| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 1,836,192 | T→A | 100% | I67I (ATA→ATT) | ynjH ← | DUF1496 family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 1,836,192 | 0 | T | A | 98.0% | 477.0 / ‑0.3 | 149 | I67I (ATA→ATT) | ynjH | DUF1496 family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/2); new base A (66/80); total (67/82) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 149 total aligned reads displayed.
TGGTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTACCTCCACGTCCGGACGATAATGCGGG > CP009273/1836048‑1836336 | tggtctggtGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAAtt < 1:3422932/148‑1 (MQ=255) gtGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCgg < 1:1614534/148‑1 (MQ=255) cTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCtt < 2:1191911/148‑1 (MQ=255) aCCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTTTGGGTTTACGCGCCGCCACACCACCGGGTTTGGGGTAAGGGTTTTGTGATAACGCTGGGATTGCAGCAGAATTGCTTCGGGGTTaa > 1:778607/1‑148 (MQ=255) aCCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCGGAATTCCTTCGGCTTTaa < 2:3363917/148‑1 (MQ=255) aCCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTaa < 2:1595654/148‑1 (MQ=255) aCCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCGTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGTTTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAAATCCTTCGGCTTTaa > 2:737476/1‑148 (MQ=255) cTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAAtt < 1:62553/148‑1 (MQ=255) cTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAAtt < 1:1945159/148‑1 (MQ=255) tGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTa < 2:1030545/148‑1 (MQ=255) aaGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTTCGCGCCGCCAGACCCGCGGCTTATTGCTAAGGGGTTTGTGATGACGCTTGCATTTCCGCAGAATTACATCGGCTTTTATTAca > 2:14746/1‑147 (MQ=255) gagGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTGTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTTCCGc > 2:2846051/1‑148 (MQ=255) ggCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGccc > 2:2302334/1‑148 (MQ=255) tGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCa > 2:120479/1‑148 (MQ=255) cAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGa < 2:1727385/148‑1 (MQ=255) cAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCGTTAATTACCGCCCCTTCAGa > 2:3551159/1‑148 (MQ=255) tatCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATTGCGTTTCGCGCCGCCACACCCGCGGGTTAGTGCTAAGGGGTTTGTAATCACGCTGGGAGTGCAGCAGAATTCCGTAGGGTTTAATTAACGCCCCGTCAGgata > 1:1550373/1‑148 (MQ=255) gCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAAtttt < 2:787787/148‑1 (MQ=255) gCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAAtttt < 2:2233758/148‑1 (MQ=255) cTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTg < 2:2142297/148‑1 (MQ=255) cTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTg < 2:2142188/148‑1 (MQ=255) tGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGa < 2:2398258/148‑1 (MQ=255) tGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGa < 1:1244005/148‑1 (MQ=255) gCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTGTATTGCTTTAAGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTTTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAAATACTTCGGCGTTAATTAACGCCCCTTCAGAATAATTTTGATc > 1:579132/1‑148 (MQ=255) ccTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTg < 2:486756/148‑1 (MQ=255) ctgctgACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGa < 2:2603401/148‑1 (MQ=255) tgctgACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGAt < 1:943916/148‑1 (MQ=255) ctgACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATaa < 2:947416/148‑1 (MQ=255) ttCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACgcag > 2:2032185/1‑148 (MQ=255) ttattaGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTTATACTGATAAAAGCAGCAATg > 2:3078546/1‑148 (MQ=255) ttaGAGGCGTTTATGGGTTTACGCGCCGCCAGAACAGCGGATTATTGCAAAGGGTTTTTTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTACTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATACTTATAAAAGCAGCACAGAGt > 2:605761/1‑148 (MQ=255) ttaGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGt < 1:871586/148‑1 (MQ=255) gagGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACa < 1:2310083/148‑1 (MQ=255) gagGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACa < 1:2309964/148‑1 (MQ=255) gCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATACTTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAggg > 2:591979/1‑148 (MQ=255) gCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAggg > 2:651589/1‑148 (MQ=255) tttATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTg < 1:2557413/148‑1 (MQ=255) tATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTgcg > 2:2258574/1‑148 (MQ=255) tATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTgcg < 2:799104/148‑1 (MQ=255) ggCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTg > 1:3334129/1‑148 (MQ=255) ggCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTg < 2:546274/148‑1 (MQ=255) ggCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTg < 1:3091045/148‑1 (MQ=255) gCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGa < 1:184538/148‑1 (MQ=255) cTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGAc > 1:156974/1‑148 (MQ=255) cTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGAc > 2:1276679/1‑148 (MQ=255) cTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGAc > 1:427154/1‑148 (MQ=255) cgccgcCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGc < 2:484782/148‑1 (MQ=255) ccgccAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCct < 2:2884160/148‑1 (MQ=255) cgccAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCctg > 2:2130126/1‑148 (MQ=255) cgccAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCctg > 2:1483075/1‑148 (MQ=255) ccAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCctgaa > 1:930132/1‑148 (MQ=255) cAGCCCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCctgaac < 1:1385237/148‑1 (MQ=255) cAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCctgaac > 1:2257298/1‑148 (MQ=255) cAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCctgaac > 1:2257583/1‑148 (MQ=255) cAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCctgaac > 1:1154045/1‑148 (MQ=255) gACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCctgaactg > 1:3314559/1‑148 (MQ=255) cAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCtgaactgaac > 1:1187809/1‑148 (MQ=255) cAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCtgaactgaac > 1:1187829/1‑148 (MQ=255) cGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACt > 1:2046481/1‑148 (MQ=255) ggATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTCCCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACtt < 1:2049819/148‑1 (MQ=255) ggATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACtt < 1:2050711/148‑1 (MQ=255) gATTTGTGCTATGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTAGCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCGGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGGTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTc < 2:3064393/148‑1 (MQ=255) gATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTc < 2:2097148/148‑1 (MQ=255) gATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTc > 1:707556/1‑148 (MQ=255) gATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTc < 2:2374157/148‑1 (MQ=255) tAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTgg > 2:1457018/1‑148 (MQ=255) tAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTgg > 1:1566979/1‑148 (MQ=255) tGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCgg > 1:3415440/1‑148 (MQ=255) cTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTa < 1:1017232/148‑1 (MQ=255) aaGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACg > 2:3346243/1‑148 (MQ=255) aaGGGTTTTGTCATCACGCGGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCATAATAATTTTGATCCTTATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACg < 1:1047348/148‑1 (MQ=255) aGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGt < 1:3229742/148‑1 (MQ=255) aGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGATTTAATTACCGCCCCTACAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGt < 1:1853335/148‑1 (MQ=255) gggTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGtt > 2:1277389/1‑148 (MQ=255) ggTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGttt < 2:1413740/148‑1 (MQ=255) gTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTa < 1:142730/148‑1 (MQ=255) ttttGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGTCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTAc > 1:514995/1‑148 (MQ=255) ttttGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTAc < 1:1501120/148‑1 (MQ=255) ttttGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTAc < 2:2403843/148‑1 (MQ=255) tttGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTAcc > 2:2851598/1‑148 (MQ=255) tGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTACCTc < 2:2211171/148‑1 (MQ=255) tcaCGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTACCTCCACGt > 2:497827/1‑148 (MQ=255) caCGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAACCGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTACCTCCACGTc < 1:771472/148‑1 (MQ=255) cGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTACCTCCACGTCCg > 1:2912219/1‑148 (MQ=255) 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cagAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTACCTCCACGTCCGGACGATAATGCggg > 2:1082125/1‑148 (MQ=255) | TGGTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTACCTCCACGTCCGGACGATAATGCGGG > CP009273/1836048‑1836336 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |