Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 1,735,082 | G→T | 42.9% | V305V (GTG→GTT) | ydhC → | putative arabinose efflux transporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 1,735,082 | 0 | G | T | 42.9% | 191.7 / 220.4 | 198 | V305V (GTG→GTT) | ydhC | putative arabinose efflux transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (63/50); new base T (36/49); total (99/99) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.46e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 210 total aligned reads displayed.
TGGCTGTCGCGCCGCGCTGCAGAAATGGCAAGGCAAGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCAACTGGGTCTGTGCTTCCTCGCAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTG > CP009273/1734935‑1735229 | tGGCTGTCGCGCCGCGCTGCAGAAATGGCAAGGCAAGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCtgtgtg < 1:1165224/148‑1 (MQ=255) ggCTGTCGCGCCGCGCTGCAGAAATGGCAAGGCAAGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGa > 2:591902/1‑148 (MQ=255) ggCTGTCGCGCCGCGCTGCAGAAATGGCAAGGCAAGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGa < 2:137845/148‑1 (MQ=255) gCTGTCGCGCCGCGCTGCAGAAATGGCTAGGCAAGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTAt < 1:164765/148‑1 (MQ=255) tGTCGCGCCGCGCTGCAGAAATGGCAAGGCAAGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATgg > 1:3074347/1‑148 (MQ=255) tCGCGCCGCGCTGCAGAAATGGCAAGGCAAGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCg > 2:1417375/1‑148 (MQ=255) cgcTGCAGAAATGGCAAGGCAAGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCaa < 2:2050757/148‑1 (MQ=255) gcTGCAGAAATGGCAAGGCAAGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAAt < 1:800926/148‑1 (MQ=255) aaaTGGCAAGGCAAGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGa > 2:449435/1‑148 (MQ=255) aaTGGCAAGGCAAGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGAt < 1:354333/148‑1 (MQ=255) aaTGGCAAGGCAAGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGAt < 1:3456708/148‑1 (MQ=255) aTGGCAAGGCAAGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATc < 1:1726322/148‑1 (MQ=255) aTGGCAAGGCAAGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATc < 2:2087975/148‑1 (MQ=255) tGGCAAGGCAAGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCt > 2:572376/1‑148 (MQ=255) tGGCAAGGCAAGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCt > 2:572215/1‑148 (MQ=255) gcaaggcaagCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTAc > 2:2281542/1‑148 (MQ=255) caaggcaagCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTAcc < 2:2512672/148‑1 (MQ=255) caaggcaagCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTAcc < 2:776467/148‑1 (MQ=255) aaggcaagCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTAccc < 2:499969/148‑1 (MQ=255) aggcaagCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCt < 2:2346595/148‑1 (MQ=255) aggcaagCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCt < 1:3179641/148‑1 (MQ=255) ggcaagCAGTTATTACCGTGGTTTCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTTATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTa < 2:966196/148‑1 (MQ=255) ggcaagCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTa < 1:2265701/148‑1 (MQ=255) ggcaagCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTa < 1:343817/148‑1 (MQ=255) ggcaagCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTa > 1:2069713/1‑148 (MQ=255) ggcaagCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTa < 2:1509512/148‑1 (MQ=255) gcaagCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTAt < 1:1780595/148‑1 (MQ=255) caagCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTAtt > 1:2184775/1‑148 (MQ=255) caagCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTAtt > 2:2848566/1‑148 (MQ=255) aagCAGTTATTACCGTGGGTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCAGTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTAttg < 2:2026099/148‑1 (MQ=255) cAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTAttgttg > 1:1110809/1‑148 (MQ=255) tattaCCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGc > 2:1079742/1‑148 (MQ=255) ttaCCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCTATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGccc < 2:3229863/148‑1 (MQ=255) ttaCCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGccc > 2:2211892/1‑148 (MQ=255) cgaggTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGgc > 2:1746649/4‑148 (MQ=255) gTGGGTGCCCGTGCAGATAGCTGTCAGCGTCATTGCGACCGGGGCTGCGGGCTTCAAGAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGgcg < 1:2109672/148‑1 (MQ=255) tGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGgcgc > 2:196594/1‑148 (MQ=255) tGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGgcgc > 1:3553357/1‑148 (MQ=255) gCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGt < 2:3429759/148‑1 (MQ=255) tGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTcc < 1:471380/148‑1 (MQ=255) cTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTcc < 1:2327813/148‑1 (MQ=255) tGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTccc < 1:1599946/148‑1 (MQ=255) tttGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCcac > 1:1164225/1‑148 (MQ=255) ttGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCcaca < 1:1298263/148‑1 (MQ=255) cTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGGCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGc > 1:596912/1‑148 (MQ=255) tGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCa > 2:2855211/1‑148 (MQ=255) gTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCaa < 2:2755103/148‑1 (MQ=255) cAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACt > 2:1829572/1‑148 (MQ=255) cAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACt > 1:2005043/1‑148 (MQ=255) aGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTg > 1:2818026/1‑148 (MQ=255) cGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGt < 1:1619098/148‑1 (MQ=255) tCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTcg < 1:982341/148‑1 (MQ=255) tCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTcg > 1:578512/1‑148 (MQ=255) tCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTcg > 1:2368372/1‑148 (MQ=255) tCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTcg > 2:116094/1‑148 (MQ=255) cATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTcgc > 2:2363873/1‑148 (MQ=255) aTTGCGACCTGGGCTGCGGGATTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGCTCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTTCCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCGTCCCACACGCAACTGGTcgcg < 2:1001711/148‑1 (MQ=255) aCCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAg < 1:3510985/148‑1 (MQ=255) ccTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGc > 2:2550088/1‑148 (MQ=255) tGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCATCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGt > 2:3085567/1‑148 (MQ=255) cGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGaa < 1:2062662/148‑1 (MQ=255) ggCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAaca > 2:2239533/1‑148 (MQ=255) gCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAacac > 1:1854049/1‑148 (MQ=255) tCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACActct > 2:3477504/1‑148 (MQ=255) tCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACActct > 2:1879478/1‑148 (MQ=255) aTTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTc > 2:2617074/1‑148 (MQ=255) ttAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGa > 1:1925851/1‑138 (MQ=255) ttAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGa < 2:124162/138‑1 (MQ=255) tAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCaa < 1:2848566/148‑1 (MQ=255) tAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCaa > 1:689924/1‑148 (MQ=255) gCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCAACt > 2:1353685/1‑148 (MQ=255) cATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCAACTgg < 2:1471209/148‑1 (MQ=255) cATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCAACTgg < 2:1111956/148‑1 (MQ=255) tgtCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCAACTGGGTCt < 1:2629801/148‑1 (MQ=255) tCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCAACTGGGTCtgt > 1:2473823/1‑148 (MQ=255) cTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCAACTGGGTCTGTGCt < 1:3219737/148‑1 (MQ=255) cTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCAACTGGGTCTGTGCt < 2:3147037/148‑1 (MQ=255) tGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCAACTGGGTCTGTGCtt < 1:1350478/148‑1 (MQ=255) tGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCAACTGGGTCTGTGCtt < 1:1351841/148‑1 (MQ=255) ggTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCAACTGGGTCTGTGCTTc > 1:2323360/1‑148 (MQ=255) tCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCAACTGGGTCTGTGCTTCCt > 1:1239731/1‑148 (MQ=255) aaaTCCTGATCCCATTCTGTGTTAGGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCAACTGGGTCTGTGCTTCCTCGc < 2:3564204/148‑1 (MQ=255) aaTCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCAACTGGGTCTGTGCTTCCTCGCa < 2:730941/148‑1 (MQ=255) tCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCAACTGGGTCTGTGCTTCCTCGCAAg > 1:2713632/1‑148 (MQ=255) ccTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCAACTGGGTCTGTGCTTCCTCGCAAGt > 2:376549/1‑148 (MQ=255) cTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCAACTGGGTCTGTGCTTCCTCGCAAGTc < 2:144542/148‑1 (MQ=255) gATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCAACTGGGTCTGTGCTTCCTCGCAAGTCTg < 2:3154602/148‑1 (MQ=255) gATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCAACTGGGTCTGTGCTTCCTCGCAAGTCTg < 2:3009929/148‑1 (MQ=255) aTCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCAACTGGGTCTGTGCTTCCTCGCAAGTCTgg < 1:3450055/148‑1 (MQ=255) ccATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCAACTGGGTCTGTGCTTCCTCGCAAGTCTGGTAg < 1:3157304/148‑1 (MQ=255) cagtCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCAACTGGGTCTGTGCTTCCTCGCAAGTCTGGTAGt < 2:3224375/145‑1 (MQ=255) cATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCAACTGGGTCTGTGCTTCCTCGCAAGTCTGGTAGt > 1:1136386/1‑148 (MQ=255) cATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCAACTGGGTCTGTGCTTCCTCGCAAGTCTGGTAGt > 1:2086394/1‑148 (MQ=255) aTTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCAACTGGGTCTGTGCTTCCTCGCAAGTCTGGTAGtt > 1:2399575/1‑148 (MQ=255) tgtgttATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCAACTGGGTCTGTGCTTCCTCGCAAGTCTGGTAGTTTCCt > 2:2066819/1‑148 (MQ=255) tgtgtgATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCAACTGGGTCTGTGCTTCCTCGCAAGTCTGGTAGTTTCCt < 1:1079741/148‑1 (MQ=255) tgttATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCAACTGGGTCTGTGCTTCCTCGCAAGTCTGGTAGTTTCCTgg < 1:295643/148‑1 (MQ=255) tgttATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCAACTGGGTCTGTGCTTCCTCGCAAGTCTGGTAGTTTCCTgg > 1:1474258/1‑148 (MQ=255) tgATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCAACTGGGTCTGTGCTTCCTCGCAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCt > 1:489109/1‑148 (MQ=255) gATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCAACTGGGTCTGTGCTTCCTCGCAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTg < 2:2196534/148‑1 (MQ=255) | TGGCTGTCGCGCCGCGCTGCAGAAATGGCAAGGCAAGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCAACTGGGTCTGTGCTTCCTCGCAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTG > CP009273/1734935‑1735229 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |