Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 1,146,949 | T→A | 22.7% | intergenic (+89/‑122) | fabG → / → acpP | 3‑oxoacyl‑[acyl‑carrier‑protein] reductase/acyl carrier protein (ACP) |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 1,146,949 | 0 | T | A | 22.7% | 434.3 / 133.8 | 207 | intergenic (+89/‑122) | fabG/acpP | 3‑oxoacyl‑[acyl‑carrier‑protein] reductase/acyl carrier protein (ACP) |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (87/73); new base A (26/21); total (113/94) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.15e-01 |
Only 100 of 212 total aligned reads displayed.
AAGCAGCTTACATCACGGGTGAAACTTTGCATGTGAACGGCGGGATGTACATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAATTTAAGAGTATGAGCACTATCGAAGAACGCGTTAA > CP009273/1146802‑1147096 | aaGCAGCTTGCATCACGGGTGAAACTTTGCATGTGAACGGCGGGATGTACATGGTCTGACCGCGATTTTCACAAAATGCTCATGTGGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATGGGGGGGt > 2:238417/1‑148 (MQ=255) aaGCAGCTTACATCACGGGTGAAACTTTGCATGTGAACGGCGGGATGTACATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGt > 2:2038764/1‑148 (MQ=255) agcagcTTACATCACGGGTGAAACTTTGCATGTGAACGGCGGGATGTACATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTa > 1:1510215/1‑148 (MQ=255) gcagcTTACATCACGGGTGAAACTTTGCATGTGAACGGCGGGATGTACATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTaa > 2:2247018/1‑148 (MQ=255) gcgtACATCACGGGTGAAACTGTGCATGTGAACGGCGGGATGTACATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGc < 2:2178578/145‑1 (MQ=255) ttACATCACGGGTGAAACTTTGCATGTGAACGGCGGGATGTACATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCt > 1:1251643/1‑148 (MQ=255) cATCACGGGTGAAACTTTGCATGTGAACGGCGGGATGTACATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGACAGGCCTCaa > 1:352151/1‑148 (MQ=255) aCGGGTGAAACTTTGCATGTGAACGGCGGGATGTACATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATa < 1:1441773/148‑1 (MQ=255) cGGGTGAAACTTTGCATGTGAACGGCGGGATGTACATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATaa < 1:669182/148‑1 (MQ=255) cGGGTGAAACTTTGCATGTGAACGGCGGGATGTACATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATaa < 1:2410383/148‑1 (MQ=255) tGAAACTTTGCATGTGAACGGCGGGATGTACATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTa > 1:64622/1‑148 (MQ=255) tGAAACTTTGCATGTGAACGGCGGGATGTACATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTa > 2:1983791/1‑148 (MQ=255) tGAAACTTTGCATGTGAACGGCGGGATGTACATGGTCTGACCGCGATGTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTa < 2:2485144/148‑1 (MQ=255) aCTTTGCATGTGAACGGCGGGATGTACATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAAt > 2:1526474/1‑148 (MQ=255) cTTTGCATGTGAACGGCGGGATGTACATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATc > 2:3020740/1‑148 (MQ=255) tttGCATGTGAACGGCGGGATGTACATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCg > 2:1608075/1‑148 (MQ=255) tttGCATGTGAACGGCGGGATGTACATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCg < 2:3552520/148‑1 (MQ=255) tttGCATGTGAACGGCGGGATGTACATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCg < 2:513681/148‑1 (MQ=255) tttGCATGTGAACGGCGGGATGTACATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCg < 2:1138934/148‑1 (MQ=255) ttGCATGTGAACGGCGGGATGTACATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGt > 2:697696/1‑148 (MQ=255) gAACGGCGGGATGTACATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGAc < 2:3294902/148‑1 (MQ=255) gAACGGCGGGATGTACATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGAc < 2:957136/148‑1 (MQ=255) aaCGGCGGGATGTACATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGAcc < 1:2116152/148‑1 (MQ=255) aaCGGCGGGATGTACATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGAcc < 2:1747293/148‑1 (MQ=255) aCGGCGGGATGTACATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCt < 2:1157127/148‑1 (MQ=255) gggATGTACATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCgg < 2:1314391/148‑1 (MQ=255) gATGTACATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGa > 1:1851076/1‑148 (MQ=255) gATGTACATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGa > 1:1552531/1‑148 (MQ=255) gTACATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGAttt > 1:1839228/1‑148 (MQ=255) tCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCaa > 1:3252583/1‑148 (MQ=255) cTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCaaa < 1:32732/148‑1 (MQ=255) tGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATTTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTCTTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTGGCAAAt > 2:2075381/1‑148 (MQ=255) tGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAAt < 1:118196/148‑1 (MQ=255) tGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAAt < 2:633203/148‑1 (MQ=255) cgcgATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAAttttt < 1:479661/148‑1 (MQ=255) cgcgATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAAttttt > 1:1770924/1‑148 (MQ=255) tttGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACa > 2:2662668/1‑148 (MQ=255) tttGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACa > 2:1620537/1‑148 (MQ=255) ttGCACAAAATGCTCCTGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACAt < 1:1699559/148‑1 (MQ=255) ttGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACAt > 1:227534/1‑148 (MQ=255) ttGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACAt < 1:3463798/148‑1 (MQ=255) tGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACAtt < 2:2900422/148‑1 (MQ=255) tGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACAtt < 2:2540220/148‑1 (MQ=255) gCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACAttt > 2:2818564/1‑148 (MQ=255) cacaAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACAtttt < 1:3418818/148‑1 (MQ=255) cacaAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACAtttt < 1:2633627/148‑1 (MQ=255) caAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTtat < 2:3430393/148‑1 (MQ=255) aaaaTGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTtata < 1:964168/148‑1 (MQ=255) aaTGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATaca > 1:339780/1‑148 (MQ=255) tGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACt > 1:1930065/1‑148 (MQ=255) tGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACt < 1:2146957/148‑1 (MQ=255) gCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTa > 2:3476486/1‑148 (MQ=255) cATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGa > 1:1506205/1‑148 (MQ=255) tGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGaaa > 2:433412/1‑148 (MQ=255) gcgcgcAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCa < 1:279132/148‑1 (MQ=255) gcgcgcAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCa < 1:525182/148‑1 (MQ=255) cgcgcAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCAt < 1:2716722/148‑1 (MQ=255) gTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGaa < 2:3471785/148‑1 (MQ=255) tCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGaaa < 2:620554/148‑1 (MQ=255) tCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGaaa > 1:430365/1‑148 (MQ=255) tCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGaaa > 2:3182661/1‑148 (MQ=255) gCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCg > 2:2988956/1‑148 (MQ=255) ggTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGtt < 2:3488572/148‑1 (MQ=255) ttATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGtttt < 2:3314385/148‑1 (MQ=255) ttATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGtttt > 1:726977/1‑148 (MQ=255) tATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTg > 1:2276840/1‑148 (MQ=255) tATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTg > 2:2758728/1‑148 (MQ=255) tATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTg > 2:1204111/1‑148 (MQ=255) tATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTg > 1:2859372/1‑148 (MQ=255) aTGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGa > 2:91150/1‑148 (MQ=255) aGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAg > 1:2046366/1‑148 (MQ=255) taataaTTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGa > 1:1689925/1‑148 (MQ=255) aataatTAGTGCAAAATGATGTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGaa < 2:1801263/148‑1 (MQ=255) ataatTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGaaa < 2:1510215/148‑1 (MQ=255) taatTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAAt > 1:1301797/1‑148 (MQ=255) aatTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAAtt > 1:81810/1‑148 (MQ=255) tGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAATTTAagag > 1:1035351/1‑148 (MQ=255) tGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAATTTAagag > 2:2356804/1‑148 (MQ=255) gCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAATTTAAGAGt > 1:116582/1‑148 (MQ=255) cAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAATTTAAGAGTa > 1:2125667/1‑148 (MQ=255) cAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAATTTAAGAGTa < 2:1072018/148‑1 (MQ=255) aaTGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAATTTAAGAGTATGa > 1:2646400/1‑148 (MQ=255) aTGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAATTTAAGAGTATGAg > 2:3116543/1‑148 (MQ=255) aTGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAATTTAAGAGTATGAg > 2:1341183/1‑148 (MQ=255) tGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAATTTAAGAGTATGAGc < 2:2034182/148‑1 (MQ=255) aTTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAATTTAAGAGTATGAGCAc > 1:3365976/1‑148 (MQ=255) aTTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAATTTAAGAGTATGAGCAc > 2:336854/1‑148 (MQ=255) aTTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAATTTAAGAGTATGAGCAc > 2:3090211/1‑148 (MQ=255) ttGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAATTTAAGAGTATGAGCACTa > 2:1412618/1‑148 (MQ=255) ttGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAATTTAAGAGTATGAGCACTa < 1:2247018/148‑1 (MQ=255) ttGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAATTTAAGAGTATGAGCACTa > 2:2305100/1‑148 (MQ=255) ttATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAATTTAAGAGTATGAGCACTATCgaa < 2:2436055/148‑1 (MQ=255) tATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAATTTAAGAGTATGAGCACTATCgaag > 1:2494895/1‑148 (MQ=255) tATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAATTTAAGAGTATGAGCACTATCgaag > 1:1865212/1‑148 (MQ=255) aTTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAATTTAAGAGTATGAGCACTATCgaaga < 2:769630/148‑1 (MQ=255) tGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAATTTAAGAGTATGAGCACTATCGAAGAAc > 1:2911580/1‑148 (MQ=255) gTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAATTTAAGAGTATGAGCACTATCGAAGAACGCGTTa > 1:2611492/1‑148 (MQ=255) tAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAATTTAAGAGTATGAGCACTATCGAAGAACGCGTTaa > 1:708456/1‑148 (MQ=255) tAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAATTTAAGAGTATGAGCACTATCGAAGAACGCGTTaa < 1:304811/148‑1 (MQ=255) tAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAATTTAAGAGTATGAGCACTATCGAAGAACGCGTTaa > 1:1010230/1‑148 (MQ=255) | AAGCAGCTTACATCACGGGTGAAACTTTGCATGTGAACGGCGGGATGTACATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAATTTAAGAGTATGAGCACTATCGAAGAACGCGTTAA > CP009273/1146802‑1147096 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |