| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 1,466,293 | 0 | C | A | 18.1% | 718.4 / 94.8 | 253 | pseudogene (1520/3497 nt) | ydbA | pseudogene, autotransporter homolog; interrupted by IS2 and IS30 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (102/104); new base A (22/24); total (125/128) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.72e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 253 total aligned reads displayed.
AGTAGTGAGGGTAACAACACCGGGATGCTGGAAGTTAATAATAATTCAGCTTTCAATAACCGCGGCGAGTTTATTCTTGATAACGACAAGAATGCTGTGCACATCAACCAGTCCGGTACGCTTTATAATACCGGTCACATGAACATCAGTAATTCTTCCCACAACGGAGCCGTTAATATGTGGGGCGGAAATGGTCGTTTTATCAATGACGGAACGATTGATGTTTCTGCGAAGTCACTGGTAGTCAGCGCTAATAATGCCGGCGATCAGAATGCCTTCTTCTGGAACCAGGA > CP009273/1466147‑1466439 | tGAGGGTAACAACACCGGGATGCTGGAAGTTAATAATAATTCAGCTTTCAATAACCGCGGCGAGTTTATTCTTGATAACGACAAGAATGCTGTGCACATCAACCAGTCCGGTACGCTTTATAATACCGGTCACATGAACATAAGTAAt < 2:2266862/148‑1 (MQ=255) gAGGGTAACAACACCGGGATGCTGGAAGTTAATAATAATTCAGCTTTCAATAACCGCGGCGAGTTTATTCTTGATAACGACAAGAATGCTGTGCACATCAACCAGTCCGGTACCCTTTATAATACCGGTCACATGAACATCAGTAAtt < 1:3322606/148‑1 (MQ=255) ggTAACAACACCGGGATGCTGGAAGTTAATAATAATTCAGCTTTCAATAACCGCGGCGAGTTTATTCTTGATAACGACAAGAATGCTGTGCACATCAACCAGTCCGGTACGCTTTATAATACCGGTCACATGAACATAAGTAAttctt < 1:2815081/148‑1 (MQ=255) gTAACAACACCGGGATGCTGGAAGTTAATAATAATTCAGCTTTCAATAACCGCGGCGAGTTTATTCTTGATAACGACAAGAATGCTGTGCACATCAACCAGTCCGGTACGCTTTATAATACCGGTCACATGAACATAAGTAAttcttc 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tCAGTAATTCTTCCCACAACGGAGCCGTTAATATGTGGGGCGGAAATGGTCGTTTTATAAATTACGGTACGATTGATGTTTGTGCGAAGTCACTGGTAGTCAGCGCTAATAATGCCGGCGATCAGAATGCCTTCTTATGGAACCCGGa > 1:479451/1‑148 (MQ=255) | AGTAGTGAGGGTAACAACACCGGGATGCTGGAAGTTAATAATAATTCAGCTTTCAATAACCGCGGCGAGTTTATTCTTGATAACGACAAGAATGCTGTGCACATCAACCAGTCCGGTACGCTTTATAATACCGGTCACATGAACATCAGTAATTCTTCCCACAACGGAGCCGTTAATATGTGGGGCGGAAATGGTCGTTTTATCAATGACGGAACGATTGATGTTTCTGCGAAGTCACTGGTAGTCAGCGCTAATAATGCCGGCGATCAGAATGCCTTCTTCTGGAACCAGGA > CP009273/1466147‑1466439 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |