| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 1,523,802 | T→G | 60.0% | pseudogene (1644/2037 nt) | rhsE → | pseudogene, Rhs family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 1,523,802 | 0 | T | G | 60.0% | 300.5 / 254.7 | 252 | pseudogene (1644/2037 nt) | rhsE | pseudogene, Rhs family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (53/48); new base G (79/72); total (132/120) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 256 total aligned reads displayed.
TATCACCCCGGACCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTCGAATGACTAAGACATTTGGAT > CP009273/1523655‑1523947 | tatCACCCCGGACCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCt < 2:46336/148‑1 (MQ=255)tatCACCCCGGACCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCt > 1:326553/1‑148 (MQ=255) atCACCCCGGACCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTg > 2:2153876/1‑148 (MQ=255) atCACCCCGGACCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTg > 1:1376770/1‑148 (MQ=255) tCACCCCGGACCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTgg > 2:1169007/1‑148 (MQ=255) cACCCCGGACCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGga > 1:2959395/1‑148 (MQ=255) ccccGGACCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGgatt > 1:2018566/1‑148 (MQ=255) cccGGACCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGgattg > 1:1513025/1‑148 (MQ=255) ccGGACCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGgattga < 2:335372/148‑1 (MQ=255) cGGACCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGgattgat > 1:2258837/1‑148 (MQ=255) cGGACCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGgattgat > 2:66507/1‑148 (MQ=255) cGGACCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGgattgat > 2:1868622/1‑148 (MQ=255) cGGACCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGgattgat > 2:66536/1‑148 (MQ=255) aCCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATtgc > 1:2704070/1‑148 (MQ=255) cGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATtgctgc > 1:2366275/1‑148 (MQ=255) cGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATtgctgc > 1:19345/1‑148 (MQ=255) ttGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCa > 1:1779192/1‑148 (MQ=255) atagGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTa > 2:1678872/3‑148 (MQ=255) agagGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTa > 2:2547178/1‑148 (MQ=255) gagGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGTGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTAc > 2:1813609/1‑148 (MQ=255) gagGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTAc > 1:3018452/1‑148 (MQ=255) gatggaATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAg < 2:2156325/148‑1 (MQ=255) gatggaATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAg < 1:2050257/148‑1 (MQ=255) atggaATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGt > 2:1557211/1‑148 (MQ=255) tggaATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTg < 1:472803/148‑1 (MQ=255) ggaATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTAc < 2:1299458/139‑1 (MQ=255) ggaATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTAc > 1:1299723/1‑139 (MQ=255) ggaATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGc < 2:2289604/148‑1 (MQ=255) tGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCa > 2:282762/1‑148 (MQ=255) tATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGt < 1:1557221/148‑1 (MQ=255) aTCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATCGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTACTTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATAGATTGCTGCAAACAGCATTACTATCAGTGCTTACCAGtt > 1:333408/1‑148 (MQ=255) aTCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGtt < 1:925160/148‑1 (MQ=255) tCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTc > 1:2392789/1‑148 (MQ=255) gTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGt > 2:65545/1‑148 (MQ=255) gTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGt > 1:1124867/1‑148 (MQ=255) tATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGtt > 1:3427018/1‑148 (MQ=255) tCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTAt < 1:628729/148‑1 (MQ=255) gTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGat > 1:3516396/1‑148 (MQ=255) gTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGat < 1:2422770/148‑1 (MQ=255) ttGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGata > 1:2909678/1‑148 (MQ=255) ttGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAAGGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGata > 2:1830935/1‑148 (MQ=255) tGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGatat < 2:2329824/148‑1 (MQ=255) tGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGatat < 2:1453624/148‑1 (MQ=255) tCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGAt > 2:2784786/1‑148 (MQ=255) tCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGAt > 2:1579162/1‑148 (MQ=255) cccATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATg < 1:3228726/148‑1 (MQ=255) ccATACAAGTGATTGACCCAATGGGGTGAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTTTCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACTGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGc < 1:2188166/148‑1 (MQ=255) aCAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTAtt > 1:2954772/1‑148 (MQ=255) aCAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTAtt > 2:342102/1‑148 (MQ=255) aaGTGATAGACCCAATGGTGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTAttgt < 2:2663933/148‑1 (MQ=255) aaGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTAttgt < 2:1740855/148‑1 (MQ=255) tGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTgg > 1:124959/1‑148 (MQ=255) aTAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCg > 2:3208553/1‑148 (MQ=255) tAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCgg < 2:1277974/148‑1 (MQ=255) aGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGa > 1:2313731/1‑148 (MQ=255) aGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGa > 1:3038791/1‑148 (MQ=255) gACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAg < 1:997536/148‑1 (MQ=255) aCCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGc < 1:2113858/148‑1 (MQ=255) aCCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGc < 2:53390/148‑1 (MQ=255) ccAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTc > 1:516256/1‑148 (MQ=255) cAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCa < 1:307230/148‑1 (MQ=255) cAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCa > 2:2254147/1‑148 (MQ=255) aaTGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCAt > 1:1003352/1‑148 (MQ=255) aTGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATa < 2:2449700/148‑1 (MQ=255) aTGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATa < 2:3062686/148‑1 (MQ=255) tGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATaa < 1:1813609/148‑1 (MQ=255) ggTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATgg < 2:3195168/148‑1 (MQ=255) gTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATggg > 2:1512026/1‑148 (MQ=255) tAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGgc < 2:2872691/148‑1 (MQ=255) tGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGgccgcc > 2:1310907/1‑148 (MQ=255) cGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGa < 2:1868512/148‑1 (MQ=255) cGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGa < 2:391523/148‑1 (MQ=255) tGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCa > 1:2847758/1‑148 (MQ=255) tGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCa < 2:1565292/148‑1 (MQ=255) gaATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATg < 2:196125/148‑1 (MQ=255) gaATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATg < 2:196078/148‑1 (MQ=255) gaATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATg > 1:1096827/1‑148 (MQ=255) aaTATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATga > 1:834285/1‑148 (MQ=255) atatGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATgag < 2:335402/148‑1 (MQ=255) tatGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATgaga > 2:2027610/1‑148 (MQ=255) aTCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGCTTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGt < 2:2880408/148‑1 (MQ=255) cAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTa > 2:2931013/1‑148 (MQ=255) cAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTa < 1:1416901/148‑1 (MQ=255) gTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACtt > 1:2533521/1‑148 (MQ=255) ggACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGa < 1:419142/148‑1 (MQ=255) ggACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGa < 1:2562673/148‑1 (MQ=255) ggACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGa < 2:1085447/148‑1 (MQ=255) cTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGAtgt < 2:1376770/148‑1 (MQ=255) tATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTCGaa < 1:222168/148‑1 (MQ=255) aTGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTCGAAt < 1:604995/148‑1 (MQ=255) tGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTCGAATg < 1:3360933/148‑1 (MQ=255) gCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTCGAATGa < 2:3431487/148‑1 (MQ=255) gTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTCGAATGACTa < 2:3256392/148‑1 (MQ=255) gTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTCGAATGACTa < 1:1850448/148‑1 (MQ=255) tCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTCGAATGACTAAGa > 2:738837/1‑148 (MQ=255) tGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTCGAATGACTAAGACa < 2:3516396/148‑1 (MQ=255) gtgtACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTCGAATGACTAAGACAtt < 2:3188704/148‑1 (MQ=255) tgtACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTCGAATGACTAAGACAttt < 1:1169007/148‑1 (MQ=255) ccTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCTATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTCGAATGACTAAGACATTAGGAt < 2:3018452/148‑1 (MQ=255) ccTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTCGAATGACTAAGACATTTGGAt > 2:2232403/1‑148 (MQ=255) | TATCACCCCGGACCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTCGAATGACTAAGACATTTGGAT > CP009273/1523655‑1523947 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |