAGCGaaaaa < 1:772567/117‑1 (MQ=255) ggTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGAGCAAt < 1:825209/148‑1 (MQ=255) gTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACTCCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGAGCAAtt < 2:2619810/148‑1 (MQ=255) tAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGAGCAATTACg < 2:3201561/148‑1 (MQ=255) tCGGCGTTATTGATGGTTTGCGGTCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGAGCAATTACGTGaaaa < 1:2802760/148‑1 (MQ=255) tCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGAGCAATTACGTGaaaa < 2:1129074/148‑1 (MQ=255) tCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCCCGGTTACTTGAACTGGTTCATCGTCTTTACCGGGACTCCTCAGGTGTTTTTCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCACTGCATTAGCAATTACGTGaaaa > 1:921119/1‑148 (MQ=255) cGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGAGCAATTACGTGaaaaa < 2:3515570/148‑1 (MQ=255) cGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGAGCAATTACGTGaaaaa < 2:2725261/148‑1 (MQ=255) cGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACTCCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGAGCAATTACGTGAAAAAggg < 1:3350407/148‑1 (MQ=255) cGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACTCCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGAGCAATTACGTGAAAAAggg < 2:584172/148‑1 (MQ=255) cGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGAGCAATTACGTGAAAAAggg > 2:1912993/1‑148 (MQ=255) tATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGAGCAATTACGTGAAAAAGGGATg > 1:2459319/1‑148 (MQ=255) ttGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGAGCAATTACGTGAAAAAGGGATGCa > 1:2451958/1‑148 (MQ=255) tGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACTCCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGAGCAATTACGTGAAAAAGGGATGCaa > 1:1174199/1‑148 (MQ=255) aGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCCTGAGCAATTACGTGAAAAAGGGCTGCaaaaa > 1:2393345/1‑148 (MQ=255) ggTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGAGCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAg < 2:2926361/148‑1 (MQ=255) tGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGAGCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTa < 1:2431358/148‑1 (MQ=255) tGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGAGCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTa < 1:996756/148‑1 (MQ=255) tGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGAGCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTa < 1:481642/148‑1 (MQ=255) tGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGAGCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTa < 2:552727/148‑1 (MQ=255) tGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGAGCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTa < 1:2848454/148‑1 (MQ=255) gggCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACTCCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGAGCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCt < 1:374917/148‑1 (MQ=255) gggCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGAGCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCt < 2:951615/148‑1 (MQ=255) ggCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACTCCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGAGCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTg > 1:394974/1‑148 (MQ=255) ggCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACTCCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGAGCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTg < 2:338144/148‑1 (MQ=255) ttGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACTCCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGAGCAATTACGTGACAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGgcgc > 1:2483833/1‑148 (MQ=255) ttGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACTCCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGAGCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGgcgc > 2:1558721/1‑148 (MQ=255) tGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACTCCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGAGCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCt > 2:248426/1‑148 (MQ=255) tGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACTCCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGAGCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCt < 1:1017846/148‑1 (MQ=255) cccGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACTCCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGAGCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTg < 2:817432/148‑1 (MQ=255) gAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGAGCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTGcgcg > 1:2906820/1‑148 (MQ=255) aGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGAGCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTGCGCGGt < 2:2754372/148‑1 (MQ=255) aGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGAGCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTGCGCGGt < 2:452426/148‑1 (MQ=255) cgcgGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACTCCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGAGCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTGCGCGGTCa > 2:2391782/1‑148 (MQ=255) gcgGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGAGCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTGCGCGGTCAg < 2:1297335/148‑1 (MQ=255) gTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGAGCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTGCGCGGTCAGTgg > 1:1521343/1‑148 (MQ=255) gAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACTCCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGAGCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTGCGCGGTCAGTGGCAGTCGc > 1:3495246/1‑148 (MQ=255) gAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGAGCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTGCGCGGTCAGTGGCAGTCGc > 2:2691674/1‑148 (MQ=255) aCTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACTCCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGAGCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTGCGCGGTCAGTGGCAGTCGCAt > 2:3423067/1‑148 (MQ=255) cTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACTCCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGAGCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTGCGCGGTCAGTGGCAGTCGCAtg > 1:1831356/1‑148 (MQ=255) tGGTTCATCGTCTTGACCGGGACTCCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGAGCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTGCGCGGTCAGTGGCAGTCGCAtgt > 2:1707521/1‑148 (MQ=255) ggTTCATCGTCTTGACCGGGACTCCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGAGCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTGCGCGGTCAGTGGCAGTCGCAtgtg > 1:2212418/1‑148 (MQ=255) ttCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGAGCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTGCGCGGTCAGTGGCAGTCGCATGTGaa > 1:2789769/1‑148 (MQ=255) tCATCGTCTTGACCGGGACTCCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGAGCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTGCGCGGTCAGTGGCAGTCGCATGTGAag < 1:1900340/148‑1 (MQ=255) cATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGAGCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTGCGCGGTCAGTGGCAGTCGCATGTGAaga < 1:749788/148‑1 (MQ=255) aTCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGAGCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTGCGCGGTCAGTGGCAGTCGCATGTGAagag < 2:2876133/148‑1 (MQ=255) cGTCTTGACCGGGACTCCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGAGCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTGCGCGGTCAGTGGCAGTCGCATGTGAAGAGCg < 2:128604/148‑1 (MQ=255) gTCTTGACCGGGACTCCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGAGCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTGCGCGGTCAGTGGCAGTCGCATGTGAAGAGCGt < 2:2583855/148‑1 (MQ=255) cTTGACCGGGACTCCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGAGCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTGCGCGGTCAGTGGCAGTCGCATGTGAAGAGCGTTc > 2:2887853/1‑148 (MQ=255) cTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGAGCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTGCGCGGTCAGTGGCAGTCGCATGTGAAGAGCGTTc > 1:1364041/1‑148 (MQ=255) tGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGAGCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTGCGCGGTCAGTGGCAGTCGCATGTGAAGAGCGTTCaa > 1:1668486/1‑148 (MQ=255) gACCGGGACTCCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGAGCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTGCGCGGTCAGTGGCAGTCGCATGTGAAGAGCGTTCAAg < 2:3470864/148‑1 (MQ=255) aCCGGGACTCCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGAGCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTGCGCGGTCAGTGGCAGTCGCATGTGAAGAGCGTTCAAGc > 2:2530553/1‑148 (MQ=255) gACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGAGCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTGCGCGGTCAGTGGCAGTCGCATGTGAAGAGCGTTCAAGCACCGt > 1:499213/1‑148 (MQ=255) | GATGATCACATCCTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGCGGTACATGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGAGCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTGCGCGGTCAGTGGCAGTCGCATGTGAAGAGCGTTCAAGCACCGTTAC > CP009273/1140690‑1140981 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |